Map Locations of contig_56196 (11420 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_56196

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_69282 1 386 bp MLOC_69282.1 Available Available None
MLOC_69281 1 731 bp AK250421.1 Available Available None
MLOC_69283 1 399 bp AK356416 Available Available None





CDS Structure of MLOC_69282






CDS Structure of MLOC_69281






CDS Structure of MLOC_69283






Contig Sequence (11420 bp)

>contig_56196 11420 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTTTTGGCCCCGATAAAAAATATATTATACAGTTGCTCTTGTTTTATAATTTGTGAAAAA
AAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAGCAGCTTCGTCGAGCGTTGGAGACGGCGATGACGCTG
AGCCTGAGGTGACTCGCGATCGAGCTGGGCTCCTAATCCGGAGTGCGTAGACGGATTAGA
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CGCGAGCAAACGGCCAACTATTGTTTTTCTTCCCCTCCCCCCACTGCCCCCGCACATGAT
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CCAACACTCCCCCCCCCACCCATGACGTCATCGATTCGGCCCCGATTCGCCCGCCGCCGA
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CCATGTGGCCGTGGCACAACTCTAGGGGGCGCAGATCAGGTGGCTACGGCTGTGGCTACG
GTGGCCATGACTCGTTGTTGCCGTGTTGCGATGGGAGGAGCCCCGCATCGTCCGGAGCGG
GACGGGCTTCCGCGGCGTGCGGCTCCGTGATTCCGAACGGTACGCGGCGGAGATCATGGT
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CGACATCATCGCATGGCAGTACGACCGGCCGAAGTCGAAGATGAATTTCTCCGACGTCGA
GACCGCCAAGGATGCCACGGCCATGGCTTCATGGTTCTGCATGGTTTATCGAGGAGGAAG
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TGTGATAGCAAAACAAAATATGAATTGTAGTAAAACAAACTAGTAAACTCATGTTGCAAC
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TTAAACATTGGTTATAGCAAACTTAAACGGTTAACACAGAGAGAAATATTGCATGTCTGA
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GGCTACGAGCGTTTCTCTAAAAGTATGCACGTCGGTATAATTTGTTGGCGACAGCGATTG
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GGCGAGCATGGGACCTATATGCTGCTTACTCCGGCAATTAGTCACGGTTTCGCACGGGTG
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GTTGCCCGTTCCCGATGCAGTTCTGGAGGTGCGTCGGTCTCTCTGTTGACGGTGCTTCGG
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TTGATTCTTCGGGGGCTTGCCCCCGTTTTTGGGTAATATATTTAGGTGGTCGAGGGCCTT
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AACAATTTTCGAAATGCAACAATTTTTGAAAGTCCTGCAAAAATGAACATATGTCCATTT
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TATTCCGGAAAACCACTATTCACAGCTTTGTGCGGAACGGTATTGGGCTTCGCACAGAAC
GGGAAGGGCATGAGCTGGATCATTTAGCGGGGTTGTAGGGTCCGGTTTTGGGAGCTTTCC
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GAAAAATGTTCATGTTTTAAAAAAATGTTCGCGCTTCCAAATTTGTTCAGGATTTTTCAA
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TGCGAAACGGTGACTCCTTGCCTCAGAGAGTGGCATATAGGAGGTCACGGGAATTGCGGG
AGCTCCTACATGCTGCTCGTTACGGCAGGAAGTTCCACACACGCATAGGGGGTCTCAAAA
AAATTTGATAACTATTTTTTTTTTCATTTTCCTGTTATTTCCTTTCTTTTTTCCTTTTTT
TTTCTTTTCAAATTTGAAGCAAAAAACATATTTCTAATTCAAAGAACATTTTTTGAATTT
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AGCCGGTGCATATGACGTCGCGGTCTCCTAAACGACAGTCCAGCTTAAAATAGGCGACGA
TAGTGGCCCATGTCCAGTTGTAGGCCAAGATTCCACCGTCGCCATCTGTCCTAGCCCGAC
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TCTCCTCGTCTCCCCGTCTTCGCCGTGGCCGTCCTCCGTTCGAGCCATGGATCCGGCTCT
TCGGCGCCGCTCCCGCCTCCCTATCCACCTCCTGCTGGTGGCCGTCACGTTACTGGCGGC
CCTCGCCGCGCGATCCGGCGCCGAGGTCATCACCCTCACCGAAGAGACCTTCTCCGACAA
GGTACTGACTGCTTTCCCCTTGTCGTGCATCTCCCCCCTTCCACCTCCCCTTCGAGGTGT
GATAGCTGTACTGTGAAGCATACCGAGGACACGTTAACTGCTAATTTTCGACTGGTCACT
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CAGATTCGTCACTGGTTCAAGCATGATTCTTAATAATAAACCGATAGATCAGTATTCTTC
GTGTATTAATTGTTCCACTTACGGAAGGTTCGGTGTTTAGATGCGGCGCTCCTTCTTAAC
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CCCTCCGTTCACTAATATAAGATGTTTTAGCTTTTTCTTGAATCGGATGTGTATAGACAC
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ATATTGACAAAATTACTTCATATATCTTCCTTTTGGACCTTGCATGATCATATACAGTTT
GGCGATACGTTCTTTTACTGCATTTTCTAACTGCAGCTGTGCTGTTATTTGAAAATTATG
TATGGTTCTTTGTTTTGTCAATATTCAGCTAGTGAATGCTCAATGCCTAATCCAACTACT
CAATGGCATTACAGGGCCTAGGGATGTGGAATCTCTCAAGAATTTTGTGTTGAACGAAGC
TGAGAAAGCAGGAGAGGCGACACTTGAAGATGAGCTATAGATGTTCGTAGCAGGCACATG
CCGCCGATAGACGATGATATTCTGGTCAGGCAACTTTGGATGCTGCTCGACCTGTTTAAA
TTTTACAACCGAGTTGGCTTGTACCGCCGCCTCCTGGCGCTTGTCACTAACTTAGAATGG
TACCATCTCAGATGCAAGAAGGAAATATTTTTGTAACTTTTAACCTTTTCAACTATTTTT
TAAAAGCTATTTGCGGGCTTAACTTTTGGTGTGTACGAAATACAACCCATCTATTCAGTG
GCCTAAGAACAAAAAAAAGAAATTTTGCTGGATTTTGCAAAACAGAAAAAATGCTATCCT
CAAATTGTTTACCTCAACAACACAACACTTTTGAACTGTCTTGGTATGGTACTGTAGATC
AGCTCCAATAAAACATGGCCATCTGTTATCCTTCCAAAACGGCTTTCTTCTGACTTGTCC
TGCGCTACTCCGGCCCGGACGGGCACCAGCGGTTGCTCCACCTTTCCTACTCAGTCTCAA
CTCTCAACCAGTAGGTCTGTACCTGTTGCGACCCATCAAGGCCTCAACCTGGCGGCAAAA
TGAAAAAATTTGATCCAAAAACGTAAGTATTTTCACGCGTTTGAAAAAAAAAATCATCCA
TCTGACCTTTTTGTGTGACGTCTTTGACTTATGCACTACACTACATTGTGTGACGGCTGA
CACTTTTGTCGTCCGAAACTACGTCTAACCCGGCGTCATACTGCACCGTGTGACGCAAGT
CAAAGACGCCACACAAAGGAACGCGGTCCAGTTTGTAAAATACTTTGGTCAGATTCGTCA
AATTTGCCCAACCTGACATCCATCTCAATTGCATGTACTCCCATCTCCATATTATTGAAT
GGAGGGAGTGCTAATACTCCTCTCAGATTTGTTTGATACAATTTGGGACAGAGGCTATTC
AACTTTATTGAGCCTTATTTTCTTTGGCCATTAGTGCTGATCCACACTATTTGCCCATCA
TCCTGTAAACGTTATGTGCATATCCTGATTTTTTTTAAGCCAGACAATGCAGTCCTTGGC
TTGAAACTAAATGGTAGACAATGATATTTACAAAGAAAATTGCATTTATTACTATCCAAG
GAAGCTTATTTCGGATATGCATTGGCCTAGATGGTGATCAAAGGTAAGTATACAAGTAGC
AGCATTCGAAAGCAGACAGATGATAAAATGATTAGTCTTCAGAAGCATCCATGTTTTCCC
GAAAGCCGAAATAACACGACAGTACTCAAATGACACATCAACAGGGCGCATATCACACGG
CGCTAACAGTAGCAAAACTTACTAAACTACTAGAGAGATCTCAAAAGCAAGACATAGATG
GATTCAGGTAAACGCCTCTATTTCTTCTTGATGGCAGCCTTGGTCACCTTGGCTCCGGTG
GGGTCCTTCTTCTCCACGCC