Map Locations of contig_56179 (8834 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_56179

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_69270 3 1793 bp AK360603 Available Available None
MLOC_69268 9 2828 bp AK364520 Available Available None
MLOC_69269 1 230 bp MLOC_69269.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_69270






CDS Structure of MLOC_69268






CDS Structure of MLOC_69269






Contig Sequence (8834 bp)

>contig_56179 8834 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CGGAGGGAGTACATGGTTGTTACATTACGACCTGGACATGAACAAGGTCATTTTGTTACT
GTATACCCATGAGCCATTGCCAACCGCCGCAACCGAGCTTCAATTGTACAGTAACTAATT
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TGTTTAACTATTAACAGAGCTTCTTGTTCTGAATTGCATCAGGGGGAAGAGATTGCTTTT
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TATTCCGAACATACTTTGCAATTGCATGACAAGCGGATACAGCAGCACTTATGCAGATTT
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AACATGGCATTAAGCCTTGAGAAACATCCCAAAATAAAACTCATGCTTCAGCTCTTTGCA
TCTGTCATTTAAACCCTGGCATGGCATGTTGATATGCCATGCTTCAAAATCAGATCATAG
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GTGCTCTTTTCATCAAGGAGTACAATAACAAACTCTTCAATTGGTTGGTGACCTTCGCTC
TGGTCATGGTCGTGCTTGGGCGCTTTGTCATCAAGTTCTTTTTACTTGAAATTGCTGCTT
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GCAGGTGCCAGAAACCACATCCATCCAAAGTATTCACCCGGCAGCAATGACAACGCACAG
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TTTCTTGGACTTCATGGCCCCGAGGAGGTGGCCGCTCCTACGAGGTCGATCCGGACGAAG
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CGGGTCTGCCCATCTTGCTGGTATCCATGGTCTCGTTGAGGAAGTTGTCATCCTCTTGAG
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AAGCGCTCAGGTCGTCCGGGACGGCAGCGTCGGAGGTGGCTTCTGATGGAGAGCCAGTGA
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CCCGCTTCACCGAGTCCTCGGCCATCTTCACCTGCAAAATTTGGTGTGGAAGTATGTTCA
GAGCAGACAATGAATGGCCAACATAGAGACTATAGGATACACTGGCAGCGTATTCTTTCT
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CTTTCTGCTTCTTGAACGCCTGGCCGATTCCCGATTGGATTGCTTCCTGGAACCAGTCAA
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ACAACATCAGGAGTTACACTATTCAGGATAAAAATATATTACCTCCATCCCAAAAAGCTT
GCCTTAGATTTATCTAGATACGGATGTATCTAACAGACTAACACTAAATCTAAAACAAGC
TTTTTGGGACGGAGGGAGTACCAAAGCGCAAACCAGCATACCATGATGTACACTTCAATA
ATTTGACATTACTAAAGACCCAAATGCCATTGTGCAACCTATATGCCTTGTGCGCTGTGC
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TTTTTATTCTACTTGATACCATCACTCCGTCAGTATCAGACAAGTCATCTAACAAATATG
ATATGGATACTTTTTTTAACCATTAACTTGTCCATTGAACAATCATAAATCATATAAGCA
ACGAGCTATGCCTATAGCCAAGATAAGAACACCCATACGAATTACTCTGTGTAACATGGC
AAAGGGATGAATGAGGGGGGATTCTAAAGGAAGGGCTAACTTGAGGAAAAGGGGCATTCA
TGCATGATGAGACAACATGATGGTGCATATAATCACAAGAAGGTACAAATGATTACCTCC
TCCGCAGTCTTTGATCAGTAGGGACCCCATTCCCAGTGATCTCATCTTCTCCTTCCATAT
CATCATCTTCTGACTGCTCCCGCGAAGAAGAGCTAGCGGCTTGCTTTACAAGGGCATCAG
CATTTTGTACCAGATGTGGACCCGACACCCCGCTTGCGCCACCAGCTAGCTTGTTTTGAA
GTGGAACCACATTACCTGATATGTGTCCAAAAGCCAGGCATGTCATGTCAGCATCACAGA
ATATGCTTTTCTGTTTATGTTTCACAACATGGCATATAACACGATTCCAGGGAACTATGG
TTTACACTACTCAGTTAAACTGTGAAGTCTATCTGCTCAAGGAAAAAACAGGATGATTTC
TTCTGAGAACTCAAAACAGGATACTGAGTGTGCCCCCCTAGGCTGCGAAAAAAGGATAGC
CATAAACACGCTTG