Map Locations of contig_56076 (7028 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_56076

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_69206 5 2088 bp AK360509 Available Available None





CDS Structure of MLOC_69206






Contig Sequence (7028 bp)

>contig_56076 7028 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGGGGGGGGGGGGGGGGAGTAGAACTAAGAACCCATCATTTGTGTGACTTACAAAAATA
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CGTAGTGTGTTGACGTGATAAGACCCTGATCTTATGAATTTTGCTCTGAGCTTCGGCATA
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GCATTTTCCTAGCATTGTCATATTATTTTGTCCCGTGTCATTGTGTTATTTTACAGGCCT
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CCTGTTTGCCGCATTACTTGTTGTGCAGAGGTGGACGTGGTGGTGGAGGCGGCTATGGCG
GGGATAGACGCAGAGATGGAGGAGGCTATGGCGGGCCTAACAGAAACCAGGGCGGTGGTT
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TCTGCTTTCCCTGGACTTCTGTTCCATTGTCTTATTCCAGTGTTGGTCGGATGTTTGTTT
GTCAAAAGTGATTGATCTATGTTGTGTGAATTTTTCCTTAGAGGCAGCTGGATAACCTCC
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TGCTTTGCTATTATGGTGACTGGTTTCACCATATATTATTTTTCCTTTTTTGATCTAATG
CTTACATTCCACATGGTATTCAGCCGGTGGATCACTGCTGTAAGCTTTGGATTTTGCTTT
GGAGAACAGGTAGGGCGTTTTTGTTGTGTGGTTGATTCGCTCCCAGGATAGTCTGCTAGT
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TTATTTCCATCTATTTGTAAAATTTAATTTACTTGAAGTAAAGCCTGTCTGAATATGAGG
TAATTAGCAGCTTGATATTACCTTGTCTTAGATTTGACTAGATACATACTTATTTAGATA
AATATAAAACAAGAATTTAGATAAACATCCAAACAAGCACTAGCATTAACGGAATTTTCT
TTATCTACTCCCTTTGAGCTTCTGTCTGCTAGCCGAACTTCAGTGGCACGACATTGCTAT
CTGCTCTTTCAGACAATCCTGAAGCTGCAGATCCAGCTTCAGTTCAGTTGGCTCGAGTTT
CATCAATTCATTTCTTTCCTTGTTTGGTTCTTCTCTTAACAATAAACTGCAGCTGACATA
CTTGAGTTTCACCCGGTGATGTTTTGAGCAACTTATGGTACTTGAGTAAAGTATCACTTA
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TACCTTATATGCATCAGTATATGTTACTACTTTCATTGCCCTCCTCTATGTTACCACGAG
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GCGGCAGTTCCAGGAAGCTGGCTCGCGCAGAGCTTCCGCACGGGGCCTAAAACAGGGAGA
GTACGCGTCTTTAAATAAATTTTGACCCATGAAGTGAGGAGAGCATTTTTCGCTTTTTTT
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ATTGACGAAGTCGTCACCGACGCCTTCGTTGTTGATGGGAACGTCTCCTCCCATTAAAAG
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CTAAGGTAAACCAGCCCTTCCCCTCGAAAAACTTCCTCCTCGTGCACGAGCGACGCGACC
AAAAATTCGTTGGGCTCCCAACAAGCGTTATTGTTTAACGTCTTTAGCCAGGCATTGACA
ATTCAATGATGCTCACATAAAGGATAGCAATCGGACACGAAGAAAACATCATGAAACATG
TGACAAACATATCTAAGTCTGACATACTTCCTATGCNNNNGCATTTTATAGAAAAACAGA
TTGTCTTGACAATCAATAGTTATCATATGCAAGGAAGAAGAATGAGATAATAGCAATCTC
AACATAACGAAAGGGTGGTTTAGTAACATGAAAGATTTTACCACAATATTTTTCTCTCTC
ATTACATGTGGGATCATANNNNNNNNNNNNNNNNTAGCTATCCCATAGGATATTCTTTTC
GTGATCCA