Map Locations of contig_56006 (10367 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_56006

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_69156 1 1677 bp AK357968 Available Available None





CDS Structure of MLOC_69156






Contig Sequence (10367 bp)

>contig_56006 10367 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGTCTACCCATTGTTTTCTCCCATTGTTTTCTATTTCTCGACACTATTTCTCGACAGAAT
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GTCCACTAGCAAAACAATCCATGACAAACAATCTTCTCCGCTTCTTCAGTAAACCTCTCA
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TTAAACGGAAAGGAAGAAAGAAGTTGTAAAGTATAAAAAAGGAAAGAGATAAAGAAAGAA
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TCCAACCAAGACGATTCGCAAGCATTTTCCCTTTCAAAAGCAACTGTTAGCAGTGCCGTG
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AGGCACCTTGTTTCGGATAGTCTTTATCGCTTTTTCCCCCCGCCACGAAAAAGCCATCAA
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GGATCGTTTCTTTCTTGGTGCTGAAACAAAGCTTAATCAGGCACTGTTTGGGTTTGGAAC
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ACACCAAGTTCTGCTACTTCAACAACTACAACGTCAACCAGCCGCGGCACTTCTGCCGAG
CCTGCCACCGCTACTGGACGGCCGGCGGCGCCATCCGCAACGTGCCCGTCGGCTCCGGCC
GCCGCAAGAACAGGCCGGTGCTGCACGGTGCCTCGACGGTGATGAGCGCCGACAACCCCT
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GGTCTCAGGTCGTGCCGTCGCCGGCTTACCTCGGCCACGGAGAGATGGAGCAGTGCTGGT
GGCTCGTTCATCAGTACCCAGCCCAAGGTCAGGTCAACGGGGACGTCCAACTAAGCCCTT
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TATGTTCAATAATATGTCGACTGAATCTACCAGAGTATATCATGTATATGACGCTATTGA
ATTCAGACATAGCTGCACGCTGGAGGATATGGCCCACCACCCTACCAAGCCCTAACCCTT
CTCTTTCTATCCCCCTCTCTCCTTCCTCCCTCCCTACCCCTCTCCCCCCTCTCCGTTCAA
CTGACCGTCGTGCCTCTGCAAGCTCATGTTGGCCGCGAGGCGATGTCTATTTTTCACTCG
TCTTGTGACCGTCCAATGCGATTCCACGAGGGGTTACCTTCACCGGTTGCGTCTCCCCAT
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GTAAATCTGACACTCCCAAACAATTTCTTGTTGCTTGGGATCTTGTGTGTAGGCCAAAAA
ATGATGGTTGCCTTGGTATCATGATTTTACACATTCGAATCAATCCTTGTTAGTTAAGCA
TTTGCATAAATTATAGAACAGGACTGATGTGCCCTGGGTGTCCCTAAGTTGGAACTCTTA
CTATGATGAGGTTGTCCCACATGCCACTGTTTTGTGTGGCTCTTTTGGCTCGCGTCATGT
CCTCAACTTGAATGATAACTATAGAACCATTGCCTCACTTAAGGTTAATGAAGGGGGTTC
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GCTGCCTCGTGTGTTCTCTTTTATTGTAGAGGATAAACTCTCTGTAAAGTATTTTATTTT
TATTGATGATAAATCCTGGAGCTGAGAGATCTTCCTCTCTTTGGAAATAAATTCACTTGG
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NNNNNNGATGTTTTGTATGCCTTTTTTATTTTTTTTGGGACTAACTT