Map Locations of contig_55862 (8406 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_55862

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_69065 10 2711 bp AK359120 Available Available None





CDS Structure of MLOC_69065






Contig Sequence (8406 bp)

>contig_55862 8406 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTTCTACAATTTTATGGAGCACCTCCTAGAGAGCTTCATAAAAAACAAGAAGTTGGACCC
CAGATTCTAGTTTTTTTATGGAGCTATATATTGTGGAGCTACCCCGTTTGGCTTATGTTT
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TGTGTAAGTGATTGTCCTAGCATGACTTGCATACAAAATTGTCTAGTGATTTATGTTTTT
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CTGCAGTCGATGGCATGATGGCACTAGTCACCACTAGTGTGCATCCTGTGTTATCCTGTA
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GGGTTTCGCCGCACGGCACGGCGTTGACGGCCAGGTCGTTCTGTTGACGGTCCGGTCACT
TGCTTTCTTAGCGTGCAGGAAAAGGAAATCAAAGCTAGTGGACCGTCCGAGTTTCACACC
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TTGTAGGTTTACATTAAACTGTACACTTTTTTCTTAGAGGAGGATGATCCCTGGCTTTTG
TATCTGGAAGAAAACCACTCTATTAATTATTCACAAAGACCTTAGAGCATCTTCAATAGC
TCTATATGAATCCTATACTCGTTTTTCACGGTGTGAGCTCAAAACGGGCGTCCAACGGCT
TGTCTGTGTGGTCGTCCAAGCATGCACATCCTCTATATTGACCTCGACAATATCCATGTT
TGGACAATGTGAAGATGTCGTCCGATCTCAGCTCTAGACATGATTTCTCCCTCTCCCTAG
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GACCATTGTCTATATAAATATATAGACATTTTAAATATAGACATGTTGTTAGATATGCTC
TTACAAAGTAGTATATCAGGAAATATGAAGTCATCATCTTAGCAACATCTCGCTACTCCT
ATCCACTTGATGAAGGGATGCCGATAGTTCGAACCTAGTACAAAACAAACATCGCACAAT
GCCTAATATCTAAAGCCGGATGTCCCAACCAAGCCACATACTGGGTTTGGGATGCAAGCC
GGTCTGATGCACTCTCATAGGTCGTCGTCGTCATCTTTGACTGATCCATCTTCAGAGCAG
GTACCGAGGCATCAACCTTTTCAGGCCTGCCATTGACGCTCCCACGGTGTTGGACAACGC
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CTCCCTCAAGTCAATGCACACCTCCAAGAATAACGCCCCCAAGGAGGGAACGACACAAAC
TGCGTCGCCGTCATCCGATCAATTGATGACTGATCCTGGGTTTCCCCCAGAGGTAGCGGA
AGGAGTTGGGAGCTTCACCTCGATGATGCCTTCAAGAAGGAAACAATGTCGAGGGCGTCA
TCATCACCGGCTCCGGACACCCGTCGAAGACCAGGTTTTCGTCCGGATCTGTCCCATGAA
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CAGATCCGACGACCATCCACTACCGCACTTCCATCATGGGAGCCCTGACACACCGGGCGT
TGCCTGCGTGTGCCACCACTGGAGCCTGGGAGGAGGGTCGTCAACCGACCTCGCCAAAGA
GCGAGAGCCACCAAGAGGAATCCCGCGTGCTCGTCACCGTCACTGATCGGATCTAATCCG
GAGCCAAAGTCACCAGATCGCCAGCCCGGATCCCCCTTGGACAGGGACATCGCCACGCCA
TGCCCTCATGAGTGACCTGGACTTCACCTGTCATCACCTTCTAGGGACGCCGCCCTCGAG
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TCTTTGAAGGAGAACCATTGACTGACTATTGGTGCGGCGATTTGGCATATTTTTTCCCGT
TGTTCAGCAACATTGTCCAGTTTCTTCACCCCGTGAAGTGGTGGTGATAGATTGCAAGTT
TGTACGCATAGGATGATACTATAATCGATGTTGCTTCAGTAGTAGATCTCATCTCAAGGG
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GACGATTTTTAATGTAATTTTATTTCTTATTGGTTGTTCTATGTCCAATTGACTGTACTG
ACTTATTTTTCTTGATATTAATCAGATCTAAAATACTCTTTGTGCATCTATTAAAAAATA
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TGGCTGACAGTTGGCTGACAGTTTTAGTTGTGTCATTGGTATCAAACTCTTTTATACTTT
CCGAAACGATGCAACCTTTCTTTCAAAAAATGTCATGCTGTTCTGAAATACTCACTCCGT
TTCTTAATGTAAGTTTTTTCAAATTTTTTACTAAAAGGCTACATATAAATGTAAATAAAC
ATTTTTACCTATGTAGTTTTCTAGTAATTTTTTTTAAAAGATTTATATTTAAAAACATCA
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CTAAAGGGGTCCTAATAATTAATTTAATATAATATAATACTTTTTATGTTCTAAAATAAT
TGTCTCAACTTTGTACTAGCTTTAGTATAAAGTTGTATTAAGGGGAGTTTATCTATACCT
GGCGGCAGCGCCTAGGGTTTACTTCCCCTGACGGAAACGTCTAGGGTTCCCGGATTGTAA
CCGACTCCAACTCCCCTTCGGTGCGGTTGAAGGGCATCCATATAGACGCACCAGTTCGGG
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ATCGGCGAATAGCACAACCATGGAGGACAAGGCGATGGGGGTGGACGATCTGATAGGGAA
GCTAAACCTGCAAGAGAGAGAGGAGGACGATCTCAATTTTGACGAGGAATTTCCAGATGA
GACAGGAGAAGCGGAGTTCATGGTGATTGCCAAAGTACACACCGATTAACCCTTTTCCAG
GGGGGCGTTCTATGAGAGTATGCGCATGGCCTGGAGCTTGGCACAAGGTGCCACTTTCAG
CGCGTTAGGAGTAAATCTCTTCTCGATCACGGTAAACTGTTTGGGTGATTGGAAGAGGAT
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CTTTACGAAATTTGATGAGGTGGCTCTGGATAAACTGGCAGTTTGGATCCACATAGTTCA
TCTCCCTCCAATGTACAGGAAGGAGCAGGTGGTTCGTGTGACAGCCCAGATGCATCTCCC
CTCCCCTTTTGTATCTTCCTTGTATGGCAACTTTGGCATGTTGATGTTTTGTGGGGTGAG
CCTAACATAGTGTCATCATTTCATGTGCATCATGCCTTCTTGCATTGCATTTTTTTGTTG
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TGTTTGTTTAGGTGTGGGGGACAACAAGTGCTTGTAAATACCCACAAGTTGCTCCATAGG
GAAAAACCATTCTCTCTCTCTATGTTATTTGTGGCAGGTTTAAAAGGCTTTGTTTCTCCC
CTTTAA