Map Locations of contig_55691 (8312 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_55691

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_68985 1 656 bp None Available Available None
MLOC_68984 1 1055 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_68985






CDS Structure of MLOC_68984






Contig Sequence (8312 bp)

>contig_55691 8312 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGGGTGGAGGGTGGAGGCACTTATATTATTGTAGTTTTTGTGGTGCCTTTTTCAACTTG
CGATGAACTTACCAAGATGGTAAGATGTTTTTATTAGGGAGCTAAGACGGTAAAAGGAAA
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GGGGGAAACCCCTAGCCCAGGTCCTCTTGGTGCGGATGATGGCGGCGCATCTGCATCGTG
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TGCACGCCGGTGTGGTGTGTTAGGCTGCTTGTTATGTCTTGTTACTGTGATCTCTCGACA
ACATCCCTGATTTACTTGTGTCTTTTATGATGATGTCCTTCAGTTTGCTAGCTAGGCGGG
TCTTGTCTTGAACTTCCTTTGTTTTGTTTTCTCCTCTCTTACTCTCTCTTGTACGGTTTT
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TTGGTGGTTTAGGTGCAGAACTCCTGGACTTTGTTCTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAACTC
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GGGACTCTGGCCTCTCGTCGGATGATGACCACGTCGCCTGATTTGTTCCCTAGCAATACT
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GCTGAACTATGGAATTAAAAGATACAAATCAAATATAAAAATATAGGCCTATATATCTCC
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GGGGAATTATCTCTCGGGGACATACTGCATTTATTAAAGGTACACAATAAAATGAGTTCT
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GGGCGTGGGAAAAAATGGCGGGCAAAAAAGGCGCATGCGGTAGTTTTGACGCGTGTCGAC
GCGCGCACACTTTTAATTCAGTGCCTCTCCACGCGCCCTTCTCCACCGCTCTGCCTTGCC
ACGCTTCTTCTTTCTCGTGTCGCCATCGCCGCTTCACCACGCCGTCGTGCTGCTGGGGAA
GTTCGGGCTACCGCGGCGTCCATGCGCTCCCCTCCGGCCTCTTCTAGGCCGAGATCCGCT
TCGGTGAGATGTGCCTCACCCTCGTCATGTTCGACGCCTTCCACGAGGCCGCCCGCGCGT
ACGACGATGCGGTGTGGCGCCTCCGACGTCCTCGTAGAAGATGAACTTTCCCAAGGTGGC
AACGCGAGAGCGGGCACAAGAGCTCGTGCCTCCCCTGCGGCTTGTAACCGATGAGGACCG
TCACGAGAACCGAAGACGGGAGCGCCGCCTCGGCATCACTTAGATGGACGAGGAGGCCAT
GACGGTGTGGCGCCAACGCTTTCCGAAGGACGTCGTCACCAAGCGCAAATTCTAAAGGAG
GGCGGAGCGAGCCGCCTATCGCGAGGACATGCATACGTGGAAGGAGGCAGCGCTCTTCAA
CATCGAGCTCAAAGAAGCGTCGACCTAGGACAATGACGATGAACGGTGGAATGACGCCTT
CATTACGACGTCGGAGTCGGAGGACACCACCGAATTGGATGAGGACAACAAGGAGTAGTT
TAGCCGTCGACTTTTCTATCGTTTGTGTGAACTTATTGGTCATGACGAACTTGCTTGTGG
TTATCTTGTTTCTGCGAACTTTGCATATTTTGGATGTTCGAGATCATCTTATATGTGTTG
TTTCTGCGTTGGCGACATAGCGCGCTTGATTTTACAGCACCTACTGAAGCGGCATGCTGG
CGAGCTAAGAATTTGCAATGCGTAGTGAAGAAATTGCCTACTCGGACGCAAAAATTGCCA
TTATGTGCAGTGTAATTTTTTTTGCACGCCACGCCTGCGCTCGTTCATTGGAGATGCTCT
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AAATGGCCTTTTGTTTTCCAAATGCTAAAACTAAAAGGATTCCCTATAAGTGGATTCAGT
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CTATCGTTGCTGATGTATTAGCTCCTTTGGTGAATAATGTAAAAAATGTTGGCATGATGA
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TTTCCTGTTGCAAGATGATTTTAAGAGTGCACATAAATTTGAAATACATATTTTGTCTGT
TTCAACAAATGTCTTGCTTGAAAATCAACTTTCATAGAAGTGAGTTGTCCTTGTTTGGTG
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TACATGATGGTTCAAAGACGACACATCAATTTGAGACCCTATGATGAAACTATGTGTGAT
ACATGAATCACAAATGGCATAGCTCTAGCTTCGTCGCCAATAACGCGGACTATGTGCGAT
GGTGGCCCATCAAGCACGATTCAGAACAGAAGTGCGTGTGTGATCCGTGCCATACGGTTG
ACATTTATGAAATGTTTGCGATGAGGCAAAATAACACAAACGTCTAACCAAATACATATG
TGTGCAATATACGACATACAGTTAACTCGGATAAACTGTTTGCAATGATTCATAATAACA
TAAATTATTACCAAGATAATTATGTGTGCGATATACGACATATAGGTTACTTGGATGGAC
TGTTTGTGATGAGATAAAATAACACAAACGGTTACCCAAATGAAGATGTGTGCACTAGAC
TGCATATAAGCCACTCTGATGAATTGTTTACGATGAAAAAATTAACACAAACGGTTATCC
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CTTGAATGAACTGTACGCGATGAGCCAAAATAACACAAATGATTCGGTGTAACAAGATGT
GTGTGATATCCAACAAAGAGGCCCGTAATTTAAATTGTGTTGAAAGAGTGGAAATAATAC
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CAACAAGGTTTAGAAAACAACAAAATAGAAGCAGCTACTCGTCGACGTTGTTGCGAGGCT
GGTCTATTGATTCGACAATGTTGAAATATTGTTTGGCCTCATGCAACATCCTCTTTTGGG
AGGAAGGATCCAGATTTGGGTCGGCGAAGACCATGTTCTTGAACAGTTCATAGGCCCGTG
CATTCCTCTGCTCCTGCTTCATCACAGTAGCTCCGGTCTCATGCAAAATCCCGTCCACGG
CCAAACGTGGGTGTGCGGTGCTCCCATGATGGATATTTTCCAAGCGAACGTAAACATCAT
AGCCATAAGTTGCGTGCTGTGCTAGAGTGGTAGCAGACTCTAACGAGGTTACTTCCCTTG
CCGCAGTGGGGACCCCGACTTAGTAGTCGAGATCGCCGAGTGAACGTGCTCGGTGATCCC
AGAGATNNATGCTCACCGAACACAAAGAAACTGAATAATAAGAGTCTTANNNNNNNNNNT
ATCGTTTGATACAACAAATGACCATCAGGGTCAAGCCTTACATAGATAGGGCCTAGAAGG
CCGATCACACCAACACATCTTCTTAGCAGAAAACTTGGTAGTAAACGGGAACCCATGCCA
TCATCCTTAACCGACAGGCATTCTGACTGGGAAGCGTCCTAGTTTGCGTGTTCGTCCCCG
ACGGCGAATTCTACTCCGTACACTAATTCCTCCATGTCTGGTGAATGACATAACCAGTGG
CAAGCCAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAACAGCCCATGATGTGGATAATGTAGTTG
GTACGATAATAAGTAATATGTAGCCTTTGTGGAAAGCAAGTTTTACTTATGAATAAGCAT
GGTCATTTACTTGTATGGGTATGCATCATAAAGTATATGGTAATCATAAGAACAGGTTAC
AGATATCAATATATCTGTTGAAGGCTGAACACCTTAGGTTCACCATTGTACCAAGTCACC
GAACTTGACATTATCATCTCTTTCAGATAACACTTTTAAACATACACACACACACACACA
CACACACTTTTATGCGGAAATGACTGGACGTA