Map Locations of contig_55585 (10298 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_55585

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_68937 4 4028 bp MLOC_68937.1 Available Available LOC_Os03g03710.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13103.m00367 protein ribonuclease protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_68937






Contig Sequence (10298 bp)

>contig_55585 10298 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GAAGGAGGAAGAAAGAGAGAGAGTTCGCGCGCGCGTTCGAGTATGCCGCGCGCGGAAGTG
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GCGCGCACGGTTTTTGCGCACCCGCTGGAGCATCCCGCCCCAGGTGAGAGTGAAGTCTAG
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GTGCCTTGTAGGGTCGGGGGTTCCGACTGCTGATGCTCTGAGAGGTTGCTGCAGATCGAT
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CTTAGACCTGAACTTGACCACTATTAACAAGATTGTATCGGCAAAATTTCTCTGCACGAG
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TGAGACGTGCATAAGCTGCCCACATCAGAACTTGCATCTGCTTAGCATCAGCGATGTTAT
TCTTCCCTGTTCATATGATTAGGATTACTCATTTACTGAAAAACGTACAGGGATACTTAT
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AGTTATATTTATGTACAGCATATCCCATTTCCAGGGATTCTATATACACTTAAATACTTA
ATGTATGCTCTGCTCTTTACTCGCCACTTCTTCTCTATTCAGCAATCCGTGTTGCTGCTC
GTTGGTACCAGAGTCACCTTGGTGACAGTGCCAAAGTGTTGCTGGTCACAAATGATAGAG
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TCTGTTGCATGAAATTCATAGCTGAATCTTTTACAATACTGCATGAATGATTGTATGGTT
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TTTGCTCGATTTGGTGGTTGTCCCAAGTAGCGGAGATGTTGCCATGGAAGATGTAGAAGA
TCTTAGACCATCCAAAAGGAAAATAGTTTACAATGAGGTATACCAAGCTATTAACTATGC
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TTTATCATCAAGGGAAGCTTCGAGTTAATCGTTACAATCCATTTGAAGCATATGTCGGAA
GTGAGAGCATTGGTGATGAGATTATTATCCGTGGGCGTTCAAATATGAACAGGTCCTTCG
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GCTTCTGTCCCCAGTCGTCCAGTTGGACGTGTTGTTGGTATCATCAAGAGGAATTGGAAC
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TCCTAAGATTCGGATCCAAACTAGACAACTTGGTAATCTTTTAAATAAAAGGATTATCGT
TGCAGTTGATTCATGGGATGTCATGTCTCGATACCCATCAGGACACTATGTGCGGACTAT
AGGAGATATTGGCGATAAGGAAACAGAAACAGAGGCAAGTTTGTATACCTAATTTTTATT
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GAGAATGATATTAACACAAGACCTTTCTCTACACAAGTCCTTGCTTGTTTGCCACCTTTG
CCTTGGACATTGTCACCTGAGGATGTGGCTAATCCTAATAGGCAAGATTTGCGGCATGTG
AGAGTCTTTAGTGTGGATCCACCAGGTAAGTTAATCATGATAAGTGTACCCTATTCTTTT
GTACTGCCCCCGGTCCTTTTTTGTCTGCATATTAGCTTTGTCTGAAGTCAAAGTATCTCT
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TAAAAAGGACTGGAGGGAGTACTTGAATTGCATTCTTACCATTAAACTGCTATTTAGGTT
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TGATTTTGTTCTATATGCTCTTGCTTGGAACAAACTCAATTTCTAAATCCTTTTGGTTGA
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TTTTGCGAGGAATGTTAATTTCCAGGAATTTCTCATGAAAAATTGGTCTGGGGGCATTCA
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ATTCGTTTAATGCATTCTCTCACCAATAGATACAAACCATTGCGAGTGCACTGAGCACTA
TTTTTGCATTTTTTGTTATGCTAGTCCTTGTGTCCAGGGTTCAAACTATTTTATCTCTGA
TCTTGACCTTGGGTATCGAAAGCTATATGTTGTCAACAGGAGATATATGGGATGTGTTTC
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ATATGGCATGCACACTGAATTACTGATTACTGAATCAACTGCGCCGAAGCATTGCATTGA
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TCCAAATTTTGTTGTTTTTTAGATGTTTGTTCTCTTCGTGCTGATGTTGAGAGGCTGGCG
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AGGCTATCCATAGTCCCTGTGTCCTACTAGCTCTATGACGAGTCCATACTATATTCAAGC
TCAAATGGAATGAATTATTTTGCACAACTTTCGCTAAGCTTTTTCACAAGTGATTTGGGT
CATTTGTCAATGCACCCTAGCCTTTTGGTCATATATATAATTTATTCTTGCAAACTGCAC
TTTATACGTAATTTGCGGTAATGCCATTTTCCTCGAAGAAAAATCTCCTCTGAGACTCTT
GAGTGCAGAGTGCGGTGTGCTTAGAAACTTACCAACTTGTTAGATCCAAGTCATACAATA
TGCCTACATGTTGGATTAGGGCAATAGCTTGACATTTTTTATCCCGTGGTATCACGAACA
GAGAATTACCGTCATCTGCCTTTGGCATTTCTTCTGTTCATCCTCGTGCGTTTTGAAGTG
ATTACATCTGTCCCTTCAAATGAGTATGCTAATTCTTGTATCATGGTGCTTTGGAATTTT
TGGAATGTTATGTGTACAGGAAATGACACCTGATGCTGATATCATATCCTCAAGATACAC
AAAGAGTGTTATCAAGTCTTGTGCTGCAATGTCTTATGTGGAAGCCCAAGCAAGAATGGA
TGACAGGTGCTTTCTGGCATTCAGCTCTCTCAGTTTCCATTACTTATATGCGGAGATACA
ATTTTGTGTTGGTCTAGCAGGCCAAAAACGTTGTCATAAAATTTATCGGTTCATTCCTTG
AAATTTCCAGCCGTTTGGTTGATCCACTGACTGTAGACTTGCGGAACTTAAATTCATTAG
CAAAGGTTTGTTCTTGTGTTACCATATCTCGGTCTGCAATAAATATTCTTGTCTGTTACC
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ATCGGCGTTGCGAAAGAGGGGCTCTGACTCTTGCTTCAGCAGAAGTCAAATTCGAAATTG
ACAGTGAAACTCATGATCCCCTTGACATAGGTATTCAGATTTGTAAACCTGTTTCCTGTC
TACTTCTATACTTCTATAGATGAAATACTTACACTCAATTTCAACAGGAATATATCAAAT
TCGTGAGGCAAACCAAATGATTGAAGAGTTTATGTTGGCAGCAAATGTTTCTGTTGCTGA
GAAGATTTTGCAGCACTACCCCTTGTGTTCATTGCTACGGTACACATTTGCTCTGTTCTT
TTTTATTGTCACATTCAGATCAGATTAAGGTTACCACTCTGGTAGTGCATTCAAGTATAT
CTGAATTTCTAGGAGAACCCTTTGAAAATATTGAGCAGGTCTTATTCATAATTGAATACA
AATTTTGACCTGTCGACCTGTTCATTCAATCATAAAATAACCAATAGGCAATAGCACAGA
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GACTAAACTTTGTACTAACTTTGTAGTCACTTATTTTGGACGGAGGGAGTATGTGATTGT
GACGTCTCCTGATGTTACCAAGTTGCATTTATATGATTGCTCATAAACTCATTCTCGATA
TTTGATACTCCCTCCGTCCCATAATTCTTGTCTTAGGTTTGTCTAGAAATGCATGTATCT
AAACACTAAAACATGACTAGATACATTCATATCTAGACAAATCTAANNNNAGAATTTTGG
GATGGAGGGAGTACAATATTTTCCATTTTGCACATATTGGTAGCTGTGAACAAAATACAT
TCAGCTGTTGACTGTCCTTGTCTTGGAATGGTTTAAGAACTTATTTGTGACTGCCATCTT
CTTACACTATTATGCAGCAATTTCAAAGAATGTACCAGTTCTTTCCTACAACTGCTGTAT
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GACCTGTATTATTTTACTCTACGGTGTATTCACATTTAGGTGACAGTCCTAGGTAGCTGG
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GGACATAGCAAGTATTTATCCATGTTACTTTCTCCGTCTATGAGCTAATTAGTTTAGTCG
GGAAGTTTAATTGGAATAACTATTTTCATGCACCTTTTGTACAAAGTGAAAGTTGTTTGT
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TGAGATTGGTGTCTGATTGTACATCTTTTCCATTGCAGATGTTGTGGTGCATAGGTTGCT
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TTTAATTGTCAATGGCTCTTTTATTTATAAGTTACATTAGATAGTATGTTCTTCAAGACG
AGGGTAGTAAGAAATGGCTCAAGTCTGTTATCATCTGAGTGACCATAGTGATTATTAATA
CTGCTCTACACTTCTAACTGTGCAGGCCTGTGGATACTGAAGCTAGAATAGTAAAGATCA
AGGCAAATGGTTTCATAGTCTTCGTACCGAAGTATGGATCTCTCTTCACAGCCCCCCCAA
CCCCATTTCTCCGCCTTCTCATTTATTTGCCAAGTTAGAGTAACAATGAACGTCCTGCTC
AGAAGTCACAAGTATAAAAAATCACACCCCAGCAATGACCTGATCAGTCATCTTAAATTA
AATTAGTACCAACTTACTGATGGATCTGAGGTAACCCAAACCAGGATCTGTCAATTGCTA
TTGCATGGATTCTGAGCTTCAATCTTGTTTCTGGCCACTATGTTCTTAGAAATATGAGAT
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GAACATTTGGTTGACACACTATGGGGCATTTTGATTCCCTACCCTTCCTCAGGGAAGCCA
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TGGTAATGCACCCCAAAATGCCCTACGGAAGTTTCCCAGTTTCTAGGCGTGTAAAAACTG
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TGGCGGGTGATTTGCAATCTGTTTGCACCTTCAGATTTCTGATGATAGGATAAATTAAGT
CTGCAGGGAATGGAATCAAACATGCCCTGTGTCATTTCTTCTTGTTCTCAATCTGGAGAG
TTTTAATTTTTCCAAATACTTCCAAACAATAGTAGTTACTTCAATTTCAGCATCATCTGC
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TTGGCATAGAAGGCCCCATCTATCTTACGGCGAAGGGAGACAAAGGGGCTGACTGGGTAG
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AGAGTGTTATGATCCATATGGAAGTGGTCGAGCCTCAGCCTCACCGCCCAAAGCTACAGC
TCACCCTCATATGAACAACAAATGTACAAATGAATTGTAACATTAGTGCATTCACCCTTT
TTCCGCTACGGCATTGTACCAGGGTCCATTCTTCAATTCAACAAATTTTGGTGATTTTAT
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ATGCTAAAAATCTATCATGCTCTGCTGCTTTGTGTTCACCAGTCGCTCATCTCTGGGCAC
TCTTATAATGTGCTTGAAACACACTGTAAAAATGTGATGATGCAAAGTTTTCTTGCTGAA
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CAACCAGGTGCGTCCAGAGGAAGATGATGGAGCACTCCTCCTCCCCAACATCAAACAGCT
GGGCTATCGTCCCTGCAACATAGGAGAGGAGGAACCAACGCCTCAGAGCATAGCACCCCT
ATGTCCGAATAAGCTGTGGTGGTAAGCCGACAATACCGACGCTCATGGCAGGGGGAACCG
TGGATTGCAGCAGGAGAACGTAGCGGTACAGGGGCGATCTTGGCAGGAACCCGAGCTTGC
TGGCGGCCTTCACCACCCCGATTCCGCAGGCGGGGAGGATGACGAAGCGTATCGCGATGA
TCGACACGACCACCAGTGGCTTCAGCGTGGTCCTGCCTCTGCCTGGCCGTGCAATTTTTT
GCAGACATGAGCATGGAGTGCTTCAACGGAGAACGCTGTGAGGAGGTCTGACATAGAATG
AACTTCACCTTTTGTAAGGTTTCCGCCAAGTATGAGGACGGTGCATGGTATCGCGGCGTC
TCTGCCCCCAAGTTAGTTTGGGTGTTATCATCCAACAGAAGGTCAGCAGCAGATGGATAT
AAAAGATGCAAGATCCAACACAAGTGCTGCAATATATA