Map Locations of contig_55462 (10292 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_55462

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_68852 2 1501 bp MLOC_68852.1 Available Available LOC_Os02g08300.2, FRAME:+3, EVALUE:5e-116, 13102.m00956 protein RAD23 DNA repair protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_68852






Contig Sequence (10292 bp)

>contig_55462 10292 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATCATGAACACGGAAATATAATAATAGCCAATTTATTATTGCATCTAGGGCATATTTCCA
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GAAGGGACTCCGATCCCCCGGCCGTGACCACCGCGGCGCCGCCATGAAGCTGACAGTGAA
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ATTACTAAAATAGTATTCTAAATGCTCTTATATTAGTTTACGGAGGGAGTAGATACGAAG
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GCAAAATTTATTGGGAACTATCGGAGGAGTGCTGAAATGTTGTTTCCTTTTGTTGTGTGA
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ACGTGTTTGGTTGTCTGCATTAGGTCTAATCAGGCTCGCGCGAAAATAATCTATTGTGTT
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TGCTTAAATCGGCAGTTTTCAACGATCCAGGCCAAGCTGAGCCACAGCGAGCGCACATCG
GTACGGATCTCTTGCATGAGAGGAGTCTGAAGGGATGCGAACTGTGTACGTGTTTCTTCT
ACTCCCAGTAAGCTCCTCCCTAATCTTCTTTCTTCCTTCCCATCTCTAATCTATAGAACG
GTGCTTTGATTCGAGATAATCTCTACACGAAAAAGATGCACATGTTACGGTTTCAATTTT
GTGATCAATTTGTAGTTCCGTCGACCCTAAATGCTCACTTTTGTGTTTATGTTTGGAGCT
ATTTTGGATGAATTTTGTCAAATTTGTCGCGCACGGTCGACGGTTTGAAATTTCCTTTAC
TAGTAGCCTAATCTTGCAGTTCCACACGATTTTTGTGTTGCAAATTTTCTGTTTCGATCT
ACATCTTGTGATTATACATATGCATATGTGTGGTCTGGTTTAAGACACTGCTTAGCCGTT
CCTTTAGGCGGGCGTGGTTCCTCCCGATTTCCTCTCGCGCACCTTGTTGGAGTGGCGTCA
TCGTTCATCTTGGCCTTCTCTTCTGAATCCTATTGCATTGACGTCGCCATGGCACCCACA
CTGCATGTCTTCTCCCTTGTACTCGGCCTCAGAGACCCCATATTCGTCCCTTTCGACGTT
GGCGACATTCCTCTTGACCTCCTTGCCTGTGTCCTAGTATACTGCAATCATTTCTGACGT
CGGTCATCTCGGCCTCCTCTTTTTCGTCCTATTTCACTGACACTGCCATGGCGCACGCAC
CACACTTCTCCTATGTCCTCTGTCTTCGCACGAACTTTCTCTGCGGTGGCGATGCTAGCA
ACTATACTAGTAGGAAAAACCTTATAGGTAGGACCCTATTAGTAGCGCTGGAATATAGAG
CAGTAGCGTTGGACTGCTAAACAAGGCCCAACGAGCCCACCGATGATAGCAGTACTAGCA
GCGCGCTCTTGTAAAAAGCGCTACTACTAAGTAGAATAGCAGTAGCGCTCTTGAGGAATC
AGCGCTACTGCTATTGGGCCTCACTTAGCAGTAGCGCTGCTCTAGAAAAGCGCTACTACT
AAGTAGAATAGCAGTAGCGCCTTTTCGAAAGCAGCGCTACTACTACGCGTGGTTGGTGGC
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