morexGenes - Barley RNA-seq Database

Contig contig_55219
Source Contig contig_55219
Contig Data
|Contig Location|
|Microarray Probes|
|Predicted Genes|
|CDS Structure|
|DNA Sequence|
morexGenes
Links
Map Locations of contig_55219 (7327 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013	Oregon Wolfe POPSEQ 2013	Morex Genome Release 2012
No map location
Predicted Genes from contig_55219

Gene ID	# CDS Predicted	Max CDS Length	Probes in Cluster	FPKM by Treatment	FPKM by Replicate	Top Rice Hit
MLOC_68706	1	627 bp	None	Available	Available	None
MLOC_68705	4	2082 bp	MLOC_68705.4	Available	Available	LOC_Os02g58100.1, FRAME:+3, EVALUE:6e-97, 13102.m06726 protein expressed protein
CDS Structure of MLOC_68706

CDS Structure of MLOC_68705

Contig Sequence (7327 bp)

>contig_55219 7327 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCACTCCCCTGGCGGTAGTACCGCTCTCAGGTTACCAATGGCGCACCTCCCCAGGAATGT
ACCAATGGTAACGAGGGTTACTAATGGCGCACCTGGGTGTGGTGCGCCATCACTAGTTTT
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GTTGGCCGGTCGGTGATTCTGACTCTTGATCAATGCTGAGCAGGTGGAGGAGCTGGCCCG
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ATCGATCGGATTAGGTGTCAGATTGCATGCTCTGTTTTTCGTTCATCGACGGGCATGATG
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ACCATTCCATCTCATCGCTTTTCCAAGGTATTATAGATTTGTCATTTAACCGTCACACAC
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CAATCTTTGATGATGCTAACAAGCACTGTGGTTCTTCTTCGTGAAATGGAAACCTCTCTC
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ATTGGTGGCCTGTGCAGGTCTCGCTATGTGATTGACTCGGAGCAATGAAAACATCGCCCT
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ACGAGGAAAAAGCTTCACGTCACCTTCCCTGTGTTCTAAAGAGCAAAGAAGATGAACCAC
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AGTCCGGTCCCGGTCCGAGCCGTCGTTTGGACCAGCCGCCGACGGTCTGGACTGGACCGG
ACCGGACAGGACCGAGGAACATGACGGTCCTGATTAGGGACCGGACCGGCGACGACGAAG
CCCGGGCTGAACCGAACGGACCAGCCAACGACCACCGGCGGCGACTTGCACGGGTGCAAC
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TTGAGGTGCGCGATGGACGTGCCGTGGGAAGTGCGTGGGAGCCCCGGCTCTTTGCCATGA
ACGTGCACATGTTTGTTCATTAGCAGTTTTTCTGTTGCATGCAAGTAATCTATCGTGTGC
ATGAGGCCGCGATTTTTCGTGTGCGGGCATTGCGTGATTGGTGGATCAAATCAGACGCAC
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TCCACCGGCCGATCCGTCCAATCCATCCGTCGCCCTGCTCGTTCGTTAAATCTCGAAACT
GGATCGGTGTTTCAGAAACTGGGCAGGTGTTTCACAAAGCTGCCTGGTACGTGCCTTCGC
CTCCGCC