Map Locations of contig_54737 (7996 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_54737

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_68405 3 2154 bp MLOC_68405.1 Available Available LOC_Os01g68810.1, FRAME:-2, EVALUE:0.0, 13101.m07501 protein expressed protein





CDS Structure of MLOC_68405






Contig Sequence (7996 bp)

>contig_54737 7996 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATAATCTGGCCTCCAAACATGCCCACCTGGATTATTTTTATAAACCAGATTATATAATCT
ATATTCATAATCCAGATTATCATAATCTATTATGATTCCAAACAGGGCCTAATTCGTAGG
TTTAACATTAATGAGAATATGAGATTAGTATTCCGTCCAACACTAATCATTTTCAATTTG
ACTATCCCCCCCCCCTTATGTACAGTAACCACAACTGGGTCCTTATAGGAATGACACAGA
GGAACAGAGTAACAGCAGACCAGCATTCGAGGGCCCGCTGCAAGCTTATAGTCGATAAGG
ATACCATGTGTGCCACCCATTGGCAGATCTAGTGCACAGAGAGCTGATGTAACCAGGGTT
AAAACTCAAACAGCATGCACTCGATGAGCTCAGCATCTAGGCTAAAAACATATAACGGAT
TTGGACACAGCCAGGTTGGTGTGGAGAAATTCCAGCGAAGATAAAAGAGCCAAATACAGT
CCAAATGGAGCTGTCAGTAGATTTAGCAATGGTTGGCCATCTTTAACATCAGAGAATTAA
GACAGAATAAGGGGTAAGTAATTCATAAAAAGCTAAAAGTACCAGTCGCTAGTCCAAATG
GAAGTAGGCATATCACATGTTTCAGATATGACTGCAGTATCTATTATTGCTTTGAAATGT
ATGTGCATTGTTGGTTCAAATACCTGTTGGACAATTGTCCGAAGTACAGTCATTGGATTT
GCATGAGCAAGTTTAGCCACCATGCGGCCAAGCTGCTTCAGATTTTCCTTGGCCAGACGT
TTTAAGAGCCGTCTCGTGTCCAGCTAATTGAGAAAATAAGGATGCTGGTGAATTTAAAAC
TCAAGATAAAATGGTAAGCGAGAAAAAGAAAACCCAGGCATGGAATAAGCAGGCAACCTT
TGCTGTTTGCCTTGCAGCAAGGACAATTGGGTTTTGTTCAGTGTCCTTCTCCCACTCACC
ATACAAACGATAGCGCACCTGAACGTGAACAGTGCCTGATTGATTAAAAAGGTAGTGCAG
TACAACAAGTAATAACCATGAAGCATTACAGACCTCGTAAGGAAGAAGGGAAAGAACTCC
CCATATCTCCATATCAACGGCAGGATTGGCAGGTATAAGCTGCAATGAAGGAAGCAAGCA
TGACCCAAGTGCTTCTTCGACCCGAGATTCTGGAGACATAATGCCCGCTGTACGGGCTGA
TTCTTTTGACGAGGCAAGGTACACCCTTAACACTCTGCAAACCTGAAAATGAACACATCG
AACGTGCCATTAAATAACAATATCCAACATTTTTGCCACTGGATGCTCCAGGAGGAAGTG
CATAATTGCAAGTATAAAGGTGTTCATAGTCATAGGACCTTTCCTAGTCTGAGGATGGGA
TTGAGGGTTTTTTTTTTATGACTGTATGCTAGTCAGTGATAATTGGTGCTAATCGCTTTA
TGTGCTAATCCGTGTTAATTTGGTGGTTGGTGCTGATTGTTTCTTATCAGGTCTTGTGCA
ACTTGAAATTACCAACTATTTGGTTGATTGGCATTTTGGGTGTGGGTCAGTACCGTTAGC
ATGCTGGATTCAGGGAATTGATGGTTATTGTGCACTTAATTGTGTTATAAAAATATTGTT
AGTTAGAAGGTACTGACAAAATCTAGGGAGTGTAATGTGGATAGTCTGTTGTTGTGGGAG
GACATAAAACATAAGGAGGGCACCTTTTGGAGGAGGCCCCATATGGAGATCTAGGGAGTG
AGATAAGGGGAGCTGCTGGAAATGCTCTTAGAGCACTTGAATACGACAGCTGACCCATAC
CCATATCGCTACGCCTGCTGGATGCAGCAGATAGATGGTGGGTGTGAGCACCAGCTCAAA
AAATCTGATCTGCATCAGGGCAGCCCGGTGCACGTAGCTCCCGCTTGCACAGGGTCCAGG
GAAGGGTCCGACCACTATAGGTTTTTTGTACGCAAGTCTTTCCCTGCATTTCAGCAAGAG
GCTGTTTCCAGGACTCAAACCCGTGACCTCGTTGTCACAAGGCAACAGCTTTACCACTGT
GCCAAGGCTCCCCAGGGATGGGCGTTTTTTACTTTTTAATTCTTACAGCAATGCAAGTGA
GGAAGTAAAATCCAGGCCATAACAACCACTGATGAAATGAACTCATGATATGGACATATG
GCATTCTTGTAGTTTGTACAAAACGTATATAACGAGGCATTCTTGTAGTTTGTACAAAAC
GTATATAACGAACTAATCATCTATGACATAAATGCAATGAAGAAAATCTCAAGTCATATC
CAATAAGGCAGCACGATATTGAGCAGGTACTAATACGAGAAGAATGCAACAAAACAATAT
TTAAGGGTACCTTCTGGAATAATTGTGTGTCACGATGAAGGTATGGTCCACAAGCAGCAA
GCATTTGGAAAAACTCTTTCGGCAGATCAACCAAATGTGAAGAGACAGATGATGCATCTA
TCATTTTAGTGTCAATGTTGCGGGTGATTTTATGATGTGTTTCACAATATGTACTGTACG
CTGACGAAATAGTCTTCTCAATAATTCTGCACAAATGGAAGTAGAATTGAACAAGATAAA
TTGGGGTGCTCAACCATTCCATTAGGATAAACATACTCGGGCATGCCATAATAAGCCATA
TTTTACGAAGTACTGACAATAGTATACAACTGCGGAGGCTGCTAGCAGAATATGCAGAGG
AAGTTGACAAACCTAAATAAAGCATCACAAATTTCAACGTGCTCGACAGGATTTAGCTGC
ACAAGACGTTGNAATAGTAGCTGCGCATGGTCCCTGGCAATTAACAGCAGAAGTCAGTCA
GTGACATTTAATAACATATCAAAAAGACAGATGTGTTTTACTGCAGATTCGAAATANNNN
NAGCATAACAATAAAATGTTATTGGCAAAAACTTTGCAATATTATAATACATCTTAAATC
AATGGCACTCGAGATAATACCAATCATGGACTGAGAGGAAACCAAGAAGAAGTCCAAGCT
TCTGGTTCTTTTCTATCTCAGGGGCTCGCTCATCAATTATATCATTTTCCATCTCCAATG
CTGTGTATAAATCGATCGTTATTTCTTGCTTCTCGTCGTCCATAAGGTCCTTTCCAGTAG
CAGCAAGATTTATTTTGCCTATTTTAGTAGCCTGGCATCAAGAAAGAGATGAGCAAACTC
CATAAGTTGAATCTCTAATGTGTCCATAATAATTATTCAAGTGTATTGAAGACCAATGCA
GGCATTTCATAAAGTAAGACCAAATCTGCATGCACAGCTTGAAATATGTCCAGTAATTGA
AAACATGGTTACTGCAACCAGTGGAAGAGCTCAATCAGTGTATCTCTACTGGTGATAGAG
ATATTCTTATACATAGAGGTACTGGAAATACGACATCCCTTCAAGGCCTACAACTACAAG
ATGACAATCAAAAGTACAACTCTTATATGTTTGCCAGTCGAGTTCCAGTTTCGATGTGGC
AACTTGTTATTAGTCCTCTTTTCATGTAGTGGTTCCAACAAGAACTATCACGGTATTTGC
ATAAACCACTTTACACGATACTGTTTTCAAACTATCATGGTATTTGCATAAAGAGACTTT
ACACGGCACTGTTTTCCTTTTTCAAATGGAAGTCGTTTGCTAAACCTAAAAGTTGGAAAC
ATAAAGATCATCTGGAATGCATTGCAATGACANNCATATAGTTCTCATTTATAACCCTGT
AAAACACAGCAGATCCTTCTTAGAACAGAATGAATTCAACAAGAAAAAATATCCTAACCT
CATCAATTTTCCTTGAAACAAAGGAGCCAAAATGCTCAAACGCCTCATCGTCATTTGGAA
GTAAATGAGCGTAGCTGAAACAGAAGCAATAAACGTGTCATGATGTATGAAGTATCTGAG
GTGCAATTGAAAAGGATATAGCAACACAAATAGATCCGGCAGCAACGCTAACTCATATTG
ATACAGCATAAATGACTACAAAAATAAAAGATAACAAGAACTTGAGACTACGGTTATGGT
CAGTCGGTTACTAAAATAACTAATGCTATTGATCCTACATATGATTTATTTATTTTCTGG
GCATTGCAGTACTAACTATCTGAGGAAAATTGCCCTAAAAGAAGTCCAGTACTGCTCATA
CAAGTTATCATACAGTTATAAGAAACGGCCATCAAAATAAGAGCAGAAGTTGAAGATGGA
ACCACCAAAGGAATGTAATGTCAAAAAATATCAAATATACATGTATATATAAACCTTACA
AAAATATGATATTTTCTTACTGCAGATATTTTGTAACAAAATATTATTACAAAAAAATAT
AAGGAGGAACACAATAACAACTAGAGAACTTACAGATTATCAAGGTCAATAAGACCAGAT
TTGACCAACAGGGCTGCTATTCGGAAAAGACCAGATGGAACAGGGCTGTTTACATCCAAT
TGTTGATAATATTGAAATTTAAACCCCAAAATTTGAGCAGCATGGGACTGTAACAATGAG
TAGTCGTAAGATGGGCTAAAAATACTGCATGAAGTATTGTAACAATCTTTACAAGCTGAA
ACAAAATACCTTTGGAAAAAGAGGTATAAGCTGATAAAAGATACTGTTGTCTGGATAGAG
TTCAAAACATTCCAACACCTAGCAGGCATATAAGGAAGAACATAATCAGATCGTAGCAGT
GACATACTTTTACAATATGAGAGAGTAATACCGGGATAAAAAAAGAGAGAACTCACAATG
TCAAATACACGATTCGGGTCCAGGTCAAAATGTCCAATTAATGACTGTGACGACAACATT
ATGTTATTATTGTTTACATGGTAATATCATAACATATGATGAAGAAAGAAGATTCAAAGT
AACAAACGCCGAACCTTTACAATGCTGATAGTTGCTGAAGAAGCATTTTGACAAGCCAAA
TCTGAACCTACTTGACAAAGTAGGGTTACCTGTATTCCAGACAAACGAAGGCAGGTTGGT
TAAAAAATAAACTAAGCTCCAGTAAACCTTTTACAGGCATCATTTAGAAACTAAGCAATA
AATGGAACTAGCAGTAAACCCCACATAGTTGCGATTTAGTCACAAATAATTTCAAAATAG
AAGTATAATAACTAATAAGTTGGAACACATGTGTGGAATTGTGGATTCAGTCTCAAATAA
TTTCAAATTGGAAGTATAAGAAGTTAGAACACATGTGTGGAATTGTGGATATTTACATTT
CTAATCAGTGTAATCACAATTACATTCGTTTATAGAAGTATCTAGATTATAGAGTTTACC
CTCTAGATTTGGTAGAACGTGTGTCAGAAAACAAAGGAAAAATTGATGCAGGAAACTGCA
CTTGTTTAACATTACCAATTCTGTCACAGCCCAGACACAGACGCGTCACAAAGTGTGTGA
ATTTGCTAGTAGATACCAAAGTGTCTAATAGCAAACAAGCATGGTTATGCTAGTGCTTTT
AGGCAATAAAAAGGGCCCAGCAAATGACTACAACTTCATAATGTGGTTGGGCAATAACAT
CATTTTGTGGTGTCTGGGGTGGTGTCTGGACATATGCTAATCAAGTGCAGTGTTCTATAG
CAATTTTTCCAATAAATACTTTCAGAAATACAGGCTTTAGGCTTTCAAGCCTTCCCCTAT
TTTGCAGTCCAGGTGTCCTACTCTGTAATTTAGGATCAAAATAATAAATCAAAGTCTGGA
ATTAATTGATTGTTTTACACTCCCCTTGAACTGCAAATGCGTCCAGTCGGTAACTCAGAT
CAAATATTCTTCGGTTCTTTAGGGCAGTATATCACTCACCATAGCATCAGTGAAGAAACT
AGAGCACACTAAGAATAATTTCTATGGTATGTATATGTTACTCATTTCATATAGCACGAA
GAAATAACAATGGTTACTGAAGTTCCAGAAAAAAATGAAGGAACCAATGTACACCATTAC
AAGAACAAGAGGTAGAAGTTCCACACGTAGGTATACATACCAACTTGGCGTAGCCCTCAC
TTTCCTCTCTTAGAAGGTTGAATTTCGTTTGCTGATACAGAAGTCGTGTGTTGACTCTGA
CCTGTTGCCAATTATTTCAAGCAACCATTAAAAAATGATGCAGTAAACAGGTAAAAAATG
AAACTGTGCAAAATAAGGAGAAGAATGGTGCCCAGGAACCATGTATAATAGATATGGGCA
ATAACGTGACATGGTATACTGTAATTCGTGTGAGCACACAAAAAATATCAGGAATCAATG
ATCACATGTGATAGCAATATGCATGGTATTAGCATGTGACACATACCTCCTTGGCTTTCA
AATCCTGGCCCTTTGACTTACTCTGTTCAACCTCCCATAGGAACTCTTCCTTCAAATGTG
CACATACAGGAAACAGAGACAGCATGTGTCAACTGCCTTGAATCATTAAAAGGTGGTTTG
GACAAAGATATGGCGCCCTAGTATGAGGGACAACAAATACTCACTTCACATCGTTCTTGA
AGAAGCCTAGGCGCAATCAACGAAGACTCCACGAATGACTTAGTCTGCATCCAAAAGTAT
TTATTTGTAAGGAAAATAGTGAGCACTAAATCTAGTGCACCAAGAAGATATGAATAGGTG
TAGAAGTATTAAAAAAATGTTACCATTTTGACAAGACGGCTGCGATATTCACCAGAAATG
GTAATCTGCACAATAATACAGGTCAGATCATCAACTAATAATGTAGCACTCGATAATTAC
AAGGAAATAGCAACATGAGCAGCTGATATGGTAAATCCAAATTACATGATTCTGAAATAA
ATGCATCTTGGATTTAGGCTAGATTCGTTCACTAAACCACAAATCTCTGAGTGACGCTCC
CCGTCGCCTGCCTCCAGCCGATCAGGTACCAGTCAACTATTGGGTGGATCCTAGATGACA
ATGATCGTGGCAACTGTTTTCTGGTATAGATCCAGAACTCCTAGATGGAAAGCTTAACGT
TCCCACCCTATAATTCAAATAATAATTAATAAGTTTGCGCTCTCAACCGTTATAAGATTT
GCTAGTGGTATTCCAAGAGCTGGTAGTTTCATGTTCATCAGAAAGGGCATAATTTAACCT
TTTTTCCTGCTACAACTTCAGCAGGATAATTATTTCAAACATAGCCTTCAGAACTTGTTC
AGAACTACCACATGCTACCACTACCAGTGAGACATCTATGCATCATGGAAACATCATACA
ATTCAACCAGGTTGTCACTCCAGCTGGCACAACAAGTAACACAGACGACAAACCGGCCAA
TTTCAGCTAATTATTGCATACAGTGCTACACTCAATGGCAAATTGACTGATACAGGCATG
CTTCATTGAGCCACTCGTAGCTAACTAAGCACCACATAGCAGCAATAAAAGGACTCGGAT
ACTCACATCCTGCCCTAGGTGAGCGACGATGTCGGCGAGCACGGAGCCGGACTCTTCCTG
CCTCACCTCCTCCACGAACACCACCGAATCCAGCGCCGCCCGGCACTTTTGCGGCGGCAG
GTCCCCCCGCACCTGCACAACCCAACCAGCGCAATCAGCCCAAAATCAAAATCCAACCAG
CTCAGCTGGCCGAGCAAAACCTAATTCACGGCAGCAGCGCAGGGAGCTCACCATCGCCCA
GCAGAGCTCGTAGAGGAAGCGGGCCATGGGGACCGGATCGGGGAGGCGGAAGGCGGCGGC
GGACTGGCCCTTCCATTCGCGGAGGCACTCCTCGGTGACGTACCTGTAGTCCGGCGCCTG
GAGCGGGGGCGGCGACATGGCGAGCGTGCGCGGGTGTCGGGGGCAGGGTTTTGGAGGGGA
ACTGGCTAGGGTTTCATGGGAGGTGGTGAAGGTCAGAGGAGGAGGATGGGGCGAGCGGGC
GAGGCGACTTGGAAGCGGAGAGACGACCTATGGGGGCGGGCGGGGGCGGAACGGCGTGGG
GACCCGCCGCGGCCTCGCGCCGACGAGGGTGGGTGGCGGCGGCGGCGGCGGGGTGGTGGG
GCGCGCCGGAAAGCGG