Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_54599 (4714 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_54599

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_68328 3 805 bp MLOC_68328.3 Available Available LOC_Os02g29510.4, FRAME:+3, EVALUE:1e-48, 13102.m03214 protein DUF803 domain containing, putative, expressed
MLOC_68330 1 805 bp None Available Available None
MLOC_68329 1 611 bp MLOC_68329.1 Available Available None
MLOC_68331 1 602 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_68328






CDS Structure of MLOC_68330






CDS Structure of MLOC_68329






CDS Structure of MLOC_68331






Contig Sequence (4714 bp)

>contig_54599 4714 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATGAGAAATAAAAAGGAATATCGAGAATTCGCGTGGCTGAAGCTGAAGCAGCTACTTTCG
AAGTAACAGAAAGAAAAGCAACGACTGGAGTGGGGGAGTCAGAGTCGAAAAGAGGATTCC
TCGCTTCTTTCTCTCATGCAAAACCGATCATTTACTCGATTATTTCAGTTATAAGTTTCC
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AAAGAACTTGAGCTTCATAAACTTTTCTTAAGTGGAAAGATATACTTATACTATTTTCTT
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TTTTTGAGAAATTGGTTATGGTACTTCAATTTCAATCAAATGGCACAATCTTGGACTTTT
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AATGAGCTCTGTCAAGTTAGCTATAGGTTTTGCCGTATCAACGATTTAGCCGTGTATCTT
TTGTATTTTCCCCGTTTTATAAAGGGTTTCCTGCCTATGGTACCACACATGTACGTGTAT
ATATGCTGGCCTGTGGCCACCTGGAAATACAAGTTGCGTATTTCCTAACATGGTACTCCC
TCCGTCCCAAAATAAGTGTCTTAATTTTAATACAACTTTGTACTAAAGTTAGTATAAAGT
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CTCCTATGTCCGACTGTGCTGTTCTTCTGCCCTCTGTTGGCGCTGCTTTCCTGTCTCCCA
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TCCCGTCCGCCTCCACCATGACCGTCAACGCCACCACCTCTCCCGACGGCCGTCGCCCTG
CCTAATTAACACCTCTCGCCGTCCTGTCTGGTTCCCGTTCCGATCCATGCCGCTGCTCTT
CTTGTTCGGCCGCTGGTCGTTCCTTACGAGATGTGCCACCACGGGTTGGGCCTGGTGTGT
TGCTGCTCCTCCAGGCAGCCAAGATCAGTAGACGGACCACTTCAACTCTGCAGCTGTGCG
TTGCCACTGCTGCTGCTGTGTTGCAGCCGCTGCCACCTCCCTGTGTGCGCTAGCAACCCT
ACCAGGAGTTTTTTCGGGCCTTCGCTGTTGGGCTGAGCATTTTTGGGCCATGCTGGGCTT
CATTCGCAGGAGGATAAGTGTGTAGCCCCCGTTGCTTTCCTGGAAGGCAGCACACTGCTG
CTATTGATGCATGTTGCTGCTAGCGCTCTGCTGATGCACGCGTGCTGCTCTGCTGACTGC
TGCTTGCTTTGCTGGGTGTTCCTTCCTGCTCCACAAGCAGAAACGGCAGCCTGGCAACTC
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AACAGAGACTTTAGTCCCAAACAAGTTAGGGTAGGCTAGAGGTGAAACTCATAAGATCTC
GCGATCAGTTCATGGTTCTGGCACATGGATAGCAAGCTTCCATGCACCTCTGTCCATGGC
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CTTCCTTATGTGGCCACACATCCATCTCAACACGCACATCTCCGCCACACCTAAGTGTTG
TACATGTCGCCTTTTGGTCGGCCAACACTCAACGTCATACAACATTGCGGGTTGAATCAC
CGTCCTATAGAACTTGCCTTTTAGTTTTTGTGGCACTCTCTTGTCACTGAGAATGCGAGA
AGCTTGGCACCACTTCGGCTTTTATTAGATGGTTCACATCTTCATCGATATCGCCATCCT
TCTGCAGTATTACCCCAAATATCGAAAGGTGTCCTTTCGAGGCTCCACCTGCCCATTAAG
GCTAACCTCCTCCTCATACCTAGTAGTACCGAAACCGCACCTCATGTACTCGTTTTTAGT
TCTACCAAGTCTAAAACCTTTCGCTTTCAATGTTTGTTCCATAGCTCTAACTTCCTATTG
ACCCGTCTGACTATCACACGTGAGAGGGGGTGTTGAAATGTATATTTGGATTGCCTAGCC
TTTTTCAACGTTTCAGACTTTTGGTTGCGTTGAATAGTGCATGAATCTTAACAGTAGGTA
TACCAAGGGATGATGATATGGTGCCCTAATGGCTTGCCCGACCTCTTTCTCTCAAGCGGG
TGGGCTATCGCCGTCACTGGTGAGAGAAAGAGGGTGGCGTTGCGCGTGCAGATTTCTCGA
TTTTAAGTGGATTTGACGGTCCTGGGAGCTCCACATACCGTTTGGGGTGAAAAATGTAAA
GTGGGCCATGGGCTGAACAGAACGAGGGAGACGGGAAGCTGCTTAACTCATGCGGCGGAA
CATAGCCTTGGGCTCGCACAGTGCAGCTTGAGTAGGCTAAGGTTTGTTTGGTTTTATTCC
TATTTATTAAATACATGAAATAAATGTGGCTAAATAAAATGCTAGTTTACTTACTAAAAA
TACCAGACAAATCACAAATATACCACTACTAGTAGGGGTACATGTGTTTATATAGGAGGA
CAACCTCCACTAAATCCTAGATAACTTGGACTCTAATATAACTTGGACTCTAAGATAGCT
AAGATAACTTGGGCTAAGCCCGTAATTAACCCTG