Map Locations of contig_54539 (8408 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_54539

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_68295 1 1117 bp MLOC_68295.1 Available Available LOC_Os01g49710.1, FRAME:-2, EVALUE:8e-123, 13101.m05171 protein glutathione S-transferase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_68295






Contig Sequence (8408 bp)

>contig_54539 8408 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTCATGAATGTCGATATACCCCACTAAAAAACTTGATTCATTATACTTGTGTTGGTTCAT
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TCACGGTTAACTGAGGTATCCACTTTCAAATTTTGAATGAGATTTTAACTAGGTCAATAG
CTTGATGGGTACATTTGATCGACGAATGGGATAGAGTGTAAATCTTTATAGATACTACAA
CTCCCCACGTCAATTGTTGACTATCATTTCATTTCTTACTCTTACTATGCTTGGTTGTTT
GTGTCGTCTTCTTTTCATGTTCGTGGCTCTATGGTGATCAATGAATTGTGAACTACCGGT
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GGAGCGCTGTCGTGTGCTCAGGAAAGGAAGAAGGTGGCAGGTGGTGAGGTCACGTGGTGC
TCTATTTTATTTTATTTTCAAAATCCTTTCATTCATTAAGGATATACTTGGTACATATAG
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AAGACGGATCAATCTGAGTAGAGTCTACTCCCTCCGTTCCTAAATATAAGTCTTTTAACA
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TCATGCATGCAGGTTGCGTGCATCGTGAAGACTCTTCTACATGGTGTTTGGTTACATACA
TGCATCGTAATTATGAATTAATAACTATATTTAATAGACAGGTTAAATTAAAACGTTCAC
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CTCTTCTTCGTCCTCATGCTGCTCAGTTTGACCATCAAGTTGCGTTTCACGACCAACTAT
GCCATGGACAACTGTGCTTCGCCCTACCTTCGACGACGCCGTTGCTAGCGCCTTTCGGGA
TACCCTCCTGCCGCTCATGTCTGCGCTGTCCGGAGTCTCTGCCTAGGCGACCCCGCGCCT
GGCGTACCTCGCCAGGGCCGCCAAGAAGCTCATCGGTTGTGGCGCGGGCAGGCACGCCGA
CGTCTAGGGGAGCGAGGGCCGCTTACTGGCCTACGTCGACGGCAACACCTCCTATGCAGA
CGAGGATTCCTTTCGCATCATCGTCTCCTTCGACCAGGAGTTCTACCTCATCTTCGTCGA
CGACGGCACACCACCCTGAAAGAATCTTCAAGCGGTCAACCGTGTCTCACCAATTTGTCA
AAATTCGTCCAAAAATATGAACACGAAATTCAACATGAGAGTGAACAAAATTACTGTCCG
GTCGCCTCAATGGAATGAGAACACCGAGGTGCATATTTTTTATGTACACCTTATCACGAA
TTGAAGTATGGTTGTATAGAATGGATAAAGGAGATTAAAAAAGTGTTTAGAAGAAAATAT
GTGCTAACAAGGTACATGCGTGGCTCGCACCGAGCAGGCCTCGCTCACTCAAAATGGTCG
ATTTAAAAGTTTTCAGCTATGCAGGCAAAAGCTGATTCAAGAAGCGTGAGCCCCAACAAT
GGTTGAATATAATCAAACAGACAAACACGAAAAAAAGTTGCATCCAATAGGCTTGGTTGG
GTTGTATACAGGATACCAAACGCCTTCTAAGCCCCTTAGGATTGAAAGCCCTCACGGTTA
ATTGAGGTATCTAATTTAAAATTTTGAATGAGATTTTGACTAGATCAATAGCTTGATGGG
TACATTTGATCGACGAATGGGATAGAGTGTAAATCTTTATAGATACAAAAACTCCCCGCG
TCTATTGTTGACTATCATTTCACTTCTTACTCTTACTATGCTTGGTTGTTTGTGTCGTCT
TCTTCTCATGTTCGTGGCTCGATGGTGACCAATGAATTATGAACTACTGGTTGCACGTGG
AACAAGAAAGTTTGTCCCCACTATGTGATAACCAAATAATTTCATAATTAACTATTTCTA
CATCCATAGCCGTAGGAGAAGAAAATGGCACAACAAAGCGCGCATAACATATCTGGTATG
AACTAATC