Map Locations of contig_54168 (9336 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_54168

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_68085 7 2008 bp MLOC_68085.2 Available Available LOC_Os06g14040.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13106.m01550 protein ThiF family domain containing protein, putative, expressed
MLOC_68086 1 167 bp AK355910 Not available Available None





CDS Structure of MLOC_68085






CDS Structure of MLOC_68086






Contig Sequence (9336 bp)

>contig_54168 9336 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CGCGCCGCGGGCAAGCAGGGGAACGCCATTCGATCAGTCTCGGGCGGCGCTGTGTCGGCG
AATTTTGCTGTGGTGGTAATGAGCCGGTGCTCTGGCGCCGGAGGGGGAGCGCGGGGCCGT
GGCATGCGCCTCGCCACAGCACGGCGTGAGGCCGTGAGGGAGGCAGGCGAGGCGAGCCCA
GGGAAAAAATGTTTTCTTCAAACAAAGCCCATTAACTGAGCAGGCCGGGCCGGGCCGAGC
CTGAAGGAGGTTTGCTCACGAAGCAGATCAGTTAGTAGCGGGCCGCGCCGGCTCGGTCGC
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TGGCGCCGTAGTAGGCGGGCTCTCCGTTGCTTCCGTCTTCAGCTTCCTCTCCAGGTAACG
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GCTTTTCCGGTTGAATAACGTGTAGTAGTAAACTAGTGATTGTAGACTGCTGAGAATCCA
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GCTATTTTTCCTGCTGCCAATATATTCGACCTCGTACCTTTCGATATTCATGTCAGCAGA
GCAGAAAGTGATATGTATTCTCACAGCACAGACATTGTAACTTCCGTTCTTTGTACATTG
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TTCCTGTTTTAGTTTAATGAGGAAATAACTGAGAGTCCTCCATGCAAACACTGCCTTCAG
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GTTACCCTATTCGGTACTTTAAACCAGTTTCTTTAGCGAAATGTTACTTGGCTCAGTCTT
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AGATGTTGATAATATTGATCTTTAGGTGTCTCTCCTTGCGGCTTGCGTACGCAGAGGGGT
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TTAACAGTGCAGATAATACTGACAACATGGCATGCATCTTCATGCAGATTGTGCCAGGAT
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AGTCAAAATCTTATCTCGTGTACTTCCTAACCCTATTGGCTTCACCTCAAATTAGTTTTG
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CGCGTGGCCGGCTCAAGAAATTAACTCTGATACGGTTCTTTGCGCTTCCAAAAAGCTACT
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GGTGTTGATCACACCGAGTGGGAGTACCACGGCACACTGCTATCAATTATCATGACCGAT
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GGAGTTAATTCCTTCAGCCAGCCACGCGACAAAACGAACCGTCCATCGATCCAATTTATA
TACGCTACACAGGGCTCTCCCATTGCATATCCATCTACACGTCGTGCGAACACTGGGACG
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AGACGTATGAAGTCAGATATGTCTGGGCAGTCCGAATCTGGGTCCAGGATGTGGGGGACT
TGGTCTCTAACTTCACTCCGTGAGAGGACTTCTTATCCATCACCATTTCTTGTTTTTTTG
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TGGTACAGTAAAAACATAATTTGGTATGCTGTAACAGGCATATTCCAGTTGCTAATGACT
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GTTTTTTTTTGGCTTTGGTGCTTTATTTTGTTATAGGTGGGACAAAACGAAGCCCGCTGG
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CGGAGTTTGCTTTATGAGCTGGTCACCGATGTTACTGGATTTCTACGATTGCTATACCGT
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TTGTGTGATAGTGACGAGGAGCAAGTAGATGATGCACACTTCCCTGAATTTTTGTTTTGG
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GTCTCCCCGGGATTTTTTATGCGTTTGAGATTGTCTCATGTAAACCAAATCAGAGATTAT
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TGTTTAATGTAGTCAATGTGGTCCTTTTCACTCCCACTTTGAGACATATGGATCCATCGT
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AAGTCGCAATAAATAATTCTGATAGATGTGGAGGTTTTGTCAAGGTCCCTTCTTCATTAA
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GGAAGATTACCCCATAATTAACACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTCCCCCTAATCTATC
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TGAACATATTCCTGGATTGTAGATGTTGGTAGAGACTTCGTGAACAAATCAGTCACATGA
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GGCAACACAAGAAACATTATCGTTGAGACAATGGTTGGTTGTAGCCATGAGGTCTGTTTC
GAAGATTCTTCATGACATGGCTACAACACCTAGTAGGAACACTAAGCTTGTCTATGATCT
GACATAGCGGGGATCTGATCAATGTATCCAATGATATTGGTGTTCAGATTTCTCTGAAAC
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CCAACCAATTGTGTTTGGTGGATCCAATGGCATTATGAAACGCTGAGTCCCAATATCTCA
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AGAGCTATGGATGGATAATATTTGTCCACAATGAATTTCTCCAATATATTTTGGATATAG
ACAACATAATATACCATAATTTATGAGCGAAGGTGCTCAAGTTGTAGTAACGAGCGGTAT
TTTGGTTTACCCAAATCCTTCATTTTAAACTCCGTCATTTAGATGATTACATGTGTCATT
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CTCACTACGTCGGTTGTACCATATGTACCGACAACAATAAGTCGTATGGTGACTTATTGA
TTTTTATACAATATATGTTGCATTTTGCATTTCGATTCAGAAGTGAAATTCCATCGGGAA
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CCTCTGGAGAATAGTTGGGTATTTGCGTGAACCCTTGTGCTACAATATTTGCTCTTTGTT
TCACGAGCTCGTTTTTCTCAATTATGTCTCTAGAAGAAAACTGGTGTAGGTATTGCTTAT
GAATGCCTTCTCATTATTGAGCAAGATCATTTCTACCNNNNNNNNNNCCTTTGCTTGAGT
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