Map Locations of contig_54127 (8252 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_54127

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_68062 3 2759 bp MLOC_68062.1 Available Available LOC_Os08g37800.1, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13108.m03989 protein CAMK_KIN1/SNF1/Nim1_like_AMPKh.4 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed





CDS Structure of MLOC_68062






Contig Sequence (8252 bp)

>contig_54127 8252 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CGAGGGAGGCAGTGAGAATTGGGGCGACGTGGCCGGGACTAGGCCGGGCCTTTAGTCCCG
GCCCAGAGGCAGGTCGGGACTAAATGGTCCCGGCCAAAGGCCCGTTTTCCACTAATGACA
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GGCTTACGGCCATATTACCCTGTACAAAGGAAATGGGCTATTGGGTTGCAGGTCTTGCAC
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GTGCGGTTCATCGCCGCAATAGTGAATAAGTGATGTTGTGTAAATATATAGGCGGCGGCG
TGTTTCATCTTCCTTCTACCCAGTCCCTGACAGCGAACCATGTTGTTTGAGTGACTAGTC
CTGTGTCAAGCACCAAAAGGTTAAGTGGTCGTTAACTTATATGGTAAATATGTTGTGGTA
CGGTGAACCTTTTCTGATTCTGCAGGCTGCACGGCTGCTGGTGGTGATGCTGAAACACAA
GCTTTTGTGATATTATTGCAAGATGTAGCTTCTATTTGCCTTGCTGTTGAACATGGTGAT
GCTGCGTGTATCTGCAATCATCGCAACCGCTAAAGAAACTAGAAAAAGTGCAATACTGTA
GTAGTGGAATATCATTTGCTTTCATTTTTTTTAGAAAAGGAGGCATCGTCCCGGCCTGTG
CATCGAGTGATGCATGCAGCCTCTTAATTGAATAAGGTAAAAATAGTTCGAGCCGAGTAC
AGCAATCTGAGACAAACAAATGAAAGATGCAAAGCGCCATACGCTCCCCAACCGGCTATG
ATAATAGAACTAGATGACTAGCCACCTATCCTATTGTTATATCGCCATCCAAACCGGCTG
AAGATACCCTGAGCTACCATCTTTCAGCGGGCACACCCAGTAACCAAAGGCTCCCTGGCT
TCCGCAGGAGTGAGTAATAACCACGTGCGGATCAAGACAGTAGCCCTGAAGATAACCTGC
AAAAAATTGATAGAGTTGCATCTGTTAAATACTAAATCATTCATGTAGTTCCATATAGCC
CACAGCAATGCACAGGTTCCCACACGAGTAAGCTTTGCCAAAAAAACATCAACTCCCTCT
ACCCACGTCTCAAATAACGTGTTAATACTGTTAGGGGGCTGATATTGAAGGCAATGTGAA
TCGAACGCCATAGAAGTTTAGCCAAAGGGCAAGCGAGAGGTGCTTAATAGTTTCTTTGTT
ATGACAGAAGTTGCATCGTTGGCTGCCTTTCCAATTACGTTTGGGCAAATTGTCCTTCGT
TAGAACAACTCCCTTGTGGACAAACCACATGAAGATCTTTATTCTCAACGGTACTTTGAC
CTTCCATATATGCTTGGATATTTTTGGATCGGCACCGAATCTATGAGATGCAGATACATA
GATTTTACAGTAAAAGCTCCATTCTTAGTCAACTTTCATTGAATAGTATCTGGTGTATCC
GATAGCTTGATAACCATTAACCTTCGGACTAGGTGAAGCCAACTGGCCCTTCTGTCGTCG
ATCAAGGATCTACGAAACTGAATATTTAGAGGCATCTCGCTCAATATTTTCGCAACGGAC
GCTTGTCGATGTTGGACAATATTGTATAACTGCGGATATTGCAGGGCTAAGGGCGCTTCC
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