Map Locations of contig_54124 (6775 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_54124

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_68059 1 1080 bp AK373483 Not available Available None





CDS Structure of MLOC_68059






Contig Sequence (6775 bp)

>contig_54124 6775 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATACACACAACGCATTTCTCCGGTGTTAGCGAGTTGCATGATCTCATGGTCATAGAAACA
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GAGAAGCTGATCATCCGGCCGGAGAAGGTGCGGTTCATCGACATCCTGTCCCTGCTGATC
CTGCGCCGGCCCATCACCAGCTACGCCTTCGTCGACGCCGGCGACCAGACGGCCCGTGAC
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GCTGCTGCCTACTACCCGGCGAAGATAATCGGGGCCATCGTCGAGCTGCTCCTCAACTTC
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TGAGAGCATGCCACAAATTGGGACGAATATATGTACATGTGCACGACGCCAAGCTGATGA
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TGCCTTACTATGTGTCATTATTCTTCATGCAAGTTGTTTCAAATATTTCCTTCACACGTG
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TGTTCATTTAATCAAGCTTAAGTAGATATGTGATAAATCCTTATAACACATATAACACAC
GTATACACACGAAGTAGTTACCTTTTTTATGGGAAGACTTTTAACAGCTGATATATAACA
AATAATGCTATATATGATCAAACTTCCATCTGAAGATTGTGTCCATGTGTAAATATCATG
TATTTGGAACATAGGGGGTTCATAAGCAAAAGCAAGCAAATGACACACCATCAGCTCATA
TTTTAATGGTTCCCAAGTGTCATGTCTGTTTTTCCTTTCTTTCTCATGACCAAGTTACAG
CCCTAATCAACGCATGCCACATACAATATAATGCGAATTAATTGCCATGCATATTCCAAC
CATAGAAATCACTTAGATCAGCACATGTATGGATGAGTATAGTACAGTTTGGTTAATGAA
GCAGCCCGCCAGTACTACAAATTTTGCTAGAATTTAGCAGCTGTACCTGTACCTAACATG
AATTGATAGCTCGTACTAGTCATTAAAACAAAACGAAGCACGCATGCATGATAGCAACAC
TGATCTGAATTGAATGCGCACTCATGCAGTTAAGCTGGTGATCCCTCGCCGGGAGGCGGC
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AGCATCTGTCGGCGACATGCGGCAGCTGCAGGTGCTTGACGTCGTGGTCTCCGGCGAGGT
GGCGGACCTGGAGAGCGGCGGGTACGTGACGGCTGGGACGCCCCTCGTCCTGCGGCAGTA
CCTCATCCTCGAGATCACAGTCATGGCGGCCAAGATCGCCTACGAGAACGGCGCCTTCGT
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TGCGTTTTTCGCAAAAAAGAAAATGATCTAATGCGTACAAGTTGGACTATATGCATGAGA
ACAGGACAGCAGCTAACACTGTTCAACGGTAGCAAGCACATCAATCATATTTTGGGCCAG
ACATATACACATGCAGGGCCTTAATTTTTCTATGCATCTCTGCATATGCATGAGTAGCTC
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TTATGTGCAAAGTTACTCTAGATCTGTTGACTGGTGCACAGCTACGCACCGCCCCCAGCA
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TGTGAGAAATAACCAAGTCACATTCAACTCCTACTACTCCCTCCGTTCCTAAATATAAGA
CATTTTAGAGATTGTACTATAAACTACATACGGATGTACCTAGACATATTTTAGA