| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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Predicted Genes from contig_53872
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_67900 |
7 |
5053 bp |
None |
Available |
Available |
LOC_Os05g28510.4, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13105.m02937 protein importin subunit beta, putative, expressed |
CDS Structure of MLOC_67900
Contig Sequence (12890 bp)
>contig_53872 12890 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTTGTGCGTGGTGGGGGAGGGTGTGGCTGTGGGGTCCCAGGGGGGGGGCGTGCCCGGGCT
CCCCCATATCCACCCCATATTTGGGCTGGAAATGGGGGTGCTGGTCAGCCTGGGCGTTTG
AGGCCGGTTTGGGAGGCCCGTCGGTGTCGCATTTTCATGACCTGCAGTGATCGGGCGGCC
TGAGTGGGCGTTTGAGACGGGTATGAGGAGTCCGACTATAGATGTTCTTACGCCAAAATG
AGTCCTCGACACACTGTCATCGCCACTCCCATATGGAGCTAGTTTGACGTTATCGATTAC
AACCGATAATTCTTCATGCAGGTGTCCCTAAGACAAGCAGCTTGGACCCGCAGTTATCGT
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AACCTTAACCTAATCATCTCCTTCGTCCTTGCGAACAAACTTGAGGAGGATCGGAGCTCA
TAAGTCCAGATTGAGATAAAGTGACGTTATCGGATCGAGTGTTGCTTGCCTGAATTGACC
TATTAGCCAGGTCCATCACACCAGGATTCTTTCCTGACAACACAATTTGCAAACTAATCA
TATGCTTAAGCCATACAGGTATATTAAAAAATAGAACAAGACGATTAGGTTCCCCTTAAA
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ACGAAGTGTCGGTCCACTACTACAGGAGTCCTCCAACCTCCTGGTTTGCCACAGTACTAG
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CTTCTTCACCATTTTGACCTACCTCTCGACTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCCAGTATTAAT
TGGTACCCAAAGCTTGTTTCACCTAGAGATCTCTCCGTAGCTACTCAAGCGTGTTGCTCT
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AAGTATAGGGGATCAATCGTAAAATTTTCTATAAGTAAGAGTATCGAACCCAATGAGGAG
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GGTGTGGCAAGGTGGACCGATACTTTTATTGCAAAGGACAAGCATTTTTATTGCAAAGGA
CAAGCATGAAATAATTCTTATAGTGAATAAATCTTCCTCGATGACACATGGAAATATTAT
CCAGTTACTTTCACCACGATTCATTGTTCGCGTTCATTGCTTTGATAAGTTGTTATGTGG
ATCGGGCAGTGCTAAGGTGTTGTTATTGCTTGAGCAAAAAACTTACTTATGATTACCCCC
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GAATATTCACTTTATTATCCACATGGTAGCCAAGTTCATTGAAATCTGAAAGGAAATTAA
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AGAACATTGACTCGTTGTTCTATAACTTAATCTACAACCTGCAACAACAACGAAAAACAT
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ATAAGAGCTTTAGGCCAAGCATTACCTTCCATTTCATCCCACGACGTCCTTTCACCACAT
GAAAACGTTTAACTATCACTTCATTTAGAATATTGTTCAACAATTCTTTTTGTACAAAGC
AAATGAGGCTATGGTTCATAAAAATCATCACTAATTTTGCTACGGAGAGCATTCTTCACA
ATCTTCATAGGTGAGAAGTACCTCTCTACGGTTTTAGGGGCAACGGGCAAAGTAAGTGTT
AGCTTTATAAGTCGGTGTACTAAAGGACAAGTAAGATGCTTCTTTGTAGTCACAATCACT
TCAGCCATATCACCAATATTATCCAAGCTAGCAAACGTTGTATCATGGGTTACATTGTCC
AAATAAAGATTAAGTTCATGCTCAAGACCCACCAAATCGTTAATGTCATCAGGGTTAAAC
TGATCCAATTTCTTGAATTTCTCAACATTATGGTGATCAAACTGATCACTTGGACTCAAA
GCTGACATTCCTACAAATCAACCGACTCATTTCAATTACGTCGACAATGTTATTTCTTTG
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CGACTCATTTCCAAAAAAATCAGTCGGGTCGGTGGCCATCCGATCGTTGTGGTCTGACGC
AACGTGGCATCTGATTTGGTCAACGCGCAAGCGCAAATATTGCTAGTTTGTTCTCGTATG
TCCTCACACACAATGTGCAAAAGGAAAAACGCACGAGCGCGGTGGTGGTGCTAGCGAGCT
CTCAAAAACCAGGTGGGCGGGTGGATGATGCTAGCTCGCGAGCTCGCTACATCGAAGTCG
GGGCTGACAAGCACTCCATTGCAGTGTAGCCACGGTACCGTCGGCGAGTGCTGCATCGGA
GCTCCGAGAAACCACGACGACCTCCATCGCAACATTGGAGCCTCCGCGCGAGCGCTCCAA
TGCAGCCCCGGAGCTGGCGACGAGTGCTGCATCGGAGCTCTGAGAAACGACGATGACCTG
CATTGGAGCCTCCGCGCGAGCACTCCATTGCAACTCCGAAGCTGCCGACGAGTGCTGTAC
TGGAGCTTCGAGAGCCGACGAGGACCGCTGCATTGCATCATCGGAGCCTCCGGCAAGCGC
TCCATTGCAGCCCCGCATCGCAGCACCAGAGCCGCCGGCGACCGCTGCAATGCAGCACCG
GGAGTCGTCGGCAACAGTGCATCAGCGCGACCCTCACTGCATCATATGATGTGTCGCGGT
GACACCCTCTTGCAGTACCTCCAGATCGGCGTTGCAGCAGAGAAAATCTCATCGTCAATG
GAGCTAGGTGGCTGGGCAATGTAGGCGGCGGGGGAGTTATTGACTTTTCGTGTATATATA
AAGAGAGCGCGCGTCGGAGATATCGGGGATGCGAGGAAGGGGATGAAGATGCGACAGACA
TGACAAGTGGATAAGAAATTTTGCCCAGAGATAAGGCGTTGATGGGACCTTTCCCTTGAC
ACGTGTACGACGAAGGAGGCGACTGACGTCGTCGCTAGATCAGTCGGATGAATTAAACAA
TTTTTCATATAACAAGGATCGAAAAAAGATAAGTCGAATAACTCTTGAGGACACTTATTT
TGAGATGGATAAAGTAGTACTAGTTTTTTTCCAGGAAAAATGATCTGCTGGAAATTGGAG
ATGTTCTGAGATCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCTCTGTCTGGGCCACCTATGCTGC
GCGCCGCCGCGGACCCTCCCCTGGGGTGAGGCCGGAGATTCGCGGGAGAAATTCCACGCC
GCGCCTCCCTCGTCGCCCTGCTCGTCCGCACAAGGCTTTGGTGGGTCTCTGTTCTCAAAC
CCTAGCTGCTGCTAGCGCGAAGGCTGCGGCTTCATACCCTCGTGTTGGAGTTTCGGGTAG
CCACCCGCACGTCGAGCCGTCGCCAACGTTCTCTCTGCTCGGTACATCCCTGCCGCCTTC
TCCATATTTCTCTGTTCCATTGGGCCATGGCCTAGGTTTAGGGCAGGGGGACTCAGATCC
CCTTCTGAAAACGAGGGTTTTTCCGTCTGCATTTGTTTGTGACTGGAAATTGCCCCCCTA
AGAAAAATGTATGATGCCCCGGTTTAATAGATGTTGAAACCAAGCAAAATTCCTGTTTTC
ACTTCACTGGCATCTCGATTTTCCTGTGCGGATACACAATTGCAGTCTCTTACATCGATG
CCTTTTTTGGTCCTCCTTGTTAGTTGCTTCCAGTTGCGATTTCTGTACGGCCTGTAATGG
GTATATCCACTTTCTTTCATGAGATGACTAAGCTGCTTGTCATTTCTCAACCATCTAGCA
TCCAATGCTGACATTTGCTCCGTTACCTCATCCTGTGCTCATCATATAGATATTTGATTT
GATTATTAATATGCTGAATTCGTAAGGAACAATTATTGTGCAATAGCTCCAAAGTTATGC
TACCTAGTGAGTAACTGTCACCTTGTTTTAGACCTCTGAGAAAACTTAATCGGCTGGAAT
TTCAATTTCGTTGTGAGTTAAGCTTATTATATATGTTGGCATTTCTTTCACACTTACAGG
CATAGATGGATAGGGAAAGGAAGGAGCTGAGGAAGAGGAGGACATCGGGCCAATTGAGGT
CTCCTGAACTTAAGAGGCTGAAGCAACGTAACCCTTATGTTGCTGCTAGATCTACCTCTC
CTGACTGCAAATTCTGGGACAACAGACAAAAAGAGCTATATGATCAGATCTGTGGTGAGA
AGAAAGTGTTTAAGCATAGATTTGTGGAGTGGTCAGATATATCTGATGCTGAAGCATGCC
CTTTTGATTTGTCCACCAAGTATGAGGATCTTGGGCTCAAAGGTCTAACTAGTAACAATT
CATCTTGGGTTTGGAACGAAGACGTCGTGAGACAGTTTTATGGCACCCTTTACATTGATC
CTGATCGCAGGGAAATGCATTTCATGATAGGCTCACAGCATTATTTTGCTACCAAGGAAG
ATCTTGAACAGGCCTTGCTAATTGAGCCTAGAGCTGACAGCCTTGTTTTGCATGCACGGG
ATGATCTTGATGTTTATTCTCTCTTTCGAGTACCTAATCCTGACATTGGTCTAGTTAGAG
ATCTTAAAACTGAAGTTGATCTCATCCAAAGGATAAACCGACATACAATTTATCCTAAAT
CAGGAAATCGGGGTGGATGCACCACCATGCTTCTCAGGCTTGCCTATGCCATTTACCACG
GAAAGCAGTTTGACATTGCTCATTTCCTCCTCAGTGAGATGTGTGAGGCCATTGATACTC
TTAATCATGCATTACCATATGCACCTTATATATTTTGCCTTCTCCGCCATCTGAAATGTG
AACCTACAAACATTGACACCAAATGCTGCCTCAAGAAGTACACCCTGTACCTTGCAAGCT
TGAATCGTGAACAACGTGCTGCCTCAGCTGAGCATGAAGTTATAGAGGTGCAACACCAGC
AGCCAATGTCCTATTCTCATCAGCCACCGCAACCAGTTAGTCCTGATTCAACGGTTGCCA
GCAATGCTCAACTTTCAAAACTGATAGAGGGGTTGCATGAGAAAGTTGTTAAAGGATTCG
ATGCAATTGAGAAGAGACTTTACACAATGGAGGTTCTCTTCTCAGTCTTGTCTTCAGAAG
TTAGTGAGATGAAAGCTTGTATGCTTGATCCTTGTCATCCGCTGAACGGCGACAAACAAA
AAAGGGCACAAACTGAAGCTCATCAAGGTGGTGATGGTTCTTCTGCAGCAGCTGATCCAT
AGCTTGCATACCTGTCTTTGCTAGACCTGGCTAACTCTCTTATGTCAGCAGAAGAGTTTA
TGTTGTACCCTGTTTTCGGTAGTGACAGGGAAACTAGTACTTCTGGTGATATATCTTGAG
CTACCCTGTTTTTGGTTTGTTTTTGTGGTTATATTTCTTTGTTATAGTGACAGGGGCACT
ACTTCTTCTGCTGGTAAATTTAATAAACTAGATGATACCCCGTGCGTTGCTGCGGGAATC
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ATATTTATTGAATATAAGTAGAATAATAGAATGAAACAAAATTCCCATGCATTGTAGCAT
GTGGTGGTGGTTTTTTTTTCCCATGCATGGTTGCATGTTGAGGTGGGCATTATTCCATTC
ATAATTGCATGGTGATGTGGCATGCTTGCATGTTGAGATAAATAAGTTAGTGGGGATAAC
TCTCTTAGTCTTGGGTATATAAGATGAGGAGAGTTTGATTGGTAAGAGAACTGGGGAAAG
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TTAATCCAGATGAAGTCACTTACATTTTAAGACTAAGCTAGGTCAAATTAGCCCTTAGGA
GTGTTCATGGATGCCCTTTATTTATTTATTTGTGGGCAATTATTTTTGTTTCTGAACTTT
ACTTGCTAACTCATATTCTGCTCAGTTAATGGATGCCCTTAGGAATGTTGCTTGATGTTT
GATTGCACAGTTACTGCAACTACTGATAGAGCTCAGATTCTGCTAGCTGCCCAATCTGTG
GATGGCAATTTTAGGTCGGTAGCGGAAGACGATCTAAAGCTGTTCCAGGAGCAGAATCTT
CCCAATTTTCTCCTCTCCATATCAGTAGAGATGTCAAGTGATGAAAGGCCGCCGGAGTCT
AGAATGGTTGCTGGTATTATCCTTAAGAATTCGTTCAACACAACGAATTCTGCAAAGAAA
GAGCTGCTATGTCAACAGTGGATCAACCTGGATCCATCTGTCAAAGTCAAAGATTAAGGA
GTCATTGTTGAGAACACTAGGATCTTCAGTGCCTCATGCCAGGCAGGACTCGCCACAAGT
CATTTCAAAGGCTGCATCCATTGAGACCTCATCGCCAAATTAGTGGGCAACATGAGGCAG
CACGGCGCAGTGCAGCAAGGAACACTAGAGGTGCTGGGGTATGTCTGCGAAGGAGATTCC
TCCTGAGCACCTGGAGCAGGATCAGGTGCCTGCTGTCGTTCAGCGAATGTACCAGGCAGA
GCTAAGCATTGAAGTCCGTCTTTGCAGTAGTTAAAGTTCTGTATAGCGTTCTTGATTTTG
CTGAAAGCAACTTTGCAAACGTTATGGAGTGGAGCTATATAGTGAAGGTAATTTGTGATA
CTGTTGTATCTTAAGAAGTGGAGAACAGGCATGCATCTTTTGAACTACAAGCGCTGTCAA
AGGAGATGATGAATTCAGTTGCAGTTCAAGCTATTGAGTTCTGGAGAACTGTTTGTGATT
AAGAGTTTAAGCTCCAAGAAGAGTACGAGGTTTCTGATGATGCAAACTCTAGTGTAATTT
AATGCTTCATTGAAAAGGCCATCCCTTCACTTGTTCCAATGCTGCTTGAAACTCTGTTGA
ATCAAGAGGGTTATCATGAGCACGCTGACAATGTGCGGAACATTTCCATGAGTGGTGCAA
AGTGCCTTGGCCTCATCGTTAGAACTGTTGGTGATGCAATTGTCCCTCTTGCCATGCCAT
TTGTTAAGGTTAACATCACAAACCTATATTGGCATTGTCGTGAGGCAGCTACTTTTGCAT
TTAGCTCTATCCTTGAAGGTCCCTCTGTTGAGAAGCTTAACCCCCTGGTGCAGGCTAGAC
TGGATTTCTCGCTGAACTCAATGAAAGATCCAAACAACCAGGTAAAAGTTGCCACCGCGT
GGACTTTTCGGTGGATGTTTGAGCTTTTGCATTCTCCAGCCAGTGGAACTCCTGTTATAA
AATGCAAACCTCCCTCCTATCCTGACTGTTGCTGGAGAGTAGTAAGATGTTTCAAATATG
GCCAAGAATGTCTGTGGGAGTCATATGTTGTTTTGTCCAAGGTTATGAAGATGCCGAGTC
AAGCTCATCTCTTCTTACACCCTATCTTCCTAATGTCATCGCTGTGCTTCAGATCATGCT
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GTTAGCAACATAGCTGAAACTTTGAGCATTATAGGCCAGCTATGTCAGGGGATCATGAAA
AGACTGAACCTGACATTTTAACTCCAAATACTCTTGCCTGGCGACAGGGAGAAGCAGAGT
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TTTGCTTGCCCCAGTTCTACTATACATGAAAAAGCAATGCGGCGTTCGTGTAGCAGGCTT
GCAGAAGTACGAAGAATACCAAATATGCTCCATTTCTGTATGGGTGATGGGTGATATTTG
CTGTACCGTTGAAGATAAAGTTCAGCCTTTCTGTGATTGCATTATGACTGTTCTTTTCAA
GGATCTTGCAAGTTCAATGCTTCACCGGTCTGTCAGACCTCCAATTTTCTCATGCTTTGG
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AAGGAGCTGCTGAGCTCGTTGTTTTGGATCAAAGCAACGAAGACACGATTGTTCACCATA
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CAAAAGCTCAGGTGATGCTACCTTATGCAAGCCGTCTATTTCAGCTCACTGAAGCTATCT
ACAAAGACCCAAGCAGGTGCACATCGTTTTTGCTGCTTTCCTTTCGTTATACGGGTATTG
TGTTTTCCCCCTTATCATTATATGTATGTGTCAGGGATGAGAGTGTGACAAAGGCTGCGG
TTGCGGCCCTGGGTGATCTCGCAGACATACTTGGTCTGATCTCGAAAGATCTGTTCAAGA
TCCACCCCTTCCATGTTGAGCTCTTGAGCGAGTGCCTTAATTCCGACAGTGAAGTCAGGG
AACGCTTGTCGTCCCAGGGAGTGACAACTGCTAACCGAAGCACGGCTTTCTTAATACGAG
AGATATTTTCCTTTTTCGTCTGTGACGAAGGTTTTTTTGTGTGGATATATATGCCAAGCC
CGTTTGCCACGGATGAATGAAAGGTTAACATATATGTACCAGTGTCAGTGCTAGGATCCT
TGCCGTAGGCTTCTTTTTGCGTTTTGTGTCAGACTGTCGAGTCGTTATGCATCACACTTG
ACAGGGGTGGATGGTGGCAGCTAACCTGATCAACGTTGTTCTCGGACTCGTTGACTCATC
TGTGCTGCTGATGTTACTGCTCCTTTGCACATGTCATGTGGTCGTCCAGTGCAACACTGT
CAAGATGTGTTTTCTTTGTGAGAAATTTTACAGTGCGATGCTCTAACTGAATCCTTGGCG
GTGGTATGATTTCTACACCGTTCAAAATTCTGTTGCGCCGTCAGCATTAGGTAAAGATGG
GGCATAACTAGTGTGAGATCTGGACCAGTGGATGTACTTCATGTGATGTAGATTGGTTGA
GATGGGGTTACAGTCACTTTTTAGGTACATTTGGCTCCTCATCTACGGCGTTCCTCTCGG
CGGTGATATTAGAACATTCTGTTCAATATGTCAAGGGAGACACGGTTGGTAGCAAGTATA
ATTTGTTTCCACAGACAACTTGTATTCCATCTTGTACTGCCGGGGTTTTTGTATTCCATC
TCATTGTGGTGATAAAAATTCTTAATGCAGTCAGTTCATGCATGTTAATATTCGGTCATG
CTTCAATCTCATAAGCACTCGTGTTAGTCTAGTAATTTGCACTGCCTTGATGCTTGATCC
AGTTCGTGATATGTGCCAAAATTTGATATTTTTTTTTCCATAGGAAAGCAGAGAAAGAAG
GCAATTGGATTTTAATCTTTTGTTGGTATGGTAGTGAAACCGACAACAATGTTGTTCTTC
ATCCTCGCCAAACTTGACATGCCCAACCAATGTGCATAGTGATAGTGGACCAATCATCTC
AGGTGAATTGTTGGCATCGACAATGCTAATCTCTCTGGTTCTTCATCGCGATATATACTA
CTTAAAATAAATGACTCAAAAATGACTCAGTTTTATACTAAAGTTAGTATAAAATCAAGT
TATTTTTGAGTCACTTATTTTGGGACGGAGGGAGTATATCACTAAGCTTTCTAGAATTAG
CGGCCTTACATTCAAATGAAGTCATCATTTTAAATTTCGGTTACCGATTCTGATCGGGTC
AACAATCGCTTACGTAATTATTTTAATTAACTATGTTCTTTTATTTCATTGAGAAATTAA
ATATTGAATTTCGTTCATGATTTTGACTGGCTCAACAATTTTCAAATCAATTGGAAGCAA
TTGGCCATTAAAACTTATCAATCCTAGGCATCCTCTGATCACCTAGAAAAAAAAGAACAA
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ATTATATGAATAAAAAGGAGAAAACACTCCATAATCTTTCCAACTAACCAAACCTAATAC
TCGCTCTGTTCTAAAATCTAAGGTGTATTAGTTTATTGAAAAGCTAATTTTTTAAAACTT
TGACCAAGTTCAAACCCAAAAATATCGACATTCACAATATTAAATAATAAAATATGAAAA
CTCATTTCATGATGAATCTAAGAATCCGATTTGATATTATGGATACTGATATACTTCTAC
AAAATTTGGTCAAATTTAAATAGGTTTGACTTTTCCAAAAACTAATACACCTTATATTTT
CGATAATACACATCTGAACCTAGGCTCATCTGCACCTGCGCTAAAGAAACAAATCAAAAC
AAATATTAGAGAAAATAAAAAATCAATTTTTTTTGCATGATAGATAAATTGATGCGTGAG
GTCTGCTCCAATTTTCAAATTATTTGGACATCTGAACAGCTCTAGATAAAAAAGACAAAT
TCGGGGTCTGTAAATTTTTTTACTGTTCGTGCACTGTTCTCGTCTGATTTGTTTTTTTTG
TTGAGAGCTACTTAGATGTCCAAATGATCTGAAAATTGGACCGAACCTCACACAAGAACT
TTTCTACCATGTCTTTTTTGAATGTTTTGAATATTTTATGATCTTTTTTCGGAGCGGGCG
CGAATGAGCCTGGGTACTGAAATGCTGCATCTTAAGATAGATTAAGTACAAAAAATATGA
AATTCAAAAACATCAACAACGCAGCAAAGCGCATTCATCCCTTCTAGTGTTATCTTCACA
TCTGTTAGAATAAAGTAGAATAGAATGGTGATAGTAACTGCTATGCTGGTTCGGAAGGAT
ATAAGGTAAATTTAATGTAGTACTCCCTCCCGCCCTAAATATATATTGGTTAGAGATTAC
ACTGTGAACTACATACAATTTTTTGTAGATAAACTTTAGAGCATAGATTCACTTACTTTG
CTCCATTTGTAGCCTATAATGAAATTTTAAAAAGACTTGTACTCCCTCCGTAAAGAAATA
TAAGAGCGTTTGAATCACTACTTGAGTGATGTAAACACTTATATTTCTTTACAGATGGAG
TATATGAAGTGAAGCCCGAGTTTATCTCCATTTTGTGTGTTGACCTGTCGAAGCACATGA
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AAAACTTATAAATGAGGAAGTGTTTACTATGACCCGGTGCTACAGTGGAGGAACCTTATC
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TCTCGATCTCGATTCCCTCTTCAGCCACTTCTGGAGCTCGCCTAGGGTTTCCGCTCCTAG
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TCAGGTGGCGGCTTCGCCTCCGCCGACGCAGTCCATGGCGGGGCGCGACGGAGGTAATCG
CTTCCATCGTGGAGATGGGGCGGCGGAAGGGCGATTCGGGCGTGGTGGTG
