Map Locations of contig_53530 (17267 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_53530

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_67735 2 1529 bp MLOC_67735.1 Available Available LOC_Os07g36420.1, FRAME:+1, EVALUE:9e-112, 13107.m03741 protein proteasome inhibitor-related, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_67735






Contig Sequence (17267 bp)

>contig_53530 17267 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
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AGCACATTGTCGTGATATCTCCAACCTCCTTTATCATCAGTGCATGCCACTTGTGCTTGA
CGTCGAAATTCCCTGTTAGGAATTCTTGTACCCCTTTGCTAACCATTGGGTAGAGTTTGT
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CTCCTAGTCTAAATAATGAACATTACCTAGTCTTTCAGTCTAAATATAATGTGAACAAAA
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AACCACAATAATATGCATACTAGACATAATGAAGCACAAATATAACCCTACCATCCAACA
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ATGTTTACTCCGACGAGGCTCAGCCCCAAAGGCGGCATCGATGTATAGTGACGACAATAC
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CGTCGGGAGCGCTTGTGTGCAAGCTGGGACGCGTCGGGTGGGGTGGCGTGTGTGCGTGCG
TGCGGGCACGGGTCTGTCCGTGCGGTGCGCTGGGTGCCTTGGTTTAGGGCTATCCGGTAG
ACGTTCTGGACCGGGTCTCTCGTGGCGATCTGGTGCAGGCTCAGCGCGTGAGCCTGGCGC
GCGGTGGATGCGGCGGGAGCGGGCACGGTCGTGGACTCGAGAGGTGGGGGGCGTGCGGGT
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CCTCAGAGTTCGTGCTCTGGAAGGAATCGAAGCCGTACGCACGGCAGGTGTTCGAGCGCC
GTAAAAACCACCATCCTCAACTTGTTTCCGTCGTGGTCTTATCTCCGGTGATTGCCGGAG
TGGCGCGGTTCCATTTTCACACCAACAATTGGTATCAGAGCCTTGTGAGAGGTGATCGCC
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CAGGGGCGTTCTGGCGCCGGCGGCAAGAGCAGCGGTGGACGCTGGGAGGTGCAAGATGGC
GCGGGCTATGCTTCTAATGGTGTTGGAGGAAGACCTGCTGATGCAGGTGGCGCCAAAGTC
ACCACGAGGGAGGTATGGGACTCCCTCAAGGTGTTCTTCATTGGCATCGATCGGGTGAAG
GCCGTGCGGCTGGCGACGCTGCGCGGCGAGTTCGACCACCTGCGGATGGACGACGGCGAT
GACCTGGACACGTACGCCGACAGAGTCTACAGGATGGTGGCGAGGTATGCACGGCTTGGA
GCAACCCTCGATGGCGCGGCGATGGTCAAGAAGCTGCTCGACACGGTGTCGGTCCACCTG
TACGCGGCGGTGGCGGATATCGAGCAGTTTTGTGACGTCGACGCGATGGCGTTCGAGGAG
GCGTTGGGGCATCAGAAGGCTTTCGAGGAGCGGACGCGGCATCAGCCACAGCAGGCGCTA
CTTCTCGGCAACGTCGAGGACATCAGACTCCTCTAGGTTGTTGACGGCAATTCTCGGAAG
CACGGATCGCTGGCTCGTTGACGGCAACGTCGAGGACGTCAGACTCCTCTGGGTTGTGGC
TTAGGGGTGTGTGTGTTGGGCATAAGCCACAGCAGGCGCTACTTCTACAAATTGCTGGGT
TCAAAAATGTTTACTCCGTCGAGGCGGAGCCCCAAAGACGGCGGCATCGATCCATACTCA
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AGGTGACGATGGACGCGCTGGGAATGGGAAGTGAAACTGAAGATTTCGCTTTGACTCTTT
ATTGACCGCTGGATCTAGGTTGGAGGGCAGATGAGATGCAGCGATGACAAGGCAAGGCAA
GTCACCCCAAAGTCATTCTCAGATCTCAGTTACTGGTTACTCTTTTCCAGTCTCTCCTCT
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CCAGGGCTCCCTCCCATCCCATCACCGCCGCAGTACTCTCCGCCCTTTCCCCGACGTCTC
CGACCCCGCATCACTGCCTCCGCTGGACGCCCGATCCGCCTTCGCTCCCTACGTTGCTCG
CCGCCGGATCCACGCCTGGTAATACTCAATTTCTTATTTGGATGCTAAGGACGCTGCGTG
TTGCTGCCCAAGAAGCTTCATGCTGAGAGCAGTTCCCATCGACAAACAGGTATTTCTCCA
GCAACCCCGCGACAACGCCGCGCGACGCCCACGAGCGTTAGGATGGTGACCGCCGAGGCC
GTGATGGCGGTCGTCAGGGCCGCCCGCCCCGTCTTCTGCTGCGCCCACGACGGCGTCGCG
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GCGCTCATCAACCCCCGGCCCGCAGGTGCGCTCCCTTCCTTCTTAAGCGCTTGATTTTAT
GTGTATATATTGGTTATATATGTATGTATATATGAGTAGTTAGGATTTGACTGACCCCAT
GTTTGGGCCTCCTGTTGCATATCTGATGATGATTTTCGGGTTCAGTTCCCGAGTGGATAG
ATGTATCTTCTTCTATTTCAGGCTTGGTTGATTTGGGAAATGCGTCCCTGAGTCAAACAG
CCTAACAGCTTAATTGACAACTTAATTCCCTGAGTCAGAGTCAGACAGCTTAACAGCTTC
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GGCTTTAGACTTGGATCACTCGATTATGATTCAATTATTTGTATGCTATGGAACTGCCTA
ATTACTACTACTTGATCATTGCAGTGTCATGTTCTATGTATACTAACATGTCTGTTACTA
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AGATATAGCATGTCAATCATAGTTTTAAATAGCGCGCTCTCTCGGTGCTATATATAGCGT
TTGGAGGGCCCTCGCGCTAAATGCATCGTGTGCAATTTAGCATCATTTATCGCGCTATGA
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ACCCACTGTTGAATTTATGCCGCACATTGCTTGTAAAATGAAGAAATGAAAATAACAACG
GCATCACGAGCCTTGCCATCATGAAGAAACGTCCAGCAAATTCTGGTCACCTCATCATGT
GGGGTTCTCTTAATTATTCTATGGTTTTGCTTGTTGCCTTGCTCTGTGCTTGCTAAACAT
GCAGACATTTTTATACAGAGTAGATCAGTATGGTGTGCTGCTTGGCCTGCATATAACTTA
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AAAGCTAATATCAATTTGGCGTCATTTAGCTCACTATAGCGTCAATTTAGCGCCAAACAT
AGAATCACAGAGCCTGCTATTTTAAGCTATTATCTCAATATCCACCATTGAGTTTACAAC
CTTTGTTTACCTCTACCCTACGCAAGTCACATAGCCGTCAAATAGGACGGCAAAAGTCAG
CTGGGTTCACTCGGCCTTACTGATATTCATTGAGAAATAAAAATAATAATGGTGTCACAA
ACCTCGAGCCTTGCCATCATGGAGAAACATCCAGAAAATTCTAGTCAGCTCATCAGGTGT
GAGTCTCTTTAATTATTCAATGCTTTGCTTGCTGCCTTGCTTTTTGCTCGCTAAACATGG
CAGAATTTTTTCAACAGATTAGATCAGTATGTTGTAGTGCTTGGCCTGCATAACTTACCA
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ACATGCATGTAATTGAACAACTCAATTTGAACTACAGATTGTGCATCAACTATAACATAA
ACCTTAAGAAGGAACATTTCCTGATTCAACTACATGCTTGCCATTGTATTCACGACTTCA
ACCACTTCCTTCTGTTAGAAATTATTGATAACCAATGATGAAGTTATTGGTTTTAAGTTT
ATAGTACCAAAGTACATTGTAATGTTGAAGTCTTGTTAGATATGATGCAAATAATTTTCA
AGGAAATTTTGCAGAATTTCAGTCACACATTTATTTTAATTTGATTTTTGGCAAGGATTT
TTTTTTCAAGGAACTGGAGTTAGGATTGTTAAATTGAACAAGTGCTTCAAGCTCTTACAA
ATTGCCTGTTGTGTACTGTATGCATATTCACTCTCTCGAACTGTTGCAAAAGTCATGCCA
TTGCATATTTACGCTCTTCGGATTTTCATGAAATTAACAAAAGCATGGTCTCAATATTAT
ATAGTTTCTACTTTTTTCTTTGTGCATTTGAGTATCCATCATTCCAAAAATTATGTTTCT
TTTGGACATAAGAGAGAAGGTTCATATTACTCACATGTTTTGTATTGTACTAGATAAGTA
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CTGTATTATTTATGTGATTACGTGGTTTAACTGCTAGTTTAATAAATACTTATTTGCAAG
GATCTACTACTAACATAAAACTAATTACTGAAAAGTAGCTAAAAGTAAACAACAATAATA
GGCTCTGCGTTATTGAGATGGGTCAGCTCCTTTATATCGTAGACAAGACATGACCAAGAA
GCCCGTAAATCTATTCAAACTCTACTATATGTAAATTAACTAGACCCTTTTCTAACAAAG
TTTCTTAATCAACTAGCACTCTAATTAAGGAACAAGACTCCACATTTGATGTCTGCGAGT
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ATAGGCCTTGGCAAAGGATATGGCGGTGTGGAGGTGAAATGGCCGTCGAAGCTTGCCGTC
AATGTGAAAACCATCAGGCAACCCTGATGTGTGCTGAAACTGTTGTTGGGACGGTGTTAA
TGGGTGGTTGTTGTTGCACTTGACCACTAGAATCCTTCTGGTGTAGATTGCAACCGAGCA
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GCATGGGAGGCCACTTTGAAATGCTCCCATGTCGGCAACCCAAAGCCTAGCTGAAGTTGT
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ATTTATATTACTTGTGCAAAACAATATGACTACAATCCAAAAAAAAGTACTAGCTCCTAA
AATTTCTCACTAGCTATTTTAGTGAGTCGTTGTCTCCGGTCGACGGCCCTCACATGCGGT
GGGTTGCCGCCTCGATGATTGAAGGTTGTTGGTCGCCACCTCCTAATGTGACCTACCGCT
GCTTCCACGCATGATCAAATTTTCGGTACGAGTGCACGAGTAGCTTTAGTCACAAATTCT
GATGTATCGCTAATACCATGGTGGCCCGCTTGCTCGCATTGACCAGGCCCAACAAGAGGG
AGCTTTACACATAGATACTGACTAGTACAATATGTACTTATATGTACAACAATCAGCAAC
GTGTAGGTATGACCAATGTCGTCAAACCTTATCAAATAGCTGCCTTCGACACTGGTGATG
GTTAGGCAAGGGCAGAAGGGAAGGGATGGGAGCGGTGGTTCCATAGATGTGTTTGGAGGG
GACACGGCCAAAACGGCATATGAAGTCGGTTCGCATGTGGAGGCAGGAAGGTGGCTGTGA
TTTGTAGCTGCTGCTTCTCGTAAATCTTCCGGTAGGTTAGTGGAAAAATCGGGGAGGGAT
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GTTCTGAAGGCATGTAGGGAGGAAAGTAAGGAGGTGGGGGAGGGTAATCTACCCAATAGG
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CTCTTGCGCGACAGACGCAACCGCTAAATCTAGTGGGAGAAAGGCTGACAGCCGTTGCTC
GAGCACTGTCAAGCACTGCACCAACCCGGCAAGGAGCATCTAGTGATCCCCTAATTGGCA
TGTGAAGATCTCCAATTGCTTCACGATGAGCTTCATCTGCTTCATAGCCTCAATATTGAT
TACTTTGTCTGCCATCATAGATGGATCTGATACCAAATTTGAATGTTCTACAACATACAT
AACCCACCTTAATTACTGAGAAGTAGATAAAAATAAACGATACTCCCTCCTTTTCGGTGT
ATAGGGCTTAAATCTGAAATCTCATCAACAAGGTGGATTATTAGTGGATGGCACTAGTTT
TAACTAGCCAATGAAGTATTTCTCACATATTTGATTTCAAAAACAATAAATGTAGCACCG
TCCCTTTCATTAGACTTGCATAATGCCTGTAGAAAAAGATGCATGTATAACCACTAATTT
CTTTTCTCTTATGTGCATGATTTAAATATGGCGTGAGACTCAAAGCACTTTAACTCAACG
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GTATAGACAAGACTTGCCAACTATCCAGTAGTAAATCTTTTCAAACTCTAATACGGTCTC
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TGTAGTTAGTTCACTCGATGGGAATTAATTAAGTTATATTTTGTTGTGAAATGAAAGAGG
AAATTGATTCTATAGATGCCTGAATTGTATTGTAATTGCTAGTCTTTAACTATATAATTA
ATATTTTTATTTTGCTTGATTCTAGAAGAGGAGGAGGTGGGAATTGATGGTTGGAACAGT
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CTCCCTCTAACCCCTTCATTTCACATGAGAGGCAAGAGTATATAATAGATCTGAGCCGTT
GACCTCATTAATTAGTGCTCAGATTTATTCTTACCTTCTTACCTCACATGTAAAAAGAGG
GGGTAAAAGGAAGCATGTCAAAATTTACCTTGTTATACTAGAAAACATGTTACTTGCTTC
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AATTATTGAAGTCGGTAGTGATGATATTTTCACCATCCCACTATTTGGTTACTAACAAGT
GGGGCTCAATTGGAAATTTTCTTTGCTGCTATACATATTTCAGTTTGCATGTTGATGGTC
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CTATATGCGGAACAGTAGAAATGGTGAAACAAATAACGACGAGCTGGACTTATCGAGCCT
GTTTATGAATTCTACCAACCTGTTAGTGTGCTTGCTCTATTCTACTATGTGATGACTTGG
GTTGTTACAAATACCTTAATATAGAAACATATTTGTTTGATTGAGTATGATTTTCCGCAA
AAGCTTTGTATATGGATAGCGAGTGTGATACAAGGTACAATATGTAATACTAAATCTATT
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AGGTTATCATTATGTACAATATTTTGGGTACTTGCGAGTTTTTAACCGAGGTTCCTCGTA
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AATTTTGTGTGCTTGATTAATATCCTTAACACCACCTTATTGGTTGAATTGGGTCGTAAG
GATACTACTGCTGTCCAGATACCTGATGTTGAGAACAGTTCGTCAATGAGCAGGTATTTC
TATGCTGGTTTTTTAACTTGTGGCATGTTCCATCTCCGTCTTTGACACTAAAAATCAGAC
CAAGTTTATGATTGTTTCATCGCAAAAAAAAATTCTAGTATATCGCCCTCTGTAAATACT
TGCATGTTGCACTTTTACTTTGTACAAATGAATTAATATCATTATTTCTGGAATTTGGGC
TTTTCTGGTAATATACTGATGATTTTCCTACTTTTCCTAAATTTTAACTTCCAAAGCGTT
TCTGTTGTAGCTTACCCCATTTGTTAATAATTCTCTAACATGTGGCACTTCTCCTTGCAG
TTCTGGAAATTTTACATGGGAAAACCCAAGTACAAGGACAACTGAACCAGCCGGGTATGA
ATACCACCATTTGCATTTCCCTTCGTCTTTTGTGTGGCACTCCTTTTTTTTGTCAAACTC
CTTTTATTCACCTTTTTGTACTTTGTTGGCACTTCTTCCAGTTCTCAATATATTCTGTGG
GAAAGCCGGAGTACAAGGATGATTGAACCTGCCGGGTACGAATACAACCATTCGTATTTC
CCCTTCTTTTTTTGTGTGGCACTCCTTTATTCACCTTTTTTTTACATTATTATCACTTCT
ACTTCTAGTTCTGAAAATGTTATGTGGGAAAACCCGTGTACAAGGTACAAGCATTTGTAT
TTCCCTTTCTTATTTTTTGTGGCACTCCTTTATTCACCTTTTTACACTTTGTTGCGTTTT
TATTGAGTCATGTCCAATCTAATTACAACTCGCTAAGACTTAGTCTTTCTAGTTTTCTCC
TACTTCATACAAGCCTACACCGCCTTCAATAATGACCTGGTTCAGTTTTCATGAGCATGC
TTGTCCTTGCACATATTCTCTTGACATTTAATTTTAGTACTACGACCTATTGATATGGTT
ACTTTATACTATATTAATCATTGCAAATTCTCTTGCTGTATGTTGGAAGCATACAGAAAA
TTATCTATAGAGTCATTACTGATTTTAGTTTGGATATAACATATGTTACTGATAGCATTT
GTGGCATATAGAAATATATATGTGCGTTTACACTCATTTTATGAATCACTCTGACAAGTT
ACAAGACAATATTATGGGAGGTCATTAGAACGGTTGCACAATAGGTAACGGCTATCGAAT
ATATAACTGTAGTTCAAAGAAGTTGCTATAAAATACATTCTCTAAAGAATTGATAAAGAC
GACGATGAAGCCATGTTCATATGCACCCATTTGTGGATTTATAGATTCAGGCATTTCAAA
ATTCTCAAAAACATTATGGCACTAGAAAATTTTAGTTTAGGCATCTATGGAAAATCTCAA
TAGATATTATATACGATCATATGTGTTCGTATACTAATACTCTGGCCTATCCTTTGCTAC
ATCACGCATATGATTATATGTTATTTTTCAAAATTCGCACATGTTCCTTTCCTAAGAATT
TCCTTTACAAGTGCACAAACTAGTGAAGGGCCAGTTCGTGTCAACCTAATTTCGGTTTTA
CCAAAATTTGCACTCTTGTAGGATAAATAGGCTATCGGTGAATTGGTTATAGGATATTGA
TAACAGGGCTAATATTTCCGTTTACGTATTGTGGTACAGACTGATTTATCCTCCGGTAGT
TCTGGTTGGTGATGATGACACCTTCCCTGTTCCTGGTGTAGGCTTGTACCCTCACAGGTC
TGTCTCCTACCATAATATGCATGCAAAAGCATCTACAAATCAGTTCTTCCGCACAGAATT
AACCATGTATCTTATTGTTTGCAGTGGTGAAACCGGTGGTAGTATGCACGTTGGTAATAT
GTTGTCAACTGAATACTTGTGGAACCTCTTTACATTTGTCCCTCTGTACTGTCTAACATG
GAACCTATTTGATTACTACAGGTCCAAATGATCCACGCTTCTTTCCTACAAATCCTTCTA
CTCCTTTTGGTGACCTTGGGTATGTTCAGTTTTCCTTTACTAAATATTGCATTGCACTAT
TTTTTTGTCATAAATGGAATCAAATATTTCATAATAGGAGTGTTCCACCCGGTGGTCGTT
ACGATCCAATTGGCCCGCCCGATGCTTCAGGATTTGAACCGTCTCGCTTTGTGAGGTAAG
TTAGCTATTCTTAACATTTTTTATAGACCCATTTATGATTGGCAACCGGTGAGACTCAAG
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ACAAACCGTTCTTATAGTTCATTTTTTCGCACAATACATAGTGCAACATTCAGCACAATA
CATATTTCTATATATTGTTGCGTCATCGAAGTCAATGAGCACAGTTCATTAACATATAAT
TGATACCGCTATGCTTATTTTTACTTGCATCCTCCTGGGATTTAGGAATAGTCACTAGCT
GAAACTTTGATTAACAGCTGACGCCAACCTCCTGGTTTTTTATTGACGCAGTCCTTCGAG
GCATTCAGGTGGAAGCACTCACCCAGACCTCGAGTTCTTCCAGCAAGGCCCGGACTTCTT
CTGAGACTCGGCTTCATGCCCACCTGCACCCTGTGGTGAATGACTCTGCTTTGTTTCTGC
TGTGCTTGACCGTGAACGCTTTGCGGAACCAATCTGCTATGTATCGCAAACCGTAAACTC
CCGTATTCACCTTCCAAATCATGCTTTGGCATACTCGACTGTACAATTGTATGTGGGGCT
GTCTTTAGATCCCTCTGTGGTCTGCAAGTTTTGCCTCATCACCACCTAGCAACATGAAAA
TTTGCTCTCAGTTTCGTCATGCAGTATCACCGCAAAGATTTCTGCATTGTTTTGTCGCTC
GCCCTCGCCCTCGCCCTCACAGCGTCATCATTGCTGGAGCAACGACAGTCCTGCTTTGTA
GCAGCGTCGGCCGCCCCATCCCTAATCCCTTTTTGTAGCAGCACACCTAGTCTCTCTTTA
CAGCAGCACCACTATCCCACCACTGCATGTGGCATCGAATCACCATGGTTGTAGAAAGCC
CACTATGGCTCACAACACCGATGGTCGCCTTCCCCGCACCTTGCCCTTGCTTCATTCGAC
ATGGCTTGCATCATCTCTCAGGATCATCATAGGCTTGTAGTACCGTCGTTCACCGCTCGC
AGCCCTGGTGGTTGATGTTTGTAGCGCCACTCGGTCATCCTCTCTATACTGGGTGATTCC
AATCACTCGTAGAAGTCTTCAGCTTCCCCAGAGCAAAAACACATGCGAGATTCTAGCGGC
GACGGCTGCCCTTGCTGTGCCATCTCTACTCTTAGCAGCTATGTGAGGTGTTCACAGCAG
TGGTGATTGGGGGTGCATCGGTGGCAGCAAGCTTGTCGTGTGCTGGAGTAGATGGGGAAG
AAGATGACGAGAGGAAGAGGTGAACCTCTTATAAATAGGCTAGTGATTAGAGTATTATTA
CGTGGTAACAACATAACTCAATTTTTTTATCGGAAGGTCGTGTGTATTCGTGACTATACT
CATGATTTGAAGATTTTGTGGAACAAGATGCACGTGGAGAATCTAGGAACAGGATTGACA
CAAGAAATATTAACTAGGTTTGCGCCGCTCCTGCTGAGGTAATACCCTACTCCTGCTGGG
TGTTCTTCTCAAGCCTCGTATAACAATTTACATGTCATGGAAGAGGAGGAATATTTTCAG
AGGTTTCGGGAGTATATACAGGCAGGGTGTGAATGGCAGCAGAGGGATGCCCTAAGGTTT
CCATGCGGCCTCACCTTGTGGCCAGCTCATGAGCCACATGGGCCCATCGCTTGGATCCCT
TGGGGATCCTCTTTAGCCCCCTTCGCCATCCTTGGTTTCATTCAGATTCAAAACTTTGTG
AAATATATTTTTCGTCTTCAAAGCGGTCTTCTTCTGAAAGTCCAAAATCATACGGAAAAT
AATAACTGATCTTGAGAATTGGATTAATTAGGTTAGTCTAATAAGTTGATATGAATTTGT
GTCAAAACTATGCAACAATAATAATAATACAAAAGTAGAATGAACGTAGCAAAAGTTATA
TGTACATCTGGGTCTCTGACATATGACTGCGCTAACTCTTAGCCCTCGCAATACCCGGGG
GATCCCACTATAGGTAGCCCTCGAGCCTTTCACGATCTCGTTGTGATAGCCAACTCTTTG
GGAGAAGTTCTATTTTGGTAGATGTTTTTTTAGAAAAGGAGGATGAC