Map Locations of contig_53273 (10225 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_53273

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_67563 1 484 bp MLOC_67563.1 Available Available None
MLOC_67565 3 1622 bp MLOC_67565.1 Available Available LOC_Os01g53630.1, FRAME:-2, EVALUE:6e-103, 13101.m05617 protein ulp1 protease family protein, putative, expressed
MLOC_67564 1 915 bp MLOC_67564.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_67563






CDS Structure of MLOC_67565






CDS Structure of MLOC_67564






Contig Sequence (10225 bp)

>contig_53273 10225 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGCTCTGATACCATGTAGGAACGGGGGGAGAGAGGAGTACGGGAGGGAGAGAGGAGTACC
TCCAGCACAAGTGTTTTGTGTGTGGCGGCTGTCTCAGGAACGGGAGATGGCTGGGAGCCT
CCTTTTAGGTTAGTCTCACTACTTGGGCCTAGGCCCTAAGAGATAACTTGTATGGGCTGG
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CACTAGCTACATGCCTTGTGGACTATACCATTTGATTTTAGCTGATGCAATCTGTAGTTC
CACTGCTTAAAACTTTTGATGACATCCTGTGCCAGTCATCTTATTGCCCTGTGACGATAT
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TTATAATTCTTCGCTCTGAATGCATCATGGAAAGTGACTCACCACATCATTTCAACGAAT
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TCCTACTGGAAACAAAACGACCCGTCCAGGCGTGTATAAACCAGCCTAATATGGATGAAA
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AAAATATAAGATATATCGGTCAGCTTTGCTGCATCGTTATAGCTTTCAAACTTTGTCCAC
AAAACAGCATATACACAAAATTGGGACCCTTAGCGCATCTACAGCCATCAGAGACAGTGT
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TTCTGGAACATATCGTGTTGAAAACCGAAAACCCATGCATATTGCAGCAATTTACTCCCT
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GAGGGAGTACACATTAAACATCCAAATAAACGCCATGGTTTTGTACAATTTCCTGGAACG
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TGAAAAGAAGCTTCGGAAAATAAATAGAACATGGAAAAATTAGTACAAAAAATAATAATG
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TTAGGTACCTGACATTGCCATAGTCAGAACGGACAGACAACATGTACTAAAAACTAGAAA
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ATTCCTGATCATTCGACTGGATAAACTTTTGCACCTAGTCCTTTATAGTTTATACACACC
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GAAGTATAGAAGCATCAATGATGATCTTCTCAGTGAATCAAATCCAAACACCATCCATCA
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TCCCACCTGCACATCAGAACAATTTATCAGAGAAACAAAATGTTATGTGGGGTACCACAT
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GGTCATAAGACCACTTTTTCATTATTTCATTAAATTCCACTAACAGCTAATGGTGACGTT
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CAAGACATATAACCTTTAAAGTCTCTAATGATGATAACAAGCCCTCCGTAGACACAAACA
AAACAAAGATATCAGTGTCTACCAGATCAGAAAAAATACCAGAATTATTTATATTGAAAT
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GAACAAATGGAGACACACACAATCAAAATATCACAACAAGGCATCAATGTTGTACAGCAA
GAACAAATTGAAAAGTTTCAGATGCATAAGCAAAACAGACAACAGCTAAAGAAGAGAAAA
CACAGCTCATAGAACTACTAAAAGTAAAAGAACAGATGAATTGGATCAGCAACTAGGAGT
GAATACCTCTTGGTCCCAAAAGTGAGATCTTCTGTTTGTAGTTTACTGGACATGCCCTTT
GGCTTGACAGAGTTATTCTGTTGATCTTCTGTACAGATCTTCCTACCTAACTTCTTACCA
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TGATTCACTGTGATCGGTGCTCTTTTCCGATCTTTCACTTGGGAAGCACGTTTGCCTAAG
TTAAAGTACTCTAGTTCAAGAGTGAATGCTGCTCCATCACCCTACATATATAACCAGGAA
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TGCATTTTTTATATCAAGAAAAATATCCATATGTTGTTTGTTGACCTTGTAAACAGACTG
TCCAGAGCCTGAAGCATCTATGCTCTCTCCCATGTAAGGAAACATCCGTCTCCTATTTCT
ATGAAGGAATTCTGGTAGAATGAGCACTAAAAGTATATAACATAATGAAATCAGTTGACC
ACAACTATCAATTATACTAACTTCCTAGAAAGTCCAAATCTAAATTCAGCTATGTTCTAA
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GGCTAGGGTTTAGGGTTTCCAGGCAGAAGGCGAGCAAATAAGTTTGCTTCTTCTTAATGC
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TAACTGGGCTAAGCTCCTAATTACTGTTGGGCCGGCGGCGGCTATAAGTAGCCCCTGTCA
TAACATCTCTCCCCGTCTACGCAAACAGCTCGTCCTCGAGCTAGAAGTCTGGAAACTGCT
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TCAGAAGTCGCCAAACTCCACGGCTCAGCTGAGCCCTCAACACCTTCTGGGGACCTGGAA
GTAGGCGACCGTTGGCAGCTGGCGGAAGGACCGGCGAAGATGCCGGTGGCTCACCGCGGA
AAGGCTTGAGCAGCCCCACATGGAAGACATCATGGATACGAGCGCCCAATGGCAATTGTA
GCCGGTAGGCCACGCTGCCGACGCGCTCCACCACCGGAAACGGCCCGGTGTAACGCGGCC
CGAGCTTGCGCTTGGCGCACGGGTCAAGCGACTGAGTGGTGCGATGGAGAAGGCGCAGCC
ACACCCAATCGCCTACCGCAAACTCTGCATCGCGATGATGGGCGTCATAGTACTTCGTGG
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GGAGAAGCTCGCTTGCCACCTCGGTCTGAGCCACCCCTTCCTGGAACGGACGCATGGGCG
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TCTCCGACTGGCCGTCGGTCTGAGGATGGAACGCTGTGCTCAGACGCAACTTGACACCCG
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GGCGGTGTAGGGATGGCCCAGTGCAACGAAGTGGGCGTACTTGGAGAAACGGTCTACCAC
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GCTGTCACTGGGGATGAATTAGTCGGTGCAAAAAGTTGTCTTCGCAATGTCGTCTGGGTG
CATTCGCACCTGATGATAGCCAAAACAGAGGTCAAGCTTGGTGAAAAAGCATGCCCCGTC
TTGCGCGTCCAGTAGTTCCTCAACAACTGGAATAGGGAATTTATCCTTGGAGGTTTTGAT
GTTGAGAGCCCGATAGTCAATGCAGAAGCGCCACGTGCCATCCGCCTTACGGACGAGGAG
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GCACTGCCTCTCAAGTTCATCTTTCTGCAGCTGGGGCTAGCGATACAGACGGACGGCCAC
GGGAGGTGTGCCTGGTAGCAAGTGGATGCGATGGTTGTAGGCCCGGGCTGGAGGAAGTCC
CTGGGGGTCTCGAAGAGGTCGCTGTATTGCTGCAGGAGACGGTCCAGTAGGGGCTGGGCC
GGGTCGGCAGAGGTGGCCGACAACTGGGGTTGGGGACTCGCGGCAGAACCGCCCCGCACA
CCCTCCCAGCGAACGTGGTGGTTCACGGGCCAAAAGACCATGGTCATCGCGTCGAAATCC
CAGAGAACGGGACCCAGGGTGCGCAGGAAGTCGACGCCAAGGATGACATCAAAGCAGCCC
AAGTCGAGGCCGGCGCACGTGATGGAGAACTGCTCGTCACCGATGGCAAGAGGAACATTG
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CCTCCAGTCGGATGAAACGCGAGACGGTGCATGGTGGCCCCGGACAGAAAATTATGGGTG
GAGCCGGTATCGAGTAGCGCCAGGAGTTGCTCGCCCTTGATGGTGACCGGGAGCAACATG
GTTTTCTCCGTCCGGATACCCGCGAGCGCGTGGAGCCACGAATGCATTCGCCGGAGCGAC
CTCGGCGGCGTCTTCCCCGCCTGGC