Map Locations of contig_53178 (11486 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_53178

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_67498 7 5991 bp MLOC_67498.3 Available Available LOC_Os07g48602.1, FRAME:+3, EVALUE:5e-60, 13107.m05208 protein EMB1011, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_67498






Contig Sequence (11486 bp)

>contig_53178 11486 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TACATCCACCATGCAAGTCCAATGAAAGAAAGGATGCTACATTTATTGTCTTGGAAATTG
CATATGTGAGAAATATTTCATTGGCTAGTTTAAACTAGTGTCATCCACTCACAATTCNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAAACCGGAAAGGAGGGAGTATTTTAAAG
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TCTGTTTGACTAGTGAAGGGAAACTAGTTATTTATTATCTTGCCAGGTAGGTTTTTTGTT
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AATGGCCAAGAGTCTGCTAGCTCCTGGGGCATCTAGCGCACCAGCAGGTAAGAGCTTGCT
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TGAGCCAGTTTCTTCATGGCAACCGAACAACAGCGGTAGTTTTGTCAGCAGCCAACTTGG
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TGCCCAACAAGATCTATCTAAAAAGATCTACAGTGTAAGATCAAGATGTTGTTGTATAAT
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ATAAGTATCCTATTGATTGAGTTCCCTAAATACGTTCACCTTGTCTTAACCTTTTCAGCT
TATTTCCTTTGATATGCATATCTGCCACTAGGATTCTATTGATTGAGTTTCTTGCATATG
TTTACCACGTTTAACCAGTCCAGAGACCTGAAATTGTTTTGTTTTATTTCTACTCTTTAA
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AATTTAAATATTGGATTTGGATCTACTTTACAGTTTGCTACCTCACTGAGCACTTAACTG
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GTGGTTTCAGAGATGCTTGCATGACCTTGCAGCAGCGCCCTCTTTCAGTTCTTGAGGGCG
ATCTGCAAAACCTCTTGGAACTATTGCAGGTCTTCAAGGTAATATATTTGTTTTCATCTG
GACTTTTTTTTGGGGATTTCCGACATTATTTGCAGTGCTGCCTGTTCAAAATTGTTACTT
AACATTTATTCTGAACTCCAGAACAAAGTAGAGGAACAATGTTCAAAAGCCGAAGATCTT
CGAAATAAGATGTTCCAAGGTACTTCCTGTTTATACCTGGAAATAGAACAATAGGAACAC
TCCACCTTAAACTAGAACAAATGTACTGCCGTAATGTTGTTAGTGATTATATATACCTGG
AAGAAATAATTTCATCATCATTCAAATCTTTCGATATGCTATAGACTAGCGCCTGTTTGT
AATCTATAGTTACTTGAGATCCCTATGCACTTGGTTTGGTGCCATGTTTTTTCTTGGCAG
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GCCACCTTGGAAATATTATTGTTTAGACAGAAACGCCTTTGAAATATTATTGTTTAAACA
GAAAAAGAGTTCACACTATACAATTTCACTTTGGCTGTTAGGTAAGGGTACATACCGGGG
GTTCCTGTTAGGGTCAGGGTACATACTGGGGGCTCCATGTGTTGCATCTGGTGTGTCTCC
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CTGAGTGCTATGGGCCTGTCTGCTTTAACAAGCTTCTATTAAGTTGAAATATCAAAACTG
TTCTGTTGCTTATTAAAATAATGGCATCACCAGTAATATAAACTTTCCTAGGCAATGCGC
CTTAAGTTTACCAGCTGATCTATGAGTATTTTCCAAGTTATTACTGGTAGTTTTGAAGTT
TTGAATCCTTGACATGGAAACATCGAGTCTGAACTCTGGAGTGATAAACAGTTATCCACT
TGCATCCAAGCCTTTTTCTTGTGCAAGGAAAAATGTCCAAATACTAAACATTTGACCTGC
GCATTGAATGACCTTATTTTCTGTTTCTCCCCAGTTTCTGCTAGGCAAGCTTATATGAAG
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GATTCAAGTGCTTTTGAAATATTAATGAACTAATATTTTCTTTTCCTTTTATATATAGAA
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GTACCTCAGACAGTGTTGGTTGTGGTGTGGCCATAGTGGTAGAATTACAGTGTAGCTAAT
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ATCCCATTAACCCCCATCCTTCAAATCATGTGATTTGCAAAGATGTTTTCTCTTGGCATA
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GCTACAACATAAGACATTCTGTTTGTCTTTTACAGTGCTGGATGAGAAAACAAAACCTTC
AGGACCCCAGGGCAACTCTTTGTTCAAATGGGTAAAGGAACCAGCTGGGCCATCTCAGGG
TTCGGACCAAAAGCATTTTGAGTTATCAGGGCGAATGAGAAGTGCTGACCAGTCTTCAAA
GTTGGCGCCATCTTTACCGGCATCATTCAGTTACACACAGAAGGATGCGAGTGATAGGAT
CAGCTCACCCAATGTTGCATCTTTAGGCACAATGCATACCATGCCCAAGTCAAATACTCT
GACCTTCAAAACCACTATAGCTCCTAAAACTAATGCCAATACACGTCCAGATATGTCACC
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GTTTGGCATTTCTCCACAGAATACGGGTGTTAATAAACCATCTTTGTCTTCTGAACCTTC
TGAACCTTCTAAGCCTGTTGTGTTGCATGGGAAGACTTTTCAACTTAGTGGAGTCAGTGA
TACTATGCAGAACTCAGCCAAAGCTTCAGCCCAGGTGGCATTTTCACCAACATCACAGTC
ATCTTTATTTCCTATGATGTCAGGTGCTTCCTCTTCATCTACTTCACTCTTATCAACTAT
GCAAGCATCAGCTGCAAAGACTTCCGATCTTTCATCTCCAACGGTTTCTTCCACACTCCC
ACCACAGAAATCAACACCAAAAACTCCCCCAACAGTACCCGAGGCTGAGGGTACAGTGTC
TTCTTCCCTGCCATCTATACCAACACCTGTTAAGGAGTCATTACCTGACTTGAATAAAAA
TGTATCTAAACCTGAAGTGGTGACACCAGAGGTAACTGGAGCCACAGTCTCTGTAAGTGC
TACTTTAACAGGCGTACCTACAAGTGAAAGCAAAACTGCATTGCTTCCAGTGGCCAATAG
CAGCTTACCTTCTAATCCTCCATCCATTCCTGTGCCTAAAACTGTGCCAGGGGCAACGGA
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TGGGTTTGGTCTTGGGTCCGCACCTTCTTCAAGTCCTAAAAAATCCAATCCTTTTGGGAG
CTCATTTGGTACATCTGAGAGTAAAAGTTCAGGTTCACCGTTTACTTTAACCACCAGCCC
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TTCTGGGGCTTTTGCTTCTGCACCTTCCAGTAATTCTGGATTTGCTGGTGCTGCAGCAGG
TGGGGGTTTCTCTGCAGCTGCTACTTCTGCTGGTGGAGGGTTTGCTGCTGCTGCTACCGG
TGGAGGGTTTGCTTCTCTTGCGTCCAAAAGCGGTGGTGGTTTCGCTGCTGCAGCTTCATC
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TGGTTTTGGAGGTGCAGCCCAGGGTGGTGGTTTTGGAGGTGCAGCCCAGGGTGGTGGTTT
TGGAGGTGCAGCTCAGGGAGGTGGCTTCGGAGGTGGTGATATATCTAGATTTTTTGCTCT
ATTTTGGATGCATACTTATATACTTTGGCCTATATCTATATGTTCATGATTAGATGTGCT
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GATTTTCTGTGAGTGAAATATATTGAATCTGACATGTACGAAATATTCTTTGAAGTTAAA
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AAGGTTGCTTTATTTAGTTGGGGCTGTTTTTAGAATATACTCCTAAAACAAGTGCATTCT
TTTATTTTCCTTGTAAAAGTTATCTTATCTTAGGTTTATGAGTAGCCTAAGTATTTAAGA
TATTATCTTTCTGCACAGCCATGATCACTAAACTGAACAATTAATCAGTTTCAGTATGTT
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TGTTTTCATTTGTAATTCCAAATGTAGGCTTGTTGTCCCACAAGGTTAATTTTGAGATAA
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ATAATTTGGTTAATCTTGAAGGTGGTTTTGGAGCTTTTGGCAGTAATAACCAAGGGGCTA
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AAATGTTCAAATGGTTTTTGCCCCTGTATACATCAAAAACTTCAAGTGACATGCTGAATG
ACAACATTTATGTGAAAGCTGATGTTGCTAAGATGGAGCTCCAAAATTTGCCTGTCCTGT
ATTCAGTTACGGTGAGTTCAAGTCTGATTATCCCCTGAGGCGTTTCATCAAGTACAGCAC
TACAGCCTCATTCATCATTCAAGAAAACAAGAGTATCCGTGGCAACAGCATAATTATTGT
GGTAACATGATGCAGTCATCTACGCTGATGCCGGACCTAGCCACTGCCAGGTAGTCAGGG
ATGTTAGGGTTTCTCATCAAAAGCATGTTGAGAGTGCAAAAGAAAAGCACTGGATAATAG
TATTTCCTAGAAAAAACGACTTAATGTATTCCGCCCTTGTTTTTTGTACAACATCAAAAG
AGGAAACGGCTGTCCGGTGCTTTTTTTTTTTCTCCCCTTGTCTCGGTGCACTGCTGACAT
TGGTTGCAAATTCACTATTCAACACCATAATATTCCTTGTCACTTTGTACAGAACTGGTC
TCTGAGGCTGCCAGGTGCTCACTCGCACAGGGATGAAAAACAAAAGCATATGATGCCAAG
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GAAAAGCTACGGCTGGAAGGAGTTTATTCCATGTGTTAGCGCTCATTAGTATAGTTTCCT
TCTCTTTTGGCCCCCGAACCGATGCTGGAGGAATATATGCATGGTTTTAGTTCCTCCTTG
TGATAACCGATTGGTCATATTTGTTGACAACTCACGAGCAATGCGGAAGGAATCCGGCAG
GTGCTTAGAACAGAACAAATGCACGCACGCACGGACGCCCACAGGTACAAGCATATCATG
AGGGCGTGGACGTGGACCCGTGGCTCATATCTCAGTATATAAATATAATTAGGCGATGAT
CTCTTTCCTGGTCGCAGTGACAAGCTGCTGATCGATTCCCTCAACAGCCTAGAGCAGATT
TAATCGATCCACGTAGCAGCAGCAACAGCAGGGAAGCATAATCCAGTCGAACCCAAAGAG
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TTTTGTATGGTCAAGCTTTCCCCGCAAGCCCCACCGCATCTACTTCGCCAGCAGCCGCAA
CCAAAATCTGAAATCTCATGTGGTTTCCGCATGGGTAAAAACGCCAAAGCGGCACGAATC
AACCAGTTTCATCATTAGCATTACTTTGCACGCCACATGTAAGGAGTAGGAGTAGTAGGA
GTAGAAGCAAAACCAAGCAGCAAACAGTGAAGCTGCAGCGTCGGCTTCAAAGCTCACACC
CCCAGCGTTCCTGCCTGCCTTTGGGAGGTGCCAAGCTTGCGAGAGGAGACACCGCGAGCG
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CCTCACCCCCGACCCGAGAAGGCATCCGAGAATGGGCACCTCCGCTTTACCCCTCTTTTG
CATGCTGCACTCATGCCCCAAATTCCCCTTCTGGATGCCCGCACCGCAGTCAAAAGATCG
ACGGCCCCTCCCCCTCCCCCTCCCCCTGCGCTCCCCCCCCCTCCCCCTCCCNNNCCTCCT
CCTCCCCCCCCTTCTCACTCTCTCTC