Map Locations of contig_53170 (10053 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_53170

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_67490 1 924 bp MLOC_67490.1 Available Available None
MLOC_67489 3 1910 bp MLOC_67489.1 Available Available LOC_Os04g43650.2, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13104.m04339 protein L-allo-threonine aldolase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_67490






CDS Structure of MLOC_67489






Contig Sequence (10053 bp)

>contig_53170 10053 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
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GAGGTTGCGTCGTCTCGTCCAGCTCCTCTTCCTCGGGTCAGGCGGCAGCACGCCAGCACC
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GCCACGGCCACGGCCACGGGGCCGCGGATCTGGTGACAAGAGGTGCCCACGATCTCGCTG
CCGAGCGCGCGCGGCGCACCCCGTACGCCCGGTGGCCCGCGCTGGCCGTCGCGGGGCGTT
TGGTGGCCGCCGCCGCCGCGAGGAATAGTCGCCGCAGGGGCCAGGTTTATGTTTCTTGCG
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TGTCCCTATCTCTCTTGTCTGTTCCCCTCCTCGTTCTTTCTCGTATGTTCCCCTTCACCT
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CCTCCTCTCGAGCCCTAACCTCGGGCACCCTCGATCGCCGCCGATCGCACTCACCGTGTC
ACTCTTTCCTCGTGCTCCTATTCCCCCCTCCCCCCTCCATCGCAAGTCACCCCCTCGGGT
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ATCTCAAATCTTTTCTGTCCCTTCTGCATATAGTACCAATAGGGGTCGGATTTGATTAGG
GTTTAGGATATGTCATGTGAGGTTTAGGGTTTATGGTTTCAGAAAGTTGTGACGAGATTT
CGATTGAAAGGAAGTGTAAGTCGGATTTAGCTAGGACATATTGATGGAGTTNNTTAGGGT
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CTAGGACATATTGATGGAGTTAGTTAGGGTTTATGGTTTCAGAAAGTTGTGACGAGATTT
CGATTGAAAGGAAGTGTAAGTCAGATTTAGCTAGGACATATTGAAGGACTTAGTTAGAGT
TATGTGGCATGAGAAAGTTGTCAGCAGATTTGG