Map Locations of contig_53133 (7824 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_53133

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_67471 4 1966 bp MLOC_67471.3 Available Available LOC_Os04g24600.1, FRAME:+2, EVALUE:1e-158, 13104.m02304 protein cysteine proteinase 1 precursor, putative, expressed
MLOC_67472 1 293 bp MLOC_67472.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_67471






CDS Structure of MLOC_67472






Contig Sequence (7824 bp)

>contig_53133 7824 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CACATTGTGATCTATATATTCGCACATGTATTATGATTTTCGGTTAATACAATTATACCA
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TGAGTAACTCACATTCACACGGGCCAAAGTCCGGTACATATACATGTGCAGTGGCGGAGC
CAACGCCCGGCTAGCCTGGGCATTTGTCGAGGCTCCCTACCTACACACAAGCTAGCGATG
GCCGTGTCACAACGGGAAAATTTGTCCTCGCATGTACCAGTAGCCTGGGCAGCCGTGGCC
GAATTGGCCGTCGTTTGCTCAGTTCATGAAACGAGAAGGCGTACTAAACATGCATGTAGC
AGTAGCTGGATTAATATTTAATAGATTAATGGGCTGATCATGGTTTACCTGTGCGTTTTC
CTTCTGCGATGGACTAGCTAAGCTAAGCATGTGGTTAATTTGGCACATCGGCTGTTGCTT
TGTTTACTCGGAAAAATGCTAGAAGCTTTTTAGTCTCTCTAAAAGTTTTGTAAGCTTTTT
ACTCCTTCCATTCCAAAATAACTATCATAGTTTAGCTCAAATCTAAATTAGAAGCACGAC
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TAAGCTTTTTACTTCCTCCGATCCAAAATAAGAGACGTGGTTTTAGTTCCAATTTGCACG
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CTCTGAATTCCAGGATGGGCCGGCCACCCCATTAATGTCCAATTAAACATTGTCAAATCA
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ATGGGACACCATCGGTCGATCGCT