Map Locations of contig_52849 (8958 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_52849

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_67295 4 1494 bp MLOC_67295.3 Available Available LOC_Os10g31520.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13110.m02741 protein ribosomal RNA assembly protein mis3, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_67295






Contig Sequence (8958 bp)

>contig_52849 8958 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CACCCCCGCCGCAACGCCGCCCCCCGCCGGGCGGCGAGGGAGTGGGCGGGCGAAGCGAGC
GCGGCGGCGGAAGCCACGGAGGGGAAGAACTGGCGGCGGAAGGGGAAGCACGAGAAGGAG
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GATAACTACTTTATTCAGCAACTTTTTTTACTGAAACCAATCCAATTGTAAGTGAGATGA
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AGATCCATCAGCAATCTTTTAGAAACTTATGAAGAGCAGTCAATGATAAGTCTGTTAATT
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GCTTAAAAGACTTATGTTTAGGAACGAAGGGAGCAATACATTGTTGCAGCTAACCATGTA
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AGCGGCTGGCAGTAGCATGTGTAACCTAGTACCCTACCGTCAGGGGTTTGGTGGTAGGCA
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TGGGAGTGATGTGATGTTGGCACGACTGCTTCAACGATGGTACAACAACAGTCTGTGTGC
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AAAAAGCTAGAAAGGATGCTTAGAGGGCTGAAGTGCTCTAAGCATGTTTTACAATTGTTC
GAGGACCTCCAAAAATGGGGAAATTTGTTTTTTGCCAGTCTGGCTTTTGCTACATTTTAT
TATGCTACTCTAGCTTTTGGCATTTCACTTTGTCACTCTTAGGTTTTGGCAATTAGCACA
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CACATTATCAAAATATAAGAGTGGGAAAAGTGAAATGTCAAATTTTAAAGTCTGATACAT
CCATTTGGCATCATGTTTTCCTACTGATATTTATTATGTTCTGAGTCATTATTTCACTTT
ATGATGCAATCCTAATGCCCTTTCTTTCTTATTTTGCAAGTTTCACACAAAGAGAGAGAG
ATTGTTGGGAGCTGGAATTCTGGACTAGAAAAGGCTATAACAAAGTTGGATATTCTCCAC
AGTTCCAAATGACCTGAAATTTTTTGAAGAGTTATTTTAGAGTATATAAAAATACTCGCG
GAATAATTACTAGGAGGGGGCCACCGGGGAGCCACGAGCTCAGGGGGCACGCCCACCCCG
CCCCCATGGCGCACCTGGTGAGCTCGTGGCTCCACTAGGAGGCCTCCGAGGCCCATATTC
TCCTATATGACACTATTTGCCCTAGAAAAAATAAATCAAAAGAACACTTTTAGCACGAAG
CACCGCCGTCTCGAGGTAGAACCTGGACAAGAGCACTTTTGCTCTTCGACGGAGCGATTC
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