Map Locations of contig_52772 (2830 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map location




Predicted Genes from contig_52772

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_67239 1 798 bp MLOC_67239.1 Available Available LOC_Os10g40780.3, FRAME:+2, EVALUE:9e-81, 13110.m03781 protein CCR4-Not complex component, Not1domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_67239






Contig Sequence (2830 bp)

>contig_52772 2830 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCGTATGTAGTCTATTAGTAAAACCTCTAGAAAGACTTANNTTTAGGAACGGAGGGAGTA
GAAGGCACTGTCAATTGATAAAGGATGTGTGCATAAATATAAAAGCAAAATTTGTTTAAA
AAAAGGCCGCCGCAATGCCAAACATGTAAGCCATACTACATGTTTAGGCATTCAGGAGTC
TAATCTAATCTTTAAGCAATGCTATCCGCTACTTTGTAACTTTAGAGTATCATCTTCAAG
TACTCGTGTCCTCACCTCCATCCACCAAATCTTCAGAGACTGCAACAGAGTTCGCTATAT
CACTTGTCCAGACATTGATTACCCAAGAACCCAATGGCGTTTCTGAGCTTTGTAATGTTG
TTGATGCATTATCGAAGGTAGGCCATTTGTTTTTGCAATTGTTGTATACTTTTGGTCTAA
TCACCATGTATTTTGCTTATTCATAAGTGGTAATACGATCTGTGTTACAGCTTGCAATCA
GGCCTGGTTCACCTGAATCATTGCAGCAGTTGATTGAGATTGCAAGGAGTCATTTCAAGA
ATGCTGCTAGCTTTGCTGCCATGAAGGATGACAAGGTTAGGCATGTGAGGGATAACAAGG
TTTTGATGTTTATGCATGATCAAGTTTCTCTGTTCCTATAGGTATATGTTTTCTGACTTG
ATGATTAATTTCTGTCATTCGATTACAGGTTTTATCTGGTCGTCCTTCAATATATAAAGA
AGAAAATGATTCTGCTTTTGCAGATGCTGTTAGTTTTCAAGACCAGGTAGGAAACACGAC
ATCCTATTTTGTTGTACACCATGCATCATACATTTCACACAAGAATTTTATTATGAGGGT
GTATTAACGATAAACATTAATGATACTATTTCAGTGTTTATCTGCGTATATTTGTATTGA
TAACTCCTTTTTCATTCCATTTTCCGTACTTTGTGTGGCAAAATTTCTGTTGTGTTATTT
TACCCATGTACTGTTCAGTATAGTAATGATGCCATCTATCTAAGTGTTTGTGCAATAACA
TATATGCACTCAACACAATAACATTCCTATTTTTCATGCTGACATCAGATGTTATTGCCA
GAAGAGTGCAACAAATGCAACTTACAGTATCACCTTTCACATATAAATTAATATGTTGAT
GACTTGATTTTTTTCTTTTTTTGAGAAAATGTAAAAGACTTTGCGTTTCATTTCATTGAA
AAGATGGGAAGTACAATCCTCCTAAGAGGCTGGTTATACATGTACATCCCAGGATGTGGG
CAGGACAACCCGTAGTCCTTGTGCCCCCAGCGAGTGCCCAACACTTGACCTCATCTCTGA
TCTGGCAGAGGGCTAAGGAACTGACTTGATTATTTTATCCAACCATACAGTCGTAATGCA
AATTAAGCGTGTCTACGCATTTTATTTTATTTGCATTAGCGCATTATTTTTGTCTCTTAG
TTGATTTGAATATACTCCAGCCATTTCTCTATATTGATGTATTGGAGTTTGAACATTGCA
GAAAGCTAATTTGGTATTTGGTTCGTGTACAGGTCGCAGTTTTATTCTCGGACTGGTGTC
ACATATGTGATCATCCAACTTTGGGTGATTCAGCATATAGTCATTACATTGTGCAGTTGC
AACAACATGGCTTGCTCAAGGGAGATGATTTGACTGACCGCTTCTTCCATACTCTCACGG
TGATTCTTCTACCCAGTATCAAGTTTATACTGATCTCCATGATACGTGAGGTCTAATACT
TAAAGTAACGCAGGAACTTGCGGTCACACATGCTGTTGTCTCTGAGCAAGTTATCGCTCC
TGGTGGGATGTCTCAGCAGTCGGCCCAACAACTCCAGATTTCATATTTCTCAGTTGATTC
ATACTCAAAGCTTGTGACTTTAATGTTCAAGGTATGTTTAATGTTTTTCTTCCAAGGAAG
GCTTGTTTTATTGCATTAATCATGCAAAAAATGATGCATAGTATTTCCTTGAACTCCAAT
TATCTCTCGTCAATAATCAATTGTAGGCCTTGCCAAGGCTTTGTGCGAGTCCTTTTGGTG
TTCATCGCAGTCGCAATGTTTGCCTAAGGAGTCGCAATGCTTGCCTAAGGAGGGCAATGT
TTAGGGGCGTGTTTGGTTGCTTGCATCGTTTTTTGCCCATTTGCATACTTGTCCTAGTTG
GGCCTGGTTGAGCATATACACGCAAAAAACCAACATCTGCATGTTGATTGGTTGCTTGCA
TGTCCTCTTCCTGCATCATAGCGACGCCTCTACGCACTGCGTTTGGTTGCTTGCATTGTA
TGTGCTCACACAAGTGCACGCTGTTTGGTTACATCCAAGACAGTAGTGTGGTAACCTCCT
CCTCGATATGGTGAGGTTACCAAAGGCACACATGAACTACTAACAAGTAAACTAGTAGCA
ACACATGAACTACTAACAAGTAAACTAGTAGCAACACAACGATCTTAAGAACAAATATAA
GTGTTAACCACGCAGAACAAGTTTTAAACCAACATAGCAAGATAAGTTCTAAACGAAACC
TAGGTCTTAACAACAGCTCAGGCGGTAGCGGCGGAGGCGTTGTCGTGCTCCTTGCACTTG
GTGGCCACCTCCATGCCCTCGTCGTCGAAGACGATCACCTTCATGGTGTCGGGGGTCAAC
AACTTGAACGTCAGCATGTACCCGATCATGATATGGTGAACGGTGACGAAGGTGTCCCAA
CCCTGATCAAGGGTGACCCTGCCGTTCATCAACCTCACCGTCACCCTCCATGCGCAGCCG
GTGTTCGTCTTCAGCTTGAACTCTGCAGGGATGGCGGGGAAGGGCTTCGTGAAGTCCACG
GGCAATGGTG