Map Locations of contig_52681 (11899 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_52681

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_67180 3 1371 bp AK369669 Available Available None





CDS Structure of MLOC_67180






Contig Sequence (11899 bp)

>contig_52681 11899 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCTCCTGGAGGCCGACGGGCCCTCTTTGGCCGCCCACAAGCCGACGGGTGGGGTTTTCGG
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GAAAGTGCTCTTCTACACCTGAGCTCAAATGAGCTTGGGTAAACAGTAAATTTATAAAAT
AATTAAAAAATGTTCAAAAAATCTGAATTATTTTTACAGCAAATTTTGACAAATGTTTTA
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TAGTGCTTCAAACTATTTTTGAAAGTAGCATTTTAGAGTTTTGAATTTTTTTTGCCACGA
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TTGGTATATTTTCAATTGTTGCATGCACATTAATAGGGAGAAAATTACTCGGTACTTATA
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ATTGTATCGGCCGTATAGCAGCTCTGCTAAAAATATCTTTCGTGGCTCCCACATTTGTTT
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GTATCCTTGGCACACTTTCAATTTTGTAGCTGTGCGATTAACTGGCAGGAATAAAAATAA
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GAACCAGCAGCAACCGGGTGCCCCCCGTACAGGCACCGATAAATAGCGTGTTCCCGGAGG
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CTACTCCACACGACGCAGGTGCGGCAATCTCTGCCAGATTCGTTCGGGTTCGCGCGGCAC
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TGCCGTTTCTTGCTGATGATGAACTGCGGCTGAACCGCCGTCGTCGACGGGGATCGTTCG
GAGCCGCGTGCGCCGTTGGAGGTCCGGTTTTTTTGGGGGCTATGTTCTGTTCGTCGTAGG
CTGGGTTCGTTTGGATTTGCACCGCGTCGTTTTAAATCCCGTTTGGATCTGAGGGAAACG
CGAGGCTTACTGACGATTTGTGTGTTGGAAGAACGCGGCTTTTTTCAGATTGAATCTCTT
GTGCTCGTGGACTCATGCATATCTTGCCTTGCTTCTTCTTCTCTGCTCTACTACTTCAGT
TCGGTACTTTCAGTTTGGTACTTTGGTATTCCGGTACCGTCTTCCTTTAAGCCCGGATGA
AACGCTCCTGCGTTTTCAATGCTCCTCAAGTTCCACGCTTCCAAATCTTCTCTTTTGTAG
GCTTGTTGTCTGCTTGTTTGTGTGCTTGCAAAACAGTTAGTGTGTTACTCACAAGATCCA
TTAGTTTTGTCCATCCCGTTGGCTGTTTGTGCTTATTACTGTGATTTCTCAAGGTAAGAA
GAGAAGAGATGGTGCACAAGGAGCTACAGCAGGCATGGTGGTTCGACAGCCACAACCTCG
CGAGGACGTCCCCATGGCTCGGCAGCACCCTTTCAGGTTTGCCTCTCGCTCATGTTTGTA
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CTGCATCCAACCATCTCTCTTACAGAGCTGTCCACCTTTCTTCTGGCCAACGGTCATGCT
CTCCTTTCCGTCTAGAGATTTCACCAACGTTCATGGCTCCAAAGTTTCATCTTGATCAAT
TCATATGCTTAGCTTCTCTTTTAGATAATAATGGCCTCTGTCTGCATCGTTACAGACTTC
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CCTGGTTATTCTCTACTTTATTAGGAATCTTGTACGTACTACAGCACGGACCACTTTTCC
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GGATGACAAGACCAAGCAAATGCTCAAGCTGATCGACCAAGATGCGGACTCCTTCGCTCA
GCGCGCTGAAATGTACTACAAGAAGCGCCCCGTCCTGGTGGACATGCTCGGCGAGCTGTA
CCGCACGCACCGCTCGCTGGCCGAGCAGTATGACCTGCTGAAGCATGGCAGCGGCACATG
CCGGTCCAAGTTCAATCCATCTCCCTGCACCAAGAGCTGGTCTCCAGGGTCCATGGATGG
CAAGGCAACCAAGAGCTGGTCGTCAGGATCCATGGATGGCAAGACAGCAAGAAGCTCTTC
CTCCAACTCACTGTGCTCGGACTCGTATGACTCCGAGTCTGAAGTCGATGACCCTGAAGA
AGAGCATGTTGAAAAGGTTTCTGACGCTGAAGCAGAGGCAGCGGCAAAGCAGGACCGGCT
TGACCAAGAAGCAGAGTTTATGCGCGCCGAGATCAAGAGGCTCAGCGAGCAGACTTCGGA
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CGAGGAGAAGAGGGAGGTCATCAGGCAGCTCGCGTCGTCCATCGACATGGTGAAGCAGGA
GAACTGCACCCTGCGCGAGCTCCTCAAGAGCCCCAACCCCAAGCACCACCCCGCCGCGGA
GGCCCAGCCCCGCGGTTTCGATTTCAGGAAGCTGACCAAGGATCTGTTCTCGGCAAAGCT
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GGCAGAATCATCCAACATGATGAAGAGAGAGAGGAAGTGGCATGATGCGATCTCTCCATC
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CTTTTGTCCCCCGTTTGTTTCTATCCTTGTTCGGGCTTAGCCAGTAGAGAGGATTTTTAA
CGATGTTGCTGCTATAGCCATGCTTTATCTGTACTTAGTAAGTACTAGTAGAATAGCCAT
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CAGCGGTACTGTGCGATGCTGCCTCCACTAGAATATTTGCTGTTGCTGAAACTACTTTAG
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GCGATTAAGGCTGGGAGGCGTCATGGGAGGAAGAAGATGAACAAAGTGGCGTGATGCTTG
CCGTTGGATGAAGATCTGACGGCCAAATAATAGCCATATGGTTTGAATAATCGCTTACCT
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TTGAAGAACCCGCATTCAATTGGGGTCTCCAACTAAAATTGGGTCACCTGATTTTAATCA
CGTCAACAATTTCTTATGAAGATGGAATTGGGTCACTCATCTACCTGTGCAATACATTAT
GCTTCCTAAGGTTAGAAGCCTCATAATCATTTGAGATTTTTAATTTAAAATCTAACCACT
CGATTTTGATCAGGTCAACTTATTTCTTAATAAACCCTCTCATTCTATTTTTTTAATTCG
CTACACACTTTAAATTTGAAGCTCCTCATTTGATTGAGGTACTCAATTTTGAATTTAGTT
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AATGTTTCACATCTCTTTACCGTTGACATTTTTCAAGTGACTCTTCTTCAATGTTGGATA
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GGTTTCGACTTTTTGTGTTGGATTGGGCGACAGTAGAATGGTAGTGCAAGCGGTAGTACT
GCTTATTGAAAATGCGTTATATCGACTAGTGGGGGTGAATGGGTGATTTTTATGAATTCG
TCATCGAGGAATTTCCTTGTGAGGAAATTGCTTAGTCATGAACAGCGTGCAACAGATGAA
GTACTCATGCGTAAGCAAAACACACCAAAAGCATAGTCATCATGATGAAATGAAACATGC
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GAGATGAGGAAATTGTGAAATTCTTTAGTCAAATTCTTCAAACAATAACAATCAATTTCA
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CAATGATTTGATGACCTAGTTCCAACTGCTATGACACTCGTATGTCTGGTTTGGAGCGGC
TTGGCATTTAAACCAAAGGACACACAATCCCAGGACACCAAGTCCTTACGTATTCTCCTT
GAGCTAAGGACACACAGTCCTCATCCAACACTCGTGGTAAGTTTCACGGTAGACTTCCAA
ACCCTCACAAACTTGGTGACCCGACAATCCACAATTTACTGCTGGATGCTCTAGACCAGT
GACGTCTAGTCGTCTAGAAGATGCACAATATTCAAATGTAACAAGCATCGGTTCAACACA
TGAACAATCTATTCACTTATGTTCAATCACTTTGGATTTTGGGTTTTGGTTTGGGTGTTT
GGGGGTTTTCCTCACTTTTGATTTTCTCTCAAAGTCTTCGAGGNNNNNNNNNNNNNNAAA
TGACAAGTGTTAGTTTCTCTCACGGAGTAGCCAACGAGATAGTGGTTAGGGGGGGGCGAC
TATTTTATAGCCTGGGAGCAATCCCGACATGATTTGGACATAAATGCCCTAATGATATGA
CTATTATGTGGATAAGGTTTGGGGACAGCTGGCGTGCGATGCAACAACAAACCATGTCAG
GGGCATCATCACCAAAGGTACGGCTACAGTGCTGCAGGTATCGCTGGCCAGACCGAGCGA
GTCTACAATGGAGGGGACGTTCCACCGATCATCGCCGACTGCGACCAGCCGACATGGCAC
AGTGACGAGCACACCCCCGCCCACTCCATTACCTGCCCCGACGTGGGCAACGGTGCAACC
GGTCGTACGATGACCGAAGCGACTACGCAAGGCGACGCGCATAACACGGTGCACGTCACT
ACGTAGCAAGCACGCACCAATGGTGGCGCCCGGTCGGTGGGCCCCAACGCCAGGCAGGAC
CCAGCAGTCGGCGGCCCCCACTTACGACAAGACTTCCCCAGCCGGTGAGACCCTTGGTCG
GCTCCATAGGATGTCAGTCGGATCCCGCCCGGTACCTTATATTCCTATTGTAAGCCACGA
GCTGGCCTATAAAACCCTGTAGCACCCCCCATGCATGGGTCGGTCGATCACACACTCACA
CACACATATGAGGGGAAAAGAGAGCTCTCATCTCCTTCTTCCTCCTCCAACATACATCTC
AAGGAGCATATGGTGTCTCCAGCCGGATCATCAACTGACTCAAGCAGGACTAGGGGTGTT
GCCTCCCACGGAGGGCCCCGAATATGGGTACTTCGTGTGTCTCGCACCGCTCGTTCCCAA
TCTCGTTTCCGGAACCCGACGTCGTCCTTTTGATCCCAATAACGTACGATTAGCCACCCC
TTGGCATCCGTCGTGAGAAAACAACGACAACAGGGTTGAAAAAATTTGATGAAAGGACGT
GGGTGAGAGGATAGCTAGCGTTCGGAGGGGAGATAGAAGGAGATCTAATCATCACGACGA
CAACACATCTCCTTTAATAATAGAGATTAGAACATCTCCAACAACACGTCTAAATTTAGA
TCTTTATATATCCATATAGACAATGGTTTATAAAGATTCTCTGATATACACGTTCAGTTT
TACATCAGAAAGTCTATATAGAGAACATCTATATTATCTCTCCTATATATTAATATTATT
TTATAACTACCATTCTATATCCTCTAAGTGGACCATCCTCCAACTGGACCATTAGTTCAT
CATCTTTAGTAGACCAATTCGGTCCTTTACTGGATTTTGCTTTGACAGGATGGGTAACTC
TTTCTGGCGCACGTGGGCAACATCTCTCAGGCGGGGTGGGTAACTCTTTCAGGCGCAAGT
GGGTAACTCTTCCAGTGAGATTCATTGAGATCCATGTGTAAAAAACTTAAGACATTCACT
GCACATTCACACATTCATTGATATTCACGCATAAAAGGTAGCCATCCTCCATCACAGCAG
CACGAGGCGACGATCGGTGCATCGCCCCGGGGCGGCGTCGACGCCATCGACCAGCAGGGC
GGCGCCTCGCGGCACCCGGCGCCGCGGCGGCGCATCCGCCCTCCCCTGCCCTCAGTGAGC
GCAACGACGACGGTGTCCCCCCGCCCCCCCCCCGCCCTGGGGGGGCCGCCCCCGCCCTCG
GGGGGGGGGGGGGGGTGGG