Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_52613 (6817 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_52613

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_67138 1 1225 bp MLOC_67138.1 Available Available LOC_Os04g32050.1, FRAME:-2, EVALUE:0.0, 13104.m03065 protein transposon protein, putative, unclassified, expressed
MLOC_67137 4 3183 bp AK249923.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_67138






CDS Structure of MLOC_67137






Contig Sequence (6817 bp)

>contig_52613 6817 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCGCCGCGCTCGCGCCCCCGTCGCCTCCGCCCTCCCTCCCCCCCTCCTCGTCGCCGGCC
AGCCAGGTACGCAGCCCCGCCGCCCGCCCTTCCGCCGCCCGCCCTTCCGCCGCCGGTGGT
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AAGAATTCCAGATAGAGAAAAGGCTTCATTGAAGCTGTACGGACGTGGAGTGGCCGACGC
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GACGACCCCATGTCAATGTCCGCCAGGCGTTATTGGCAACAATGATGGACGTGGAGTGGC
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CTGGCCACTAGGAGAAGAATTCGTGTTACTGATGCCGTTGAGTCGATCGCGACGTCCCCA
TGTCTATGTCCGTGCAATGTCGAACTTGAAGCAGTAATGTATAGTATAATTTGGTCAAAA
TTGGACCAGTCAAAGCTCAAGGGGCGACCCTTGGCTATGACAAAATATATTCAGGTGGGA
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TCCTAAAGTAGCATTAATTATGATATACTTAGTGCTAGGTACACATCCCCGTTTCATAAT
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TGGTAGCTCCCTTGTAATGCTAGGAACAAAAGGTAAATTCCCACAAAAATACAGTTTAGG
GTTTATCAAAAGAGATAATAAAGAATTGATGAATCCATACTTTGTAATATGGGCAACTAC
AATCCATGGATGTAAGATCAATGATTCCATGCTCAAGTTTAAACTGACACCAAAGGTTCA
AGTAGAACCAGACAAAGACATAATGGAGAGAAACATAGCCAAGAGTCTTAGAATTTCTTT
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ATGGCATGTATTAAAGGAGGGAGATAATGGCTACTAGGTTGGAGATGAGTGAAAGCCGGT
GGGGAGGGAGTAGACAAGGCATGCATCACCGGGGATGGGAGAAAAATCTACATTAAACAT
AGGGACAAGCTCTTAATTACAATAAGTGGGACTTATTGACATGGATCAATGAATGAGTTG
CTGATATGGCATGCCTGCACGGATAGGGAAAATACTTGTGGGCTGTACCTACATAGGAAC
AGAGGACTTTGGACACTTGAACATACACATGTAGTATGTGCCCAATGATTTTGTGAGAAA
TTGGTTTCCCATTAACGTCAACCTCAAAGTTTTATGTTACATGTTACATATGCTTATTGT
TTTTAAAATATTGATCAAGAACACTCTTTGCTTTTGTGTTAGTTTTAGTTATTTTTAGCA
TACATTATACATTTATTCTAACAAGGTTTTCACAACAACATTATTCTTATTTTCCTGGAC
GGCGAGAATTTACTAGCGCAATTATCTAGTTCGAGAAATAGCTGGATATGCAAGCATACT
CTGACAAAGAATACCAAAGAACACACACACATAATGAAAATAGCTTGTTGTATTTCCGTG
GTAATTTACACGAGTGTGAAATGTGTTCTATTGTGGTACTATCACATAAAACAAACAAAT
TTCCTCTATCATCAGCCATAAGTGAAAGATGGCTTGAAGTACATGCACATCGGTGGGTCG
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CCAGAAGCAACCGCACCAGCAAACTCCTCAGACTCCTTACGATTCACCCTCTCCCAGACA
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ATAGCCATGGCCATCGGGAGCGGGATGAAATTGGACACACAATTTGGGGTGACGTCCCGC
ATGAGCTTGATTGCTATGGCTGCAAAGAAGAAGAAAGAGCATATTGCTAGGCAATGTTGT
GGTAACACTGAAAATCCTTCGACACCGATGATTGACATCTCACGAAAGATTATTGCATAT
GGAGCTTTGAACATGCCATTAGGATTGCCAACATCGAAGGATGTCCAGTAAAGCCAAAAG
GTTAGAGGAGCAATGACACATCCAAGGGCAGTCCCAATCATCTGTGACACAAACATGGAC
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TCTGTTAGTCCAGTGCCGTATGAGTTGCAGAAGGCAAGTAGAGGAGCAAACACATAAGCT
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GCTGCAAGGCCCACATAACCAGATCTTGCCAACCAGGAAGGGATACTGTCTGTTAGAAAG
ACCTCATTTAGAAGCTTTTCCTTGACTGATACTTTGGAAAGTTTATCATCTGCAATTATA
AAAGGGAAACAAGATGAGAGCCACGATATATGATATGTTGTTAGGTCAATTGGGTACAAT
ATTAAAATGTCATTACCATCCTGAACCCATATAAGGGGAAGTCTTTCTTGCTTTGCTCGT
GCATTCCGTATTTTCTTGATAGTAGCATAAATGATTTTGATGAGGTTATAAATACCGTCA
CCAAGTATCAAGGATATGGATATGAAAACCTGGAAGGGTGAATACACAACTTAGTTTTTT
GCCAAACATAATGTTGGCAAAGGCTGGTCGTGAAGTGAACATAGAATAATTTAGGAAGCT
AATGACCAGATGAGCCATATATATATATATATATATA