| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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No map location |
Predicted Genes from contig_52608
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_67129 |
1 |
503 bp |
AK250137.1 |
Not available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_67129
Contig Sequence (8230 bp)
>contig_52608 8230 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AAGGACTAAAGGGCCAACTATAGCTGTCGGAGTCAGGAGTTATCCCTAAACCGACGGCGA
CTGGAGTCGAATCTACAAGCGACGATTGGATTCCCCTATCACCGTCCGTTGGCGTTGCCT
GCAAGGAGATCCCATCGCTCCGCACCCTAGCGAACGACATCACACGACGAGTCGACATGC
TCGTCAAGGTCAACGTCGTGCGCTGGAGTGCTTCGCTTGACCTTTCTGTCATGTACGCTC
CCGTCTCTTTCGTCCACGGGAACTTCCCCGCCGCTGCCTGGAATGGTTAGGGTTAGGGAG
AAAGGAGCACGACTGCATTGTTCGGAGCAGATTTTTTTCCAACGCTATTTTGTCTCGACG
GCTTCGCTAGATGGGCTGCCTGGCCCAATTAACCATAATGGTCCAAAAAAGCTATGGGAA
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GGTGCATTCAACGGCAAAAAACAGTGGAATCTTAAAAACGAATGGTTCAGACATTTGATG
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GCTATGCGGATTTAGGGAAACTGCTAGAGTTGTTGTAGCAAAGGTGCTTGGAACTATATG
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GTAGCACTTGATGTCCACTAAAAAAAGGTAGTACTTGATGTATAATTGCTACTACAAGTT
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AGCTGAGGATAATCCTTGATGAAGAGTAGTTTTAATTATTTCAGTATCTTTTGTGATTTT
TTAAACTCTGAAGTTTATGAGTATGTTTAGTTGATCAGTACTAAGTTGTAAACTCTAAAG
TTTACGAGTATGTTTAATTGATCAATACCTTTTGTGAAGTTTAAATTCTTAGTCTCTGAA
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TAACATGTAATATACTATTGGCATCGTCTTCAATCCCACCACTATTTTTTAATTGTGGCG
GGATATTGATGGCGTCGGGTATTCACGCCAGCAAGGCTATTTTTTGTCACATCATAGCTA
GAATTTTCTGCAGTAGTGTGAGGTTGATCAAACCATAGATGATGCTTGGGAGATAGATTA
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TTACTTACACGCATACTACAATGCCATACCTGTTGTGACGCCTCCGTTTATAATCGTTTA
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TATTGTGAACCCGACACACAACCGAAGCTGCTCCACCTCTCCATTCCCGCATATACATGA
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GTTTGTATTCCTCCAATGTTATGTGGTTTGCCTTCTTGTAATATCTCCAACTTTGCAATG
AATCTTGTGGTAAACGAGCGCAAAGATTTAGGACTTTGGAATATGCCTTCATGTATGCTT
TTCTCCTAGTTCTCCAAATGGCCCAAAGTGTGTCAGTGAGCTTCACGAACAAGTCATGCG
ATAAATGCTTCCTTATGGAAGAACAACAAATGTTTGGCACTCGGTTCTGCATTAGCTATC
AAGCTCTGACCCACATCTTGGTCAACCAAAGCCCATGTGCATCATGCCATGGTGCACTCA
AGTAAAGAGTGGCGCCATGAATCCGCTGCTCCACAAAGACCGCATGCTCGAGACGTGGCC
ATGTGTTGGTGAGCCCTCACATCCTCAGTTGGGAGAGAGTGTTTTGAAAGTCGCCAAACA
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CTTGTACCGCTCGGAGATCCGACCGATCCCTTTAGCTATGCTTCATGGCGTTTCTTGGTC
GCCACCAACATGTTATCTGCTGATCTAACGGTAAACCGGCCATTCCATTCGAAGTGCCAC
AACCATACATCCTCGATATTTCTCGCGCGGGGGAATCTTGGCTATGATCGCCGCATCAAA
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TTCAGAGACGAACGTTCGGGGGTTCTGCACTAAGAAACTATAGGGTGGCATCATCTCATC
TCTCGGAAGCCAATTCCATGACCATATTCTCGTTGTCTCAGCATTGCCAATCCGTTTAAT
GAGACCTTGTCTCAATGTATCCCGCCCCTTCTATAATTGGTCTCCAGGCTAGGATGATTG
ACGAAAGTTGCATGAAGAATTGATGATTGTGGGTAGTAGACACTCTTTAGGATTCAAGCA
CTTAAGGACCGAGGATTTTGAAGCATGCACCACGTTTGTCTTGCCAACAATGCAAGGTTG
AACAACTCAATGTCCTTGAAATCCAAGCCCCCATTGTTTTTGTTTGCGTCATATCCTTCC
ATGAGACTCAATGAGGCTTCCTTTGGCTATTTTGGTCCCCCCAACAGAATTTCCTGATTA
GCATGTTCACATGTTCACACAATCCCCTCGGAAGTTTAAAGCAAGACATTGAATACACCG
GAACTGCCTAAGCAACCGACTTGACTAACACTTCTTTGCCTGATGTAGAGAGAGTTTGTT
CCATCTATCCCGGAATCCTGCTCCACAATAGGTCCTTCAAATATTTGAAGGCCCATTCTT
TGAATTTTCGATGTTAGAGGGTATTCCCAAATATTTCTCATTCACTATCTCACTGGGCAC
ATTGAGCATGCAGTTTATTTCATTATCTCGGTCAGTGCATGTGTTAGTTAAGTTGCATGC
TTTCGTATGGGGCTTTTATGTTTTTGGTGGACAAATGAGACAAATGGAAATTCCAATGGG
CTCATGCTAATTTTGCGAATAACCATAGCATGCTGACCACCCTGGTGGTCATTAATGGCA
TATATCACCTTGCATCCAGAAGCTATTCTAAAATGATGAAGGAGAAGATCAGTTTTTTTA
GGGGCAGGAGAAGATATTTTTTTTTCAGCAGTAGGAGAAGATCATTTTTTTTATTTTAGA
AAAAGGAGAAGACCAGAAGCTATTCTAAAATGACGAATTTTATTTTCAATTTTGATGAAC
ATTTTTCAGATTGGACGAACTTTTTTCAAGATCAATGATTTTTGTTTTCACATTTGATGA
TTTTTTTTCCAAATTCGATGAACTTTTTCAGCCTTGATGAACTCTTTTCAAAATCAATGA
AGTTTTTTTTCAAATTTGATGAATTGTTTTCATATCCGATGAACTTGTTTTCAAATCCTA
TGATCGGTTTTCAATTCCGATGAACTTTTTTCAGATTTGATTTACTTTTTTTTTCAAATC
CGATGAACTTTTCCATATCTGATGAACTTTTTTGAAAAATTCGTGATCTTTTCTTCAAAA
TCCGTGAAATTTTCAAATTCACAATTTTCCCCCTTAATTACGAGTTTTTTTATTTTCTTT
CATACTATTAGTCAACGACTGACTGAAACGAGCCCGCCACCAGTCACTGGTCTAGGAGCG
CCTGCGTATATGGGCCGGGACACTAGCAGAGGTGCGTGGGCGCCAGCAAGCGAAACTGGC
GCCTGCAGTGCCAGTTAGGAGGTCCCATTTGCCCGGGCCTTCAGTCGACGCAGCCAGCTA
CTCCCGGGCCGTGGTTGCGTGCCGCCCATTCTGCACCACACGCATCTGGGCCAGGACAGC
GGCAGTTGAAGTATATCGGCAATCCTCCCTCTCCACCCCTTGTCCCCGTCCCCGTCCCCT
AAACCCGAAGCCCTCTTCTCCGCCGCCGCTTCCTCATCTCATCCTCCCCGCCGGATCGGG
ACGCGGAACGCGAAGCCCCAAGGTGAGACCCCCGCTCCTCCGATTGCTTCTCCCCGGAGC
CCGCCGCCGCGTCCGCTGCCAGCTAGCTGCCACCCAGTCGAGCGGCTTCACTGGGTTATC
TAGGCTCTGGTTCGCCGGATTCGTGGTCGTCAGGGACGTGCGCGCATCATTCCCGCGGTA
GATCTGCCGCTCCGTTCGCCCCGCTCGGTTGCTCCGGAAGCGATCCGTTCCGGCGTAGTT
GGATCGATGCCCCTCGTTCCTCCCCCTGCGTGCGTGCGCCAGTTACCTGTGGTCGCTTAG
GTGGTAGGCGCCCGTGGTTTCCGTCGTTGCGGTGCGGTCGACGCCGGTCTATGTTTTTTT
TTTGTTCGGGTTCGTGTTCTGTTATCTTCTACTTTTGGCTGCTTTGCTTGGCTGCTCGGC
CATTGGATTCGTTGGAACTCGTTCGAGCTGCAGAGTTCTGCTTGCTCGATTTGCTGCCTG
TCGTAGTCTGGTCGATTTTTTTTTCTGCCATCATGTTCAGCGTGGAGAAAATGGAGGGAG
ATGCATGTCACTGTCTCGCATGCTTAATCTAATTTAATTTAATGTGTAAAAGGGAAGATG
CCTATGTCGCTGTGCTTTACTACTACTCTTATGTAATTTTAGTTCAGTCGTTCTGCATGA
ATTTTTCTCTGATCTGAACTATTATAGGCGTTCTGCATGAGTTTTTCTCTGATCTGAACT
ATTATATGTGGGCATCTTCTGCATTTTTCTCTGTGCTCATCATGTATGATTTGTTTTTTC
CCAATGCTACCCCTGTATTAGTTTCTCTCTGACCTGACCATTATCCGTCTTGTTTTGGGG
CTCTACTTCTACAGTGCTTTGCAATTCATACATTGCTTGGAAAAGAAATTGTTACATGGT
TGCTTGGTTCCCTGTCTAATCAGGCGTCAAGCTATGCTTTTTGAGTTGTACCAGCTTTTG
TGCTTGCGTACTGATTATAGTTATGTGGTAATAATGAAATTTAAATTACATGACTTACTG
GTCACTTAATGGTCAGCAGATACATGCTTGCTTATTCATGTACAGATCACTTAATAGTAT
ATATACTTATTAAGCCTTTCTAACTTGATTAGACCAATTCCTGTCAAGTTTTACTAGTAT
TCACCTCTTGGTTAGTTGTACACATCTGGAAGTTTTTGGTTTAATTTGTGAAATCCATAC
ATGTTTGTTCCTCATAGTTGTGCAGCACCTTCAATACTGGAGGACCAGCTTTTGCAAGGA
CACTTTTCATAGTTGATTGCTTTTCTTGCCGTGATTTTTTTTTTGCATTACCTGTTTGTT
CTGGATTGTTTTTTTCTTCAATATTAAGCATTTTTAGTAGACAATTGTGGTTACAGTTAC
TTCAACATTATCATTATATTACAGTGCTGGACATTTACGTTTAGTAGTTCACATCTGATT
CTTGTTCATTTCTCATAACTTTGCCGTTCTCTGGACAGGAACTTAAATTCTCGGTGTGAT
ATTCAAAGGCAGTCACGATGGTGAAGTTTACTGCAGAGGAGCTCCGTGGAATTATGGACA
AAAAGAACAATATCCGTAACATGTCTGTTATTGCTCATGTCGACCATGGTATGTGCCTGA
ACAGTGAACAGTGGTTTCTGACTGCTGGGTTAATCTAGAAACTCGTTGATCATCGTTTTT
ATTGTCTGTTCTTAATGCTGTAAACTGTTTATTTCAATAAATTGGTTTAATTAGCTGTTC
AGATTTGTTTTAATTAATTAGTTCCATCTCGCGTGTCGTAGAGTTTCAGTTAACTCATTG
TCCCAGGACTCAAAATAATTAGTAACCTTAAAATGTACTCCCACGCGTGTCGTAGAGTTT
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GGCTGTATTTGTTACAATTTATAAGCTCAGCAATTTGCACCATTGTGCTTAATAACTTTG
ATTTGATGATCTCATACATGTGCTGTTTTTCTTGCTTTGTCCCAGTAGATTGTGTTTAGC
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GTACTGTGCTGTTGTGTACTACTTAATTCTTAAAAACTTAATATATTCAATTCCCAGTTC
TTATGAATTGTGTTCTACTGTTCAAACTTGATCCTTTTTGTTGGCAGAATACTAAAATTG
TGCATTGTCCTTGTATTTTTTACATGTGTACAGGCAAGTCTACGCTTACGGATTCCCTTG
TGGCAGCTGCTGGGATTATTGCCCAGGAAGTAGCTGGTGATGTTCGCATGACTGATACGC
GTGCAGACGAGGCAGAACGTGGTATTACAATCAAATCCACGGGCATCTCTCTTTTCTATC
AGATGACTCC
