Map Locations of contig_52504 (6604 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map locationNo map location




Predicted Genes from contig_52504

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_67061 1 677 bp MLOC_67061.1 Available Available LOC_Os03g59440.1, FRAME:+2, EVALUE:5e-51, 13103.m06525 protein dirigent, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_67061






Contig Sequence (6604 bp)

>contig_52504 6604 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TATATATATATATATGATTCTCATAAGATCTAGATCTAGCAGAAGCGTTTGTTTCTGTCA
AATTCAGGAACTAACATGAAGATTAGTCACGGTCAAAAGACAAACGGGGCGGGGAAGTTG
AGGTGGGAGGAGGAGAAAGACTAATTAGTCTGTGAGACGAGGTCAATGGCAACCGACACA
TGGAACTATGAACACTATATAGATTCAGATTTAAAGGCATGCCTGGTCAAGGGATGAAAG
CGCTCCAACTTGACGCCCCCACAAGCCACAAATTAGGAGCATAAGGAAACGGAAGAAAGA
CAGAGGGAGGGGCATGGATGACCTCGTATCTTTCTTTCAATAAGACGATTTGTCCAACAT
CAAGAATGGTCACGTCATAGGCTCAAGATGTGGCCTCTTTTTATGCAACCTACCTCTCTC
GCATGTTGATATTTGTTGGTCGAACCAAAGGCAACGTTAGGGTTATCAACATCGAAGAAG
AACTTTGAGTCAATACCTTCAATAGAAAACAACGTGGGAACATCAACGCTAAGTGATCCA
GCCAAAAGTAAAATCATGGGTTTTCAGTTTTTACCCACAGAACACACATCGTCAAGGTCA
ACCACAAATGTCATCATCCACGTCTCTACTAGCATGCTCACATTGTCTTACGAAACAAAT
CCGACCAAAGGAGATTTTACCAAAATAGAAGACGTCATCACGTTGATGCATCACATCATT
GTCTCGTCGATGGTTGTAGTGTGCACCATGGCAACACCTCGTAGCTTCACCACCAGATGT
GCCACCTGGATGCCACAACCTTCTTGGACCCATATCCATCCAATGGTCAAGCCACATACG
ACCAACCAAGCTGATGCCTACCGGCTTGCAATGTCCTTGCTTCAAGTAGGCTATATTTAA
CCAAATATTCTATAGATGGATCATATTAATTTCTTTCCAAAGATAGGCGATACTTAAGTA
TAATCATTAATTATTTGTACATATCGACTACCAAAAGATATCCTCCTATCTATATTCATT
AATTTTCTTCCATATAACGAATACCAAAAGATATGCTCTCCCCAACTATAAATACACATA
CAAAACCTTCTCACCGATCATATTCAATTCACAATCCAAAAACCACAAGAACGCAAGATG
AGAATTCAATTCTTGCTCCTCACCATCCTCCTTCTATCTCTCCAATGCAATACTTCCCCG
GTTAGTGGAAGCAGGAAGGTGACGAACATCCGCTTCTACCTCCACAACACTCATAGCGTG
AATGATCCATCCTCGGTCCTCGTCGCCGAAAACAAGAATGCCACAACCCATGCTCGTGGT
CTAGTGCCCTTTAGCTCCGTCTACGTGTTTGACGATGTGCTCACCGAGGGGCCCGCAAGT
ACATCAAAGGTGATTGGGAATGCACAGGGCATGTATGTTGAAACGGGGAAAGATGGGTAC
ACGATCTTGGAAACTATTGATTGTGAGATGACAGATGGTCCGTTCAAAGGTAGCTCGTTT
GTGATGTTCTCAAGAAACCAATTCAGTAATCCAAGCAGAGAGCTCCCCGTTATTGGAGGT
CGTGGTGCATTTCAAATGGCCCAAGGGTACGGCTTGCTCAGGACCGTATGCATAAACTGT
ATTAACTCCGTGAACCCGTCCAAGGGAGATATCATCGAGTATAATGTGACTCTCTACCTC
CATTGAGTTTATATATTGTTGTCATGGGTTTCTTGTACCGGTAATAATAATAATGGATGA
TTGATGTTTCTAGTTATTGTGCTTTGTGAAATTCCCGCTCAAATTATGATGTGAAGCTTG
CAGTCCAGTAGTTTGCCAATAATTATCATGCACTACTATTTCTAGTCCTAGAATAGCACT
ACAAGTCCCAAATCATTTGCTTACTTTCCGACCTTTATACACCTTTCATTTCATTTCAAA
TTAGCAGCCAGCAGAACGAGCATGCTGCAATAATAATAAATATAAAACTGAAAAGTGTAC
GCCAAGACTTGATGAAGCACACCTTCACCGCACATGACAACAATAACAATAAATTAGGGC
GGTATTATGCATTTCAAAAATAATATGCTTTTGGTTCATTCCAGCGAACAAACTGAAGCA
ATCAGCACTTTACCTCAATAGTATACAATCTGTAAGCGAGCATGCAGGATTAAGAATCAC
ACATATGAGCTAATTGTTGATCTTTAGGTACATCAAAGTGAAGAAAGGAGAAAGAAAACA
CAATTAGGTCGTCGGAAAGTAAACAACATAAACCACATAACGGATCTGGATCATGCATGT
ATGAACCATTTCAAAATCTACATACAAAAAACCAGAGCAAGTAAACTACACATATTTTTC
TTTTTTTAGGCAACATGTACTTGTAACTTCTAGTCCCTCCGTAAACTAATATAAAAGCAT
TTAGATTACTATTCTAGTTATCTAAACACTCTTATATTAGTTTACAGAGGGAGTACATAA
AATTCAAGGGCTCCTGCATATCTTGCATTAAGCGAGACGGAAGCACCTCTCGCGTTAAGG
CTATATATAGTATCAGGTCGACCCACTAGATTATATTTTACAAAAAATGAAGTTAAGAAA
AGGAACGCGGACCTCCTTGTTGCATCGCGACACTGTTAGCCGCTATGCTGACTTTGAGTT
CATGTACTATTACTAGGATGCGACCTACTAGAAGGAAAATAACCGGTGTTTACACATTAT
TTATTTATTTGTTTCTTCGACTTTTGTTTCCTTCTTGGTTTTCAATGCGTTTTTTTTTCT
TTCTCCATTTTTTCTGCTTCATCATGTTTTCTTTGGTTTCTTTTTTTCTTCTTTGTTTTT
TCATTCTTTTTCCATTTGTTTCTTTGGTTTTATTTTTCATTTCCGTTTTCCTTTGGTTTA
TTCCATTTCTTATTTGATTATACTTTTTTTAGTTTTTGTTTGTTTCTTTTGGTTTTCATT
CTACATTTATTTATATTTCACCAAAAAAAATCGAATACACATTTAACTTTTTTGAAATAC
AATTTAACATTTTTTAATACATAGTCAACATATTTTCTATACACATTTAAAAAATGCTTG
ATTAACGTTTTTCAAGCACAAGATAAACAATTTTTTAATGCATGGTAAATATTTTTCTAT
GCGCACTCTAACCTTTTTGAAATGATTGATAACATTTTTCAAATACAAGAATAGCATTTT
AGCAATACATGGTCAACTTTTTTTCTATTTCTATTTATTATTTTCAGATGCTTGATCAAC
ATTTTTAAATGCAATATTTACATTTTCTGAACACATGGTCAACATGTTTTTGTAAACACA
TTTAACGTTGATTAATATTTTTCCATATACTTGTTCAATTTTTTTGGAATGCTCGATTGA
CATTTTTATATACATGATCAAAAACTTCATCATGTTTTTAATACATCATCAACATTTTTT
CTATGCACGTTTAAAATTTTAAAACTACTTGTTCAACATTTTTTTCAAATGCTTGATTAA
CTTTTTATGTACATGATCAACTTTGTTCATCATTTTTTAATACATGGTCAACACTTTTTC
TATACACATTTAATATTTTTCAAATGTTTGATTAACATTTTGTAAACACTTGTTCAACAT
TTTTTTAAATGCTTGATTAACTTTAATTGTGTTAAACACTTGTGCAACATTAATTGTGTT
AGGTATGATTTTAATATGATACCATTGTTTAATTATGCAATAAAAAATTTATGTTTATTT
TTTTTAAATGAACTTGTGTGAAAACATTCTTTTTGGAAATGGCTAACCCCTATAAAAGGG
AGGAACTAAAGAATAATGGATTAATTTTTGAGGGATTTTCTAGAGATGCTCCAAAAACAA
ATTTTGATCCATTCACCAATTCTACTTTATTTCCTACTTTATTTCATTTTCAGCCATTGA
AACACATTTATTTCCTACTTTATTTCATTCAACGACATTTTGATACATTGGAGTACTTCA
CCAACTCTTCGCTACAAGAGCAAGACCAAAGAAAACAAGAACCACATCTAAACATTTTAA
AAGATATCCAACTTCCATAACTGCTTCCACTAGTTGGATTAATACATTTTCTGTGTCTTC
ATTGCTAATCTGCAGATGCTTAAGCTTGCACACTCTTTTTTCTTTGATTCTAAAAAAATG
GACGTTGCTTCCCCTCTAGCCTTTTCTCTAGTCTCATCTCTAGCCTCAATTCTAGCAACG
AGTGCATGAACATCTACCAAATTTCGTGCTATAAATAAATTGATGTATTCTTTTTTCTAA
CACCAAAACTTGCATCCGTACTACGCATAAGTTTGAGCAAAGAATGAGCTACCGAAATTG
CACCGAATTCGATGAACAAACGAATCAAAACAAGTACATAACACATCTTTTTTGCACTTG
AAGAACACCCATCCGAAATGTTACGGTGTGGTAGAAACTCGATGCATCACTTGCAACAGT
CGGTCGTCGCACTTTATGACTGGCAAGGCGAGCCGTTGGGCTAGCGTCGACCAGGGTGAC
GGTCGGGCGTGTCTTTGCCGACGAACTGTCGAGTGGCTAGAGGCGAAGCCGGTGTGGTAT
GGTTCCCAGCCAATCCATGATAAGGTTCAGTCGCCCGCTGTCGTAAACCCCAAATCCAGC
GACGACAATAGCATTCGTAGATCCATCGGTTGTTCGTCGGGCATAAATCCAAGTGGTAGA
GGATAACGGTGGAGCCTGCGGAAGATGGATGTGGGTGCGACTGAAAGTCCCATCCAACGT
GTTGTGTGACGGATGGATTGGTTGCTCAGATTTTAGTAGTATAGTTAGTTATATGTGGAT
TTTGGGTTTGTGTAAGTATACAAACAAGTAGCACTGCAGAATACAGTATGTGTGATTATG
AATATATACGAGAGTGTGAAATTTATAGTATTATATATTGTTATTATTGCATACTAGTTG
GCTGTCTGTGCGTTGCTACGGACAAAAAAAACAAATGAGTCAAATAATTGTTCTTATTTG
GAAGTGTATATGTGTATTCATCAATACTCCCTTCGTTCCTTTATATAAGGTGCATTTGTT
GTTTATAAAAATCTATAATATAAGGTGCATTTGTTCTAGTTTCTCATAATTCCCATCTTG
ACCCTCTAGAGAAAAAGAAAGTATATCTCTCCTGGTTGCATGTATCTCTTCTTGTAGAGA
AAAAAATGAAACTACCTCTCTTCTGATTGTATGTATCTCTTACTTTTTTAGCCTAAATAA
TTTACTTGTCGCTAATCCACAAATTAGATAGCGGTAATTTTGACCTAACTTATCTATAAT
TATATGTCTTGGTCACTATGCTGAAATTTATACACCTTATATAAAAATGAAGGGAGTGAA
ATAATAGATACCAATTCTTTGTTCGCCTATTTACTCCTCCGCAACCATCGTGTCTCTTTT
TTCTTACAACGAAATACAAAAGAAACCAAATTGCATGTGTACATACGAAGTTGAATTCAT
AAATTCCCCCCTCTTTTCATGTAATTTCAGCAAAGAAGCATTTGAATTTTCCTTAGGTTC
ATTAGTCTGCCTATCTGTAGAACCTCTTGAATCCCCTCTTCTTCGTGCAACTTTCTTCCT
GCTCTTGCTTGCTTTCCTCTCAAAGCCACTGTGAGCATCAACAACTCTAGTTAAATGGCA
CCAAGAGGGTAGTGTAAGATAAGGGAAGTGAATACTAACACGGTAAGTGCGCCACCTCCT
TTCGCATGGCCGTCCATTTTTGTAACAATTACAGCACCAACCGGAACACTTTGCCTGAAT
GCTTGGGCGTGAGCAAATGTAGCCTGACCAATGCTACCATCCATCACAAATATTACGAGG
TCCGGTTTCTGCATGATATCATGACAATGAAGGTGAGCTTTTTATTTGGTTCAGGTTACA
ACTGAAAATAAGGGTTCCGAGTTTATTACCGTTGCTTCTGAAACTTGGCGCGTCTCTTCA
AACAGAGTTGCTTCCTGTTTGTGCCTTCCACTTGTATCTACAATTATGAGATCACAATTT
TCTTTTCTAAACCTCTCCACGCCCTCAACAACAATTTTTACTGGGTCTGATTCCATGTAG
CTGCAGTGACACAACAATTAGTGAAAACAAGAGATAGCAAATCATAATATTAGCAGTCAA
AGTGGTAAAGAGGTGCTAGTGTACCTTCCATAGAAAGGAACCATGATCTTTGTCGCATTC
TGTTTTAGCTGATCAAAAGCACCAGCCCTGAATGTGTCGGCACAAACCAGTGCCGGTTTA
AATCCTATCTTTTGATGATAATGGGCATATTTCATACAAGTGGTAGTTTTTCCAGAACCT
GCATGAACAAGACGATGCCTTGTGATTTGTGAACAGTATATTATAAGAATTGCAACTAAA
GTGCAGAAGACATATAACCGATCATTAGTGAGCCAGTCAGCTAAACAACAGCAACCCCAC
ACCGAAGCCAAATAGTACGATAAGAATGTGACCTATCACTTACAACTAGCCCTTCAAATG
ACTCGCTAATTACAAACTACCCATCCAAGATGAGAAAACTTGCAATATAAAGTGTATCTT
TCTTTTAGAATAGAACAAAATTTGCAACACATCAGGTATCCACCCCAAAGGAACATAAGA
ATGG