Map Locations of contig_52484 (10701 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_52484

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_67049 1 882 bp AK249133.1 Available Available None
MLOC_67050 7 1566 bp AK375358 Available Available None





CDS Structure of MLOC_67049






CDS Structure of MLOC_67050






Contig Sequence (10701 bp)

>contig_52484 10701 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTTAGATTCTATAAGCAAAATCGTAGAATCGGAGGGGCTAGTTTGGATCGTAAAGTTGTA
AGATTCTAAGACTTGAGTCGCGATTCTGACAACTTTGCACGCAGCATACCTCATATGGAG
GCTACCAAACACAGTCTCAATCCAACATGTATGTTTAGATGTGGTCCAAAGTCTCATCTC
AACATGTTTCAGCATATACATTAGTACCAAACAACATCAAATGCATCTACTCACCATATT
TACACTCAACATTGCTTAGGAAGTTAGGAGGGAACAACCATGCTAGGGAGGAAATGCAAC
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TATCTTTTTAACTTTTAGCGACAGTTGGGGACATTGCTTTCTGGATACTACAACATATAT
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TCCATCTGTTTACAGCTACCAACTCTGCAATGAATCAAGGTACCTCCTATTGGACGCCTC
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CGAGCAAAGTGTGATGCCCTATACCGCTGTCTTCGCTCGGCCCCTAGCTAGGCTGGTAAC
AGTCATGTAAAAATGCATTTAAAAATCATGAATTCAGAAATATTCATGGATTTTGAAAAA
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AAAGAAAAATAAAGATTTGTTAAACATTGCAGGTACTTTATTTTCAGAACTCTTTACATT
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TTTCTGTTACAAAGCATTACATCACATGCCTATTACAATATGCTACAAGGAAATTCCTCC
TCGCGGTCGACGATGAAGTCCGGCCTGGGGGAACTTGAAGTTTATCCATGTAGACTTTTT
TCGACGACATTATGCTTGATGTTTTGCCATATGGTTCTCTATCAAGCAACACATCTTGTT
CATGTTCAACTTCATTTATCTTATATGGTGTAAATGAAGGTTGATTTTGGCTAGGCTTGA
TTTGGCCCCATGTTTGGATGGATAGGATCTAAGCATGTATTTTCAGTATTTATAACTCAT
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ATGTGACAGCTAATTAACGAGGAGAGAGATAAATTGAGTAACATAGCTAGTTAGTCATAT
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CTATGTTATCACTTCTATGTTACTACCCACTATGGAGGTAGTGACATAGACTAGTAACAT
ATGCATGTTACTACTCTATGTTACTTTCCATTGTGGTTAGTCTTATGCCATGGGATTCAT
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TACCCATGTCATAGCATAGTTTGTGTTTCACTTATATTATGGAGCATGTCATATAATTTA
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GAACTCATATGAAAGAACTCAATGCATGATTTGTATTTCCTTTGTTTTATGGCTTATGCC
ATGGAATTCATATGAGTAGAGCCCATGACGAAACATGGTTTGTATTTCCTTTGTTTTATG
GCTTATGCCATGGAACTCATATGAAAGAACCCATGACATAGCACAATTTGTATTTCGTTT
ATTTTATGGATCACTCCATGGAATTCATATGCGAGAACCCATGTCATGCCATATTTTGTA
TTTTAGTCGTGGCTTATGCCATGAAACTCGTATGAATGGATTCATGCCATAGCGTAATTT
GTATTTTGTTATTTTATGGTTTATACCATGGAATTCGTATGAAATAACCCATGACATAAC
ATAATTTTAATTTTCTTTATTTTATGGTTTATGCCATGGGATTCATATGAGAAAAACCCA
TGACATAACATAGTTTGTATTTCCTTTATTTTATGGCTTATGTCATGGATTTCATATGAG
AAGAAACCATGACATAGCGTAATTTGCATTTCGTTCATTTTATGCTTGATGGCATGGAAT
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TAAAAGAACACATGTCATAGCATAGCTTGCACTATGAAGTATTTTAGAACCTTATATGGC
TTCTGCCATGGAATTCGTATAAATAACCCATGTGTAAAGTGTAACGTTTGATCTCCGCAT
TTTGCGGCTCGTGTCATGCTACTCGAATCCTACAAGATTTTGGCTTGTTTGATTGCATCG
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CTATAGGGTTATAAAACTACGACAATTTGGATGAAAGAGTGTTTCATAGCACAAGTTACG
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ACAAACATTTCCTATAGAAATCAATTCTCCGAATCAAACGACCAATGTACGAGCAAAAAA
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AAGACGTGTTTCTTTGTTTTTTGTCCCACGCGTAGGATTACTCCTAAAGTTGAAGAAAAT
TATCCATCATGTCACCCATAAGCTGAAAAATTGTTTCATTGAGAAAAGCTAGAGAAAATA
TTTCGCTAAGAAAAACAATTGGATGCGCTCCTATCCGAGCCATGGACCACGCAGTGCACG
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AACCCTCAAACATAAGAAAACTTGCACGCATATATAGAAAAAAGGGAAGGGGGAAACATA
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ATTTCCATGTTTGTTCATCCGTTAAATAGTCACACCATGCTTTTTTTACTGTAAATCCCA
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AGGATGAGTCGTTGATCTGATTTATCCCTTGAGGCAATTGATAAGCAAATGACCAATCAA
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TTATTCATGAATTGAATTGTGGTCGACTAAAGGATGCGCAATGAACCAACATCGTTGGAA
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GTATAATACAAATGATTATCACATAGAAAAAAAAATATACTCTCCATAATACAAATGATT
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TTCCACCTCAACCCGCTGATGGATCAGTTGGCATGCCGTGATCAAAATATTCGCGAGCGG
GGCGAGTATATCCATCTACCCAACAACCATCTCATTGGTCTACGTATGCGATCCTATCCA
CTTGTCTTGAAAAAACCGGGAGCTACTGGCAGAAAACCAGGTGGAAACGCGAGGGCAGGC
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ATAAAGCCGGCTCACGCGCACCCGCCCACTCCCTCTCACCCGCACCCGCCGTCTCCACTC
CCCCCTCTCTCCCCCTCCGCCGCCGGCGCAGCGTCATCCCCGCGCGCGACTCCGATGGCC
AGCAAGTGGGTCCGTCCCGAGGTGAGCTCCGCGGCCATCCACCCACTCTCTTCTTTGTTT
TCTTCCGTTCGCTTATTATTACCCTGCCTCGCGGCTTCGCAGGTGTACCCGCTCTTCGCG
GCGACGGGCGTCGCCATCGGCATCTGCGCCTTCAGCCTCCTCCGCAACATCACCGGCAAC
CCAGAAGTCAGGTAAGGATCTGGATTTCTTGCAGTCTACCCCCATCCCCCTCTCCTCCTA
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GGATCTTGCGGTGGTATAATTTTCTGTTCTGATTTCTGAGTATGATATTGTGCCAATCAT
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TTGTACTACTACACGATCTACTTTTTGTCCTAGCAATTATTTAGTGCGCTTGCATGATCG
GGAGACGATCTTAATAAACGTTATCTGTATTGATCATTATTTTAATAAATTCGTGGCAGC
TCATCTTAATCTTGTTAGACAAGAGCCTGAAACAACCTGTAATTCTTAGTAACGATGTGC
TGAAATGATTTCATCTGCAGGGTCAGCAAGATGGGGAGGGCAGCAGGAGTGCTTGAGAAC
CATGAGGAGGGCAGGCGCTACGCCGAGCACGGCCTCAGAGCCTACGTGCAGGACAAGACC
CCCGAGATCATGCCAGGAATCAACAAGTTCTTCACCAGCCCGAAATGAAGCACTTTAGAC
TGTCTGTCTGTGACTCGCTATTAGCAACTGTTGTGGTCAAGTGCAAACCTATTTCAAGCA
TTCAGTAATGTTGTTGCGTCCATAATTCAGAGGATATCATCCAGTACCTCTTAATGAAAG
AACCATGTGATGTTTGTTGGCTTGCTATATATGTGATGGTTGGTGGCTATAAAATACCTG
TATCATAGAGATCGTTCAATGTTTCATGTTTGTGCTTAGTTGTTTTGTTGCGCAGGCCTC
AGTGGTAGCTCGTTGATGTGTGTGCACATTTGGGTGTTGCTGCTTGTATTTTGAAGCATG
TTCCTGTCTTAACAGTATCTTGGACATAACTCCTTTGGAATTTGTGAATTTTGTGAGCAT
GTATGCGCTGTGAGCATGGAAAATGACTGTCCTGTAAGTTAATCCTGGTACCACATTTTA
TCTAACAGCCCAGGTCTTGTAGTACTTAATGCATATTACATCAGTGATTAACAACTTTCT
AGATTATTCTGTTGAATTTGACTGGCATGGCCTGCCGAGGTCTTAAGATCCAGGTGATGG
CGAAACAAATTAACTCGTTAGAGCTGACTGAAGAGCGGAACTTATAGATCAAACCATGTG
GCTCTAGCCTCAGCTGTTGTCCCAGCTATCTCCTCTCTTATACACACTTTGCTGGAGAGA
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TTCTAGAGTCCTCAGCAGATGAGTTGATCTGCCTACAAGAACTGATTTACAACAGACCTG
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CCATGCTTCAACATAATGGCCAAAAAGATCATTCAGCGCTGCATTCACAAAATGTAGGGG
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TTGGGATTTCTGGTATGGTTGTGAAAGTTCAATCCCTAAAAAAATTTGCCTTTTGGGATA
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GAAAACCGACATTTTTTAGCCCGGAAGGTAACAAATTGCGCTGACCAGAGGCTTAGCACA
TTTGGTTGTCAAAAGACCAAATGCTATTAATGTCAGCTATCGTGGAACGTGTTTACATAC
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GTCCTGAATTCCTGAACTCCAGTTTCTTCTTGATCATGCATATCAGTTGGATGTGAAGTG
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TGCATCCAGTGCAAAGAGAAGGGTAGGTACCAAAACTGGCATCTCAAAACAAAATTCCAT
CCAGTGCAGTTTCTTGAATCCTAAATCTTAACTATAGAAAATAAACATGTGGGGAAAATG
TTTAGCTTACCGTGATTTTGGTACTGTGGACGGAATGAAACAGCGAGACTCTCCCAGTCT
TGAATGTTCTTCGTCTCATTCTCCCTCACTGTCTGATCATCAACTTCTTGTTTCCTTGCA
CCAGCAGGGTGGAAGGGCCCATAAACAAAGCCACTACTCTTCCCTTGCCCAAGCTGACTC
TCGAAAGTTTTCAACATGCTGCTGCCAGCCTGCATGAGTTTGGGTTTGTTCTCTGTTTCC
AAGACTAACTTGCCCCTCTTATTGTCAATGTTGGTGATGTCGGTACCAAATGCCCTCTTG
CTAGACATAATCTTCCTGTTTGGCGGTAAAGCAACCGTGACAGCGGCACCTTCCTTTCGC
TTTGCCTGACCAAGCCATCGGAATGCAGGTTTTCTGGAGTCCACCTGTTGTGTCTGAAAC
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GGTCTAGAGACTACCTTCTCAATGAGGTTCAAAGAAGATAGCACATTGGCAATGTCATAT
AGTCGACGAACTTTAGCTGTATTATCAACATCAGAATTGTAATGAGTTCCAGTTGGATAG
AAAAATCGGTTGCAGGGACTAAGCCATGGATCCCATAAAATATAAGAAATGCAAGTACTG
ACTTCTCATATTGCTCTCGGCATGTCTCTCTCCAAGGAGCAGCCTTGCAGCCTCATCAAG
TGAGACTGTCTCAACCTGTGCAAGTAGCGAATCACATTGAAATTAACCACGAAGGAGAAG
CCGCCTTAATGAAAAAAATGTAGTGGAATTCTTAGTATGTTGACCTCCATGGTGAGGAAG
AGCTTGACGAAATTCTGAGTGAGCAGCCCAAGCGACTTCTCCTTCCTATGATCTACTAAT
GTGGCATCAGAAACACTAATTCAGTACATAACATGATGGTCACTAGGCACAGCAAAATAA
TTAGAAAGAGATTGATCAGTCATACCAGATCTAAGCGGGCACATGGGTGCGTCAGGCTTA
TCAGAAGCATTGTCAAGGGACTGGCTAAGCTTCTCGCTGTCGGCGTCCCCATCTGCATCA
CCCAATTTATCATCTTCGTCTTCATCATCCGACACCTTCAGAGCCACGTTGAGAAAAGAC
ACCTTTTTTATCAGCAACAACTGCTGATTTGCATCACAACTAAAAGGGGCAAGAAGAACA
AAGTGAAGAAATCTAACATTGGTAGCAGATGGTTCCTCCGGTGGTGGGGCTAATCCAGAC
ATCTCTCTCAATGTCCTCTCCTGAACAAACGGGAAGAACAAAATAGGAAGCCATTAATCA
TTTTATTGTTTCAGTATAAGCAATCTCTTTTGCTGAAACAATGTAAAAGACTTGCCATTT
TCATTAATTAACTGATGAGAAGAAGAGAATTATGCAGATAATTAAGAGCAATCATTACAC
GGTGTAGAATTGGTATATATCAGAATAGGCGGATCCAAACCTTGAGTTCCTTGAGCGCGG
CAGGGACGCCCTCAAAGCCGATCCATGTGTACCGATTCTTGGCCCTCCTCACGAGAATCT
GCGTGATGCTCAGCAAATGTCAGGGAAAGAAGAGCCGAACAGAAACGAAACGGAGCGTCG
GTAAAAATCGCACGCCGAGAACCAAAAAAAAAAGGTTTCTTTGTTGTGAGAAAGGCCCTG
CCAGGCAAGGAAATTAGGGTTCACCCCGACGCTCTCGAGCACGTTGACGATGTCGTAGAT
CCGGCGCCTCTCGACGCCGAGCCGCCTGGCGGCGTCGTCCAGCCCCACCGTCTCCACGTC
GTCCCGGTCGTACAGCGCCACGAAGCTGCAAAGCCCGGCAGCCTAGCTAGGTCAAAAACC
GGCGAAATGCACAGCGCGTGTCGCGGGAAACGAGAGAGCGATGAGATCTGCCACCTACTT
GGAGCAGAGGAGGCCGAGGGACTTCTGCTTGCGGCTGTAGGAGTGGTGCCGGCAGGCCCT
CGCGGCGGCGCCCGAGCCCGA