Map Locations of contig_52159 (10310 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_52159

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_66827 2 2475 bp MLOC_66827.1 Available Available LOC_Os11g35400.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13111.m03446 protein AMP-binding enzyme, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_66827






Contig Sequence (10310 bp)

>contig_52159 10310 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGGCGCGCCTGCCGCCACCCGGGGTGGGGGTCTTTTTTCTCCTTTCCACTCGCAGGTGGT
CTATTTTGACAATCTCATTCGACAGGGGGTCCTTTTGGACAAAAATTCCACTTTTCATCG
CACGAAGGGAGTATGATACTATCTTCATAGTGCAGAATATCATAGAGTAGTGTCATATAT
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AATTTGGGAAAAAAAATGTAAATTTTTTTGAACAAACTTTGACAATTTTTTTAAGTGCTC
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TTTGTTTTTTTTTGTCACGACTTCCACAAATATGATTTCGTACTGAAATTTTACAAGCTC
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TTTTGAATTCAGTGTTTACCAGAGCTCAAGAGCTCGGGTGTAGAAAAACACTTTCCACTA
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GTCGGCTCGTGTCATGCTAACGAGGTACCCACCTTCGTCGGGGTTTTAAGCTACGTACAA
AATATTTTTGGAGCTCAAAATTTAGAACGCGAGTAGTGACGGAGACAGGAGAGAGAACCC
ACCAAACGTATAGCATTCCCTCACGCGAGGATTATGCTTCATCAACATGTTAGTGCTTAT
TATCGGGTAAGGACATCAAAAAGTTTAGAAATAGAAAAGTTACACAAAGTTCACGAATCG
AATATGATCTGTAATAATCCAGCTTCTGCGATATATGATGATTCGCTCGTTATTTGAGGC
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TTTATAAATAGCTTCGGTCCAAAAGACAGAAGAGTCTCTCCATCGCATAAATGATTGTGA
GTTTACTTTTTCATTATCTTTGGTAAAAGCAAGTCCATCACGTAGACACTCATAACATGC
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TTCTCACACCAACCCACAAAAACGTAGGTTCTCCCCCCGACTCGTCGGTGCCCTGTATAT
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GTTCGTGCATTTCTTAGTATAACTGAGTCTAACGATGCAGCTGCATGTGCAATTACAAAA
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GAAGCAGTTATGGAAGTTGGATATCTTCTAAAATGTCTAATTAAGGTTCTTGTTTCTTTG
GTCTTGTTGTTTTAGCGAATATTTGATGAATGATAATGTATCCAATGCCTTTAAAAAAAT
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TTTTTCACGACTTATAAACGACTTTTGTGGGGCGCCTTTATACGGGATGTGCTACAAATG
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GTTCTTGTAATTTTCAGAAAGATCAGCAACATGACTGTATTAACTTTCTGTCAATGGATC
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GACCTGCATTTTCCACTGCTGGCATGCGGCGCCTTCAATTGCCGCCACATCTCGTCCATC
TGATAGCAACTTGGCCATTTGGGGATTGCTCATTTAGTTTTGCATTCAATATGATACTAC
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TTCTAGCTAAATGCTCGTGTATTGCTATCGGATTTACTTTTGATTGAATTCCATCTTTTC
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AGATAATATCTATCACAAACGTGAATTTTGGTGGTAAAAATCGAATTCACTCTTTATTTA
TTTTGTTATATACTATCACTTGCTTAAACCGTATGTGGCCACCATATTCGTTGTGTTCCT
TTTTTCGGTCACTATTTGTTAACTCATAATGAAGCATTAAGGGGAGAAAAACATACTACA
TTGACTGTATGACTAAAATACACACAGTAACATCAACATGCACATCATCTCTTTATAGAA
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GTATATACGTACTTAAAATGTGTTAAAAAACACCAACACACATCAAAAAACGTTCTTAGA
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TCTGCATTTATAATGTGTTAAAAAAACACCAACACACATAAAAAAACGTCGTTAAAGAGC
AAAAACATTAAAAATAAAATGTAAAAATGTAATATTGAGTGACAGCTTCAAATCATCCCT
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CAGTACCAGAATAGTAACACAAGCTTTAAATTGCCCACCAACCTTCACCACCACCATAAC
TGCCACACATCTGGGCTCCAAGCCCTCGCTGACTGACTCAAGCTACAAGCTCAGCAAGCT
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GCTGGAGAGGAAGGTTCGATGGAGAACACGGTGTACACCGTGAAGGTGGGCGAGGGTACG
CCGGCCGGCGGCGGCAGGCCCGCGGCCGGACCCGTCTACCGGAGCATCTATGCCAAGGAC
GGCCTCATGCAGCTTCCGCAGGAAATCCATTCCCCATGGGACTTCTTCAGGTTCGTTCAT
GGGTCATGGCAACATGCGTTCGTAAGCATTCTGTCATCACTTTATTAGAAATTTCAGTGT
GATCCGAGGGTTGCAGGTGTTGAGATTTCAGATAATTTTGTTCAGTGTTTTCCCCTTTCT
GTTTCCGTTCCTGCAGTGGAGCAGTCAAGAAGTACCCCAAGAACAGAATGCTAGGACGGC
GTCAGGTTTCTGATGGCAAGGTAAAGCAAAGTAGTTCACTATGATGGGCATAATGATAGT
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TGACTATGTGTGGCAAACTTATGAACAAGTGTACCAGAAAGTCATCCAGATTGGGGCAGC
TATCAGAGGCTTCGGCGTTAAGCCCGTGAGTGAAGAATGTTGCTCTGTCTTTAAACGCCG
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TTGGTAGGGGGCTCACTGTGCCATATATGGATCCAACTGCCCAGAATGGGTCATGGCCAT
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TGTTGTATTGACTGGATAGGGTTCAACGCAATGCAGGACAAAATGCAGTTCAATTCATCT
TGGACCATGCTGAGATCTCCATAGCCTTTATGCAGGAGAGCAAGATAAAATCAGTAAGCA
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ATATATAAGCATGTCTCCAGTAAATGCTAAATGTGTTTCTACAAAGTTGATCAATGGGAA
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CAGCCCACATCAAAGGTTAGCTACCTAGGGTCCGGACATCAACTATTCCCAATTTTGTGT
GATTAATTTCTTACTTTATATGTGCAACCTCAGCCATTGTTAGTTTTGGAGATGTGCCAA
TTGAGCTGAAAAGGGAAGTTGAACAATTAGGAGTATCTTGCTTTTCTTGGGAAGAATTTT
CTACAATGGTCAGTGTTAGTTCCTATTAAAATACTCCATTACAGGATCATAAATGGTCTG
ACACATAAAGTGCTGTTTCAACAGGGAGAAGAAATTCAAGAACTTCCTAAGAAACAAAAG
GACGACATTTGTACAATCATGTATACCAGTGGAACAACAGGAGAGCCAAAGGGTGTGATA
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ATACTCTACATTTTCCCACAAAAAGAAAAGAACAGCAATCGAGCGTAAACTTTTGTGCAA
TGGGGCTGATGCACGACTGATCACACACCGTCCTTGTCGCGTTGCTCTAACAAACGGCAC
CACAGCTTCCAGATTATGCCGCCAGTGCTCCGTCGCCCCGGGATGGTGCTATGTACCGTT
CGCACCATATAATTCATAAATTGTTTCTTGGAAAGGCTGACCCAAAGTGGTCGGACCCTT
CTCCGGACCCTACGCAAGCGGGAGCTATGTGCACCGGGCTGCCCCTTTCTTCCATAAGTT
GTATTTCACAAAAATATTTTAATAAAAAAATAGTGAAAAATGCTAATCCTTTGTTCATCG
ATGATTTAGAGCTTTGTTTTCCTGTCATGTTAACCTGGTAACTATTACTTTTTAATGATA
ACCTAAATCCAAATATGTATGCAGGTGGATGAATATGATTCATACTTTTCCTATCTTCCA
TTAGCTCACATTTTCGATCAAGTAATCGGGAATTACTGCATCTCCAAAGGGGCTTCCATT
GGATTCTGGCAAGGGGTATGGAGCTATACCTTGCAAGAAAAAAAATATTATGTTGCTTGT
CTGTGCCTTCATCATCTAAGAGGTAAAACTTTCTTAATAGGACATTAGGTACCTGATGGA
GGATGTGCAAGTGATGAAACCAACAATATTCTGTGGTGTTCCCCGCGTTTATGACCGTAT
ATACACAGGTATGATGCAAACCTCCATAATTTGTTGTTGCAAAATTCCCACCACATTTTG
TGCTTCATCATAATTAAGGAATCTCATGAACTGAAGGTATCAACCAAAAAATTCAGTATG
GAGGGCTGATAGCCAAGCACCTTTTTCAGTATGCTTACAACTAGTAAGTATTTTCAACAA
GATTAAATAAACACCTACTCCCTCATTCCCACAATATAAGATCATTTCTCAAGCTAAAAC
ATAGCTTGAAAAATGATCTTATATTGTGGGACGGAGGGAGTACCATTTAATCTCTTTTTC
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TCTTATGACAACTCTGCTCATCATAACCATATTGACAAGTTTGTCCTTAGTTCTTTGGTC
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AACCTTATCTTAAATTACATGCCTCTACTTACTACTAGTATACTAGAAGTCTAGTTACTT
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TTGTTCAGGATGCTTTACATCAATCGCCAATGTTATCTCGATGATTGGGACGGTTGGCCC
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CTCCAGTGCACCGCGAGGCGAGATCTGTTTGAGGGGGCAGACCTTGTTCTCCGGGTACTA
CAAGCGCCCTGACCTCACTGAAGAAGTGTTCTCAGATGGGTGGTTCCATACAGGTGAAGC
CCCTTCTCTTCCATAATCCATTCCTAAGTGTACCGTACAACACAACAATGAACACATGGT
CCCCAACGAAATTTGCAACCAATTTATATATGAAGGCGATATCGGAGAGTGGCAGCCAGA
TGGCACGATGAAGATCATCGACAGAAAGAAGAACATCTTCAAGCTGTCCCAGGGGGAATA
TGTAGCAGTGGAGGTCCTGGAAAGCGCATACGCTCAATCTCAACTCGTTGCATCGGTACG
ATAAGCAAAATAACGGAATGAATAAATAAATAAAACTGCAGTGCGTCGAATTCATGGTTT
TGTTCAGATGTAAGTGACCAAGAGACTCTCATCTTTGAACAAGGTTTGGGTCTACGGTAA
CAGCTTCGAGTCCTTCCTTGTTGCTGTGGTCGTCCCTGAGAAGCAAGCAATTGAGGACTG
GGCTGCACTTAACGGCAAGTCTGGTGACTACGCCGAGCTGTGCAGTGATCCGAAGGCGAG
GAGGTACATCCAGGATGAGCTGAACCAAACCGGCAAGAAACTCGGGGTACGTCGTCGTTG
ATACACACATAAATTTAGTAAGCTATGATCCGTGCCCAGTTTTTTCCATCATAAACCACG
ATCTCGTGCCATGATTGCAGTTGAGAGGATTTGAGATGCTGAGGGCCGTTCACCTGGAGC
CAGTGCCATTCAGCATAGACAAGGACCTGATCACTCCAACTTTCAAGCTCAAGAGGCCCC
AGCTTCTTAAACATTACAAGGTTAGAGAGAACAAACCTGGTCATGTTCGTACCAGTTAGT
GGTTTAATTTTTGTTCACGGGAAGAACAAAATTATGCTGCAGGATCGCGTTGATCAGCTG
TACAAGGATGCCAAGATGGGAACTGCACAATAGAAAACGATGCTTAAAATCAACCAGTGT
ATACTATGATCAGCTTTCTGAATGTTTCCTCAAGAGTCAAAACTAGTATGATACTATGAT
GTAGCAACGGTAAGTAAGTTGGTTACGGCTCGAGGCGGTGACACTTTGTACCACCACTAC
TGCATACATATACTTGGTCTGTCATTCAAGACCTGGATATCCCAGTGATGTAAGTCTGTT
GCGCTTTCCTTTTGGAACTTTAGTTTTACCAGTTTGTAGTTTGTGTTATACCAGATGATT
TATCGATATGAAATCGGAGGGGGCGGCCTCTGTTTCATTCAAAAAATAAATTCAAGACCC
GGATCCAGCATAAATCTCTGCTTCAAAAGCTATATGCCGTGGAAGTATTACAGTAATTCG
TGTCAGAGTAAAATATATTTTCACAGAACGTGCTAGTTTTTGTTTAGCGAACATAACGTG
CTAGTTATTAGTTTTTTTAGAAAAGGAAGGTTACCTCTGATCTCTGCATCGAAAGTTTCG
ATGCAACCCCTTTATTAAAAGAAACAATAATATAGTCTGTGGTTCCAAAACAAGCTCAAA
AATGTTACAAAATATGCAACATGTATTCCCATAAGGTCATAGATCATAGATCGATATAAT
ATATGCAGAAAACCTCTTATACAATGGGATAAGTACAAAAGGGTACATGACTATATTATA
TATACTCTAACACACACACCCTCAAACTCATGGTGGATGAACAACACTGAGTTTAGAAAG
ATAGAAGCCATGTTGCGCTCTAGTCTGGGTCTTCCTTAGAAAATTCGTCAACTGTAACTC
GGAACACACATACTGAAGAGCAACAACCTGATCCTGCACACCAACACGCACATAGAAAGC
ATCAACACCAATATGCTTGATGAGCTCATGCTTCACAGGATCGCGCGCAA