Map Locations of contig_51916 (9219 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_51916

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_66661 7 2479 bp MLOC_66661.5 Available Available LOC_Os03g61500.1, FRAME:-1, EVALUE:1e-20, 13103.m06772 protein uncharacterized Cys-rich domain containing protein, putative
MLOC_66660 8 6951 bp AK374889 Available Available None





CDS Structure of MLOC_66661






CDS Structure of MLOC_66660






Contig Sequence (9219 bp)

>contig_51916 9219 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGGGGCGCGCCCCGGCCGCGACCCCCCCAGGGGGAGGGCGGCGCCGTGCCCCCGCGGGG
GAGGCCGCCGTCACCGCGTCCGAGCCGGCCATGGCCGACCGCCTCGCGCGCGTGCTCATG
CTCGCCCGCGGCCGCCGCCTCCCGGTATCCAAGCTCGCCGCGCTCCGCGGCCCGCTCGGC
CTCCCCGATGACTACCTCCTCCGCATCCTCCCCGCCCACACCGATCTCTTCCGCCTCGCC
AACCCGTACCCTCATCGCCGCAACGCGGCAGAGCTGGAGCTGCTCCGATGGGTCCCTTCC
CGCGCGGTCTCTGCCGTCGAGGCCGCTGCCTCGGCGAGCAACTCCCTCCCGCGGTTCACC
TGCTCATTGCCGTCCTCTTGGGCCAAGTCCCACGACAGGATGGAGGACTTCAACTCCACA
CCCTACATTTCGCCCTACTCGGAGGACGGGGCGGTGGCTGGTACAGACGCAGAGGCTGAG
AAGCGTGCCGTGGCTGTGGTTCACGAGCTTCTTTCGCTCACCTTGTGGAAGAAGATTTCG
ATTATGAAGCTAGAACACTTCAGATGGGAGTTTGGGCTGCCAGAAGACACAGCTAGGATG
CTGCTCCGTCATTCTTGCCTCTTCTACGTGTCGAATCGATACAAGATTCACACGGCAGTG
CTCCGTGAGTATTACGAGGGGTCTGAGCTGAGGGTGAAGGATCCACTGGTGGTGGCAAAG
GATAGACTTGGGGAACTGATGCAGGAGGGTCTGCATGAATTTAATCAGCGGCGACGTGCT
GCGAATTTGGAGAAGAAGAGGAGGCAAGGTGAGGTTGATGTGAAGAAGGAAGAAGAGGAG
CTCGAAGATGAGTCAGGGGTACTGTTGGATAGTGCGGAGAAGAGGGAGGAAAGACGGAGG
TTTTACAAGGTTTTATTTGGTGATGATGATAACCGGTGATTGATGTATGTAAGCCTGATG
CCCCTCTTAGCAAATTGTTGAACGAACGATGATATCTTGTGATGCACTAAAGCAATAAGA
GTGACATTGTTACGAAAGGATGGCACATCTATCTGCACATGGAAATTGTTTGGGTTGTTG
TCTCGCTTACTGATCAAAGATAACTGATTCCCGACCTGCTAGTTTTTCTTTCATCTCAGG
ACATGTAATCTGAGAACTGCAAGAAAATACCGGCCAGCCAGGTAGTTTGATCTTTTTGCA
GATTATAGGATGTCCTTCAAGATAAAAGCAATCACATATGGATTCTCCTAAATGAATAAA
TGGTGGAATTCTGGTGTAAAAGGGATTCTTATCAAGGAAACCAAACATATGGATGCAATC
ATTTAACAATGTGAGCAAGAAAGTTCGACAGATTGCAGAACTTGCGAGTGAAATGCCAAC
ACAAACTGGTCTTATATTGTCAGAGAGAACTGCAATTGACTATCTACAAATGTGAGCACT
GCGATTTTGGTGGATCTTTGAGCACACTTGGAGTTGTAGCCTTCTGCCGGAATATGTTTT
GTATAGCAGATATGATCATCGTCAGAAATGGAACTTTGATGAGCATGATTTTAGGTACAC
ACCTTTTCCCCCCTTTTTTAGGATAATTATTTGTTATAGTTGAGCTTCTGTGTGTTAGCA
TTTCAGTTATGAGGTTTTATAGATAGCAACTTTACAGAAGTTCGTCCATGTCCTGTCTAG
TCATTTTTTATCACAAAACTCTTTAGTTAATCATTTAAATTCTACTGGGATGATGCCTTG
TCCTTACGTAAGCACTTATTTGCTTATGCCAGTTTGGCACTGAGTGGTGGACTACTGGAC
TAATGAATAATTGCATTTTGAAATGAGCGGTATATTTCTATGTAACAGTCCAAGGGCCTG
TATAACGAATTAACAGCTTGCTCAACGAGTAGCAAGTTATATGCTATATGTTACCTGCTG
ATGTTGTGGTATAAGTAAAAGTAAGAAAATTGAACCTAAACAGAGGGATACATAAAAGGA
GCTTTAACAACTTGATGACCAAATGTGGCAAGGATATAAGCCTGCCTTTATGTTTGAAGC
ACATAGGGAAATGGGGATCAATGGAAAGCTATTGAAGAGAAGTGCCAACCATCACAAGCA
CCAAACTCTGGATTTATTTTATGGTCTAAAAGCACATCCATCCCTTGTTTTTCTGGTGCT
GTCATGCCTTCAGTTATCTTGTTGCTACCTTCTCATCCTGCAAATGTGATGTAGATAACA
GTTTAGTATTTTTTGTTATTAAGGCTTGTGTTGTGAACATGTATGTTTTGTTTTATATTT
TGTTTCAGCAAGGAGAGATACCTTTGGACATGTTGAAGCCACGATTTTCCAGCTGCTTGT
ACTCTTGGCATAGCGCGCAACTCTCACAGCACATGTAAACAAAGCAGTCCATGCAGGGCG
ATCCTTGGAAGTTGTACTGTTCCCGCATTGAGGAGCGTTTGGTACAAGAATACAACCAGT
TGCAGCCTATGGACCCTAGCAGAACATACAGGGTCCCATGCATGCAGCATGCTGGAAACA
CGGGGAGTTAGTCAACAAGACGTATGTTTTGTATGGCTGATTCCATGCTTAAATTATAAT
TGAAGCACATACATCCTGAGCCTCTGTCGACAACCTCAGCAATGCGACCAAATGTAATGC
AGGGGCATCAACAAGTCAAGCAACCTGCAGCATTAGCCAAAAAAATTAAAAAAATGAAGC
ATCAGGATGTAATTGGAATGCACTCTTATAAACCCTCAAACGTATAAGCCACAATGACGT
GCGGGAAGAGCATGAAAGATAGCTCCATACAGGTTCCGCAATCTCCAAAGCAGTCACAAA
GCCCAACCGACCACTTCCCCGGCATGGTGCTGACTTCTTGGGGTTGTGATCTGTGGAATA
TGCAAATAGATGGTGTGTAGCTGTGCCTTTGTGAGCAATAAATCTTGATCCTGGTATTTA
TAAACTAGTAACAACATGGTATCAGTGCCCATTTGCACAAGTATCTGCTCATAGTATATT
CCACTGCATCATTTTTGTTGTCTCTTGGGCTTTCTCTTTTCTTCTTGCACTTTAATGTTG
TATGTTGTGTTTACTGGTTTTGCTGTAAATTAGTGTTTTTAGTTACATCATAGTATATTC
CACTGCATCATTTTTGTTGTCTCATGGGCTTTCTCTTTTCTTCTTGCACTTTAATGTTGT
ATGTTGTGTTTACAGGTTTTGCTGTAAACTAGTGTTTTTAGTTACATCATGTTCACTTGG
CTTGTTCTGTTTGATTGTTTATTCGGGAAATCTTACGCTCAATTAGCATCTGGCAGCTAT
TTGGAGCTTCCAGTTTTGGTTGTAGCATACCCCTTTTGTTCTTTTCATCATTCATTACTT
GGCAAGTAATAGCTGCTATGATGATTGGAATTCGTGGGCTGACGATGATAGCAATTTGAG
GTCCTCACACGATGATTGGAATCCAGTCTTATTATGTTTTCAGTTTCATTAGTCATGCGA
CTCCAGATTGAAGCTATGGAAAATGTAACTGCAGTCCTCTTTCTGAGGCTTTTTTTGGGG
GACTTTTCAATGTAAATTCGAGTTGGGTAAGATCTTCTGCTTCCGAGATTTCCTTTATGG
AGCTCATACTGTACCCTAAATAAAAGCCCCAAATTTAGGTTGCTGTTTTCGAGTTTCTTA
ATTGCCTCCAGTTCTGTGCTCGCTTTGGGCTTTTGTCCATTTGCATCTGGGGGGTATTAT
CTAGCTTTGTTACCTGTACTGTAAAAATGGAGATCATCTGTCATACACTGTGAAGTACCA
TTTTTGGTGTGCCAGGGTTTGCTCTTGCAAGTCTTGAGCTAAAGAATTCGCTGATCTGGC
CCAAACTGATTGGCTACAGGACAGGATACGGCGAAGTCAATGTACAAGGGCTACATCATG
CATGCATGACATTGACAATATGGTCCATATTCTGGTTAGGTTTTTAACTTTTTGCCCTAT
GGTTTTATCTTTCTTAGGACAATGTTTCGTGCGGCTGAACTATCCCTTGTGAGAATTTTG
CCATCTCGACTATGAGCTTCTGCAGATGTCAGACCTTTTTAACCTTTCTTGCTTGTTCTG
TAGCCTTTTTATCCTAATTTTTTCTTCAATCATCTTATAAGCATACAAGATATCCAATAG
TATTATATTTCTTATCAGTTCGGCAGTCAGTACCGTGTTAATAGATTCATAGCTTTACAA
ATTGAAAAGTAGTACATTTTAGTTCATAAGAAATTGAACCAAAATCACAAGGACAGATAA
AAGGATATTTAACAACTTGGTTACCAAACGGAGCAAGTCATATAAGCCTGCCTTTATTAT
TCCTTTGGATGTTGGAGAACATCGCGAAATGAAAATTAAGAGAAAACAAGAGAGCCAATC
ATCATATCCGTAGCTATCAAATTATGGACATGTTCTAGAAGCACATCGCTTGCTTCGCTG
GCGCTTTCATGCCTTGCACACACCCCACAAACTTGTTGCTACCTTTCCATCCTGCAAATG
TAAATGGTGTAGAGCATGATTTAATTATGATTATTTTATCTTGTTAACATTCATTTTCTT
GATTATGCTTTCTTTCAGTAAGATGCAGAGACCTTTGGCCATGTTGAAGCCGCGATTTTC
CAGCTCCCTGTACTCTTGGCATAGCGCGCAACTCGGGTAGTGGAGGTGGACGTACCAGTC
CATGAAGGGCCATTCTTTCAAGTTATATTGAGACCGCATTGCCGAGCGTTTGGTAAAAGA
ATACAACCAGTGGCAGCATAAGAGCGACAGGCAAACATACAGGGTCCCACTCATGCAGCA
TGCTGAAAACGAGGAGAGTCAGCTATGAAGATTGATGATTTTTATGCTTCAACCCAAGCA
CAAATTCTAAGCGAAACACCTACATGTGGAGCCTTTGTCCGCAATCTCAGCAATGCGGCC
AAAGGTAACACAGGGGCACCAGCATGTCAAGCAACCTGCAATATTAGGAAATAGAATGAT
ACACAGATGCGTACTGCAAAGGGGGTAAATAATCCAGTACCCCAGTACTTTGCATGCTGC
TTTATGAAACCCATGTATAAGAGGCGCAAGAAGAACAAAAAAAGGCTAGCTCTGCATACA
GATGTCGAAATCGTCAAGGCAGTCGAAAAGCCCAACTGACCACTCCACAACCATGGTACT
AGTTAGTTTGGTAGATTTGTGAATTTGTAATCTATGGAGTTGGGAATAGCATGGTGTGCA
GCTGTGCCTTTGTGAGCAACCAATGTTTATATACTAGTAGTAATGGTGCAGTACTAGTTA
GAAGATGTGAAAAGGTCAATTGATCTAACCAACTCCAGTGCAGGAATTTCTTTCTTGTTT
TTATCGCCTTTCTCTTGCAATCTACACCGGATGTTACACGCTAATGCTTTGTTTACAGGT
TTGGCTTTGGATTGGTCTTCCCAAGGACACAGTGTTCAATTGGCATGTTCTGCTTTGGAT
CAATCTTTCGGAAATCCCATGTTGAATCAGCATATGTCAGCACTTTGGAGCTTCCAGCTT
TGGTGGTAATTTCCATGCCGTATCGTATGTATGAAATCAGCCTGATAGTAAAATACTGAT
GATAATCACCCAGGTGATCTCGGTCTAAAATGGGGGAACCATGCCTGGTTATTAGCTTGT
AAAAGTGTCAGTCGTAACTTCTTCCTATCCAAGCCTATAGATAGCTAAGTAATTAACGAA
TATTCCATGTTCTGCTTTGGATCAATCTTTCTGGAAATCCCATGCTCAATCAGCATATGA
CAGCACTTTGGAGCTTCTAGCTTTGGTGGTAATTTCCATGCCGTATTGTCACTTTCCTTA
TGTATGAAATCAGCCTGATAGTAAATACTGATTATAATCATCATGTCAGCCTCGATCTAA
AATGGGGGAACCATGCCTGGTGATAAGCTTGTAAAAGTGTTGGTCATAACTTCTCCCTGT
CCAAGGCTACAGATAGCTAAGTAATTAACGAATATTTTAAAGTTATTATGTGGAGATCCT
CTATCATACACTGTAAAGTCCCCTTTGTGTGCCAGGCTTTGCTCTTAAAGTTTTGAGATA
AGGAATTCGCTGATCTGGCCCGAATCTGATTGGCTACAGGACTAGAGGGTACCACGAAGT
CAATGTACAAGGACTACACCATGCATGCATGACATAAACAACATGGTACATATTCCGGTT
TGATTCTAACTTTTTGCCCTATGGTTTATATCTTTCTTAGTACAATGCTTCATGCGGCTG
AACTACCTCTTGTCCGAATTTTTGCCATCTCAATTATGAGCTTCTGTATCTGTCCAATCT
TTCTTGAAATATCTTGCTTGTTGTGTAGCCATTTGTTATCACATTTTTTCTTCAATCATC
TTAAGCATACAGGATGCCCCATCTTCAAGTATTTATTTCTCATGCCAGTTTGGCAGTCAG
TATTGAGTCAAGAGATTCGTAGTTTTACAACTTGAGCACTGCATTTTAGTTCACAGGCCA
CTAAACTTTTGTACAATCTACAACCGTATAATGTGTGTCAAGTAAGAAAACTGAACCAAA
ATCACAAGGACAGATAACAGGAGATTTAACAACTTGATTACCAAATGGAGCAAGTCACTA
GGCCTGCCTTTCCTCTTTCCATGTTGTAGAGCATCATGAAACGAAAATTCACTGAGAAGA
GGACAGCTAACATCACTATTTTATTGACATGTTGTAGAAGAACATCCCTTGCTTCCCAGG
TGCTTTCATGCCTTGCACACACCCCACCATCTTGTTGCTACCTTCCCATCCTACAAATGT
AATGATTTAGTAATGATTACTTTGTCTTTGTGAAACATGAATTTTCTTGACTATGCATTC
TCTCAGCAAGACGTGGCTACCTTTGGCCATGTTGAAGCCACGGTTTACCAGCTCCTTGTA
CTCTTGGCATAGCGCGCAACCCTTGCAGAAGAAGTGGATGCAGCAATCGATGCAGGGCGA
TGCTTTCAAGTTGTATTGCGACCGCATCGCCGAGCGTTTGATACAGGAATACAACCAGTT
GCAGCCTACGCGCCAGGCAAACATACAGGGTCCCATTCATGCAGCATGCTGAAAACAAGG
AGACTCAGCCACAAAGATGGATGATTTTTATGCTTCAACCCAAGCATGAATTCTAAGCGA
AACACCAACATGGGGAGCCTTTGTCCACAATCACAGCAAGACGACCAAAGGTAACACAGG
GGCACCAGAAAGTCAAGCAACCTGCAATGTTTGGAAATGGAATGGAACATAGATGAGTAC
TTTGCAAGTTTGCATGCTGCCTATGAAACCCATGTACAAGGGATGCAAGAAGAGCAGAAA
AAAACTAGGTCTGCATACAGGTGGCGGAAATCTCCAAAGCAGTCGAAAAGCCCAACTGAC
CAATCCGCAACCATGGTGCTACTTAGTTTGGTAGATTGTGAATCTGTGATCGTTGGAGTA
TGGTAATAGCAGTGGTGTGCAGCTGGTACCCTTGTGAGCAATCTGTGATGCTGCCGATGT
TTATATACTAGCAGTAACAGTGCAGTATCAAGTATGACAGAGTCAGTTGCTTCAGCAACC
AATTCCAGTGCAGCATTTTTGTTTTTGTTTTATGGGCTTTCTCTTGCAATCTGCACCGAA
TATTGTACGCTAATGCCATGTTTACTGGTTCTGCTTTGATTTGGTCTTCTCAAGGAAACG
GTGTTCAATTGGCATGTTCTGCTTTGGACCAATCTTTCTGGAAATCCCATGCCCAATTAG
CACATGGCAGCATTCTGGAGCTTCTAGTCTTGGTGGTAACTTTCATGCCTTATCGGCGTT
TTCCTTATGTATGAAATCCCATGTAAGTCTCCATTTAGAGTAGGGGAACCATGCCTGGTG
ACAAACTTCGTAAATGTGCCAGTTATAAATCCAAGCCTTTAACCAGACACTTGCCAGTTA
ACATAACGTATGCTTTCTGCACAAAGGTGTGTCCTGCTTGAACTTTCCGGTTACGACCAT
GGTTTGGTTTTTCGTATCGCCTACTAGAGCTAGGGTACTCCCTATTGGGGATGCTGTTGA
TGTGCTTCTTTTGATCTTCTACTGGTAGGCTACCATCTGCTTGTTGAAGCTGAAAGTTCT
GTAACACTTGAAACAAATTTGGTGGAAACTGAATATTAGGAGTAGCAGCCAGTCGGTAAC
GCCTCCTGGCAACCTAATTAATTTGATTAAATAGACACTGACATGTGGGCCCTGATAATT
AGATTAGTAATTAGATAAAAGGACATGACTAGACAGCGGCGCTGTATATTCGCCTTCCGG
TGCGGCGTCTGGATTAGCAAAGAGTTTATCATTTGGATGTCTCGGATAACCTACTGGGCC
TAATACACCGATGCATAGCAGGGTGCCCATGCCTAAAAAAATCACGTCGCTTTCAAACAG
TTTCGAGTGAATTGCACTATTGCTATACCTGCTGGGCCTAATCACAAGTATGACATTATT
AAATGTTCTTTTGATTTTGCATTTGAATTTTTTTATCTTTCAAACCATTATCTCAATTAA
TGAACCGCTTTCACCACTGACTTTTTCGTGATGAGATTTTCAAAACTAGATCCCATGTTG
ACATATTTCGATAACTTATGTTTTCGCCGGTACTTGTTAGATTACAATCACTTACTCGTC
ATATTATTTGTTATATAGTTTTCACATTTAGTCAACTTGATTATCAGGTTTATGAACGTC
GATATACCCCATTAAAAAACTTCATTCATTGTATTTGTGCTGATTTATGCATTTACTTGC
TTATTGTTATTGTTTTAATACCCACTTTTCAGCTTCACATAACATTACAATGCTTAAAAT
GTATAAAAGTATTGTCTTGATAACTATGTACATAATTTTTATGACAACCATACACCCGTA
AGATGAATTTAGCGGTGAATTTTGGTGTAATATGTTATAATTCATATGTTCGTGATATGG
CTCTCATAACTTTTGATGTGGCAAGTGACTTGGTAGATTTATTTATTTTTACGAGTTATA
GTTTTTGAATTTTTTGAATATATTATTTCATGTGTTATTTTTCTTTGATGTCGTAAGTAG
TCGTAGGATATAAACAGGTACATGTGTTGTGAATTATTACCATGTTTGTAAGGATATTAT
TTACTTATTTATTTTAGTTTTATAGTCCTCTCTTGTGCATGCGCACACAACTTTGATAAN
NNNNNNNATGCTTATAGTTGCATAGAATTTTTATTGTTT