| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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No map location |
Predicted Genes from contig_51915
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_66657 |
3 |
2700 bp |
MLOC_66657.2 |
Available |
Available |
LOC_Os01g15480.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13101.m01713 protein EMB3013, putative, expressed |
| MLOC_66658 |
2 |
1778 bp |
MLOC_66658.1 |
Available |
Available |
LOC_Os01g15480.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13101.m01713 protein EMB3013, putative, expressed |
| MLOC_66659 |
1 |
304 bp |
None |
Available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_66657
CDS Structure of MLOC_66658
CDS Structure of MLOC_66659
Contig Sequence (11991 bp)
>contig_51915 11991 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
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CGTGTTGGTATGTGTGCCCTCCGCTGGCATGTGTGCCAACATGAACTGCATGGTGGTTTT
AATGTAGGCTGACAACGTATGCTAGCCGCTGGCATGATGCCGACATGAACTCTTGGACGT
TGACATGCTAGCCTGTTTAATCTAACTGTGCGAACATACATGGGTCGCCAGCGTTGGGCG
CGCGGCTGATCCAAAAAGAAAAGCGGGCGGACGCGGAGCGGGCGACCGACCCAAATAGAC
AAAAAGCGAACAAAATCACCGTCCTTTTGAGTCGGCTGGTTGGAGTTGCTCTTGGTCTCT
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CGGGCCGCCACCCCGAGCCCGCGTGCCAGCACGACACGACACGATTAACGTGAGCCGGCC
CGTGGCACGGCACGGCCCGCTTGGCATGGCATGGCACGAGAGCATCGAGGAGATGGGGGA
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GGGCAGGGCGCTAGCTGGTTGGGGTGGGGCGAGGGACGGGAGTAGTCGTTGGTGCGGGGG
GAGCGAGCCAGGGCGCCAGCCAGCCGGGATTGGGAGGGATTAGCTATAGGATTAGATGGG
TTTAGAAGGAATTAGGAGGGATTTTTAATACATAATTTATATTTTTGATTAGAGAAAAAA
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CGTCTCGTTTACTAATCAGGTCCAGACGTGCAGTGCCGTGTCACGCACGATTTTGACGGG
CCGGCCCGGCAGGCCGTGCCGGGCGGGCCGGCCCGTTTGGCCAGGTATGAGCTCAAGACG
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AACTAGCCGAGCGGCGGCCATCTCAAATCGAAATCCCGCTCCTTATCTCTCTCTCCCCCC
GTTCCGCTCCGCTCCCCCCGCCGGCCTCAGATCACAAGCCCTAACCTAGCCGGAGACCAG
AGGAGGAGCCCTCCTCTTCCTCCTCCCCCCTCCAGCTGTTGCTGCTCCGCCATGAATAAC
TTCCACGTCTACGAGGCCATTGGCCGCGGCAAGCACTCGGTAACCCTCCGCCCCATTCTC
TCCCGTCTCCGTCGGTCCCGCCCCCCTTTTCCGGACTCGGATCCGCCCGTATCTGGCCGG
GGCTGGCTCGAATGCGATGGATCTCTGATTGTTTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGCGG
GGTTGTGGCGGAAGACTGTCTACAAAGGGCGGAAGAAGAAAACCATCGAGTACTTCGCTG
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CTCACTCCTACCGGAACGCTCTTGACCCCGCCGCGTCGATTTTGGGGGTTGCGGCGTTTG
CATCTTGTTTAGGAGCGGCTACTTGGTCTGGCGACTTGTATTCACGTGCGAGTGCGTGTA
TGTCGCGATTCGCATAATTTACTTGATAGATCTTCCGTGGCTTCGTGTTGAGGCTTGGCA
AACGTCAGTATTTGACTAATTGTTGTTTGCCGAATCATTTCTGATTTCTGGTTAGTGTTT
TGCTTGAGAAATGATGCAGTATGAAGGGGAAACTGCCCCAAGCTAGATGTAACCGTGACT
AAGATAATGATAAGCTTGACGTGCTTAATGCGCTGCTGTTTTTATCTTGCCACAATTCTT
ATTTTCAAGTGCTGGACGAACATGAACTTCCTAATAATTTTGCACATAGGTTGTTTCTCA
TACCCAATTATAGAAGAGATGTTCCCATGAAGACAAGTTACAACATGTGCTCACTAATAA
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GAAAAAGAAAATGAGGCCCTAACATTTGAAAAAAATAACTCAAGCATAATCACTTAATTA
TATAATTTAACTTTATGCTATGTCGTACAATGTTTAGAAAATTCTCAAGTATCAATGCAA
AATACTAAAACCAATAAACTGATCTCATACTCTATTGAAAAGTGTCATTCGTCTTGTGTA
CCTTGAAATAAAATCTTCAATTATTTTCAAGTGCTATTGTCGCCAAACCATTGAGTCTTT
CTTGTGTCATCGTATAAAATATAGCTTGATCAACCACTTGCAGAAAATAATTGACTATAA
ATGACTTCTCTGCAGATTGTGAAAGATTTATGAACCAAACAAAGTATATCAATGAATTTG
AACTGATAAACTAGATGAACTATAGGCTTGTAACCTGTATAGATAGTTAGAATATAAAAG
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TGACAACTTCTGAAACTGTTGTACAACTTGCAAGTTAGTTTTATCAAAATTAGCTAGAGA
AAAAGGGAGGATTGTAGGGCACCGCACCGGTTTGCCATCTGTTTGGCTGCACCGCGGCAG
CGTCGGTCGTCGCGGCGGCAGTTCTGCTTCCGACTGTCTTTGGGCTAGTTGCAGAAGCGA
TCACCATCGGTGATTCAGTTGAAGCGAAAAGATGGGAAGCCAATTAGCGAAGGGATTAGG
GAACGAACAAACGACGGAAGTCACGGAACCTACGTGCGTTGCGCTTGCCGTTTTGTTTAT
TGATCAGATGGATCGACACAACGAGGCAGTGTACACTCTCCTACATGCATATTGATTGAA
CCATTGAGCGGACCAAGCCCAAAGGGCAGTACTTCAGGCGACAGAGTAAATATTGGGCCA
AAAATATTTTTTTCAGACTAATACATAGTATATGGACCCTATTTGCCCCCCCCCCCCTGG
ATTTTGGGGGCCCTGTGCGAGCGCACACCTCGCACAGACCCTTCAACGGCCCTGTATTGG
CAAATGCTGTTCTTTCATTGGGTTTTTACTTAGTTTTTTTCATTGTCCTCCCAAGGACCT
GTTTTTCTTTTGGATGTGCCTTTGTCTCTCTGAGCAACTGTTCAGGGGTAAATATCAGTA
AGGTAGATAAATTGTTACCAGAGAGAGAATCATTCTCAAGCTTCGTAAGCATTCTTAGAT
GTTCTATCAAAAGTTTAATCAATGCTTATGCACATAATTTGTTTATTTTTTGATTTGTGC
CTTTGTGCTAATGATGCTTTTCAACTTATCTTTGCAGGTCCGGATGCTTCATTCTTTAGA
TCATCCAAATGTCCTGAAATTTTTCTCTTGGTAAATTTCTAGGGATTTGTATTAACTTTT
GCTTTGGCCTGTGCTAATTTGCATTATAGCAATGCCAAACACTTTGCTATTCTTGTTGAG
GTTATCCTTATTGTACACTTAACATTTGACCATCCTGGTGTATACCATAACTATGTCTTG
CTTCTTTCCCTAGGTATGAAACTTCAGCACATTTCTGGCTAGTATTGGAATATTGTGTCG
GTGGAGACCTCAAGGGCTTGCTTGAGCAGGTATCTTGCTTACTCTTTTAAACAATGTATG
TATTTCTCTAATTTTAAGAAGGGAACACAAAGCATCCACTTGCATACTCCCTCCGTCCGG
TGAAGAGTGTACGTTTGGCTTTAAAATTTGTCCACAAAAGAGTGTACTTTTATCTTCCCA
ATGCACTATAAAGTAGAAAGAATGTCTCTCTCTCATCACACGGTAATCAAGACCAATAAC
ATTCTACACATAGTCTCCTTAATTTCTACATGCACTTAGCTCATTGGGGGTTGGGTATAA
AGAGGAGAGAGATGATGACTTGCACCTTTCCAATGCATTTTTTACTTCACTTCATAATTT
GTCCTAAANNNNNNNNATGTACACTTTTCACCGGACGGAGGGAGTAATGTTTGTAATCGA
TATATTCTGCAGATATCACAGATTAGTGAGAAAAAACTGCACCTAAAGTTTAGGAGCTTG
GAAGATTTGAACTAGAAGTACATGAAACGAAACCTAACGTTTTCATTAGCTTTTAGGAAA
ATTCCACATGAAACTTTATATGACAACTTGCTAATTGCTATTCCAAGAGGAATAGACGTT
TCACACAATCTTGTTATTATTGTATTTATAACCGTGTAACTTCAATCTGACAAGTTGAAG
TTGTGAATGCTACTAAAACTATTTTTGCTTGAGCAAACTATTTGTCATTACATTGAAGTA
TGGTCAGCCCGAACCAGCTGCTTTTATGATCTTACTTGTAGCATTTACGGTTTTAATACT
TTCTGTTCATGCATTCTCGCTTGTGCTCCACTTGGAAAATAATTTGACAATTAACTGCTT
CAAGATGGGAAACTGGACCATTTTTTCCACTTGGAAACACTCAACGCGCCCTGCATATTC
TTTGACTCTTGAGAAATGCTTGACTTATTTGCTACTTGATAATGCTGCTCTATTGTTTTT
AGTAGTGTATTGTATTGTTGTGGCACAAAGCTTTTGCAAGCCTGTTTATCAGTACTTGCT
TGTCATCCTAGACAACACGTGTTGATAATGGCGACCCACACAATTCTCTGGTGGTTGTTT
GTGTTCCAGAGACCTGTTGCGTGAGTAGATATGCAGACCTTTTACTATATGTAACATCAT
TGAAGACAAAATGCTACCCCATTTTTCTGCTTGCTTGTCATCCTACAAACACGTGTTTGT
AAGGGCGATCCACACAATTCTCTGTGGTGCTTGTTTGTGTTCCAGAGACCTGTTGTGTGA
CATATGCAGACCTTTTACTATATGTAACATCAGTGAAGACAAATGCCACTCCATTTTTCT
GCCTGCTTTGCCTTTATGTATTTTGTCTCATATCTATTTTCATGCAGGATAAGAAGCTAC
CTGAAAGTGCCATGCATGACCTGGCTTATGATCTTGTCAAGGCCCTCCTGTAAAGTTTCT
TTGGTAACCTCGTTTCAATATACTTATTTGTGTTATGCGTGGACTTCGATTGACTGAAAA
CATGTTGGGTGTTAGGTTCTTGCATTCACAAGGAATTATATATTGTGATCTGAAGCCATC
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TAAATACAGTGACAGCAAAGGAACAGAAAATTGCTGGGAACTAACAGTAATTTCCCCTTA
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TTATTTTAATGATTTTCCTCGGTCTGAACACATGGCCTTTAGGTGCCACAACCTATGAGG
GGGACACCATGTTACATGGCTCCTGAGTTGTTCCAAGAGGGAGGGGTCCATTCGTATGCT
TCTGATTTCTGGGCCCTTGGTTGTGTGCTATATGAATGCTATGCAGGAAGACCTCCTTTC
GTGGGCCGTGAATTTACCCAGTTGGTCAAATCCATACTTTCAGAGCCTGCACCACCTTTA
CCTGATAACTCGTCAAGGTCTTTCCAGAATCTGATCAACTGCTTACTCATGAAAGACCCA
GCTGAAAGACTACAGTGGTCTGAACTATGTGCACACAACTTTTGGAGAAACAGTATGCCA
ATGATTCCTTTACCTCCTCAACCTGCCTTCGACAACATGGTTGGACTTCCCACTACACCT
TATTTATCTGAGCGAAATGATGATAAACCCTCCAGACAGCTGACGCCACCCAAGACTCGT
GAACACCTACGCAAGAAAGATGAAAATTCTGCCAAGGTGTTCACAACCCCTGTTAAGAAT
GTGCAAACTGGAAAGAAAAATAATGCCAAACCTTGTAAGGCTGATGGTTTGAAGGGTGTA
AATGTCCTTAGAATGTCTCGCATAGCTAAGAAAAATTTGCAAAGGGAAAAGGACAAGGAG
AACTACAGGCGTCCTCCCACAGAAACAGATGAAAATGAGGCTGAAGTTAAGATAGAAAAT
AATGACATGGAGCTTGATTTCGGTGAAAATCCAGAAGGTGATACACCTGATGATAATGAT
GCATCAGATAATGCTGGATCCACAGCAGATGAAAAACATACAGCTGAAGGAACTGATGGC
AATGAAGAGAACTGCATAAATCAGGTGGATATGCTCACGGATGAGTGTTCTATTAAGCCT
GATACCATGTTGAAAGCTGGGCAGAACTGCTCAGAGAATCTTGATGTGGTGGCCACTCCA
CCTAGTTTCTGTATGAGGAAAGCACGTCCAAAGATAACATCTGGTGCCGCAACGGGTTCT
GAGCCGTCTAACATCTTTGAAGCATTCTGGCATCCAACAGATCTTGCAGTTAAACCAGTT
ATGCCCAGTAAAAAGGGAGATAAAGCTACCGAGGCTGTCCCTGTGCTTCCTTTTGAAGCT
CTTCCTGCTGCTGATTACATCAGGTTACCACGAGAACAGATGAATGCATTCAATAGCCAG
ATAATTCAGAGTTTGAGTGGGTCTTTTCAGGTTTCAGAGAAACAGAATATCATCAGATAC
CTGGAGTTGTTAAGCATGAACTCTGATGCTGCAAATGTAATCACCAATGGCCCAATTATG
TCGCTGCTTATAAAAATGCTTCGACTATCAAAGACTTCAGTCTTGCGTGTCCAGGTTGCT
TCACTTATGGGACTGTTGATACGCTACTCCACTATCCTTGATGCGGAGCTAGCTAGTTCA
GGAATTGTTAATGCCTTGTCAGATGGCTTAAGGGACCGGCACGATAAACTGAGGAGATTC
TGTATGGCAACACTTGGAGAATTACTGTTCTACATATCAACTCAATCTGATCAGGATAGC
AAAGAAAGCAATGCCCAAGAGTCTCCTATGAAGGACAACAAATCTGGTGCTTTGTGGCAG
GTTAGAAACTCCAAATGAAAAATGTGCTCTACATGTTTATTTGCATGTCAGTGGTTGATT
TACTTGGACATACCTCGTATTACCCTATACTGCATCCCGCTGTGAAAAGATAAGTTGTGC
CGGTAAGATATTGGGAATTAGATTCCAACATCTTTAATAGTTGGTACGGATTCTTCTATA
GGAGCATATTCTCTTTGCCCACCATAATGGTACTGCAGCAGAAATTTATTAGAAGTTGAA
TGTATATTAACTGCAAGAACTAATTTGCACACATATACATAAACTAGCGTGTAGCCCACA
TTAGATATTTTAGTGAGTTCATTTTGAAATATTTATAGATAAAATTTGTGTTTTAAACAT
AGAGTTGCAAAGTTCAAATGCTGTTGAAGTGCGTAAAAAATTGAAATGTTAAATTTTGGT
ACATTAGTGTTCTAGCATAGTTAAGGCAATTACAATTGTCACATCTTTTGGGAAGTTACA
GACTAAATTTTATAACATGTGATAATCATTATGCTTCTGTTCATTCCTATTAATTATTAA
TATATTTTACCATGAAGAAACATTATTTTAAGGGATGTTTCTTTCCACAGCAAGACATTT
TTTCACCAAAGGATGTGTTTTTCCATAAATAGACATTCGTTCACCAGGGGATGTGTCTTT
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TAATCCAACAACTACAATTTCTGGGGTGATGTGGCTTAACGTGGATGCTGCATTAGGAGT
CGGTTTTAGATTGAAGAGGGAAGGAATATCCCTAGATAGTTGATACTGACTTCATGTTCC
AATACATGCTCTTTTCTTTATTTATGTGTCTAGGCAAATGCTTATTATGAATGTGTGCGT
TGAGCTTTTGCAGTTATTATAAGTACATAAAAGAGTATGTATTAGAACATGAAGATATTT
ATATAAATATCTTAGTTTTATGTGGTCATGTAGCCTAGATATACATATGAGTGGCTCCTT
TCTTTGATTTGCAGCTACAAATTCAAACTACTGTCTTCTCATGATTTAACTTGGCAAACT
CTGCAGGTCCCTAGTTCTGTAATCGCACTGGTCTCATCTATCTTGCGTAAAGGGGAAGAC
GATCTAGCCCAGCTTTATGCCTTACGGACCATTGATAATATATGTAGCCAAGGGACAGAT
TGGACATCACGGTTTGCTTCCCAAGATGTAATTGGTCATCTTTGCTACATCTATAAAGCA
ACTGGGAAGCAGGAGAATACAAGGCTTATTGCAATTTCTTGTTTGAGCCGCCTAGCTCGA
TTCAGTTCGTCATGTACTCATTTAATACTGGAGAAGCTATCGTTCAAGGATATTGCATGC
ACACTCCTTAAGGGCAATCCACGTGAGCAACAGATAAGTCTGAATCTTCTGAACTCGGCA
TTAGGGAACAGTCATATCATACCAAATATGAGCCGCTATATTCTGTCATTAACCGAGGAG
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GACACTGTATCCAGTGATATACAGCAGGTCATGGGTGGCAAACGTCATGGACCTATTATT
GCTTTAACTGGACGTGCTCATCCAAAGAGCACAATTCATTTGTTCCCTGTCATCCTTCAT
CTTCTTGGGAGTGTATCCTTCAATCACAGAGTTGTGACAAGTCAAGTATTGCTCCAGTTG
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TCTAAAAGGAACTCATCTTAGTGTTGATGTTGTCTTGCCTTAACAGTCTTTGCATTACAC
AATGGGTTCACTAAACTTCCGTCTTTTGTGATAATTTCTGTACACTTTATTGTACTTCCA
GGCTCGGGATGATTTCCAAATGACATTGCTGCGGGTTCTTGAGGCAGCTACGGAGGAGCC
TTCTGTTATACTTAGGGAACACAAAATATTCACAAGTCGATTCCTTCCAAGCTTATCCAT
CTTATACAAGGGCAATAAAGATTGTGATGCCAGATTCCTGTGTTTGAAGATACTGTCTGA
TGTGATGATTGTGATCTTCAGTGATTCTTCATTCACTGCAGACGAACAATGTTTAGCTGA
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AGATCTTTCAAATGCAAACGTAAGCAATGTCAAGCTTTGTTTTGCTCTGGCATCTGCTCC
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TGAGTTTGTGACTGCCAAAGATATGGATGATTTTCTGGAACCAACCTTGGAACTCTGCAG
AGCTTTCATTATCCGTGGCACCGGCAGCAACAGAAGTATCGTCCTCACCAAAGAACCTGC
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GGACATATGCGACCTTGGTGGCAGTATGGGTATATTTCTGGAGGTGGTTGGAAATTCAGA
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GGAGGCCACAATGGGCTTGCTGACAAATCTTCCTAAACTGAGCGCTCTTCTGGACTTGTT
GAAGCATGGCGCCTCCCTCCTGCTGGCTCGCCTGCTATACAGCCTAGCATTCTCTTGTAG
GCAGTACCTGACACAAGGAATGATACTCTCAATATCAGTGCCAGCTCTGATGCGAGTAGA
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CTGGCGCCAAGTGTATCAGCAGGGCCATTGCCAGCCTCATCATCTTATAAGGCATGCTGC
TGAACCCAGTTGCTACTGTCTGGCACCGGAGGATCTTTAAAAAAAAACTGTCTGGCACCG
GAGTGCTGTCCGTGTGCAGGACACCGATGCATGCTATGTAATCTTTATCCGCGATGATGC
GGGGCTGCTGTATATGGTACTTTTGGCCAAATCTGTATTTGCCTTGCCAGTTTTGGTTGG
CATGTAGGTTTTCAGTTCCATGTAATTCCCTAGTTGCACATCATGATCATGTCTTATTTC
AGTTACCAAGCAAGTGGAGGAAATTTCCATTTTTGTTGAGATCTCTGTACGAAGTCGGTA
AGCAACTTTTGCTTCAGTAATGAAGTATGCAATTTATTTGTGGTTGGGTTTTGCCGGGCC
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CAGAATCCGTCACTTCGAAAACGACCTCCAATGCGTTTTGATTTCTTCGTTGCAACTTGT
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ACAGCCCTAGTATAAGTAATTTTTTACAAGAAAGTTGTGTATGTTAATACATAACTAGTA
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