Map Locations of contig_51584 (4305 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location No map location




Predicted Genes from contig_51584

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_66461 3 1572 bp AK249710.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_66461






Contig Sequence (4305 bp)

>contig_51584 4305 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCCCCCTCCCTCCGTTGTAGGCGTTATACGGACTGTACATGTTTCTTTGTATTTCGC
CTTTATATTTTTTGTTTGTGTGAGAATATCTTGTTTGGCTGTGTGCATCAGTAATAAAGC
GCCCCTTTTCGAAAAAGTATGCTTTCACGATAATTCTATCCCTGCATTAGTTGTAACCCA
AGTCTGGATTCTGATCACTGGTGTATGAACATCTCATTTGTTGGCTTTAGGTTAAAATGA
TGGTTGTTCTTGGGGAGCTTGGAGGAAGTGACGAGTATTCGCTCGTCGAGGCCTTGAAAC
AAGGAAAGGTTCAGAAACCTGTTGTTGCTTGGGTTAGTGGGACATGTGCACGTCTATTCA
AATCTGAGGTCCAGTTTGGCCATGCTGTAAGTTGTAAACAAATTGGTGCTCTTTTCCAGT
GAGCTGAACAATATACTCGGTATGCACAGATGTGGTTTATTTATTTATTTTGATATCATA
ACAGGGTGCGAAGAGCGGTGGTGAGTTGGAATCCGCACAAGCTAAGAATCAGGCACTGAG
GGATGCTGGGGCAGTTGTCCCTACTTCCTTTGAAGCTCTTGAAAGTGTGATTAAGGAGAC
ATTCGAGAAGCTGGTACATCACGTCTGATGTTTTTTGCAAGTATATTGTTTTGGGAATGT
GTTAGTCGGAACCTAAGCTTGGGGTTACATATATTTTTTGCAGGTTGAGGAAGGAAATAT
TCCTCCTGTCCCTGAGGTTACACCTCCCCCCATACCTGAGGATCTTAACACTGCCATCAA
AAGTGGGAAGGTCCGGGCTCCCACTCACATTATCTCCACTATCTCTGATGATAGAGGTCA
GATTGGGGGCAACATATTATCCTACATGCTTGATAATTGTCCTTTGCCCTGCTTTCCTTC
CCCGAAAATAATAAATGTGCATGTGTATGATGCAGGTGAGGAACCTTGCTATGCTGGTGT
GCCCATGTCTACAATTATTGAAAGGGGTTATGGAGTTGGTGATGTTATTTCTCTTTTGTG
GTTCAAGCGCAGCCTTCCTCGTTATTGTACCCAATTTATTGAGGTAATTTATGGGCTAAA
TGTAACATGGCTAATCTTCCATACAAAAGCTCTAATATGCTGTGATAATTATGTACCTTT
CCCCCTTCTATATCTAGACTTCACTTGGTCCTAATAAGGTTTCTTCATATGTCTGACAGA
TATGCGTCATGCTTTGTGCTGATCATGGTCCTTGTGTATCCGGTGCTCACAATTCTATAG
TTACTGCTAGGGCAGGAAAGGACCTTGTTTCCAGCTTGGTATCTGGTGAGCTTGTTTAAT
TGATGCATGCGAACCTGTACCATTATGTACACAACAGCAAACTGAGACTTATGGTTGGAA
TAACACAGGATTGTTGACAATTGGCCCCCGATTTGGTGGTGCAATTGATGACGCCGCTCG
GTACTTCAAAGATGCATATGATAGGGTGAGCCATCTTATTTCACATCCCTTTATTTATTT
TTCGAGCTTTGGTTTTCATGTGTTTCTTAGTTGATCTTGTAAACTACAACAATTGATTGT
AGGGTCTTACGCCTTATGAATTTGTTGAGGGCATGAAAAAGAAGGGAATTCGTGTCCCTG
GGATTGGTCACAGGTATAATACCCCCTTGACATCATAATAAACTTGCACCTGAAAATGGG
CTTAAGACATAAGTTGATTGTTTTTAATGTACAACCTCTGAGTTATGTTGTTACCTTTTT
CTGAAATTTCACTTGCATGTCTTTATTAGGATCAAAAGCAGAGACAACAGGGACAAGCGA
GTGCAGCTTTTACAGAAATATGCTCACGCACACTTCCCTTCAGTCAAGTACATGGAGTAC
GCTGTTCAGGTTGAGACCTACACCCTGTCAAAGGCCAACAATTTGGTTATGAATGTTGAC
GGTGCCATCGGCTCGCTTTTCTTGGATCTTCTTTCTGGGAGTGGAATGTTCAGCAAGCAA
GAGATTGACGAGATTGTAGAGATCGGGTATCTTAATGGACTCTTTGTGCTTGCACGTTCA
ATTGGCCTAATTGGGTAAGTCTCACTCTTTTCTAAAGATAAATGTAATTAACTACACTAT
TGCTACCCTAGTTATATTTATATTTTATATATTCCCAATCTGCTTCTTGGATTCACAGGC
ACACCTTTGACCAGAAGAGGCTCAAGCAACCACTCTATCGTCACCCTTGGGAGGATGTCC
TCTACACCAAATGAGGCACCATATAGTGTATTCCACCTGTGTGTACACCATAAAAATAAA
ATCGAGCATAACTGCATAGAATTCAAGATGGAACTACGCAAGGAGGGATAGAGAACCATT
ACAGATGGAAGTTTGTTTCATTTTTTTCATTCAACCATGAAAGCATTAGGGCATCAGATA
TTTGAAAGGATACTTGATAGTTGTTTCATCTTATCATAGTTGGCTGTTAAATTTAGTTCA
GACATTTGGGGAATATTGTAATGATTATGATGCTAGTTCCCCATCACAAAACTCTGAATT
ATCTATTGTCAATTTTATGGTAATAAAATATACATGTGTTGCTGCTGGATATTTCAATTG
ATTTATTCCAAACTTATTGGCATGTACTCCCGTCATGGTTAGCATATATTCCCTCCATTC
ATAAATATAAGATGTTCTACTCCCTCCATACTTAATATGGATCGAAGGAAGTACCTTTTT
TTTTGAATCAGATGTATATTGATACTGATTAACGGAGGGAGTACCATATAATGGTATCCA
TTCAAAACCTTTTCTCTGTTTGATATGTCTCTCTTCTGCTGATGCACAACACCAGCCACT
GCCCCTACCAAGCTGCACTAGAAGCATACGCCTGCTTTGCCGTGTCGTTTTCACCTTTTA
TTGTTGTGTTTTTATACTATATATTGTTTAAGATAAATTAAATATCTCAATAACATGCTA
ATATACCGAAAAGAAAATTGTATGCAGGAAGGCCCGGTTTAGTGATGCAATTTATCTGTT
TTAACCTTATGACATGTCTATTTTGATTTCTGTCACAGCTTACACCCTGCCTTAGTTGTT
CCCGGTGTGGTGATAGCGCTTCAATTTATTGTTGAGATCTTGATCTTTGCCAGGGACATA
CTCCCTCCGTTCCTAAATATAAGTCTTTGTACAGATTTCAATAGTGGACTACATACGGAT
GTATATAGACATACTTTAGAATGTACATTCAATCATTTTTCTTCGTATGTAGACACCTAT
TGAAATCGCTTAAAAGANNNNNNNNNAGGAACGGAGGGAGTATATTGCAGTACTAAATTT
TAGCTGGACCATGTCATGTGTTTGCATTGTTTGTTTTTAGGTTGCTGGCCAGATGTACCG
CGTGGTTATTAAACATGGAAAATACACTTTGGTTCTGGTTGTATATGCATCTTATATGAA
TTTTTTTTCTTCTAATAATTAAATAAAGATTCAAAATAGTTCTGTCATGGTATTTTCGCA
GCATATGTCAGGGGTGGCTTAGATCATGGTTTGGGGCCGACGGGCGCCAGCGGCGTATGT
GAACGGATGTAGGAGCAAGACACATGACACTGATCTGCCCAGGTTCAGGGGCCTCCGGTG
AGGTAAAACCCCTAGCCCTGTCTGTGTGACTATATGAGATCACACCACAAATGATGCTCC
TCGATCTGTTTATGAGGAGGGGGTCAAAGCTCTTGCTGCCGGCCTCGCCGCCTCGGTGGT
GTGTGTGGTTCTGGAGTCTAAGGATTCGCTAGTTGCTTCTGGGTGTGCACCCTCTCTCGG
GCTAAGATGAGGCTTTATAGTGTAGCCTGAGATGTATAGTTGTGGGAGGAAATAGGAGGC
GGGACCCGGCTGCCAGCCTCTTCGGCTGGCCGTGGGGCCCGTTGGCTGTCGGCTCTTGTC
CGGTGCGGGGCCCGCTGGCCGTGCGTCTCAGCGACTAACGCGTCGGTCATTGGGGAGTAG
GTAGGGGTGAGCATGGCTATAGGGTTGCCTCGCCCGGTCAGCCTCGGGGGCGACGGGGGT
CCTGTAGCCTCGCTGACCCTTCCATCATTGCGCACGTGGCCACGCCGAGCTTGTCAACAT
GCACTGTGGCCACGAGCACCTCTGCATCATGCATGAGGTCTCGTCACAGCACGTTGGTAC
GGTCGGATGGGACGGGGATGATCGGCCGGCTGGCGTCGGGCCAACTGGCCAGCCGAATGC
CGCCAGTCGGTCGGCAGCGCGTCGACCAGACGGGCCGGCCGCCCCTAGCCCGGCCGAGAG
GGGGGGGGGCGGGCCGGGCCACACGGGTCCGGGGACGGTGGTCCT