Map Locations of contig_51470 (12598 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_51470

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_66368 2 1453 bp MLOC_66368.2 Available Available LOC_Os12g02760.1, FRAME:-2, EVALUE:2e-77, 13112.m00221 protein DUF567 domain containing protein, putative, expressed
MLOC_66367 4 2279 bp MLOC_66367.4 Available Available LOC_Os12g02730.1, FRAME:+1, EVALUE:6e-82, 13112.m00216 protein histidine triad family protein, putative





CDS Structure of MLOC_66368






CDS Structure of MLOC_66367






Contig Sequence (12598 bp)

>contig_51470 12598 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CGTTTTTTCGTTTCTGAGAGGCACGAAACGTGCCTCTCGCGAAGGCAAAACCGTACCTCT
CGCAAAAGTAAAACCGTGCCTCTCGCGGAAGTAAAACCGTGCCTCTCGCGGAAAAAAAGA
GAGCAGAAAATACATTTTTTTCCTTACCGAGAGGCGATAACAAAATCGTGCCTTTCGTAG
AAAAGAGAGAGTAGAAAACACATTTTTTTCCATTTTCGAGAGACACGTCCGTGCCTTTCC
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GGAGAAAACAGGTTTTTTTTTTCCTTTCCGAGAAGCACGGCCGTGCCTCTGGCAAAAAAA
CAGAAACACGTCTTTCCCTTCCAAAAGGCACGTCCATGCCTCTCGTGATAGCAAAACCGT
GCCCCTAAAAGAACGCATTTTTTAAAAAAATTACGTCGTCCAAAAGCTACGAAAGACCGG
TAAAAAGCCGAAATGAAAAAAAAGAAAAAAACCAATCTAAAAGGCCGAAAACACGTGCGA
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GAAAACGTATAGGAGTGATTATTAAGAGACTTTCGAAGGAATGCTCGCTAACTAGTTGCT
TGCGGCTTTGGTTGTTTGCAGCCCAGCGGCTGCATCTGCAGCAAAGCTACTAAGATGGGC
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CTCGGTGCTCAACTGTTGTGTTGCTTGCTCCCCTTAAAAAAAAAAAAAACTGTCGCCTGC
TGCTGCGGATGCTGCTTGGGCTCTGCTCCGCCCTGCGCTCGCGTGCCCTCCTCCTCCCCC
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ACCTACGCCCCCTCCTCCCTGGTAAAAATCTCTATGATTGCCCCAACTTTCCCTTGTCTA
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GGTGTAGTTAATAATTGCAAGTCTGAATCACAATTATCGCCGATATCGTCTGAGTAGCAC
ATGCACATTTAAACCCTAGCGATGTTGTATTAACATTGTGCTCATTCATTTCTGCGACAA
GGAATGCGGGACGGAGGGAGTATGTATTTGTAGTATTGCAGCTAGTATTTATGATTACGA
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AAGCCTGGAATCTCTTTTTTTGTCGGACTGTTCATAAACCTTGTTTCGCTTGCTTGTTTC
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CTACACCGACAAGTTCACCCAAAAGCTTATCCTCTCGAGGAAAGGCAGGAAATGTACTCA
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ACGACTACTTACACTGTATGCATTTTTTCCTTAACAAAACGTACATGTCCTTGTGTGCCC
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CACTGCAAAGGAAGTTGGTGTACGGCTTGAGCAGTACCACAAAGCTTCTTCGCTTACATT
TGCAATTCAGGTCAACTCACATTCTCGCTATATATGTACTGATTAGCTTATGCTTCCAAT
TTTTATATAATTAGTTCATCCAATTGAAAGCACATGATGTTTGGATTCTGCTACTGGGGT
TCAGAACAAAATAGATCACGCTAATCACCTAAATTACACCACACTGCCATATGAGGTTCC
TGTTGGTTCTTTCGACTTTTACTCCAAATCTTCTGCTGATTTGATTACCTTGTTCGCCTT
TTACCTTATAAATAACCTATGAATGAAAAGGAAACATTTCCTTATTGATAGCTCTTTTGG
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GGAGGAAGGGAGATTTTGAAAATAATGATGAAATATATGACGCGGTTCGTTGACCACCCA
TTTTGCCATCCATATAATTTCTTATGAATTTTTTCACTAAACCTACCATTTTCCTTCGTA
ATAGATTGATGTGAAAGAAAAAGAATTGAAGGAAAAGCTCGATCTGGATGTTCAAAGAAA
AGATAGGACCATGGAAGAAATGAGTCATGAAGCTAACGAGTACCGTGCTCTTTTCTCCTA
GATGTATTTCTTACAAACTGTTTTCTAATTTTTCACTCAGTGTTTTCACTGAAATAGACT
TCTGGACTGTTTGTTCTGCATTGTTTTTCGAGAGTGTAGCAATGGATATTTTATTTTCCA
CTGACCTGGTGATGTCGAGTCTTAACTGATGAGTCTGAGGTAGTGGGTTACTTATGTAGT
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GTTTATTGATCGCAAACATGCATGAAAAAACACAGGAGTCCGAGCCTTACAATGCCTGCC
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AGATGTACAAGAGACTAAGAGAGTGGCTAGATTGTAGCAAAAATGATATATGGTGTTTAG
ACATTCTATTGCAGGGGATGTAATAGCTTCCTAGGCATGGAGCGTTACTGTTTTACTTCC
TCCTTCCTAAATATAAGTATTTTTAGAGATTTTACTATTGAACTACATATGAATGTATAT
AGAGATATTTTAGACTGTAGATTTACTCATTTTGCTTCGTATGTAGTCCCCTATTGGAAT
GTCTACAAAGACTTATATTTAAGAACGGAGGGAGTGCTTCTCAACCGAAAAGCATTATTT
GTTTTACGTTTATGATTATTCCATGAGTGATGAAATCTGCTATTATCAGTAGTAACCATA
CTATAGGCAACAGCTCTAGCATGGACTAACATGAACTTTTAATACGTGGAAGACACTGAA
CTAGGCCTCTTGCAGATTGTTCTAAGGATATACTAAGAGTTGCAGTTGTAAACTGGCATC
ACGAATTAATATGAACCAACTGGGCACGCATCATTTAGTTTCAGTTTACAAATTGACTCA
ACATTACCCGTGTAACATTTAAGTTGGTGAAAGTCAAATTTTCTTGATATTACTTTGGAA
GGTGCATTAAGGGTTAATACCGCACAGAGGTGATAGTTTATTTGGGTGGAAGTATTCTGC
TCATTTTAAAGCCTAAGATGTTACAGCTGATACATTGCACAACATTATAGCAAAACTGAA
TTTGTAATACTCGATTCAACATATTCTTGATGGGGACAGGAAGGGCTGTATGATGTTACG
TGCTTATGTGCTAAAGCTTTATTCCCTGAGCCGGCTAAGCATTTAGCTTGTGCTTTGCCG
AAAGTGGACTCTTCACTGTTATAAAATGTTTATTAGCAAAACAATTCCATCGTAAATCCA
CTCATAACCTGTCGTGAGTTGAGCCTGCCTTGTGCACACAAGAAAACCGAGTGTTTGAAG
CTTTGTTTTTCCTCTCATAAAGCATCATGGCATCAAAATTTCCTTGCGATGGTCGAAAAC
GTTTCTTAGCTCCGAAGGACAGTAGTAGATCCTTTGAGGGTATTTGATTGATTGAATTTC
AGCGCTTGGGTTTCTTTACGCGTCGTGGAAGAAAGCTCAGGTAACGGCTGATTTGGCCTG
CGGAGTCGGGGCAACTTTTGTCCCTTTCATCTTGTGCATATTCTGCCTGTGGAGCTTGTG
CGACTTTGGTCATTTTCATCTTTTTACGCTGCATGCCAAAGAGGACCTTTGTTCTTGTGG
CCGCGGAAAGAAGGCTTTTGTCTCTCACCGGATGCCCCTGGCTGGATGCCACATGAATAC
ATGATAGGATGTGCTGATGGAGAAGAATATTTCTGCCTTGTGTTTGCTTGCTGTGCGTGC
TCTGGATTGCAATTCGCCACACCTGCTGGTGTCTTTGCCGAGCGGTGAGTGGTCAGTGTT
GGATTCGTTGCCTCTGTACTAGGTAACCTGCACCAGGTAATTTCCTCCCCGTCGTGGTCG
TGTGTCCTGGAGGGCTTGGCAATGGCATTGGCATGCCAACAACTAGGGCCGTCGCTTTGG
CGCACTTGCTTGCCCATTTATTGTTCGCTTGCTTGGTTGCCCCAACATGTTGGTTGGAAC
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AAGGAGAATTTAACTTGTTAGGGATTTAATCTACTCAATCCCTGCCAAATCCCTTCCACT
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ATTTCAGTGCTTTGGGTGTCCACTAATCCCACTGAATTTCTCAACTCTACTGGGGATGGA
ATTGGCATCCTGAGGTCACATTGTGCGCGTCAGTATATTTATTTTCTATGTAGGAGTATA
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AAGAACAGCTCTTCGACATCACAATGTCCGGCGTTCGTGTGCCGCGGTTCTCCGACTCAT
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GAACACGTCGTCGCCGAGAGCGACGGGCCTGGACGACGACGCCACCGCCGTAGGTCCACC
GGCTTTCTTCCTGAGTATCCGCGCCGCCTCCTGGCCGTCGCTCCGGGAGATCTTGCAGCT
CCTCCTGGAGAAGCAGCCCTCGACGCGGTAGCCCGGAGGAGGGGAAGGCGGGGCCCGGCA
GCCGCGCCCTGACGTCGTCGCCGTCGAGGCCGATGACATGTGGACCTCTGCGTCGTCCGT
GCTCTGCAGAGCGGTGCACTTCCGCATGGAGAACAGCTGCTGCGGCTGCGGTTGCGGCAC
GGAGGAGCTCCTGTCCGTGTCCGGGCAGCCTTCTTCTCCCGGTGCAACTCTGTAGCAGTT
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ACCAGACGCAACGTTTTATGCTGATGCTGTGTTGTTGTGATCATGCCTGCATGCATGGTA
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GCCGGCGAAGGCCTTGGGGCGGCGGGCGTAGTTGTCGACGCGGAAGGCGAGCCGCCCAGC
GGAGTCGTAGACGGAGAAGCCGTCGGTGCCCTGGAACCCCATGCTGGACCTCTTCCACAC
CGTGTACACCGCCGGCAGCTGCCGCTCCGCCGCCGTCCGCGCCGCGCGGCGGGCGCCGTC
GCCGCGATCGGAGGGGTGGATCCTGCTCATGCTGGTTGCTCCGCCGGCGCCAGAGAGAAG
CAGGCACATATGATTCTGCAGGCTGCTGCAGGTGTGCGATGGATGGATGGATGGATGAAT
AGAATGAGATGGCCGGGAACCAGTGTGGTGCTTGGCTCTTGATTTGTGGGGCGGGAAGCG
AGCGAGTCGATTGCGATCGGCGTACGTGTGCGTGGGCGTGTGGAATGGATGGAGCGAGGA
GTAGGGTGTCGTGAGGGGGCGGGCGCTGGATCGAGGATGACTGCGGATGGATGGGTATGG
AATGGAATGGAGACCTGGCTTGCATGCAGGCTGGACAACGAGTGCGTCCCAGTATTTAAG
GCCGGTGTTGCAAGCCCGCAACAGCCACCAGCCCGTTAAAGCCCAAAAGTGCCGTCTCCG
GCGCTGCATGCCACCCCGTCCAGTGGAGACAAAATATAAGGCATTTTTCAGCTGATAACC
ATTTTGTTCTAAAAAAACAGGTAGCCACTTTTCTCGGTCTACTGAAGTGCCACGTATCTA
CTTCTAGTGAGACTGCTTCTCGGTCGTCGGGGTTTTGGGTTTCGATGATGGGTCCACTTG
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TCCCCTTGCTGCCCTCCACCCCACCCTCCTACGATTCCCTCTCTTTCCGCATGATAAAAG
GAAAAACAAAACAAAAAATAAAAGCCACGACAAAAAAAAACAGCCACAACGTCCCGCATC
CCACGTCCAACAACCCCCTAGCGCCTCCTGATCCCATATCGCTCCCGAGAAAATTCGCCA
TCGCCGTCCCTCGTGCTAGCTGATGGCCAATCCCAGATCCCTTGGAGCTCACCACGGTCC
TCCTCCACCATGCGCCCGCCTCCTCCCACGGCTGTGGCCCGACTTATCCTCATCTTTCTC
TCTCACTATCCATGGGTCGGCCACGCCGGCGCGAGCGCTCACCCTTCTAGCGCTTGATCA
CCGCCCACGCATAGATGATGGCGTCAGCCGCTTCATCGAGGTCGACGAGTCCCTCGGCCC
CAGACCCAACCCTTTCGCTTGCCTGCATGAGTGGCTCCGTTCGTGTTGATGGGGTCGGTT
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CGGATAATAATAGCGCGGTCCCATAGCTAGCTCGTTCAAGTCTTTGGTCGACGCCGTCCT
GCCGCTGCTCTCTGTGCCGGCGCCCACGCCGCACTGGTTATCATCCCCTCCAGCAACAAG
GTTGTCATCCCCGCTCTCTCTATCTTTCTTATTTTATTTTCACATCCTTGTCACAAAGCT
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GAGTTGCTGATTTTTGAATAACATTGACATGCTTGCAGATTCTTGTATGTGCAGAAGAAT
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GAAGAGTGACGCTAGACGATGTGGGGATGCCGTACTCGGCCGACAACATGCTCCGGGTCA
AGACTGGGGCAACCAAGGAGAAGAGTTTGCTCATCGAGGTAGTCATCCTACCTGTACATT
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GGATGCAACATTTGTTTGGCAGTTCTTTACTCCAGTGGATTCGTTTAGATAGAAGTAGGA
GAGCAAGAAACTAATGATATCGTTAGTCTAACGACTAATGTTTTATTTTACTATCATCGA
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AGTATTTCACCGGTCAGTCCGTCCACCCGCGAGCCATGAGATCCATCTACCCAGTTGTTG
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GCTGCTGTGTAAGCTACGTGAGAGAGAAAAGAGGACTGAGAGATCACAGGGATGCAGTGT
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GATGACCCGCTCCTGTGTGGGACTGAAAATTGGGCTGGGGGAGTTGCAGTTCAGTTACCA
CCCGCGAGCCATGAGATCCATCTACCCAGTTGTTGATGTTTGTTTGCCTTCTGTTGCTAT
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GTCTAGACTTGCTTTAAAAAAAATTATGATACCATCACCTGATATGTTTCTGTTGTTACC
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GAGGTTTCCCGGGATTGTGTGTATCATTGCTTTGTGCATGCTGAAAAGGTTTTGTATATG
TACTGAATTGATAAAATTATAGTTGCCTTCGGATTATTAATTAGCAAACAGATCGAGACT
GGAAGATTCTTCAGGAATAGAGGTGCCGCAAAGGCCCCAACAGTTAGATTCTTCAAGAAT
ATTATTTCTCCTTTTTGCTGTAGGAACTCTTCTTTTAGTTGTCGTTCTCACAAGATTCTG
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GTTGCCTTCTGGTTCAAAGATAAATCAACAAGCACTCTTACCTTATTTAAGAACATGTTG
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ATTGATGTTATAGTCATATGTATATTATTTTAATCTTACAAAGTAACAAGTGAGTTGAAG
ATCACAAAGTCATGTTTAGCTATATAGGAGTGAACTCATTTATTAGTTTACTGAAGTGAT
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TGTTCAATTTGTGTTTTATTTAGTGGATTCTGAAAGATGAAACCAGTATGGTGGCATCTA
CCAAACAAAACCATGACATATATTTTCATGGAAGTCGTGTGATGGCAAGAAGAATGCAGC
AATGAGGATTGCTATGTAGAATCTATTGTTGTACTAGAGTATTGATGTTATAGTCATATG
TATATTATTTTAATCTTACAAAGTAACAAGTGAGTTGAAGATCACAAAGTCATGTTTAGC
TATATAGAAGTGAACTCATTTATTAGTTTACTGAAGTGATTATCTAGAGCTTGTGAGGGA
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CCTGCATCTTTTTCCAAGAGATCATTAATGTATCGTATGATCATGCTGCAGTTTTATCCA
TTTCTCTTGTTTGATCTACTCCAGTTTCATTTATTTAGTGGTGACAGAGGATGGTTATTT
ACCGTGGAAGTGTTCTGAGATATAGTAGTCGAAGTTGTGGTTGATCATACTGTAGTCAAA
GATGAGTACAAGCACAAGCTGTTTGACACGATGTAGTTTTGACTACATGGGACGCATGTA
TATATAGTACGTTTGTGAAGCTAAATGGATCCATGATTCTAGGCTCTAGATTTCTTGGAT
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ACATGATTTTCTGGAGATTTGTTTGGAGCTTAGTAGGCTTGAACATGCTGGTGTTTATTA
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GCAGCCCCGAGGCTTAGATTGTAGGTTGTGACATCATTGGTGATGGTTCATTAGGACCTC
ACCAAATTTGAATATGATGTGGCTTGCCACGCCATTACTGACGTAAGAGAGGCAGATGTT
AATGGACTGGAGTGCAGGATGCGGGAGGTCGGCGATGCTAGGGATGATCACAAGGTTTAG
AGGGGTAGCCTACAACTGAGACGACCGCTTATTTTTTGCGCAGGGGGCTTCACTCGGGCA
AGGGGGCGATGAGGTAGCGAGTGACAACACTTGCTCACCATGGATGGCGGTCACAAGTGG
TTGAAGGTAGAGTTGGGTGGGTCGATAGGGTAGAGAAGAAAAGGTAGGCGTCGGAAGAAT
AGTGGCAGCACTGGGTTGTCGCGACGGAGGAGAGGCAAGGGGTTAATGTACTTGAGTGTG
TGGGGTGCAGGAGGTCACGGGCACAGGTGATGGTGGTAGGGTTTAGAGGGATGGTTGGCA
TCGTCCTGGCGACCTGAAGAGGGGGTGGCATGTGCCAACACTCACCAGTTTTAGGGTGGT
GTAGGCAGGGAGAGGTAGGCGGTGTTACAGGGTGGATGAAGAAAAGAGCAGCAACAGGAA
GAAGAAGAAGAAGAACCAGTAGCAGCAGAGGCGGATCATCACTCGCAGAGAAGGGGTAGG
GGATTTACTGATTTGAGTCTGGGTAAGGGAGTTCTCCTGTGGCGGAGATGGTGGCATGAT
TTAGAGGGATGGCTGGCACAACATGCTGCAACATTTCGTTTGCACAATCCATCATGAGCA
GTCATAGAAAAAGAAGAAATTGGTGAAACTATGTTACAATGATTTGTTTGTATGGAGAAA
CGAGGAAGATGCAACACCCTGATTTTTCAAAACCTTTTCTTTTTAAAATATTTTTTGAAG
ATCACTTGCAATTTGGTGGATTTTCAAATTCTCAAAGCAAGTTGGATTGTGAGGTCTTTG
ATTTCTTTTCTCAAGCAACCCAAAACCTTTTGCTTCTTACTAAATCCTTTCTGAGACTTA
TTTGCAAAATTTTATTCCATAAAATAATTCTCTTTTTCCATTTTGGGAATTATAGCATCA
CTATGGGTTGTGAAGCAACCTATAAAATTTTACAAGATATTCTCAATACCATATGATTTC
AAAATATTCAAAAATATTTCTTNNNNNNNNNNNNAATTATGGCCAGAATAATTATTTATT
TTCTGACCAGAATTATCCCTTTGTGAAGTAACCCCATGATTCCTGTTTTGAAAAATTC