Map Locations of contig_51253 (8756 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_51253

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_66218 3 3175 bp MLOC_66218.1 Available Available LOC_Os07g39730.2, FRAME:-2, EVALUE:3e-171, 13107.m09961 protein ZCW7, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_66218






Contig Sequence (8756 bp)

>contig_51253 8756 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGCGTCTAATACTTTGCTTCGATAAGACTTTTGCAATAAGTATGTGAGTNNNNNATGACT
AATGTTGAGTTCATGGGTTATACGCACTCTCACCCTTCCACCTTTGCTAGCCTCTATTAC
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AAGATATTTTTATCGAGTTAATGTAGTGTTTTATAGCTTTGCTCTAATTTTCAAATACTA
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AATTACGGGATAATGGGATCTATCAAAGAGTCACTACCTCCGGTGCTAATTGCCATGTAT
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TGCCAAAAAGAAGCTTTTTGCAATGAATTCTGACTATTTGTTACTGGATTTATGCACACA
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TGAGAAAATAAGGAGGTTATACATGAATGGCATCATATTAGAAATCACATATTAAGGAAT
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TGGACACTAAACTGCACCTTATTTTACCAAGAGCTGAGAAGATAGTGTGGGTGACCAATG
TGGATGCCTTCGACGATATCCTCGTCTCCGCAAACCACCTGGATGGCACACCCCTCACAA
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TTTCGGAGGAAGGCGAGGAGCGCGGACTTGAGCTGCCACTCGTCGACGGGGCTCACAGAG
AGGCCGGTGCGGGAGAAGGAGAGGAGCAGCTTCAGGCGCCGCGCGAGGGACACGCCGCTC
GGGAGAGGGAACGGCTCGCTTGGACGGAGCGCGGTGGCGGCGGACATGGCTGCGCGGTGG
CTAGGGATGGCGTCGACGGCCTGCGGTTTTTTTTTCTTTTTGACTGGCAGAGAGACTGAA
GACGATACTTCACAACTCACACGAGGGGCCACGGTAAGATCTAAATCAACGGCTACGATT
AGAACAAAACTCCAACGCACAGATGCATTTGGTCCCTATGTGTCTGTTTGAGTTCAAACC
GACCAAATCATCCGATCAACACACCGATGCAAACCCAAAATCCGTCCATCTCATGTTTAT
CTGGACGTATCCCGGTTTAAATTTACGCCGGGTTGCGTCTACACGTACACGAGACGAACG
CGTCACATGTCTGCTCGGTATCTGTGTCGATCCACGTATCGATCGTCCAACCATCAATAC
AGTCCTACTTAATGCCTGAGCCTGAGACCGCTTTTTTCCGTATTTGTCATCGTATTGTTT
GTTTTATGTTATTTTTACACTGCATCATATCATCATTGCCATCATGCCATTAAAAATTCA
TCATTTTTTAAAACCATAAATATTTTCAGAAAGTAATATGTGCCTTCCTTTTGTTTTATT
CAAATGCTTTTTCAAATTTCATTTTAATCTTTCCTAAAATCACATGCCTATTCTTTTTCA
AGTTTAGCATCAAAACTTTGTCATAAATTCTCTTCTCACTTCCCAAAGCTCCACCAAAAG
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TTTCGGTTTATATTCAATAAATAAGAAAAAGGAGTCACTACTGGAAAACAGTTTTT