Map Locations of contig_51218 (7146 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_51218

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_66198 1 1232 bp AK374404 Not available Available None
MLOC_66199 1 1502 bp MLOC_66199.1 Available Available LOC_Os03g04960.5, FRAME:+1, EVALUE:2e-20, 13103.m00520 protein cysteinyl-tRNA synthetase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_66198






CDS Structure of MLOC_66199






Contig Sequence (7146 bp)

>contig_51218 7146 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GACTGAAAGGCTTGGTTGTTGTTATTACCTATCTTGATAAATATGGTAAAAGCATCAATG
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CAAGATAGTTGGCTGTCGGGATCTCCCGATCATGCTCCTTTGCGTCCTGGTGGACTCGCC
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GGACCATGATCGGAGGGAGGGAGGTGGCGGCGTGGTTTGGCGGGTTGGCCATGGCGCGCG
TGCGGAGGTAGAGGGAGGTTTTGAGGAGAGAGTAGAAAAATGAAGTGGGCGAGAGACCAT
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GGCGTGACGCCCTACGACTTCAGCCACGTCGGCCACGCCCGCGCCTACGTCGCCTTTGAC
GTCCTCTACAGGTTCATGTGCCCCGCCGCCCGCGCACTCCATCCGCTGTGACTCTATTAA
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GACCTGTAGCCCGTGCCGCCAGGCCCCAGATCCGGCCTCGACCCCGCCGTCCCTGGTGAC
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GTGAGCCGCCCCGCGTCTCGCCACCCGTACGGGGAAAGAAGAGCGCCCCGCCGCCGGCCA
GGCTTCGCCCAGTCGCGCCCGTAGCCGCCGACGGTCGCTCCTCTTCATGTTTTCATTCAA
AGCGGGCTTTCTGTCTAGTTTTTTCCCCCTCTCCTTTCTGTTTTTGCTGCTTCTAAATTC
CAAATTCATCAAATGCTCGTTCCCCATACCGCTAATCAGGCTCCTCTATTTTTGTGTTGC
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CCGTACGTTGGAGCAGGAATTATTCACAATACATCTCAATTAGATTTAGTTACACCAAAA
TCAATATTTGTATTAATAATATAGGCCTAAAACTGAAGATAGATGTAATTAATGTATAAT
TGTGAAACATTTGTTGAATATAAGTAGCACAATATAATTAAACATTCGAGCATATTTGCA
TGTTGAGGTTTGCCTTTTCTCATGCATAGTTGCAACGATGAAATAAATGTGTTTGTGGGA
AAACATATACTCCCTCCGTTTCTAAATATAAGTTCTTTTAGAGATTTCACTAGGGGCTAC
ATACGGAGCAAAATGANNNNNNNNNNNTTCTAAAGTATGTCTATATACATCCTGTTATGA
CCAGAGGCCCAGTTAGCAAAACTGGCCCAGTTATCTTAATATTATTAGGGGCTTAGCCCA
GTTTATTATAGCCTAGGGAACTTATATATAGTCATGTAATCAACACTTTTGAGATTAAGC
AAATATCAATCTATTTTGACCGGCTCCAACTAGGAGCCGGTGCCCTAACCCTAGCCGCCT
CTTCCA