| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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No map location |
Predicted Genes from contig_51213
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_66191 |
1 |
221 bp |
None |
Available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_66191
Contig Sequence (10313 bp)
>contig_51213 10313 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AGACTCAAAGAATAGCGCTATGCCTCCCCGGCAACAGTGCCAGAAAATAGTCTTGATAAC
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG
ATTCGACACAAGGGGAAGCCAAGGAGTGTAAGGGTCGTCGTATCTCCACTCAATGGAGAC
GATGGAGGTTGGTTTGGTGGGAGCACACCAGATCTGCCGTGGGGCTACAAAATACTCGCC
GTGGGTGGGTGCGGTGTGAGCTCATGCTAGACGTGGCTGGAGGAGGAGGTCACAGGGTGG
TGGAGGAGAGTGGCGGTGGCAGAGGAGGAAGTGGATGACCGGCGAGGAACTTTTCTTTTG
ACTTACGACTGGCAAGAAACAGTGCGGACAAGTTTGTGTTTTGGGATTTTTGGTGCGGTG
CAAAAATACTGGTGGCGTTACTCTTTAACCCCACGCCATTAAAAAAATTGTTAGTTTTTT
TGTTTTTCAAATAGGTTTTCCTGGTTACTAATGGCATGGCAAAAAATGACACGCCATCAT
TATACCCAATACCGATGGCCCGGAAATAATTCACACGCCATCCAAAGTACTCGTTGTGAC
GTGTTGATTTTCCAAGGCCGAGCATGACCCAGGAAAGTGTGTCCAGCGAGAGTTTATCAA
GCGTGTTGGGTAATTTGGTGCACCCCTGCAGGGATAAAAAATAACTATTCAAGTAGCCGC
GTTCACCGTTACAGGACGACTTGGAATTGTATCCCGATCTAATACAAATAGAACTGGTAT
TAACTCAAATGTTTGGCTCCGGGATTGCTGTCTCGCAGGGAGTCGAGGAAGAATATCTAG
GCATGACTTATTTAAATTTGCTGCAACAATATGACTATATATGTGTTATTGTTCTACTCT
CGTCTAATGCTGCAAGACACTAAAGATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCCCTTCTCTCT
ATTCTTGCATTGCATTAGTTAGTCTAGATATAACCCCATTCCCTTGATACTGATGCATAC
TTTGCATCATTCTAATGTCAGTCTTGCAAGTATTTTGGATGAGTACTCACCGTTGCTTTT
CTCTCCCTTTTCCCCTTGATATGATTGTCGTAACCAGATGATGTAGCCCTGAATATGGCG
TATCCCGCTGACGATGACTACTACCCCGACGGTGCCNNCTACTACGTGGAGGTCGCTGAC
GACCAGGGGTAGTTCAGGAGGTTCCCAAGCAAGAGGCATCGCCTCTTTTGATCTATGTAT
ATTTTGTGCTAGCCTTCTCTAAGGCATAAACTTGTTTTTATGCGTGTACTCATATATTAT
TGCATCCGCTGACTCGTGTGTTTCCCGAGCTTATATATTCGAGCACTCGAGGTCCGTGGC
TTGTAATATGAAGCTTGTATGACTTATTTTGTGTCTAGAGTTTTGTTGTGCTATCTTCCG
ATGAGTGCCTAATCTTGGTCGTACACATTGCGTGTATGATTAGCGTACGATCAAAATTGG
GGGTGTCACAAGTTGGTATTAGAGCCGACTGCATGTTGGTTGCCCCCTTTCCAACTCCTT
GGCCGAAGTTGAGTGTAGTATTTGAAGAACTTTTATTAACATTGTTGCCTCAGTTACGAG
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ATCTCTCTTCTCTTTGGGGTTAAAGATTCTACTAATTCTCACTCTAGGTTCTTGTACTAC
TTCCTCCTGGAGAGCCCCTCATCCCAGATGATGACTTGATTCATTAGAAGACTTCAAAGA
TACTCTGTGATGTTCTCTCTTGAACGTGTGCTGATCGCTTTTTGCAATTCCCTTCCACCA
TAAACCCCTATGAACGATTGCACACAATTGTTGCTCATACTTCCATTTTCTAATTTATCT
TGGTATTACAAGGTACATTAAATTATCTTATCGGGGATTCGTTTGTCCTTAGTTGTCATG
GGTTTCGCGAGTCCTTCGAATTGCTATTTGATATTTCAAAATCCTCAATAGCCTATTTCT
CTTGACCTTCCTCACCTTCTTGCATTATGGTTAATTCCATATGTCTAGAAACATTCATTA
AAATACTTTGTGATTGTCCTTTGATCTTATTNNNNNCAACATGTGTGTGAATGCACGCAA
TCTTTAGTAGATCCTCATAAATTATATGTCCGACTCAGACGTCTTTCCAAACAGGAACTG
GTTCTCGGCAAATCAAACTTCATTGATTTCCCAATCTAAGTCAATTCAACTTGCTTGAAT
TTGATCGGAGCATCTTATTTTGATACATCAACCTAGGAATATTAATTCCTTTGGTATTTA
TCTATCGATACTTTTCAAGTGTTCTATTAGCCGATGCCTTGCATTATATCTTCCTTTGAT
TGAGTATCGATACTCAAATCAGGTCCTTTGTGGACCGCCAGACCCATTGTTGCGTTATTA
TCCGATGGCATACTTCACATTCAAATTTTATGTGATATTGCTCCCCTGATCAGTTGTATC
CTATTTTTGTCAGCCATGCTCTTCAATCATGTGTTAATTACTCTTGAAGTTTGTGTCATA
TGTTCCTAAGATGCCCCAATGGGTTGAACCTATGTCTGCCCTAATCCGTGTGAACTAGGG
AGTTTTCACGAGTCCTACTCTCCTGGTGTTTTGCCACATAATCCCTCCAAGCTACAACTT
CCTCAAATGCGAGGAGTAAATGTCAGATGATGCATTGATGAAGTGGGGGTCGACCTTGAA
CTTTATGTTCATGCCCATGGATCCGATGTATGCCGTATCATGGAAGCTTCTCGTAACAAT
GAAATTATATAATTTGATGGGGCATCCGTGATCTTGTTCCGTGCAATCGTGGTTCCAACC
ATGTAGTTCTGCTTTGGTTTCATTCTCATACAAGTTAATGTGCTTGTCTTCCGCAAATCA
ATACACTAGTCTAACCTCTATTATAATCTACCACCAAGTATTATGCCTGGTATCTCGAGA
TTATCATGAAGCTATGTAACTTCTTATGACCTCCTTATAAACTATCATATTTCATTGATT
CCAGTTTCCTCGTGTTCTAGGTTATTGGAAACTCAAGGAAACCGATAACAGGATCAAGTA
TGCATTGGGATTAAACAACTCTTAGTAATCTCCTTTGCTTACGAGTTTGTACTCGATCAC
GTTACTCGAAGCTGTTAGGTTACATGACCATCGTCAGGCTACAACTTGACCATGCTATAT
ATGTCCTTCATCCACGGAACACATTCCAACAGTGCAATAAGCTTACGTCGAGTTTTCAAC
ATTATGTTAGTTGTCCTGACAGGCAATTTCGATTCTGAGCTAGCAACCTTATTTGTGTTT
CCGATAACCTTTCGCTTTACCATTCCTTTGATTGACGTCATTGCTGAATGGTTACATCTT
CATGAAACTTCTTGACAAATGTGTCGTGATCACCATCAGCATTCTGAGCTCTTACAGTAT
ATCAACTGAATTCAAGATGAGAAATGCCATCCTTTCCCACTGATGATTTGTGTTATTATT
GACAGGCTTATTGCCTTCCCTCCAGCACAAAATTGTTCATGTTTTGTGTTGTCCCTTGAG
TTCTTTGCTATCCAGATTATGTCATATACTACCTTGGAGTATTACCATCTTTTATGCCAA
GAGTGATGTGAGAATTGATGCACCCCTTAAGAATTTCCTGATATAGTGATACTTCTTGCC
ATCACCACTCATTTTTTGGTTCCCTTGTTGTTTCTAACTGGAATACCGACAAGTGAACTC
TAATGTGTGATTCCAATACTTCTGGCAACCCTATGGCTTTGAAGTTAATGACTGATAGTT
TCATTCTTAGTGTGTTGGTTGTTGACTAAACATCTTAGCATTGGTCGTTCTACTCAGTCC
GTAATTTTCGAGTGCACCATGCGATCAATGTTTAATTGTTGATGTTTCCTCGAGCATACG
TCATTATATCATTTGTTTTGACAAATGCTATCTGCTTGTTCTTATAACTTTGGAAATTCA
TCCCTATCGAAATCTTAAGGGATTATTGCTGAGCCCATCGGCCACACCCTCTGTATGGTT
CATGATGAACCTTTTGAAAGAATTGTCCATGTGCCTAGCTCATGAAGAATATGTTTTATA
GAAGAAGTGTTTTCCAAAGTTGACTTGCATTCTTGCCGCCGTGAATATGAGGAAGTTTTA
TTTCGCTTTCTTTGGGGTCATCCCAAATAATCATTCACACATGTGTGAGGTGTTACATGT
TTTGATGATTTGGCATCTTCACTTCATATAACTTTTCTTATCACCCAAGCCACTGACTGA
TTTGGTCAAAGAAAATAAGTTCCTTCATAATAGCTAAGCCAGACTTACACAAGGACCTTG
ATATCCTCGATGATGGTTCCCAAATCGGAACTCGGTTGCATTTTATGGTAAGAACCCCAT
GTGGGCACGAATGTATTGAAATTGTATTCATGTGTCTTACAATCCAACTCCCGATCCAAG
ACTTGCTTCCGTAGTTCATATCTCGAGAATCTTGTATCCTCATCTCTTCTATTTTGGTTG
CCCACTTTTCTTCTCGGGCCTCCTGAGTGTGAGGTATCCTAACACTAATCAGATCTGAAT
CTCGTGCGGATATGATGGTTGGGACATTTTTTCGAAGAATTATAACTTGGATCCTTATGT
AATCCTGTAAGGTGATGGCTTGTCTAGCACACCTGGCCAGATGACCTATTGTTATAGTAT
TTTTTTCAGCAAGATTCGCCATTTTTCCACGAGGAAATCGTATGAGTTATCTTGTAAGTT
GTTCCTAATGAGTCCGTTGTGTACCAAAGGTCCGGCCTTTATATGATTACCATGTCAATG
CTACCTCGAAGCACGGATGTAGTACTTCAAATGTCAAGAGGATCATTGGAATCACAATGC
TAAATTGTTCTCGATCAATTATCCAAAACAATGTTGTATGGGTACAAATCATGATTTTCC
TTCCCGTTTACCTAAATGATTATGTCCTTGCTATCCTTCCATGGACATCATGCTCTACTT
TTCCTTGGGAAGGTTATACTCCTGATAATTGTGTTTAAACACATTTCCCCCTTCCATTAG
TCTATTTAACGTTTCTTGAAATCCAAACTTATCTGAGCAGTTGTAATTCCCTGCTTTAGT
AAAAACCTCGGTGTACAGCTCTGTCAGTAAGACCCTGTTACTATTGTGGATAACAATCCG
GTAGCCGCCGGCGGACGAGAACTTTGCCTATTGGTCCGCCTCATTTCAACGATTAGGAAA
ATGGTTCTATTCATCCCCCGCCCTCGGTACCGACGTTGTTGCCAACATAACTGGCAGGCT
ATCCTCTAACATGTCATTCTACCAACACCGTGCAAGATGTCACTGCTCTTCCTACTCTTA
ACCCATGATGGGCCCATAACCACTAGTTCCATAGGATCGAAACCTGACTCGCATGTACAT
CTTTGATTCCAAAGTATGCTTTGCACTTGGATTTGTATGTAATTCCTGAGCCATTGTCCA
AGGGATGATCTATTCTAGTATCAGACACGAAACATACTTTTGTTGCTGTGAACCCCTTTC
ACTTTCTGATTAGGCATGGAATGATTGCCTACCCTTTTGAAACTTTTGTACCAGCGTTCA
TGCTCTCAATGGAATTCCTGGGTTAGAACTAAAGAAATAAGTCATGTCTTCTTCACCGAG
TTCACCGTCAGATGCCCAGCTTGGTGTACCTATGTTCTTCCAAGGTTTTCCCTATTGTCG
CATTCATAGGACGATGAAGATCCCGATGGAAGGATGACGAGTTCATCAGGTTAACCTTAA
TCAGAGTAGTGAATACATCAACAAGAAGGACCAACCTCTTCGATGATAACAACGAATACA
AGAGGACTTGTTAGAATTTCGTAACCAAATGTTCCTCCCCTTACCTCTATCTCTTCATTC
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AACCACACACAAATGATGTCACGTCATCATTTTTAACTAAGCCAGATAGTCACTTAATAG
AATCAAAGCCAAATTTAAATTTTAAAATAAAGGCAAATAAATTATTTCATCAAATTGTAA
AATAAAAATGTTGGCTCACATGCAAATATTCACAAAGGAATTGCTAGGTTGAACCCAACA
TTATCATACCCACCAATTAACCCCTAGGAAATTATAAAGTCGACCATCAGCAAATAAAAT
AGCCTTTTCAAAATAAATAAATATTTATACTTTTCTAATTGACCTCAAACTTTGTGGGCT
TCTCCAATATATTGTGCTTGAATTATGTGTCAAGTTTGAGTTATAACAAGAATTGTTTTA
AACTAAATACAAAAGTCTGGTGTAAAATATTACAGAAAGGAAAAAGATAAAATATACGAG
ATCTACTATGCTACTAAGTCATAAATGGCCACGGTGCATTTCGCCCAACCCACCTATCCT
TTCCCTAACTCACGTACAGTGGAGGCAGAGGCCATGGCATGGCGCACATCCATGGCTCAT
CTTCGTCCATCCCCTCTCCCTCGATCCCCTTGGTTCCCCCTTCCTCTCTTGCCTGAATTT
GAGCTCGGAAAATTCATGGTGAACGTCGCCTCGCCATCATTACCGCAGCCATCATCGTTG
CCAACGTGCGGGAGCATGCCCAGGAGGTTCGATGCGCTCGGCTTCGTCCACTTTGGGCAA
GAGATAGAGCCGGGAAGTTGCATAGCAGTCGCCATCGTCATTATATCCGTACGGCTGCCA
GAAACTCGCCGTCGATGTCGTTGCTCTGGTCCGTCCCAGCCGCAACCGAGCAGTCCACAA
GCTCCGGGACGAGCTTCTCATCCGACCCCCCTTCTCCGGCTCGATCCGTGCCTATAGTCA
CCGTAATCGAGCTCGCCCGACCCTTTGTACGTGTACGTGCGGACATGCGGTTGCTGCTCC
TGCGTTGTTGTTTTTGCTGCTCTACGAATGCGCTGGCCTGCGTGCGGCCTCGCCCACTTG
CTCCTGGCCGCGCCCCTGCGCCTGCCCACGCTTGCGCACCCGCCCACTGCCGGTTGCCCT
TGCTGCTGACGCTGCCACTGTTGGCTTCCGTTTTTGCTAGTGTTTTTGTCGCCGCTGCTA
CTCTATTTTGCTGCTGCTGGTTGCCGAGCTACTACTGTTGCGATGCCGCCGTTACTGCTT
TTCCCCTCGGCCGCTAGGTGCTCCTGTTGCTACCGTTGCTGCTATGCTGCTTGTTGCCCT
TGGTGATGCGTTGCTGCTTCCCGTTGCTGCCTTGCCTCGTGCTGCTACCAGCCGCCGTGG
TTGCCTGCAGCTGCTGCTGGCCGTGTGTGTATGCCTAAGTGTGCGTGAGTGTGCGCCTGT
GTGTACATGAGTTTGAGGGAGCGTGAGTTTGTGTGTTTGTGTGTTTGTGTTTGTGTGTGT
AGGTGTGTGTATGAGCCGGCCCTTGTTTTGGAGCTGTTCGGTACCGCTCAAAATTAGGGA
GTTAGAGTCTCCCCGCTCCGCAGATCTTAGGGCATGTACAACGGTGCTATCTTAGAAGTG
TCACATAAGATAAATGATGAGGTGGAGGAGAGAGAACTCGAAAAAAAGGCTTTGCCTTCT
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AAAATAACTGATTATAGAAGAGAAGGCTAAGAGATGACCCACTATAGACTCTCTTTTTTG
TCATCTCTAAATTACATGCAAGATTTAAGATAAGACTATCTTATTAATCATTGTACATGC
CCTTAGGAGCAGATGATTACCTAACAGGGCCTTAGTCTAGCTTAGGATTATATTAGTGTT
AAGTTAGTCTAGTAGTAGATGACCTATGGAACCATCCCCTGTTATTTATCATATACTTAA
ATCATAGACAATGATATGTGGGACCCATACACTATTCACCCCTTTGACCAGTCAAATATT
TACTGGGTCAACCCACCCCACTGGCCCCACTATCTTACACTATTGCTAGAATAGCACTAG
CTCACAATAGTATTTTCTATTTAATTTGAATTAATATTAATTTCAGAATATTAATAAAAA
ATTGTAAATTCATATAGAATAAACCACAACTCTGATGAGAAAAATTTATGTAAGAAAAAT
TAGCAGAAAAATATAATGAATCTAAATATGCCATCCACATACGTGTGAGACCTCTCTAAC
ATAGTGAACATGGTCATTTTGCATGAGGATCATCTGTTCAAAAAATACCTAGAGCACGGA
AAATATTGCGAGTTATTTTCCCCTTCTTGTAAAATGCTTAGGGATGCATTAGGGCATGTC
ACCCACACATCTTGCCGTGCCATTGCATTTGTGTTGCATTTGATAGCCCCATCATTTATT
TGTTTTCCCCTGTGTTACTTATTTCCGGTAGACCCCGTGACTAATGATGATTCGGTGATC
GACTACTTCATCGACGAGGATCTGTATCTGTGTGCAGAGCAACCAGACAAGCAACCCCCT
TGATCTTTCCTATATCGCCCATTCGTTCTCCCTCATGCTTGCATTCGATTTTGCTACTGT
TGTAGATAGCTCATGTTCTGATGCATAGCGTGCTTTTGATAAACTGTTAGTATACCATGT
TGCACATTAAATGTTTAGTATAGGTGGATCAGTGATCCCCATTGACCTCTTAGTCCCCGT
TGCCCCGCTTTATCATCGAAGACTCGATTTACTGATCGACGAGCCAAGAGCCATCACATC
ACTCACACACCCCTTGTTGTAAGATGTTACAGAGCTACTATCGAGTACCGAGGGTGACAC
CTCATTACCTACTCTTGATGTTAGCTATGTATTGTAGTTAACCGGCGGTGGTTCATGAAG
AGTGATTCCTCCTTCACACTACAAGAAATATGTCAACNNNNNNNNNNNNATATTGGTCAC
CGAATGGTCATTGATTTTCACTTGCGACCTTTTTATGACCAAAAACAGACGGTCAAAAGC
TGAGGGTCTCTAATGAACTATAACGACCTTTTTGCTGGATTGGTTGTAGGATTTTACGAC
CAAACGAAAGCATTAAAATTATTTTGGTCGTTAGTTGTCTGGCCAAGCCACATAGGATCC
AACGTGGCAAGCCGACGTGGCAAAGTTACGACCAATTGGATTGGTCGTTGGTAAGAATCA
GCCAGGTCTACATGGGCCGAGCCCAACAAATCATCCTTTTATTATTTTTTCCTATTAATT
TTCGTCAACGGCCAGGCCCAACATTTTAGCCTTTTTTATTTTTGGGTTGTAGCCTTTGTT
TTTTGTTTTTCAAATGCACCCCAATTGTCAAGTTCTGGTAAGTGGGTCCCACATGTCACA
TTCTGCTTTGTGGACCCATGTTGTCAAGGTCATGTTTTTCAGATTTCAATATGCTCATAA
TTAAACAATCAATATTAAAATCAAAATAGACACAATACTTCAAATAACAGCAAAAGGCAA
TCTTTTACATAATATAACACATATAAATGTGATCAGCATTAAGTTTACAATCAGATAAAA
AGCTCTACAAGTGTATAGTAATGAAGCATCACATGGGCTTCATTACTCCCAGAACTAGAT
CCACTGAACTATGCTTCTTCTTATTTGTCCTCATGTTTGTGAAGAAACATGAAAGGCTAG
CATCTGCACGTTATACAACAAAATGGTTAGGGGCAAAATAAAAATAATCTAACAGCATAT
TTAACAGTAAATAACAAATAATGCAAGGTACAATGCATAGGCCAGAGGAACAATAAATTG
GTACTAAATCCAGAAATCACCATGTGAAATAAAGTTAATAGGACATTTTAGAATCAATTT
GTCAGCTCACAGTAATGTTTGCATTGGACACATACAGAACTAAAATTATACAGAAATTCC
TAAATTCCAATGCCCAATGCCCGAAATGTAAGATGTTGGTTCTGGAAAAATAATAACTTG
CAACCAGATTTAAAACAGAACAGCAAGGTGATGCTACGACCAAATCCTAACCAGAATGCA
AACCAGAATGCATTTAATAAAATGAATTGCTTCTGGCTGTTGTAGTAGAATGCATTTAAC
CAGATTTAATGCATTTAATATATATACATGCTAACGACATGTAGGTTTCATCAGGTCATG
ATCAAGTATTCCAAACCATTGCATGCTTCGCAAAAAAAATACTAGATGAATCTCACTAAT
AGGAGCACTAGATGATTAATGGAAGAAGTAATCTGCAGATTACAAAGTGAACAAGTAAAG
GATTTATATCTCTCCCTGTGGAAGAACTAAGTCGATGAAGACATGCAGCAGCA
