Map Locations of contig_51069 (12413 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_51069

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_66066 3 1414 bp MLOC_66066.1 Available Available LOC_Os01g35170.1, FRAME:+3, EVALUE:8e-155, 13101.m03558 protein tRNA methyltransferase, putative, expressed
MLOC_66067 1 1116 bp MLOC_66067.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_66066






CDS Structure of MLOC_66067






Contig Sequence (12413 bp)

>contig_51069 12413 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AATATATGCTATACGAAGTTATTACGAAATAACACCAAGGTAGTTCTGCTGAAAGCAGCG
CTAGTCCGGGTTAGTTTCATGCAAATTAGAGGTCAAAATGAGAGCAAAAGTGTTTGNNNA
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ATATTAGTGTGCACCATATCAAGAACATTTTCCGCACGATGTGGAGGGAGTGTACGAAAT
GCAACCCTATGTTGTTTGCCAGCAAAACAATGTGCACAAGGTTTCAAGGATATACCTTTC
AACTCAGGGAGGTACTCCATGCGAGCAAGAGCATGCACGCCCATTTCACTCATATGCCCA
AGCCTCTTGTGCCACAATTCCACCGAAGTGTCTTTTTCAGCAATATTCAACACCTCATTA
CACATCTTGGTTTTAGTCACATAGAGATTATCTTGCCTACTTCCTCGAGCCACAATCAAT
GAGCCTTTGGTGGGCTAAAAAAAGAGAGTCTTCAGTGAGCTTTCACTTTCCTTCGCCAAA
ATAACTAGGATGTTTGATACCTTCAGGCTTGCCCACAAAAAATAAATTCAGTCTTATGTC
GGGAACATGTCTCGCATCATCGAGCACCAATCTGCAACATGTGTTTTGTTTAAATGCATA
TAGAGCCCTTGCTAACAGTTGTTGACGAACTATTGTTTCCCATCCTCACTTGACGAGTAA
CACAACTAGTGTAAGATTTGCAGCACTCCTTGTGTGATGTGATGTACAAGGACGCACCTG
AATCCACAACCCAACTNNTGGCATCATCACGAACAACACTATAGCATTCATCATCTTCAA
TGACTAGATAGTCCTCATCTGTTGCAGTCATTGTTGAGTTGTTCTCAGCCTTTTTCTCGG
TTTTCTTTCCAAGTTTCCCCTCTGTAAGATTTCTTTTGTACTTCCTGCATTCACTCTTTA
TGTGTCGCGGATTGCCACAATGAAAGCAAGTAATGTCTTTTCTCTGTTTTGACTTTAATC
TCCCCCTAGATTTGCTTTTTTCCTTGCTGAAATCTGGTATTGCTCCATCCACGGTTCTCA
TTCGTCCCATGAGTTTCAGCCACATACACATCAGAAGAAGANNCATCACCCTTTTCCTTC
TTTCTGGCTTCTTCATTCAGCATGTTGTTCTTCACCATCTCCAAAGTCAGTTTCCCATCT
GGAGCTGAATTGCTAAGTGACACAACAAGCATGTTCCAACTATCAGGCATGGAACTCAGC
AGCAACAATGCTTTCACCTCATCCTCAAAGTTTATCTTCATGAATGAAAGTTGATTTATA
TGGCATTGGAAGACATTCAAGTGCTCAGTCACACTTGTGCCATCTTGGTACTCAAGCATT
GCAAGTATTTTGAACACCGAGACCTTGTCCATTGATTTCTTTATCTCATACATAGACTCC
AACTTCTGCCACATCTCATACGCATTTGTGTCATTTGCAACATGGTAGAATATATTGTGG
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ATGACCACTATGGGTATCTTATCTTTCACAACTGGCTCATACAAATCCTTGCAATAAAGG
ATGTCTTCCATCATGGGCTTCCATAATGAGTAGTTGGAAGAATTAAGTTTCATCATGCCA
CTTGTGGTAGCGCTTTCTTCCAAAGCCGTTGTGAGCATCACTTCCAGCAACAATCAAGCA
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ACAAATGCACTTGTGATTAACTGAAAACTACAACGGAAACAAATATGGGATACAACAAAT
TTCTTCTCTAGATAGCACTAGAGGATCTCATACATCAAGNNNNNNNNTAGAGGATCTCAT
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CTTGGATGANNNNNNNNAGATTTGGGGCTCAAGAGCTAGGGATTGGAACAATCTCAGAAA
ATATGGAGGAACTGCAGCGTGAAGGAGACAAGGTGGTGGATCTGAAGCATCACAACCTTG
GGAAGGAGCTCCCTTTTCTTCTTCCTTCAATCTTTCTATTCTCCCCTTTCTCTCTTGGTT
TTCTCTCTTCTTCTCCAATGGAGGTTGAACTGATTTTCGTCATCCTAGATGGTGGTTGTT
GGATGGAGGGTAAAGAATCCCCATCCACTCATGTGCAAAGACCAAAATGACCCTAGNNCA
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GTCAAGCAATATGACTTTTCTAATCCTCCCTTCTTTTTAGAAATAACGTAAAAGAAAAAC
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ATGGGTCTCTTAAGGCCTTCCTTTTTGTCTATCAGAGTTATTTCTAAAGGACTTACCGTG
CTAAGAGGGAGAACGGTGAAGAAGCACACTTTCCCACTTTACCACTCAAGGACTCAAGCA
TTGGTGCAAACCCATGCGGTAGATCATATAGTTGCACCAAAATATTTATATGGTTCAATG
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CTACCAAATCCACCAACACCTCAGTTGGTGCATCCACATAGCATGAGGGGGCGAAGCTGG
TCAGGTACATTAGCAATGACCCGAGCCTCCTCCCCACGTCTGGCTCTGGCTGCCAGTTCA
TGAGCAAGCTTATTCTTCTCCCTTGAGATGGAGCTAAGGCGAACATCTCCAACAGCACTA
CAAGAGTGCCCCTTGATTGTCCCTATTGAGGGGACAACCATGAGATCGGAGGAGGAGGGA
TACTCAACTGCATTGACGAAGGGCAGCGAGAGAAAAAATTGGAATAGCAGAAATGTTTTT
AGACAGCTTTGAGAGTAGCATTATTAGGAAGATTGGTAGAGAAAGCAGGGGCGACACACG
CTTTGGCAGACCACGCTAGGAAATTCTTCATGTATGACTATTTGGCAAGGAAAACGTTTA
AAATTGCCCGACTGATTGTACCGTCACTTAAGCCGCACCGAGAGATGGACACGTGGCCAT
GGGCCTCACACAGCTTCCCACCCCTGTCTTATCTTTTCACTTTCCCCTTTCTTCCATCTC
TCTCGTCGCAGTACTAGACGCGGGTTGCTCGGTGCAAGGCGCTAGGCACGCCATCGACCA
TTGCTGATGCATCACCCCTTGCTTGATCGTCGTAGTAGGTGCGTTGCTGCAATCTAGAGG
GGACGACGTCGCGTGCGCTGCTGCATCCCTTGTCGCAACGACATGCTCTACTGTTGCTAC
CCCACACGAGCTGCTCCATGCAGCGTGCAATGGCCACTGGTGACCCCTGTGTTGCATCCC
CGCTGCAAGGCCTCAACGAGCATCCGGAATCAAGTTGCCGCATATCAAGAAGGATCATGG
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CTTGCCGGTGGAAGATGTTGCACTGAAAAGTTGTCGGCGCTGCAATAGAGCTTCATCGGG
GTGTGTTGGAGCTTTTGACGCGTCATCGGGCTGCAATGGAGCACCACCAGAGTTACAATG
CAGCACCGATAGAGCTGTGAAAGTTGTGATGGCGATGCAATGGAGCTCCCTCGGGCCTGC
AATGGTGATTTGCCGGACATCGTCAGGGCTGCTTTGGAGCTTTTTGTCTCGCCATGTGGT
GCACCATGAAAGCTGTAATGGAGCTTCGCGGGAAGTCATCAGTGTTGCGTTGAAACTGTC
GTGGCTCGGTGCTATGAGACATCGCTGCAATCGAACATCAACCAACGCGCAGATCAACTG
GTGATGATTTCTTAGAAAAAAACGTCCGCCATTTGGCAAAGATTGCCCTCCTAGAGTACA
ATAGCTCTTACCCAAAAAAAAAACTGTTATTTTTCTAAAAAGAACCTCCTCGAACATTTC
CACCCCTTCCCCAAATTACAGGAGGAAAAAAAAAAGATAACCCCTTCGGCTGGGTGTCGA
ACAGCAGCGCCGCCGCTGAAGCACCAGCCGGAACCGGCGCCAGAATGGCCTGGACGGCCG
CGGCCTCCCTGTGCTGCCGCCTCGTCCGCGCGCCCCCCGTCCGCGGCCGCTCTCGACGCC
GGACCTTGTGCTCCGCCGCGCGGAGCACCGACGCGGTGGACAGGGAGTACGCGGACCTCA
ATCTCCGCCCCCTCTACCCCAATGTCCGCCCCAACCCCATCTATCCTCCCCGTCTTCAAC
CTCCGTGTCTTCTTCGAAATAGCGTACCAGCCTGACCACCCATCAATCTGTTTCGGTGTT
TGCAGCGGGGCCATCACCTTCGCATCCGGCAGCACGTGAATCCGCTCAGCGCCTTGTTCG
TCGTAAGCCTGTGCCGTAATCTTCAAGATCCCCCCTTGGCACCTTCCGTCAATTCTTACT
CTGCTTTACCCGTAGGAGCCCACGGAGCCGCCTGAGTGGACGGAGGTGTTCGAGGATCCC
CTGCTGCCCCTCATGGTCGACATCGGCTGCGGTGGGCATACGTCTCCTTCCATTGCATCT
CCATTGTGCTGATACATTTCCTTTAGCCTCAGCTATCAGGGGATTTTTATGTGCAGGGAG
TGGGAGATTCTTGGTTTGGCTAGCAAAGAACTCCGGTGAAAAGCGGAATTACCTCGGACT
GGAAATCCGGCAAAAGGTTCTTCTGCTTCTATGGTTTAATTTAATCATGGTTCTCAATGT
GTGATTTTTGGTGTGGTCATAATGCTCTGCTTGGATTGCTTGTCTAGCTGGTCGAGCGGA
CACAGTTCTGGGTTACAGAATTGGGGCTTAGAAATGTGTAAGCCACACCTCAGATCTTTC
TCACTTATGGACATTTGAGGGTTTCGTGCTATCTGAACAATTTAACAGTACTTGAAATTG
CTCCCTTGGTACAGTTACTTTATGTTTGCAAATGCAACGGTGTCTTTCGAGCAAATTGTG
TCATCATACCCTGGTCCCCTATCGCTTGTTTCAATACTGGTGAGTAGCTGGGTGTAATTC
CGTAACTATTCTAAGTTATATACGATATGTCCCTGTGCTTATGCTGGTCTAGTTTTTTTG
TTTTAGCTGATGTTATGGAATTGACAGCTGAGTTGCAATAATATGTTCTGCAGTGTCCTG
ATCCCCACTTTAAGAAAAGGCATCACAAGCGAAGAGTTCTACAGACACCATTGGTGGATT
CAATCACAAAGAACCTTTGTCTGGGTGGGCGGGTATGACAGTTGTCTAAGATTTTCATGC
AAAGTATTATCTGTTAAACTAACAATCTGCATGGGTCAGGGTCCTTCTTTATGCTTCAGT
TTTGTCCAGGGACTGTTTAACTTAGGACAGACACTATTTTGTTAGTTCTAGCTGTATGAA
GGTATCATGGATGTTTTATTGACTGGACCCTGAAAATTTGTCCTAACAAAAAGTAGTAAA
GCATGTTGCAGGCCTGAAACATCTATTATTTAAAAATAGTCCTAATAACACAATAATGTT
CTTGAGGGTCCTGAAGTACATCAGATTGAGGATATATTAACCATGTACATCTCGCTTAAT
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TTGCACAGCCTCTATGCATTGTATGGGTCATAGAGTGATAAGTACAAGTTAATATGATCT
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TTATGTAGTGAGTTTAACATTCAAAGGCAGCTCAGGTACTCTTTTGCAAGTTGACATCTC
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AGAGAAAGGTTTGATGGATACTCGGATGTGTTTGAGCATGCTGATCGTGTTGATAAAGAT
CTTCAGTGTGACAACGAAGGCTGGCTTCTGGACAACCCTATGGGAATACGGACGGAGAGA
GAAATCCATGCTGAGCTCGAAGGAGCGACCATATACAGGAGGATGTACCAAAAGACGAGA
TGTTTCTCACCAGATTACTCCATCAGTTAAGTGGATGCCTGTGTGGCCAGGTAGTGCTGG
GCTAATGGCTGGTTTCTCTCTGCTTGATTCGTTAACTTTGAGCACCAATTTTCACATTCC
CTGGCATGTCCCAAAGCAAATTCTTAGTGAATGAATTGGGCCTTGTGCTTGTGAGGGGTT
AAACTGGTCAAGGCTTGGCATCTCTCCAATGGTTGATATCCTTAGATCTGAGATCACCCT
TCTGGCTGAGGAAGAAAGATCACGGTGCAGTTAATTTCAGTGTTAACCATACACGAGGAT
GTTTGATTGACATCTGCGATTTGTATCCAGGGTTGCATTGGCCATCTTAGTTATGATGAA
AGGCAAGCAAGTGTCGTTGGCAATCAAGAGCATTGTATTTTGCCTCTTTTTTTTAAAAAA
AAAAGAGCATTGCTGTTTGATGTATGGCCGAATGTAAGAAACTTTGCCCTCAGTGGTCAG
AAACGATGGATGGGCAATTTCATTTCACGCTGGTTCTTGTAGGAGGCCGATACTTTTCTG
CGCGCGAAAAATGTTTACATCTGCAAATTCGTATCAATCCAATATGAAAATATACTCCAT
GATTGATCTAGTGATGTTGATTTTGTTGATATTGCACCACAGCCTCCTCTCCCGGTTGTG
GTGTAGCATCTGGAGACACCTCACTGACAACACCTTCTGTGATGTCGCACTTGCGTTGCT
CCTTTCCCCTACTTGACATCCATATGCATCCCTAGAAAAAGAAGTGTAAATAGGATTATA
AACTTAGACATAAGATGCCATTATTGGCTTGACTCAGAAGTCGGAACAAGTGTCCACCAA
GGACTGAACGCTTGGATCAACAGACGATGAAATTTTCGAAACAGGTAGGTGCTACGTCGT
TGGGCAAGCAAAGTTGTGCCTGTTGGTGTCGACATACCAGAAATTGTCGACCAGACACCA
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TCCGGTGCGCGACTTTACATAATCAATAACAAACCTAGAGCAGTATGACAATGGTTCACC
AACTACTGAACAAATTCTCTCAAGTGATACCCAGCCCCATAAGCAACGGGTGAATTATAC
CTGACAACTTGAAGCATCCTATTTCACTGTGAAACTGCATTAGTAGACAGATGGTAACAC
CTAGTAAACCTTGATGTTTCTTCTTCATTTTGAAGTCATGTCCCATGCTGTACAGTCCAC
TACAAACAGAAAACACTAACCAGTTTAATATATACTGAATCGATTGTAAGCATTAAGTTG
ATTCTACTTTACAGCATTGGTAAGTGCTGCTCACTGTAAGCAAATGGGGCGATTAATGCG
TACTGGAGAAGATGGGAGGCGTAGTTGGGTGCAAAAAATATGGATTAAGTCGGGTGCCTT
TCATTTCTGTAGGATAAGGTCGGTGATAAGTAGTGTGGTAATTGATGCCTTTTGGTTACT
TGGAGATTAAGAACTGTTCAAAAGATGGATTTTGTAGCGAACTGAATCAGTGTGTAGTGT
CTTCTTTACTGAACTCTGTTGAACTAAACATGACATGTGTGTGGACTGTTACGTCCCGTA
GTACTTTCTGTCCTGTTTTCCTGCCTGCTCAGATCTTCTTTCCAAACCGAGAGCAATTAG
TTAGCAAGCATTCCTTTAAAAGCCTTTCGACGATAACTTCCACACGTCGCCGCTTGGCGC
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TCGCACGTGTTTTTGGCTTTTTTGATTGTTTTTTATGTTTTCCTGGTGTTTTGGCTTTTC
AATGGTCTTTCTTAGCCTTTTGACGATTTTTTTTTCATAAAAAACTGTTTTTTGCACGGA
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TTACATTCTCTCTCCCCGAGAGACGGTTTTGCGTTTGCGAGAGGCACGGTCGTACCTCTT
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AAAGGCACGCATTTCTGTTTTTTTTGTGAGAGATGCGGTTTTGCGTTCGTGAGAGGCACG
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TTGCTTTCTGAGAGGCATGGTTTCGCATTCACACTGTGCTTCTCGAAAACAGAAAAAAAC
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AGTTTTTTTCTTGTAAAAATAAAGTTTGTCAAAATCTATCAATACGGGATCTAGTTATGA
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AAGATAATTTTTTTTGAAAATACGAATCTATGGAAAAAAGAAAAAACTCTCCGGTTGCTA
CAAGTGGTATACATGCAGTGTACCACTTGTTTCAACCTAAAAAAGTGAGAGTAATCTTTC
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GGGCCGGCGTTGCTTCAATTTTGGCCTTCAACTTGTTGTTGTAGTCGTTGTTGGGTTGTA
CTCCCTTTGCCTCGGTGCATTAGGCATCTTAGAAGGTGTACTACAATCTAGGCACACAGA
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AATTAATATACATGCAACTAGTACTACGTACTATAATGTGTCTTAACGTTTTGGATTATT
TGATTTCTGTAAGATGTCTAATGCATCGAGACAGAGGGAGTACATAGACATGTTTGTGTT
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CTACTAACATGGCGTAAAACCACTTTTTACTGGGAGTTTTGTTGGAGATGCTCTAAGCCG
AAGATAACTTACGTGTTCCCCTCAAAAATAAAAATAAAAAGATAACTTACGTGTGAACGT
TCAGCAATGCTCCACGTACGTCCGGTTTCCAGATAAACAGGAATATATCCGATCCGGAAT
CCGCTCGGCCGATTTGGATATACATGCGAGCCCGTGTGTAACTTGTAGGGGAGCTGATTA
ATGAGATTGGTGCGTGCATGCATGCAAACTCTTTCTATCGTCGTCGCGCGAGCAGCACGC
ACCTGCACTGCACATAGTCCACTTAAGTCAGATGCCGGCGCCATTGGTACTCCTGCGGAG
GTTGCGGAGCTTAGCTATTTGCGTGCTAGACCGCTGGGATCGATACATTAATGCGCGCCG
TCCATATCACAACCACCACGCGCGGCTCCACGGGGCCGACGGGTCGCGACGCCCATGGCC
ATGGCCCCCAGCTAGCTCAACTCGCTCACAGTCACAGCTCCTCGTGATCCCGAGCTATCT
ACCGTATGTCCGTATCCAAGCCCCTCCATGGGCCTCTCCCTCCTATAAATTCGCCTGCTC
TGCATGGTAATCTGCATCTCATATTCTCATCCATCGCACGAGCCAGCCTGCAGTAGGCAG
CCACTACAGCCCCTGAAGAAGAGGCACGGATCACGGATGCCAAGCATGGCATCCAAGTCC
AAGGGTCTTGTTGTGCTTGCTCTCCTGCTTGCTGCTGCTATCCTCGTCGCCTCGGCTGAT
GAACACCCTCGTGAGTTGACTCGGAGTGGTTTTGAGCGGGCAGTAATTGAACTAATTGGT
CGTCATTAGAGGCTAAAAAACTTGCTTTGCTGCATTTTGCTGCTAATCTCCATGCACCTT
TTTTTGTTTCTCTTCATGTAGAGGCCAAGAAGGAAGAGAACGAGGCCGGAGTAGAGAACT
TCTTCCACGGTGGCGGAGGCCACCACGGACACGGCAGGGGAGGCCACGGCGGAGGAGGTT
ACGGCGGCGGGGGAGGCTACGGAGGAGGCGGCGGAGGCTACCCAGGCGGTGGAGGAGGCT
ACGGCGGCGGTGGCGGCGGCTACCCTGGCCACGGCGGAGAAGGTGGTGGAGGCTACGGCG
GCGGTGGCGGCTACCCTGGCCACGGTGGGGAAGGTGGTGGAGGCTACGGCGGCGGCGGCG
GTGGCTACCCGGGCCACGGAGGAGGAGGCGGCCACGGAGGCGGCAGATGTAAGTGGGGCT
GCTGCGGCCACGGGTTCCTTCACCATGGCTGCCGCTGCTGTGCGCGCGCCGACGAGGTTC
CGGAGGTCCGCAACTGAGCACACGTAACAATGCAGCCATGCATACGTACGTACGGTATAG
GCTAGCTGCATGCCTACCCTGGGTTGACTGTACGTCCATGACATTGCTCTGCACGCGTAC
GTGCATAGTAATTAAATTACTCGTAATATAAATAAACATTGTCCCTGATGAACAAAAGGA
AGAGACCTTGTAGAACAGTGACCTTGTACGCGTTGCACAGTGACCTTGTAGAATGCATGC
ATCCCCTGTGTGTTCTTGCAAGCGTGTATGTATGTCTCGTATTAATACCCCCGCTTTATC
TGTTAGTAGGTAATGTGGAATAAAATCACACTGGGATAATATATATAGCCTGGTTCTACT
AGGTGCATTTAACTCCTGTGATCATCAGTGCTGTATTTCACTGTTGCAAAGAACTGAAAG
AGATTTTTACAGCCACTGCGAGCAAGGGCATGCCACGTAAGTTGATCCAACGCAGTGTAG
GGACTTTCAAAGTACTCCCTTCGTTCTTAAATATAAGACTTTTTTAAAGATTTTAATATA
CCTTTCAAAATGAGTGAATTCATACTCTAAAATGCGTCTATATGTATATCCGTATATAGT
TCATATGAATATCTCGACGAAAAAAGGGTTTCCCTCCGCTTATATCGAAGTCTCTAAAAA
GTCTTATATTTAAAAACGAAGGAAGTAGTAATGTATAACATAAACTCATGAAGTATAAAA
AAAAATTCACAATAAGCCAGAGGCTTATAAGTACTAATTTGGCTTCCCACAAAAATAAAA
TACTATTAATTCGTGCCTTTTGGTCCTCTCAAGTCTCAACGAAAATAAGAGTGCCGTCGT
TGGGTGGACACAAATGAACCGCGCCTACCATGCATTTTTGCTCTGCAGTTACCGCTCCTC
CATCGTGCGAAGACGGGTCACTCGGGATTAATTAGGTTTGCCGGATCTGGCAGCAGCAAC
CGATCGACTGTCACGCAAAAAGTCAAAATTGTAATGGGAAAAGCCCGATCGGGTAATGCC
TGCAAAGCACAAGCTTGTGTGTGTCACTGTCACTGTCCTTGTCCTCTGTGGCTGCAGGAA
GGGAAATCTTTCATTTGATAATATGGCAGTGGAAATGGGAGGGCATATTCAACTCAAGTA
CGTAGGGGTTGGAAGCAGAATGAAAATGAACGAGTTGTTTCCGTCTATTTTCAGTTGAAA
CTGGTACCACCGTGGAAATTCAGAAAGGCGGAGATGTAACTGGTATAGCCAAAAACGAAA
AGCAAGTTAATTATATGTTGTGAACATGAAATACAAAGGTGAAAGTTTGCTAGAACTCGA
AAACGCCAAGAGCATATAGAAAGATACAGTACGACCTATCCAACAAAGTTGTGCAACTGC
GCGCCGAAGAAAAGGTCGCTAGTGAGCATGTCTGGAGCTGAAGGCTTGTGATCGGAGGGG
CGAGGATCACCACAGTACAGTAGATTACGTTTTTAGTGGATACTAGCGAAATGGACCGTG
CGTTGTCACGGAAGAAAAAAAAACATAATCTTCAATGACAATGACCACATTATGTTCACA
TATCATCGCTTGATTTAAAATATTTATGCACAAATGCAAGAAAATGTTTCTTCTTTTAAA
TTTATTCACAAGTTGAAGCAATATTTACATTTTCAAAAAATATATATCATGGT