Map Locations of contig_50953 (5969 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_50953

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_65966 2 1549 bp MLOC_65966.1 Available Available LOC_Os02g07430.2, FRAME:-3, EVALUE:2e-120, 13102.m12319 protein OsMADS29 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed





CDS Structure of MLOC_65966






Contig Sequence (5969 bp)

>contig_50953 5969 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGAGAGATGAAAGGATGAAGTAGCTAACCTTTAGAACACTTGTGTAGTTGGTGCACCGTC
AAACCTAGACAAATCTTGAGGAAAATGGAACTTGGAGATGTCGAGCTTGGAGAGGAGAAC
GCTTATGTGTGGCTCGGGAATTTCATCGAACACCTCATGTGCATGCATAGAAGGATGGCA
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CTATTACCATGCGGCACAGGAAACTGTTCTGATCTTCCAAGATATGCTCCTGTTAATTGA
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TAAAAGTACCCAGTTCATATCCTGGCATGCATTGCCTTTTTTTACCTTCCTTGCACGGAC
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TACCTAGTTCAGTTATACTTTGTCAGTAATTTCATGCGAAACAAGGGTCTAGTTCTTGAC
GAACATCAGACAACGATTATCTGGGAAATTAGTTCAGTTTTGTGCATTTTCTTGATGCAT
GACATGAATCTATCACGTGAATGATTGAACAATTTTACTTAAGAATTCATCTGTTGGACG
CTTAGAGCCAGCTGCACCAGATTTACAGTAACAAGCCCTAGCTTATAGTCAAAACTTAAT
TTGGTGTTCACAATAATGTTTCATGGACTCACTACAAAACTGTGTAACTTATGATCATAT
AAATGTCTGCATGCATGTCCGCTGAATTAATATATATAAGCATCTACTTCCTTCGTTCCT
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TACACTCCAAAATATGTTTATATACCTCCGTATGTGGTCCATAGTTGAAACTCTAAAAAG
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ACAGAAATTCAGCATCGATCTGTCTGAATAGTGAGCTTGAATATCATCTCTGAATAAGAA
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ACCAGAAAATCCAGGCTTACGATGACATGCATGTTCGACAATACTGTACAAGGTAGAGGA
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CAGCAGCATATATTTGTACTAATTAATTAACTAGCTGCTAGTAGATCCGGTTCTCCAAAC
AAGTGGAAAGAAAGAAGTACGTGGTAGCAGATCGACGAAGAGAAGCTAATCAGTTAAGAA
AGACGGACCTGGAGGCGGGGCTGGAGTACTCGAACATCCTGCCGGTGCTGGAGAAGATGA
CGACGCCGACGCGCGCGTCGCAGAGCACGGCCAGCTCGTTGGCCTTCTTGAGCAGCCCGC
CCCGGCGCTTGGAGAAGGTCACCTGCCGGTTCGTGGCGTTCTCGATCCGCTTGATCTCGA
TTTTCCCGCGACCCATCTCCCCAACCGCAACGATCGATCCAACCAGGATTCCAGGAACCA
AACCCCAGCTGTGACCTGCTAAGAATTAATCTGCACGTCTCCGCCCCCCTGCCGCATCAA
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TCAACTGGATCTGATCCAACAGCACAATCACACAAGCAGACCAACAGAAAGAAGGAAGAA
AGAAAATCGTGTGGAGCTAGCTGGCGCCCTCTTAATTTGCGAGGAACCAAAAACAAGAAG
TGGCTAGGAGATGGATGCTCCAGCTAAAGTAGAATTTTTCACTAAATTTGCGAGGAACAA
AGGGGCCATTCTTTCCGGCGCCGATCATAAGGATGGAGAGACAGGAGGGGAGGAGGAGTA
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AAGGCTAAGGCAGGGGGTGCAGAAGGAGGGACATATATAGAAGGAGAGTGAGGTAGTGTA
CTACTGCTGCTGCTGCTGGTACCGCTGGCTGGCTGGCTAGCTAGGTCTACACTCTACACC
CGATCTCCTCACATACTGCCTAGCTAGCATGCAAAATAATGGTAAATGCCTGGCAGTGAC
ACTTGTTAACTGGCCCTCTTGACTGGCTGTAAATAACGATGGCTGGCTTTAAATCCTGCT
TCTTTTCGGCGGTGTTTCTTTCTTGCGTGGCTGTCTTGTTGCTACCAGCATGCAAAGTGG
TTGCTTCTCTGGCTCTTGTTTGCGGTCAATCAACTTTTATTTTCTTTCTTGCCCTCCATA
TATAGAAGAGAGCTCTATATAGGATAGAATGACCCGCAAACCCTTCTCTCCCCTTCATAA
TTGCTTCTGATTTGCTTCCTTTTCTTGTGGACACCTAGATGATTAATTGACTATCATGCA
TAAAGTTAGACTAACGTATATTTGCTCACAATAGCTCTATGTAAGTCGTCTAAATTTCCA
ATTTGGGCCAGTCGATTTTTTGTACAAGAAGCAAGTTCGCCCAAGGAAAAGAAGGAGCAG
CCGTCGGCGATCTATCTTAGGGTGACAGGCTCGCCAACGATCTATCTTAGGGTGGCAGGC
CATGGGAAGGCGGGTCAGGCAGGAATGCCGGACCCGACACCGTATGCCGCTTCTTGTTTT
AAAAACATTTATCGCTATAATCTCGTATA