Map Locations of contig_50950 (9185 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_50950

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_65964 1 841 bp MLOC_65964.1 Available Available LOC_Os08g35760.1, FRAME:+3, EVALUE:2e-78, 13108.m03751 protein Cupin domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_65964






Contig Sequence (9185 bp)

>contig_50950 9185 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
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GTTTCAATCCCTTCCCCCCAACAAAGTAGGGGCCACTAGTGTCATTAATTCTAACCTGAA
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TTTTCATGACGTGTCCGAGGTGATGTCTTGATCAGTTTCTTGCAATGGCAATGGCAATGG
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GTTGCCGAGGTTGTACTGGAAGTGCTGCTGGCCCTGCGGGAGCACCATGAGGTCGCCCTT
GTACAAGGTCTTGGTGTAGACCCTGTTGGACGTGGCGCTGATGAAGCCGCAGGACAGGGT
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ATCAAGTTAGTCCACAAACGACCCAACTTGAAATTGATCAAGATGCAACTGAGGCTGGCC
GGTTGCGTGTGGTTAACTGTCGGTCAGAGCGCCGCCTGATAACCGCACGTGTTCACTTGA
GGTGAGCAAGTCACGCAACGCCTCCCAGAAACTATTGAACACATTGTTGGTGGTAAGAAC
ATTTTCAGCGGCGACTCATAAATTTCCTTCCGCATCTGTACATATATAGAAGGCTAGTAG
TATGTCTGTATTTCATAGTCATGTACTCACTCTTAGCTGTCATACGCTACTATTCACTCT
GTTTCTTTCCAGTTTGCATATAATTTTTTGTGAAATCAAACTATGTAAAGTTTGATCAAC
TTTATTAAAAATATATAAATATTCATGATACGAAATCAATATATCAGATTGATCATGAAA
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TGAGCAAACTTTACGTAGTTTGACCTTAAACAAATCTTATATGCCGAATAAAAAGAAATA
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TCAAAGGCGTCCACACACAATGAGCGGGCAACTCTAAAATTTTATTCTCTGCGTCTGAAT
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TAGATTAACTAAAACATAGCCTACACTAGTTGTCGTTAGCGATGTCCACGAACTCCATTT
CGGGCTCCGGGTATATGGGCGGTAGCGGCTCCGGCTCCTTCTCCGCCTCTGCCTCCAGAT
CGGTGAAAAGCTCGTCGATCTTCGCTCGTTGCTACCGGATGAAGCGTCAGTTGGCGTCCA
CATATTCCTCATCTTGGATGGACTCCAGGATGATGGTCTCCTCTGCCATCTCCGTCGCTT
GGGTGACCTCGGACTCCGCCATGACATCCTCCATGGCGAAGCCTGCAACCGGCTCCGACT
CCTTCTCCCGATTTGCCAACTCCATGGGCTCCGGCTGCAGCTCCGCCTTCGGATGCTGCT
CCCCCTCCTCTTCCACCTCCTCCTAATTCGACTCCAGCGAGTTTGGGGAAAGATCGCTGC
GATCGGGGCGGCGCCTAGCCCTGGTCTTCTCGATCAGCTGAAGGTGCCGCTCTAGCGTCG
GCATAGCGCGCGTAGTCACCCTCTGTTGGGTCATGTATGTTGTGGACGACGAGCAGAGAG
GGAGGCGTGAAGGGAGAGAAGTCAATGTTCTCGGACTAGCGGTGTGAAGAGGATGGAAGC
GGATGTGGCTAGGGCTGGGTGTTGTCATCCAGCTTAAATAGTCGAACTTTGGCCCTCGGG
AGGCGAGCTAGAGAGGCGTCACAAGGATCCCCCCCCCCCACACACACACCCCCACACACA
CCCAC