Map Locations of contig_50751 (9666 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_50751

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_65843 1 1347 bp MLOC_65843.1 Available Available LOC_Os01g66290.2, FRAME:-1, EVALUE:6e-92, 13101.m07178 protein OsMADS21 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed





CDS Structure of MLOC_65843






Contig Sequence (9666 bp)

>contig_50751 9666 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GCGTAATAGCTTGTAGTAGAAAACATGAGACGGGGTTACAGAGCGGGTGGCCGCCGCCGC
GTGGGGCGGGGGGGCGGCTTCGTGCGCGGTCTAGAGCGTGCCGAGGCCGAGGCGGATGTC
GCCGGACCGAATCTCGGCGTAGTAGACGCCAGAGGGGCGCGCGCGGACACCTGTGTAGCC
CGAAGATCCACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGGCTCGGTGGGGGCGCTTCGGTGGTTGCGC
GGTAGAGGAAGTGACGAGGAAGCGGCAGAGCGTGCGTGGCAGTGCGGAGGGCGATGGACA
GCCGTGTGGCGAGCGCCGCAATTTATAGGCGCGCCCGAAGCGGTGCGCCAAATCTAGCGC
GCTTTCTCCCGCGCGCGCGCAATCGTTTGCACTGCGCGCTAATTTTCCGCGTCCGCTGGA
GCGCGCGTTTCCGTCCCGCGTGCGCTAAAAATTCAGTTTACCGCGCTCTTAGGGTAACCT
GAACCTGGGTAAAGGGCATTGTGTCCCACATGGGTCGGTTCGTCTCCCATGTCCCACTCT
TCCTCGACGGAGACTGCACCTTCACTTCACGGGTCTTAAATCCCGTCACCGCTCATGGAT
GACGGCTGGAGGACTGGTCGTTGATGCGGATATAAAGGACGTGAATGAAGGGTGCCTTCA
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TTTCCTTAATAAAAAGTTGATTTATAAAGAAACTCAATATAGCACGCTACGTCATAGTCG
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GCCGGCCGTCTAGTCCGCTTCACCTCGATGAAACTTTAAGGGACCTACACACGGTGATGT
GAACCAATGCTTTCTTCAAGTATTCTCCTTTCCTTCTTCCCTAAAAATAAACAAATAAGG
CTCTACTTACGTGCAACCGACCAAGGCGCGTGTCGGAGTCCAGAGGTCCAGCACTCCACC
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ACTACGGCGAGGCTTGGGCTCCTGTCTCTCTCACGCACTGCACCCCCATGGCCGGCCCAC
TGCGACGCCAACATGTGCACGCGGTTAATGGAGATTATGATACGCTTTCTCGATCAGTGT
GTTATACTCCTATTATAGGAGGAGAAACTACAAGACCAAGCGAAAGACTATGCTCGTGGT
GAATATCTCGCTCCTATGTAGCTCCGCGTATATGAACTTGGTCAAGAAGATCGACGTACA
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AAATAAAACACGGCCGAACAACAAAAACGATGGCCCATTTTCATGTACATATTTGTTTTC
TACACCACATATAAAAGTATATCGTTATGAAAATTTTCCTGAACGTGTTATATATTTATT
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TCCAATGAGCCCGGTCCCACTTTACAGTTTTCGGGGTGTTTATTGTTTGTTTGTGGCTCC
GCTACTATATGAAGGGGAGTTGGGCTGGCCAGATGGTAAACACTATGAACGCTCATTGTG
TTCAAGTACTCGTTGTTTTGCGCATGAGCGGAGCGAAGGTAAGATGGGCGGGCCATGTAA
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AGTTTCTTCGGGTTTTTTTTTTCTGTTTCCTCGTTGCAGGTTACTATCGGTTTTTTCTCT
TTCTTGCATTAAAAAAATCTTTCTTTTAAATGTTGGATGTTTTAAATGTTCATAGTTTTG
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TTTTCGTAAATGTTCAAGTTTTTTAAAACTGGCTGCATATTCTAATAATGTTCACGTTTC
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TTTTATAAATAATATTGGCATATTTTGCAAAATAAATTTACCATGTTTAATGGAAAACGT
GGTTGAAAACTCAAAAATACAAGAAAAGTCGCCGCTATAGTGGCCAAGTGGCTACAATGT
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TTTTCTGTCATTTGGGTTGCTAAATTTTTCGACCTTCCACCAAGAACTGATCGTAGCAAG
CTTCTCCTTCCGTCGTTTCGGACGGATACCCTCGTCTCGGCTTCCGATTTGGCATCTTTA
TACGAGGGGAACCTCTCATCTATTTTGCATCGCAATATTTTTCTTCAATGTTAGGTTTTT
GTGGCTAGTGACGATTTTATGACGGTGTAGATGGCATATCACACGTGAATAGCAGTTTCA
TAGCTCTATCCTCGTCCTAGCATAACCATCGGGGCTAATGTAATTTGGACATCGAGTAAC
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GTTTTCACCTACGGGAGTGAGGAGACAGCTTGTGGGAGACCATTGGTGGCGCCACCTCCT
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CTTCAAGGCCTTCAATGCATCCTTTGTCATTATCGTGTGTTTTATCCTCTTCAATATATT
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GTGTGTAATTGTAATCGTTTGTAAAATAGTAGTAATGCTTGGCTATAAATCACTCATGAA
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GTTTCCAACTTGCTATACTGCACGAGTTCGGATGCATTCAATTCAACAAGAGTACTACAC
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TCAGTCTTCACAACACGCACACGCTCTCGAGTCGCATGGCACACATGACGCAATTATTTA
GGTAGCATACCGCAATACAGTACTGTGGTAACTAAGTAGACGTAGGTCATCCAGTTCAGT
TCAGTTCAGTTGGGCCTGCCCCCCCTTAATCTCGTAGCCGAGGTGAAGAGCGGTGGCCGC
CGCCGCCGCCGCCGCCGTCTGGGGCTGGGACGACTGGGAGTAGCGCGAGGAGGAGGAGGC
CGCCGCGGCGTCCTGCAGCATGTTCACCTGGTGCTGGTAGTAGCTCCTCGCGTCGAACGT
CGGGAGCACCTCCAGTTCCCCCCCGCCCGACGCCGGCGCGAGGGCCAGCCGCTCCGCGTC
CGCCACCTGCTCGACGTGGTACAGAGCAGAGCATAACAATCAGAGATCAACAACGGACGA
TCTTTGATTATACTACTATTTCCAAGAAGCATGCAGGAATGTGCGTACCTTGGCTCGAAG
ATACATGTTCTCGCTCTGCAGATCAGCCTCCTGCATGCACCGCACAGATGGATGGTGCCA
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ATCGAAATCAACCAGTACGTAGATGCATATGGATGGATCAGTTACCAGCTTCTGCATGTA
TTCGATCTCGGCGGACAGCAGCTCGTGCTGGCGACCGAAAGTGCATGCATAAGGATATAT
ATCGGTTAATCAATTTGATTGACTACTGGAACTATGGAAAGCACAGATGTAATGCAGGTA
TACGTGACCAGTAGTTAATCACAAAGGCGAAACTCACCTTCTTTGATCGGATCCGTCCGA
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AACTAGCCTCGGACGTACGTACCTGTTAGCATTTTGCAGGGACAGTATCTGCTGGCGCAG
TTTTGCAGATTCCTGCTGAAAGTATTGCTGGTGTACGTGCAAAATCAAGTAAATCGGCCA
GGAACCAGTTAGTAGCGAGCCGAACACATCAGACATCTATCTACTGAGTTTGCTACTCCC
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TTCTTGTCTTAGATTTGTCTAGACACATCTAAGATACATTTATATCTAGACAAATTTAAG
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GTACTAAATCTAATGTAATCCATGTGATCACAAACTAAACAGCGATGTTTGGGACAGCAA
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TGCATGCAACTGAATCTCGAGTGGAGGAGCTCTTTAACGCCCTTAGAGCATCTCCAACTG
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GCCCAGTGCACATGAACGAAACACGATCGAATCGACCTTTTTATTCCAGGGGTGTGTGCC
ATGCCATGCCCACTGGCTGCTGCAGCTACACGTGCAGACGCATGGAAGCCATTATATGCA
TGGTCATGCGTGTACACGGCGACTCAAAAGACAGTCGAAGGAGTACGTATGGGTTACTCT
TGGATCGTAATTAAGAAAAATCATTTATGCCTTTGTAAATGAAAAAGGGAAATGCTGGCT
AGCAACGAGCCATGTAATGAGTGTTTTCATATAATGTATGTGTTTATAATGGCAGAAATA
TATATAACCTCCACAGAAGGAATGGATTATGCCAACAATGATGCATTCAAATTGTAGCGT
TGTTGTATCATGTCTTAGGTGTGTGTGTTGTGTTGAGGTGCATCTGTACCGGGATGACGA
TTGCTTTATACATAAATCGGGATGAAACCTTTTTTGATAATTGTAGCGTTGTTTCAGAAA
GTGAAAACAAAAGGCTAAAGCGTGATGCTGGCATTATTCCACTATTAAAACTACAGTACA
TTATTGAAATTTAATTATAGTATAATAATGCATTTGATGAAGTGTGAAACTACTGGGAAA
AAATGTTGTCTACTACTACCTCCGTACCAAAATATAAATCATTTTTGTCTACTACTATTA
CAAAAACATGTTTAGCCTAAGTCTTATATTTTGATACCGACCTAGGGTTTACTTTTTGTG
CAGTCCAAAAAAAGGAGGGAGTATAGTGCCTAACACATACTTCTTGAATGTACACATATT
TGTTATTTATGAACCAGGGGAAGATACAGTTTCCGGCCAAAATTTGTGGGTCGCATATCA
CCAAATAGCATACGTTTTCAAAGCTTGTACATGGGCGAACTCACCCAGTGCACCCGGACC
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CAGTGGTGGTGCCAGGACTTAAACATTGTCGAGACGTACATATGTTTATGAACACATTTT
GCAAAATTGCCCGGCGTGTTATAAATTTATTTATTTATTTTTATAATCTTGCTAAAAAAA
TCTATGGTCAGCTGGCTGTTCAGCCTCCAGTCATTTGATCCATCCAAACAATATATATGG
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GTCATAAGTAGACAGAGCGAACGCAAGCACATCATTGCAACTCGATCGGAAGTTAGAGAA
CTCCCAATTTACCAAAAGAAAAGGAAGAACTCAATATTAACCACAAAATTAGCATGCTAG
CTTCTCCTAATCACGTCGTGTCTATCTTGATAGGCCTATTTTGTGGCAGATATCTGGTAG
CTACGGTATCTCATGCATACCTGTTACTAGCATACTCGTAGAGGCGGCCGCGGGCGGAGA
AGACGATCAAGGCGATCTCCGCTTCGCAGAGGACGGAGAGCTCGTAGGCCTTCTTGAGCA
GCCCGTTCCTGCGCTTGCAGAAGGTCACTTGGCGGCTCGTCGTGTTCTCGATCCTCTTGA
TCTCGATCCTCCCCCTCCCCATGGTAGCAAGCAGCTCCAACCTTGAAAGAGTACAACAAA
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GTTCGTGGATGGGTATTGAACGTCCACTGAGAACAGACCATGGATGAACTTGATTAGGAC
GCAGTTAGCCTGAACCTAGCTTTAGACCAAAATTCAGTTGCCTAAATGACGAGTTTGAAT
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TGCCTAGATTGAACCGATAAACCCCACAAATTTCGAAGATATCTACATGTGACCAGAGAG
CTAGAAAGAGATCTAGTGAAAAGGAAGGCTCCTCTCCCGTTTCCGGAACGAGAAGCCCCG
CAGATTGAGAAGCCAGGCAGAGCTGTAAGCAGGACGAAGTAGCGGTCGATCATACCCAGA
ATCCAATCAATCCCGAAGCGGAGGTGATGGACAGGGGGAGTGGCGGGGGAGTGAAATCAG
GAAGCTGCAGCCGAGAGGGCGAGTGGAAGGGGTTGGTCTCGCTGCAGCTAGCTAGGTTTC
CTTTTAAAGAAGGAAGGAGATGAGAGTGGCACGGTGTGTGGCGTGCCTGCGGAGTTCACT
GGCTTTTCTAACGTGACGGGCTCTCTTTTTTACGGCAGTCTCACAGCTAAGCTGAATAAT
ATGTGTGTCAAGAGAAATAATATTCACTTTGTTATGTACCAAATCGATCTATAGTTCACG
GGATCATACAAGCTCGATCTCGCGGGGACAGCCGCACGGATCTCGCGGAGAGGGAAGAAA
TGGGGAAGGAGAAGAAAGCCGACGGTTCGTCCTGATCCAAATGGATGTCAAGCACGACAC
GCTCGGGTACAATCAGGGTCCCCAACGTCTAGGGGGGGCCATGTCACAGATAGGATCGTA
ACAAGCAGCCAGTAGCCTACGCATGGTGCGTCGCTGCGCGCACATACACATGCATGCTTC
GATCGAGGGAAGAAGTGTTGAATAAATAGGCAATTTTTTGAATATATTAATCCACGAAAT
AATAACTAGCATGGTATTGACTAGACTAATGACATAGATCATGAACTATTCTAGCACATA
CTACGCATATAGTTGATACATCTATGCATGCGAGTAGTATTGCTAGGATTAAAATGAACA
TGAGTAAGATAAAGGAGTTATATCCTCCAGTAGGCCAGTTGGCCGTAGCAGCGGTGTTGG
CGGCGG