Map Locations of contig_50269 (8758 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_50269

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_65493 4 2095 bp AK360038 Available Available None





CDS Structure of MLOC_65493






Contig Sequence (8758 bp)

>contig_50269 8758 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGGGGGGGGGGGGGGGGGCTTTTGATAATGTACCATTGTTCAGATCAACAATGATGGCT
ACGCGAGTGGGGCGTGCGAGCTCGTCTTTGCCTACGTCAGTGGACTAGGGCCGATGCTTG
CTCCACGGTGGCTGTTGGCAACCAGAGGTTGTGTTCCTGCCGGTCCACTGGGATTGGCTA
GGGACACACGGTGTGGACGCCTCCTACTTTTGGCGGTGCGCTGAGATGAGGATGGTTGGT
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AATATTTGGAGACACTCTGCTCGCCCGTCTCCGTCGCTGTTTCCTGAGATGGGCCGGGCC
GAGGAGGGAAAAAGAAGAAAGAAAAGGATGAACGGGGCGCGTGCGTGCGGTGCGGGTGCG
GCCCGTCCGCGAGTGATTAATAAGAAAGTGAACCCTGCTCGGTGGCTCGTCTCCCTCCTC
TTATCCAGTGCGCCGCGCTTTATATCTCCCTTCCACCTCTCGCACCCCTCGCCGCCAATG
CCATCGCCACTTGTTGACTGACTCACTCATTCACCCCCGCGCCATTCCGCACGCACGCCC
GCCACAGACGAGCCTTCTTCGTGCGCAGTAGAGGGCCGGAGCTTGTTCCATCATCCATGG
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AGCTGGCCAGGGGCGCGGCGCGCGTGACGGTGTACGAGGCGGAGGAGGCGCTCGGCGGCC
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GTCTTAATAGCCCACATCTTATCTAAGTAGTATTTACGAAATAAATTTTTTTTGGTAAGC
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AAAATTATTTTTTCTGATAGGCGATTTCTCACTTTAAATAGAAATGGAAGGTAAATCACA
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AGTGGCGAGCTAACCAAGTAGAATCTCGTTGCAACGCACGGATAACTATTAACTTACATG
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GTTACCTCAGGCATGGTATCTAGTGGCATTCTTTATCCTGTCCAAGAACCATGTTGTCAT
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GAAGGGACAGGGACACATGTACCAACAGTTGAACCTTCATCTTTTCTGCCTCGTGGCCGT
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CTCTGATTACTTTACTGTCAAGGCTCGAGGCATGTGGCATTTACCATTTACAGCTCCCTC
TTTGGCTCATATTGGTTAGTATTGTTCTGCTTGTGCATCTGTCTGCATCGTCTCCCGTTA
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TTCCTTCTGCTTCTCTCTCTCTCTTTAACAAAGAAATTCAAATCCGATCAACTTTTTGAT
GATGACAGAAAACCAGCACAATGTAAATATGCATACGCAGGTCTAACTTTAGTGGAAGGG
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GTCGTCGTTGTCGCGAGGTCGCAACACCGTCTTGATGGATGTAGCAAAAAGGTTCATCAA
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GCAGCTTTCCTTGTTGGACAGAGCCGATTGAAGCTTTCTCTATCTATAGTTAAAGCTTTT
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GCCGCCAGATCTAGAAGGATCGCATGGGTCTCACGTGACCGGCCCGAGCGTTCCACCCGC
GCACCGGCTGTAAAGTGAAAACTAATGAGCCATGGTGGTACCGAGCGGGCGACGTGGACG
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TCTCTAACAAAAAGTGAAACACATGTCCAGTTTTTTCGGATCAGGAGAAGAACATCAGTA
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AACTTAACCTGAGCAATATTTAGTTGAAATGTTGTCATTAGATTTTTCATTTAAATATTT
TAGCAATGTAATAATTTAAACTGTTTAACTAACATATTGACACGTAGTAAATTTGCAAAG
TTGATATAATTCAAAATAATTTTGTTTTGGTGAAGTTCAAAACAGGAGATCATGTCCGTA
TCCAAAAATGTTGGCATTTACAGCCGTATTGGGTGAGCTTTTTTCAGTGCAGATTGAGGA
GCACTTCGCCCCTGGTTTTCATCAAAGAAAACCGATAACACACAACAATATTATGCAGTG
AGTATCTTTCGTTATGCTTAACCGAACTACTATTGTGCGTACACCTCCTCCTCTTCTTCG
CCTCATCACCGTATCTCCTACTCTTGAAATAGGTTTTATCCCGTTTTATAGATAAAGCAA
AGCCGTATCTCCTACTCCCATGCACGTGCCACATACGGCACCAATACACCACGTACCACC
GTGATATGGGTACTAATATTATCACAAGGATATCCTTTCTCGAGGTTACAAAGATAGATT
AATTTAGTCTGGACATTTCCTCTTCTGCACTTCCCCATCATTTTTAGCTTGCTCACTGTC
CCATGTGCAATGGCTTTCATTATTCTGCCCAAGAACCACCTGTTCATTGGGGTCCTTAAC
CAAACCTTGAATCGGGACGAGGACGACGGGCGACGACAGGGACACATGTACCAACAGTGC
CACTTCCATCTTTTTTATGCTTGTCCTTGACAAGATTTTTTTGGGTCCAGCCTGGCTGGC
TGGCTGGCACAAGCTGACGAAGCCCATTTTCTGCAACTGGTCAAGCTAATTTTGCCCATG
CCAAATGTATTCTTGCAGAGGCATCTCCACAGGTTTTTGATTACTCTACTGTCAAGGTCT
CATTTTGGCATCTGTACTACTATGGTCTCTGATGGAAACTAATGCACAATTGTGGTACTA
AATATCACCCGAAAGAGGCACTTGTGTTGCTGTCAATGCCACAGCAGGCTGTTCCCGTGG
GTTGGCTTGAGGTTTTCTGCGCTGTCTTTCCTTGTCCCTGTCTCCCTAGTATTATTTCTA
TTCCAACCTTACTGCATCTGACTGGACGAGAATGGTCGACCTCTCTTTGTGTGAATTTAT
TTGTCTAGGTTAGATGCATGGTCACACTCAGCCATTGAAATTCTGAGCCTTTTACACATT
TGACATACTTTTCGCTCGCTTAATTTATTTGTACTCAATTGTTATGTATAGTACTCCCTT
TGTAAACTAATATAAAAGCATTTAGATCACTAAAATAGTGATCTAAACGTTCTTATATTA
GTTTACGGAGGGAGTAAGTCTGAATACAAGTCTGAATGGCAACATCTTAAACACAGTTAG
TTATTTTTTCCCAATCCATCAAGGGTTTTCCTAATTAATTACTCCCATATATAGGTAGTA
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GTTGAATGAATATTGATGTGTCGGTACTGTGGTTGGTGAAATGGATGGTTATATGTGTAC
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GGTCATGTATTCTGGAACAAAGGATTTAATATACGAAACAGACATCTAGATTGGCAACTT
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ATGGAGATATCAGACATGTCGCTCTCGGTGAGCACGCAGCTCTCCGGGGGCGGCAGGTGC
GAGTGGGGCAGCCGGAACGGCCTCTCAGGCCTCCTGGCACAGAAGAGCAATGCCGTCCGC
CCCGCCTTCTGGCACATGATCCGTGAGATCCTCAAGTTCAAGGAGGATGCTCTCAAGTAC
TTGGAGGATCATGAGAGCAACCCTGACCTGGACCGGCACGAGACTCTCGGGCAGTTCATC
AAGACCCATGGGTACTCCCAGCTCTTCCAGGAGGCTTACCTGATCCCAATCTGTGCGAGC
ATATGGTCATGCCCGTCGCAGGGTGTGCTCGGCTTCTCCGCTTTCTTCGTCCTCTCCTTC
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CTGGAGAGCATGGGTTGTCAGATTAAGACTAGCTGCCAAGTCAAATCAGTTTCAAGCTTC
GACGGAGGTAGTTGATCCATTTAAATTTGTTTTTTTAACCTGAATCCTGTTCTTTTCCTG
CAAATGATGTCATTGCTCATTGATTTCTGGCTGCAGGATACAAAGTCTTGGAGGTCGGTG
GCTCGGAGGAGGTGTACGACAAGATCATATTTGGTGCTCATGCACCTGATGTTCTGAGAA
TGCTAGGGGGTGAAGCAACACACGAGGAGTTGAGAATTCTGGGTGCGTTCCAGTATGTCC
ACAGGCAAGTAATATTTGCGCTATAAAATTTATTTTAACTGCCTGGCCTGCTGTTCTCCT
CATCTCTGAACTATTAACATTGCAGTGACATATACCTCCATCGCGACGACACTTTGATGC
CACAGAACCCGTCCGCATGGAGCGCCTGGAATTTTCTGGGGACAACAAGCAGCGGCGTCT
CTGTTACCTATTGGCTAAATCTGCTCCAGGCAAAACTCTCAGTCGTCAGCAATGCATGAA
TCTACTTTGATTAATACTCTTGTCCACAATGAACTCACATCTGCGCTTGGAAAATTCAGA
ACATCGAATCTACCGGCAGGCCTTTCCTGGTGACACTGAACCCACCTCATGTACCGGATC
ATGTACTGCTCAAATGGAACACAGGCCATCCTGTTCCATCCGTCGCTGCTGCAAAGGCTT
CATTGGAGCTTCAGCAGATCCAAGGAAACAGGGGAATATGGTTCTGCGGGGCATATCAAG
GTAATTCAGTTTATTTCTCCCTTTCAGCATATGTTTTTGTTTATTACTACGTGTATTTCG
GTTAGGTGCCTTATGTCCTGGATTACACAGGTTATGGCTTCCATGAAGATGGCCATAAGG
TACTCCCTGCCTGCCCAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTGCCTTCAGTGGATTATATGTTTGG
CACTGATATCTATGTGTTTGATTTATCGCAGGCTGGGAAGTCTGCAGCTCAAGGTTTGCT
TGGGCAGAAAAGCAGCCTTCTTCTGAACCCAAAACAGATGGTCCCATCATGGACGGAAAC
TGGGGCTCGCCTTCTGGTAACAAGGTTTCTCAACCAATATGTAACCATCGGTAACATGAC
GTGAGTGATCCTTCTTTGAAACTCCTGATTCAATCCAGGCTTTGTATGGTATAAACCTAA
CTTGGTTATTTTTGCTTGTCTGTAGCATTCTTGAAGAAGGTGGCACTATGTTCAGTTTTG
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ATTGAAGTGGTGAGTGGTCCAGTATGTAATTATATTGTTAATTGGCAGGGGTTGGTGG