Map Locations of contig_50241 (10549 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_50241

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_65476 1 633 bp MLOC_65476.1 Available Available None
MLOC_65477 2 1546 bp MLOC_65477.1 Available Available LOC_Os04g59150.1, FRAME:-1, EVALUE:7e-142, 13104.m06232 protein peroxidase precursor, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_65476






CDS Structure of MLOC_65477






Contig Sequence (10549 bp)

>contig_50241 10549 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGGTTCGATAAACCTTGGTTCTATACTAAGGAAAATACTTACCTATATTGTGTTGCATCA
CATGTTCCTCTTCATGGAAAAACCAACGCGGATCACAAGTATCATCTACCATCGAGAACG
ATGCATTGTTGGCTCCCTTTGAGGAGATGGAGGTGGAATCGTTCATTAAATCTATGAACT
CGGACTCGGCTTCGGGCCCCTATGGCTTGCGAGTCTATTTCTTCCAAGCGTTCTCGCAAA
CCATCAAGGGGGATGTCCTCGCTTTGTTATCACGAGTTTTCCCGAGGAATGTTAGAAATC
TCTCGCCTAAACTATGGGATCATTTCTCTTAACCCGAAGGTGCAAGGAGTTGTGCACATT
AGGCAGTTCCGACCGATCACAATAATCAATGTGATATGTCGGATTCTAGCCAAGGGGTAC
GCCACTAGAGCGGCCCTGATTGCTCCCAGGATACATCACCCTTAGCAGACTGCGTTCACC
AAGGGGCGAATCATTCTTGATGGAATCCTCGTCCTCCACGAGGCGCTCCATGAAGTTAAA
AGGAAAAACGTTCGAGCGGTGTTTTTCAAAATTGACTTCCGTAAGGCTTATGATACAGTT
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TGGGTCATGCAGCTCGTGTCGAGTGGACGCACCATAATCAACATTAATGGGGAGGTGGGT
CCTTTCTTTCCTACGACGCAAGGGGTTCCGTAGGGAGACCCTATGTCCCCATTCCTCTTC
AACCTAGTAGTGGACGCCCTAGCGGTGATCTTGGACCTTGCCAAAAGGGCTGGTTATCAT
AAGGGTATTTGCCCCCACCTTGTCCCCAAGGGTGGTCTAACCCATCTGCAATATGCCGAC
GACATGATCTTGATGATAGAAGGCTCGGATGAGGACATCACTCACCCCAAGTTCCTCCTT
CTATGCTTCCGGGAGATGTTGGGGTTAAAGATTAACTTTGCAAAGAGCTAAGTAGTTGTG
TTGGCCTACTCCTTTGAGGAATCCCACTATATATCTAATCACCTTAACTATTGACTCGGG
TCCTTCCCGACAACTTACCTAGGCATGTTGATTGGTGACACCCGGCTTCAGGAGAAGGAC
CTCCGTCCTACAGTGGCCAAGGTCCAGCATAGGGTCGAACCTTGGCAAGGACGGTGGTTG
TCGAAGGCGCCAATGCTTGTACGTATCAACTCTTCCATGATTAGTCTATTGATGTACCTG
ATGGGATTCTATAGCTTGCATAATCCCTACATCATGATATTACGAAGTACCAATCCCGGT
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GCAAACCCAAGGACTAGGGTGGCCCCGGTGTCATCTCGTCAAAACGAACGAACATAGCCC
TACTGTCGAAGTGGCTCTCGCGTATTGAGATTGGGGATGGGGGACTATGGCTTGACATTA
TATGTGCCAAATATTTGTGTGGTCAACCACTCGCCTTTGACCTCAAGGCCCGCGACATTT
AGTTCTCTCAATCGATTACCCAACTAACGCCGGTTCTACCGATAGGCTCGTCAATTAGGA
TTGGTTCGGGTGCGAGCACCCTATTTTGGCTAGACCGATGGTCTGGTAGTAGGCCTTTTG
CGGAGCAATTCTATTCGCTCTTTATTATTTGTACTCGCCCGAAACTTACGGTTGGGGCGT
CCCTAACTGATCTCGGGACGGTGTCGTTCCGATGTGCCTTTGGTCCTCAGTAACAGGTCC
AGTGGGAGGAGATGCTCGAATGCCTCGCCGTGCACTCCCCCTCTTTTGAGCCGGATGCCA
CCTATTAGCATCTCGAGTCGAGTGGCTAATTCTCCACTCAGTCTCTCTATAAGAACCTGT
TGGCCACCCCTGGGCTGCGGGAGCTGAATCTCCTTTGGGAGATTAAGTTGCCACTGAAGA
TTCAAATATTTCTCTGGCAATAGTTACGTGGTCTCCTACCCTCGGGGACGGAGGTTCTTA
AATGCAACGGTCCTAGGGAAGGACGATGCCCCCTTTGCTACGTGCCCGAGGACACCTACC
ACATCTTCTTTCGGTGTCCAGACACAATTTTCGTTTGAGGATGCTTCCGGGATGTACTGG
GCGATAACTGGTCCCATGATAACCTCCCGTACTTATTCAGCGAGGTCCTTGATGACTCCC
CTTGTTATAACCGTCCATCCATGTGGGTGGCTATAGGTGCTTTAGCATGGACGTTGTGGA
ATGTGCGAAACAAACTATAATCGAGCATGTGATTCTGCAACGCATAATTGACGCCATATA
CAAACTGTGTGACTTCTTGCAGCTCTGGCGACCGCTTAGCAAACGATGGCAGCATGGCTT
CATCGATGTCATTAGCGCCGGCCTCCGCTCCCGCACGACCTCCATCGCACCACCGGCTCC
TCCACCACCTCTTGAGACGGATTAGCCTTGTAGCTCTTTCATAGGGGTTTGTTGTGATGT
GCCCACACAGACTTATTTTGCTTTCTTGTTGTCTTGACTCTTTCATTTCTCTTTCGACAA
AACTTGTGGTACCGTTGGATGTTTGGTTCAGTTGCTTTATAATATAAAGCGGTGGAAAAA
ACCCTTTTTCGTCAACAAGGTCACGCCACGGTTATCTCGCGGGGATTGGGTGCAATACGA
GACACCGAACGGCCTACTGCCTAATTTTGATGTCCTCTAACAGCAGGGCACGGTGCAGAC
AGATAAGGACAACTCCTGATGGCAGCCCGTGATGCAGTACCAAACTTGTCCTTCATAGAA
GTGAAAAAAACAAGTGTTCCTTCAAATTATTCCTACATCATAGCACCCTCTAGTTTTTCA
TCCATCGCGAGACTGCCCTTTTCTTCTCCTTCTTACCCACGCGTCGAGGATTTACTAAAA
AAGTACACACGTGAAAGATCAATTGAACATTGAGCCATCGTGAGCATGTTAGAAACTTAG
CAGCCACGTGCCTTAAGTCCACATGGGCGCTGGTTGGTGCACAAGTACTCAAATACATAT
ATACATGAAGTATAATTATTTGGAACTTGATTTGATTTGAAGACCACAATTTCATCACCC
CGTTGCATCACACGAGCCCTTTTGCCGATGATTAATCAAAATGTTTACATGAATGTCCAA
GTGGTCGTGGGGATTGCCCGTCCATACATGTCTGCCAGGATTGGGAGAGACACCAAACCT
AGCCAAACCATGAACATCAACATTTGATGCTCTACATTCAAAAGCAAAATTACTAGATAG
GTTTTTTTTTTGCTTGATCTATAAACTCTTTTTAAATCCCCTCATAGCTTCCTCCCCTCG
ATGGATGAAATGACCAACAACCTGTTCACAATCTGATGCGATGTACGACAAACAAATCCC
CAGATCCTCCTTCAAAGACATGGCTTTCCGGCATGTTATTGCTTCTATCGAACTTCGATC
TGAGAGACTTTGAATAACGAGCACCGATGAACCCAGGAAACGCCATTCCGATCATGACAA
ATAGAAGGGTGACATAAGATCGAACCATGTAATGTGGCAGATTGGAAGCGAAGAAGTGGG
TGACCTCAATTGTAAAACCCGTCATGATCCGCGACCCTTTCATGGTCCTTAGCTCCAGTT
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GAAGACACTGTTTTTTGTTTTGCCATGAAAAAGGTCACTTTCTCGTAAAAACATACTTTT
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TTGATTATACTTTTTCATGATTTTGTTTTATCGAAGACAATGTGGAACTGTGAACCTTTT
ATTTACTTGCAATAAAGGGGCCGTATGCATCATGCTGATGCAAATGCCAGAGGTAATCCT
CCTTTTCTAAAAAAAATCATGGCATTTCCGAAAGCACAAAAACTTTTTTTAACACAACTA
GAAATTAAACTTTGGCAAGTACAGTGCATCATCGAACATATGCCATTTGATAAGCATTTC
TGGGCTTATGTGTTTAAGTTGTATGTATTGACCCTGATACAATAACACTAAAAGTGAGAG
ATGAAGCACTGTTTCCGATGCTTAATTATCTGGTTATGCTGTCTTCACCATCGTACAGTA
CGTGACACGGACAGCTTCTCCATTTTGTGTTGACGAGACGTAACACTGAGAGTGACACGG
TACTTTGCGATTCTAGTTGGTCTTGAAGCTGAACTATTCGAGAGAAGGTTTGTGGGGATC
CCGTTAAAATAACGTTGCAAATTGGTGGTGTATTTAGTGTGTTTAGCGTGTGTTTTAGCT
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GTCTTCATTTTAAGTTAATAAAATTCATTCTTTGTTGAGAAAATAAAGTGGATCCAGTCA
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GGCTAGACATCACACTTCCACGATTCAAAGTTTAAAACACATAGACTACTTAACGGCCAC
TCACACAGTCACACAGTACTACTACGTTACACCGATTGGTTATATATCTCTCACATGTCA
GCGGCGATCCCCTCGTCGCCGGCGACGGCGGTCTCGATGTCCTGGACACGCCTGTTGGGG
ACGGCGCAGTTGTTCCGGATCTCGCCCTTGGTGCCGGTGAGAATGTCCATGTTGCTCATC
TTGGTCATGGACCTCGCGAACTGCTCGAAGAAAGCGCCCTGGTTGAGGGAGAAGCGTGTG
GCCATGCGCTTGGTGGTCGGGTGGTCGATCAGGCCCTGGTCCGACTTGAACAGCCCCTGC
CTCGCGATCAGGTCGAAGTAGTACTTGTTGTCGAACACGTCCGGCGTGCGCACGTCGAGG
TTCTGGGTCAGCGTGCCGGCGGGGTTGTCCCCGGCGCACTTGTTCCTCAGCGCCGTGGCG
AACTTGCCGTCGATGGCCGGGTTGGTGTCGAACACCGGCTTGAACCGGTCCTCGAAGGCC
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AGGCTCCGGTTGGCGAAGGAGGAGATGAGGGTGGGCACGTCGAAGAAGGGCGCCGGCAGG
AGGCCGACGAGTGCGGACGACGCCGGGGCGAGCCCGTCGCGGCGGCCGAGGGCGACGTCG
AAGCTGGGGCCGCCGGCCTTGACGAGGGAGTCGCGGGTGGCGAGCACGGTGATGTCGGCG
CAGGAGACGGTGGGCCCGCATGCGCGGTGCACGGCAGCGCGGATGCGCTCGATGAGGTCG
AGCGCCACGGGGCGGAGCGTCTGGTTGGGGATCTCGTTGAGCTCGCTGCCGGCGCCCTTG
AGCAGCACGGAGGCGTCGCAGCCCTGCGGGAAGCAGTCGTGGAAGAGGATGCGGATGAGC
GCCGGCGCCACGCCCACGTCGCGCCGGAACGTCTCGGCGACGTGGAACTCCACGATGCGC
TCCAGGTCCGGGCACGTGGCGGCGTGGAAGTTTGGTGACAGCTGGCCCTCCGACGAGTGG
ACGGCGGCGCAGACCAAGGCCAGGACGGCGATGGCCGCTGCTGCTCTGGACGCCATTGCT
GAAGCTGAGCTTCTTCTTGCACCTGGACCTAGCTAGGTAGCTACTTAGGACTGAGGGAGG
GTCGTGTGGCTTGCACAAGATACCCACTACACCTTGTTATTTATACATCGAGCTGGGTTG
CTCGATCTGATCCCATCATGTGAAGTTAAAGTCGTAGAGGTTAACTAGAGAAGTTGATAG
ACGACGATTAGCTACCTCCATCTCCATGCTGGGCACCCACCCACGCAGCTAGCACGATGT
GATCCACAAGAGAGAAGACTAGTCGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGACTAATTACAAATTAA
AGAGAACATGCAACATGGGCAAGTTGCATGGACAAAGCTGGTAAGGAAAATCAACTGGCC
GGCTAGGGTACTAGGGTACCCCAAATTCGTGTCTCTTATTCTAACTTTCCTCCTGGTTTC
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TTGAAACCTAGATGTATATACATTCTGTATGAAAAAAAAATTATAATTCAACAAAAAATC
AAAAAAATTGAAAATGTTTTTCAAATAAACTTGACCTTTCATTGTATTTGTGTGAAATTT
TTTCACAAAAATAAAATTATACTTTAACTTCTTTCTAAAAAATAAAAAAAATCATTAGAA
TTGTATGAATAATGACCTATAATAGCTAATAAATTTGTCTTTTCTCTCAGAAGTCAATGT
TGTTTTTGTTGAAAATTTATATACTTGTGCAAAACAAAATCAAGTTTTATATAAAAATAT
TTCCAAACTATTTTAACTTCTTAATTAATTATTAAAATTTTAATATATATATGTTGCATC
TACAACCAGAAACCAAAGTATATTTTCCTATAGATTGCTAGACAGATTCCATGAATCGTG
TACGTGCTTGCTAATTTGGTAGGGCATAATTTACGGATCAAGCAAGGGCATCCAGTTGGA
TCTACTTAACGTATATGGAATAATTCTGAACGGCACGAAGCTACGTGTTGAGTGAGCGAT
TAGTTAATGGCGGCTAGCAAAGCTAAGCTAGGTGTGGTTAGTTGGGATCAAGTGTCGTCT
TATCTCTCGGACGATGCTTGCAAAGCTACGTACCACTTGCATGCCAAATTAAAGCCGCTG
AAAGTTCGCCGCCGGGCACGTGCTGCACTATACCACAACAGTATTATATCAGCTACGTAC
GTACACTGGATCGGGTCAGGCATGGGCATGGGCATGGTCGGCATAGACGCGTGCTTTCCT
ACAGTAGTTCCTATCCAAAAACTCATTGGCTCTTCTATCGTCGCCGCTCCTTCATCAGCA
AATACAATAAGTGAATGGATGAAAACTCGTTCCTTTTTTGCGTGAATATGCACGTCAAGC
TATAAGAGCAACTCCAACGAGTCGGCTTATTTCGTCCGAAGGCGTTCTTGAATTTTAATG
GACTGAAAAATCGTTTCAACGCATCGATCTAAATGGACATATGTCCGCTTTTCGTCTATT
TGTCGACCCTCCCGGTTGACCTTGATTTGCATCGGCATGGATAGGCGACGGATGGGCGCG
CTGCGAGCCAACTACTTCCTCTGACCCGTCAATCGGTGGCAAAGCCTTCATTGTTTTCCT
AAAATCCTTCCGCCCGTACGCGCTCCGAGCCACTTGCCATGGACGACAACCTTGATGCCA
AAAACTTCTGATTATTTTGATGTGAAACGTTCTGATTATTTTGATGTGAAACGTTGACAA
AAGGTTTATCCGCTTGCAAAATTCCATCACCGTATGTCATTGCTAGAAATCATGCAAGAA
AAAAAATCAATGCTACAAACTGCGTTTGAATTAACATTTTGGAGCATTGATCTTTTTTTT
TGCCATGGTTTTCACGGATGTCATATGTGATGAAATTTCGCAAGCCAACAAATATCTTGT
TAATGTATCGCACGAAACAAATTCAGAATTTTAAGAATTGATTTTCATTTTGAAGTAATT
TTACTGTTCATTAAAGTTCGTATGAGCTCCGGATAAGAACAGCCACGTCCATATATGCAA
GGAAAAGTGGTACAGATTGCTAGACAGACTCCATGAATTTACGGATCAAGCAAGGGCATC
CAGTTGAATCTACTTTAGGGAAATGGAATCGTTTTGAACGACACGAAGCTACGAGTTGAA
TGATTGATTAGTTAATGGCGGCTACCAAAGCTAAGCTTAGGTTTGGTTAGTTCGGGATCA
AGTTTGGTCTTATCTCTTGACGATGCATGCAAAGCTACGTACCACTTGCAGGTCAAATTG
GAGAGCTGAAAGTTCGCCGCCGGGCACGTGCTGTGCTGCATCACAACAATGCTTTTTCAG
GCATCTCCAACAGCGACCCATAATCTGTCCGGATTGCACTGTTCGGACCGCGCAAGCCAT
CTAACACGGTTCTGTATCAGTCCGTAATTCGAACGGATTTATTTCTGTAAACTGAAGGCA
AACATGAAGGCTTTGTGGTACTCCGGACATTTGAACTGTTGCTTTTTCCTCTCATGCATC
CAAAAGGAAGACGGAGCTCGTGCTTTTGTAGCATCCCCAACTGTTTGTGTAGTAGGAATC
CCCCACTCTCTTCTTCCATACCCCGCCGCACTCCATCCAATTCCCTCTTTTTCCCACCCT
CTCATTTCTTCAGCTGTCGATGCATCGAACCATCCGAGGTGCCGTCAGAGGGTTCGAATA
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GGTGGCGACGATGTGCATGAAGGTCGTGGCGAGAGGTGATCGTTGCAGCCGTGGCGGACG
CCGCTACATGGGCGGGCACACAGTATAGACGGCGGCGGCGTGGTCGGAGCCTTCCAAGCC
TCTGTACTACTCCGCCGACAAGCAGCTCACAACCCCCGTATTATAGTGCCCTACATCGTC
AACGTCAAAGCAGCGCCGCTCTTCTCTGCGTATTCTTTGCCGCAACTTGTCCAGGGGTGG
ACGGGGGCCAGGGTGCACATGGGTGCCCACAAGCTGTTCACTCCAATGCCTAGAGCGGGG
GAGCGGGCGTACGATGCAGACGGAGAGATGCTCCATATCATCCACGGCGTAGGCGAGGGA
GGAGGAGGCAGGCATGAGGACGAGCAGGTGAAAGACTCGGACCCCACCCGTCAACTACCA
GCAGCAACAGTCATACACCTAGATAGCCACACAATGGTCGTACACACAGACCGGCGATGA
CACACAACAATAACAACATTTGGCCGCCGGAGAGCAGCAGCCGTAGGGGGAGGAGTAGGA
GGATGGACGCGCCGATAATCCAAGGAAGAAGGGTAGATGAGACAACTTTAACATGTCGGA
GGACGAGCTGTTTTGTGATGGATGGTTGGTCACTAGCATTGATCCGTTTCATGGCACGGA
GAAAAAAGACACAACCTTTTAGAGAAACATTCACATATGCTTCATGAACACGAGAATTCG
CATCCTACTGTGACATGCTCATCCACAACCGTCAATGGAAGTCCCTAAACCATTCCCAAC
GGGGCGAACCAAATCTGGTCCAAACGTCTAAATTGACCAGCAACCCCATATTCGGCCCAC
ATATAGGAAGGATATTGTGATGCCCGGATGCGCTTGCCACATCGGCTTGGACCGTTAGGG
CCAGGCCGACCTCACAAAATCCCCATCCCATTCGACGAACCTTAGTCAAACCTCAGTTCG
CACACATCTTCTCCACTTTCCTTGTCTCTTGAGCTTCCTCCCAAACCCTCTTCCCTCCGC
CATGTTCAACTCTGGTGAGCGCTCCAGTAGCAAGCCCGATGAAATCGAATGGGACGGTGT
CGCCAAAGAGGAGGACGGTGGATCTAGCTCCAAGGTGACGGATGACGAAGAGCTCGCGCT
ACACATCACCATCGAGTGCTCGAGCGTACGTGGACACCTCCCTCGCTTTCGCCGTGAGCT
TGTCAACCTCCCGCCGATGGAATGGGGGTCGCGGACGCCCATTCCGCTCCAAATCCGGAG
CTCGAGCGTCTCCCTTAATTTCCTCACTGGTGCGCGCACCACCCGAGAAGCGGTGGGTGC
TTGCGCCTGTGCTGTGCGGTTCCAGTGGCTATGCTCATGCATGAGCCAAAGGCAAAGGCA
ACCCGATAGTGGGTGACGGCTTTGGAGGCGCCCGTTCATCTTGCTCTATCCCCCTCGAAC
CAGAGGAGGCGCTCATCCGCGAGGATCATGTGGCGGTGGCTGGCCACGGCGGATACCTGC
GTGACGTCTCCGGCTCGAGAATGCGAAGGCGCTCCGTCTCAATCTCGAGGCGTCCGAGTG
CCTCACCCAGGAGAAGGAGGCCGCCGCCATCAAGGTCGCTATGATATACTCCCTTCCTTT
TTAAATATAAGTCTTTGAAGAGGTTTCATTAGTGGACTACATACGGATGTATATAGACAT
ACTTTGAAGTATAGATTCACTCATTTTGCTTCGTATATAGACTCCTAGTGAAATATCTTT
AAAGACTTATATTTAGAAACGGAGGGAGTAAATGCTATGTTCTATGATATCTCGTATGAT
CTACGTACGTACATATGAACTATTCCCTCCGTTCTAAAATATAAGACCTTTTAGGGATTT
CATTAAGAGACTACACACGGAGCAAAATGAGTGAATCTGTACTCTAAAATATGTCTATGT
ACATCNGTATGTAGTTTATAGTACAATCTCTATAAGGTCTTATATTTAG