Map Locations of contig_50095 (9390 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_50095

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_65374 1 1274 bp None Available Available None
MLOC_65375 1 654 bp MLOC_65375.1 Available Available None
MLOC_65373 3 2010 bp MLOC_65373.1 Available Available LOC_Os05g13330.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13105.m01397 protein per1-like family protein, putative, expressed
MLOC_65372 1 971 bp AK357850 Available Available None





CDS Structure of MLOC_65374






CDS Structure of MLOC_65375






CDS Structure of MLOC_65373






CDS Structure of MLOC_65372






Contig Sequence (9390 bp)

>contig_50095 9390 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTGTGTTACCCTGGCCTTGTCATACCTTGCTTACTTTCCAACCTACACTAGACTAGACTA
GTCTAGAGAGGAGAGGAGAGGAGAGGAGAGGGTGGTACCTTTGCAGATTTACTCCCTTCC
CTTTAGTTTAGGCCAAGGGTCTCTCAACTTTTCAGATGATTACAACTTTTTCTTTCTTTT
GGCACTGTGATAGGGTCTACTTGTACCTAAATATATATGCGTCACTTCTACTTCTACTTG
TACTAGGTTAAGGCTAAAATTTGAGATGATATTAAGGATATATGCGTCACTTAACTGAAA
AACAAATTCAGTTTTACTGGAATCCCGCGTTGCCCTAAATACCGGGAACAAATGGTGTAT
GGCTCCCAAATACTGTGATTTTTTCAGTCATAAAATTATTCGTGCAAGGATGATTCATGT
ATTAATTTCCAAAGTACTGCTCTAGGCTTGGAAGTTGCCATGCTGCTGTTATTTGTTTCT
GGTATTTCTTCTTCACCTGCATGGCTGGAATCAATTTTATGAACCAGACCAATTCTCTTA
TTCGTAAGGAAGGTTCAGGAGAATCAGTTTTATGACCCTTTTGCCATTTTATGAGATAAA
AAAAAAGTGTTATATAACAAATAAGCAGTCCTGTGAAACTAATCAACACATATTCCCTGT
CTGTATCGGGCATAAACCAGCCATATCTGCCTAACTCAGTCCTTGCTATGTTGTTGTGCG
AAGCTATTGCCTAGCTTCTTTGACATACCGAGATAAACCTAGGTCGATTCTAGGTACGAA
ACCCACTTTTCATACCGAGAACAGAGCCGGCCCTCTGGTTGTAAGTGCAGGTGCATGTTC
GAGTTTCGGACTCCACAGGACGCCCAGGTTGTTTCTTTTATTAAAAAGAATGCCGCCAAG
GGCTCCTAGCTGGTCTCTTCTTTTTTATACCGACACTTCGAATATAACTTCCTGTAATTT
TGTTATCATTCTGCGTTTCAAGAATCACTTATTGTAAAGTACTCCCTCCGTCCCATAAAA
TAGTGTCAAAAAACGTCTTACATTATGGGACGGAGGGAGTAAGAAATCAAATGGTCATTT
TCATTTATTTAGCTGCAACAGACTCTTGTTGAATTATAATTTTGCTGTCCTGACATTCAC
ACTGGCGAATTGAAAATTTTGTAATTGAAGCCTGCCTTTTTTGCCAATTCGTAACTTGTG
GTGAATGAACCTGGGATGCACGCCTTTTATCATTTCCGTGGGTTCTGAATACTTTTCTTG
CTGACTGCTTTTCTGCCACTTCATGTTTTTCTCTATCTAGAGTTTATGAGATTCTATCTG
TCTTTTGTTGCATTGGAAGGTATTGTTGTACCATCTTTAGCAATTACTCCCTCCGTTCCT
AAATATAAGTCTTTTAAGAAGTTTCACTAAAATGACTACATGCGGATGTATATAGACATA
CTTTAAAATATAGATTCATTCATTTTGCTCCGTATGTAGCCCTCTAGTGAAATGTCTAAA
AAGANNNNNNNNNAGGAACGGAGGGAGTATATCTCTATATATTTGAGGTGATTTAATGTG
CATTTGTAGAGCATGTTCCCGTATTCCCAAGACAAAAAACATGGGATCCCTACAAGCTTC
TTGGTGTTGACCATGATGCCTCTGAAGAAGAGATCAATAGTGCAAGGAACTTCCTTCTTC
AACAATACGCTGGGAATGAAGAAAGCGAAGAGGCAATTGAAGGTGCCTATGATAAGATAA
TGATGAAGAGCTACTCACACCGTAAGAAATCGAAAATCAACCTGAAAAGCAAATTAAGGA
AGCAAGTGGAAGAATCCCCATCATGGGCTAAGTCACTGCTTGGACACTTTGAGGTGCCAT
CGATGGATGTTGTGTCAAAAAGATTTGCTCTCTTCGGCTTTATTGCTGGGTGGAGCATCG
CAACCTCTGCTGAGACCGGACCTACCTTCCAGGTATATATGATTGTAATGATTTTCCCAA
CTGATTCAACAATCCCTTTTCCCCAAGCATTGAACCTGTTAAGAGATTACTTACAGCCTA
AAGACTGTTGTTTAATTTCTCTCATGGTTGGGCATTGGAACCATTAAGCAGAAAATTGAC
CTATATTAACACCATACCAATGATAGATGTTGCTTGTTCTAACGCTCTTTCTATCATTGA
TGGTTTTGTGTTGCAGCTTGCACTGGCACTCGTCTCATGCATATACTTTCTCAACGACAA
GATGAAAAACCTTATGAGGGCGTCTGCCACTGGGTCAGTTAGCACACTACACTTACATAG
CAACATACTACTACTACCTTAGCTGTTATTTAGTCACGCACGTATAGGGTGCTCACTCCT
CCTTGGTATTTTGCAGGCTTGGAGTCTTTGCTGGTGGCTGGATAGTAGGCTCGCTGGTGG
TCCCAGTGATCCCGACATTTACTTTCCCGCATACTTGGTGTCTAGAGCTCCTTACTTCGC
TGGTCGCTTATGTATTTTTATTTTTGGGCAGCACTCTTGTCAAGTGAAATCTGTGACACT
TGAAACTGTTGTTGTTTGTGCGAGATTTTCTCTTGCTGACGTCTCAGTGGACTCAGTTCA
CCCTTTTGACACATGAGTATAGATAGATGCCCTATTGAGAAACCGAAACTTGGGCCACTA
TTGTTCAGATCCGGTAAGGTGTTGTCATCTCTAGGTTAAGCGAGCTTATATTGATTTGTA
TTGTATTGCATTGTATTGTATTGTATTGTAGGCAGAGCAATCCAGTTTCTGCAAGCTGCT
GCTGCTGGGCATGCTATTGTGATTATACATGACTTTGTACAGTTTCAGATGTGCAATCAT
TAATTTATCATGTTTTTTATCACTTGTTTGTGCTTTGTGAGAGTTTTTTTTTCACGTGTG
TTGTGGTGCATCTCTGCATGTGGATCAACAGCAGCAATTTGGGTAGTTAGCCCTCTGTCA
AACCCATCATTTTAGCAGCAATTTGGGTAGTTAGCCCTGTGTCAAACACATCATTTTAGC
TTGCCAAATGTGAATACAAGTTGCAATCCTTGGCATGTCGGCGGTCATCTTGATTACTTT
GTAGTAGCTGAGAATTTTCTTGCCGGGATTCAGTCCAGTTGGAATAAATTGTAACAGTTG
TTAGAAATCAATTGTAAATGTTGTTGGATTGTTAGAAAAACATGGAAAACACGCTTGTGG
TAGTGGTAGGAGGGAACGACAAGCTGAGAAAATCAATTTGAAATCCATATCGGCCAAGCA
AGTTCAATTTTATTTTATACATATAACAGCCTATTAAAAAAATTTGCTAGCTGTCTGACA
ATAATAATAATAATAATAATAAAGAGAAAAAAAAGGAAAACCAAAGTCAGTCGGAACAAA
CATCAGAATCTTATGTAGTAGCGTATGTATCTGAGTAGAATAGAGCAGAGCAGATAAGAT
TCACAGAGCTGGCAATATCACTCTACACAGATTATACGTTGGCCAGCTTACTTTACTCAC
TAATATAATATTCAAAGAAAAGAAAAGAAAAATGTGGTCATTCTTCGCGACCCCTCCCTC
GCTCGGCAAAAATGTGCTAGTTTCAGAAAACAAAACTCTGAATTCATTCTGAAAGCCCCG
CATACTAACGGATTGGGGGATGGAACAAGCCGCCGCAGGGATATGTAAAACTGAATGTCG
ATGCAGGTTTTGATCACGACCTCCTCCAAGGATCGATTGGGGCAATAATCAGGGTCCAAA
AAGGGCAGTTCTTGGCGGCAGCAAATGATAGGATTGATATATGCTATGATCCGAACACGG
CGGAAGCGTTGGCGGTAAGATTTGGGCTCAACCTTGCAACAACTATTGGATGCAGTAAAA
TCATGGTGAATTCTGATAATCTGGAGATAGTGGAGGATCTTAAGAAGGGATATTATCATC
GATGACTGTTTCTTTTTGGGATCGGAATTCAATCATGTTTTATTTGAACATTGTGGTAGA
GATAGTAATCAAGTAGCGCATGAACTAGCTAAGTTAGCAAAGTCTTCCCCCTTAACTGTT
GGATGGACTCAGCTCCTGAGATTATCTCAGCTATTGTAAACGATATGGTTACTCTTATTT
CTGAATAAAGTTGGAGGGAGTTGTAAAAAAAAAAAAAACGGATTGGTATCCAAACAGACC
CGTAACCTGTTGCCAAGCGACCGTCCGTCCGTAGCACCTCTAGGTTAGGCGTTGACTTAC
TGCATTCTTGGGCTGGGCTGGGCTGGAGGTTCTTCTGCTTCCAGCCTGAAAATAGGCCGG
GCCGGCCCGGCCCGGTCCTTTAGGAAAGAAGGCCCAAAGAAAAGTGAAACCTAATCACCG
ACGCGACGCGACGCTCCCCGACCAAACCTCCGATTCTGCCGGCGGCGGTCGGTCGCTGGA
TGCTGCTGGATTCATTCTAGCCGCCGAGCAGGAGCAGCGACGAAACGTAGGTCGCTGGAT
CCTCTGCTTTGCCTCGACTCTCCTCTCCTCTGCTCTCCTCTGCTCTGCATCGCATCCTTC
CAAGTCGTCCTCTCCTCGCTCGCCGGTTTACATCTCCATCCTCTGCAAACAACAACAACA
ACAACAAGCAAGGTAATCCGCCGCTGTTCCTAAATACTACAAGCTTCTATGCATTTCTGT
TTTGTTGATTCAACCAACCAACAAGGTAATCTGCTTTTCGTGCATTTTAGGCCCCTTCAC
CACTGATCCAGTAATAAAAGTAACCAACGAATCCATAGCTGCTGCTGCTGCTTGCCGCCG
TGAGGCAGGGATGACCGGAAGCAGCCTCCGGAGGCTACTTCCATTGGTTTCCCTTCTTCT
TCTTCTTGCCGCGCTCGGATTCCTCTCCGTCTCCGTCCAGGCCAGCCGGGGGGATGCCGA
TCCGCACTACAGGTAACAAGCATGCGTTCCTCTCATCTTCACTTTTCTAACTTTGATTGA
AAAATACACTATATCTCATCTTTGACTTCGCCTTGACAATCCTTTAACAAATTTTTTTTT
TTTTAGAAAAGGAGGAACATGGTTTTACAATACAAACACAATTTCTATTCCTGGCCATTC
TAATGTTAAATAATGTTAGTTAAATTGTTTACAAGTTTCTGGTAACTTGCGTCGTGATCA
ACGTGCAGAACCTGTGTGGACGAGTGTCAGAATACAGGGATTATTGCAAGTAACATCATC
AGTCACTGCTCGTCCCTGGAAAATGACAGCACATCCGCTGGAACTTCTTGGTACACACAG
GAGGCCCTTGGCATGCAGTGGAAGCAACTAAACTGTATGACAGACTGCCGCTACTACTGC
ATGATGCAAAGAGAAGAGGAACGGCGATTAGGTGGCCTGAGCCCTGTTCAGTATCATGGA
AAATGGCCCTTCAAACGTGTTTCTGTCTTCCAGGCATGTCACATTTGGCTTGTATGTTGA
TGAGTGTTCCACCTTCACCATGATGACTAGCACTAACTTGTTGGCCATTCCTATATTTAT
CAGGAGCCCCTTTCGGCTGCACTGTCTGTTCTCAACCTATTGATGCACTTCACTGGCTGG
CTTTCATTCTTCCTGCTAGTGAAATACAAATTACCTCTTAGACCTCAGACCAAGAGGACG
TACTACGAATACACTGGCTTATGGCATATCTATGCAATATTATCAATGAATGCATGGATC
TGGAGCTCTGTATTCCATACCAGGTGCGCCATTTGCTCAATCAATTCAAGGCTTGGGCAT
GCTGCAACAACAATATAGGATATCTTGCTCACCACCATTCCTTCTTTATTTTGTAGGGAT
ATTGACTTGACTGAGAAATTGGATTACTCTTCAGCTGTGGCCGTACTTGGCTACTCTTTA
ATCCTTACATTGCTAAGAATTTTTAATGTCAAGGATGCGGCTGCCAGGGTGATGTTTGCT
GCACCTATTCTAGCATTCGTCACAACACACATCTTGTATCTTAACTTCTATGAGCTTGAC
TACGGTAAAGTTCCTTTTGCTTCTCCTAGAGTAAATTTTTTTTTACCTTGCATACACTTG
CACAAACAGATTAATTCATGTGCATCTGCTGTCTTTATATGCCTGCCTTTTTCTACAGGA
TGGAACATGAAAGTTTGTGTGGCGATGGGTGTGGTTCAAATTGTCGCATGGGCAACCTGG
GCTGGCGTGACCCGTCATCCGTCACGATTCAAGCTTTGGGTCGTTGTGTTTGGAGGAGCT
CTAGCTATGCTTCTTGAAGTGTTTGACTTTCCTCCGTACAAGGGGTATGCCGACGCGCAC
TCGTTGTGGCACGCGAGCACGGTTCCCCTCACCTACCTTTGGTGGAGCTTCATTAAAGAT
GATGCAGAATTCCGCACCTCCACACTCACACTTGTTAAGAAGGCCAGGTAAACTAAAAGG
CCATTATGTTGTTCGGTCCTCTAAAGGTAACACAAGCAAAAGCTCGGGTATTCCCTGGAA
CCGCAAATCGTTCGTCTTTGAGCGTCACGGTTTTGGTCTGCAAACTCAGCATCTTGTTTC
TGCGGTTCTTGCCCTCCTCCCGACTTGTGTTTTGATTGATGTATGTATGAAGAATTGTTT
TGTAGTAGAAAAAGAGACATTTATCTTTTTTCCATGCCTGTTGAAACGGTCAGCTCATGA
GTTTCGGTATAAGCTTGTATGAACCTAGCATTGCAGAAGGAGCAATCAAAGACGGAATAT
TTGTGGGGGATACGTGGTTGTTTCTTCACAGGCCTGCTTGTTTCTTTGACACTTTTATAG
TATCTGATCTGACAAACAAAACGGCAAGAAGGTACAATTTGAGTCTCCCAAACCTTTGAA
AATTCGTGCGATTCCAGCTATATATGCAAGCCAAGAACAAAATACTTAAAACATATTATT
CAAACTGGCATGCGGTCATGTAGCAAGTACTTACTGCCTAGGGTTCCGATTTACAGATCA
TTTTCCATCATTCACATGTTGACAAAATTGCAATTTACTTTCCCGTGTGAACCGCCACCG
CACATAATTGTTTTCGTTTTAACCACGAAACTAGCATTAGGGAATGGACCGAAACAGTGA
CAGAGCTGAGTCCCCAACTAGTCGCACCACCAAACCATAGTATTATCGCCATTTGCTGTC
TAACAAATAGGGGCGTAGTCTTTTTTTTTTTTTGATGGGATTAACCTTAGTCTTCTCTAG
CCTATAGTCTAGTAACTAAAAAAGAAGGTGAGGCTTATGTTTTTCCCCCTGAAAAGTCCC
CTTGATGTGACCATTCTCCTTCCCTAGGGCCGCGACCTAGAAAGAAGCAGACAACGTACA
GCAAAGGAGGGGAGGCGGCGGTTCCCTTTAATTAATCGAAACTGCACTATATATCTATAC
ATTTAGTGTTAAAAACACTTATATATTATGAAGTGGAGGGAGTACATTGCAACTAGAATG
AGATTGATCATCGGTCGAGGACGAGGATTGAGGATCGTACCATGGACCTGACGGGCATTG
ATATGTATCTTTTTCTCTTTAATAATTTATATCATAGTATATATCATCTGTTTGCAATCG
CATCACAGAACAAGGCTAAAACTCAAGATGGATCACAACAAATCTTACACTTAGTTAATT
ATGTTCAGAGCCAAACACAATTGGCAAAAGAAAGAAGGTGGAAAAATTGATCTCAACGAA
CAATAATTAATAAGGGAAAACAATTGTTGGCATAGATAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAA
AGGTTTGGATGGGGCGGCGTGACACGTAGTAACAGAGGTCGGTCAGCGCGCCTTATTTAT
TACATTACAGTAGAAGCGATGGAGTGAAACCGTTTCATGATGCATCGATCGATTCGATCG
CCGGACGACTGTGTCAGCTCAGTCGGAGGTGGTGGGCTCCGGTGCGTCCGCCGCGGAGGG
CTCGTCGGCTGGGGAGTCGGCGGCGGGCGCGTCGGCGGGCGAATCGGCGGAGGGCGCGGG
CGCCTCGGCCTTCTTCTCGGCCTTCTTCTCCTTCTTGGCCGCCTCGGCGAACGGGGCCAC
CGCGACGGCGACGAGGAGGAGGGCGACGATGAAGAGAGCGCGGGCCATTTTTGCTTGCTT
GCTTGGATTGGATTGGATGGGTCTCTCTAGACTCTTACTATGTAGTAGAGCGAGGTTGGC
GATGGATGCACTCGTCTCGATCGTATGTAGTTGGCTTGTGTGTCTAGGAGTGCTTCGCCG
TGGTGTTTATATGCAGGGGACGCCGGCTATTCTTAGCATCTACTAGCATGACATGCGGCA
TGGATGTTGAACTTGAATGGGTTGCCGGGTCGGAGGGTGCGCAGGTGCCGGGAGCATGAC
ATGCGGCATGGATGATGAATGGCTTGCCGGGGTCCCAAACGATTTTGACCACTAGGAGTA
GTAGTATATCTTTGTATTTTGGATGTTGATGCATGCCACTCCATAATAAGGTACAGTACT
TTTCTAAACTATCTGTTTTTCACGTCACGTGTCCATAATTAATCTTGAGTCTGTTTCTAT
CCCCAACCTGCTAACGTACGTAACATGCTTAATTATCATCCTATACCCCGTTTCTCTCAA
CTGCATGCTAGCTCTCCCTCCTTCCTCTAGCGCGCTTGCACACCGTTCCAACTCGTCGAC
GCCTTATCTCCCCCTTCCTCCATTCTTCTTCTTTCACGGTTGCCTTGCGGCCGACTGCTT
CCTGCTCACCACAATCCCATGACTCCATCCTAATTGGATGCAGGATGCTGCTACTCGCGT
CCATCATCATCACTCGCATCGCATGCTTGTGTTAATTAGCATAATTTTGTTAGGATTAAC
ATGATCACTTATGCATGCATGATCTTAGTCTCACCATTACAACACCTCTTTATGTAGAAA
ATTGATGACTAACCATGATTGCCAGCGACCATCAGGGGCTCCATGCACTTGTCGTGAGCC
TCCAGGGTTGTGGAGCTTGCCGGGGAACAAGCAACGGCAGGGAGATCGACGTGAAGGGTG
CATGACATTGCCGACAATACCCTCCATCGTGGTGGTCGGTGGTGGTAGTCGGTCTTTGGA
TGCCTTTAGTGCCTCCTTAGGATCGCTAGTCAGGATTAGGAGCCCAAGTCATGTGCTGTT
ATCTCTTTCTAACAACCCCAAATCCCCTTATTATTTTTCTGGCGCCTAGGAACTAGGATT
TGTCGTGGGAACGATTCTGACAGCAAGAGAGGGGTAGGAAGGTGGAGCATGGTCTAGCTA
CAACCAAGGTGTGACACAAGGTATTTTACGAGTCCAGGCCCCTCTCAGAAGAGGTAAAGA
CCCTACGACTCGAGCTACTAGAGTTGTTTCTCTTATGTATGGATGATTACAAGGGATCCC
GAACTCTCGTCCTTGAGCTATCACTAGCAGAAAATGACCCATTTGTTCCGGTTCCAGAGG
CCCAGGGGCTAAAGGGTCGGGACTAAAGCC