Map Locations of contig_49735 (7650 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_49735

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_65087 5 2175 bp MLOC_65087.2 Available Available LOC_Os02g11840.2, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13102.m01284 protein coatomer subunit beta-2, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_65087






Contig Sequence (7650 bp)

>contig_49735 7650 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGACTTGGTTTCGAGATCTTATGGGTTTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TTATATCCCTTAAACCAAACAAACATGAGATAACACCACCCTTTCAACCAAACAAAAAAA
TGACTACCCCTAACCAGGTGGTTGGGGATGCCCTCAACCATCCTAGCATGTCTCTGCAAC
CGAACGCACCCTTAGAGCCTTTACAGCTGCGGTGGGTAAATCCGGACCCTCAAACTCGTG
TGGATGTGCCTTATACCTGTGTTCCTTATATTTGAAACCTTAAAGACGATGCAACGCTAT
CTAAAAGCCGATCAATCACATGTAGTTCATTGGGTTAACATTTCATCGTTGGACAAAAGA
TGCATTGTTCATTGTAGTTCAACGATGTGAAATCCATACTATAAGCTACTTAAAACATAG
GTAAATTATAAACAAAACAACGAAGGATGGAGAAAATCATCATTTTCTTGCTGGGCCGTT
CCCCTCTTTCGGTTGTCAATGCGGCTATGCTCCTCCATAGTTAAAATATAAACACAACAA
CAATGGATGGAGAAAATCATCATTTTCTTGTCGGCCCCTTCCCCTTTCGGTCATCTATGC
TGTTAGAGCATATATCTCCATNNGTGGTTTTGGTAATTGATGACAATTGCTATGGACTAA
TGGTTGCCTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTTCTTGAAGTCCATCTGT
TGGGTTGATGGAGTTTATATGATGACCAAG