Map Locations of contig_49690 (10406 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_49690

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_65057 19 4324 bp MLOC_65057.18 Available Available LOC_Os12g27520.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13112.m02797 protein serine/threonine-protein kinase AFC2, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_65057






Contig Sequence (10406 bp)

>contig_49690 10406 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GCCTTGTATATATGCAAATTGTAATTAATGTCCTCCTTTGCTAGTACTACGAGGCAAACA
CCATTAATATTGCATCGANTAGTGTTAGTGGCCTTGTATATATGCAAATTGTAATTTTGA
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GTTTGATCTACCAAACCGAGACGGACACCGATCCATCTGACATCTGGGCCAAACCTGGAT
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TTTTCTGCGGAAAAACAGTTACCGCTCATTCCCAGTTGCCATAGTTCGGGAGGTTGCCAA
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AGTATGCTATTTTAGATCATTATTCCATTATTTTAGGGTGTCATCTGTTGATGACTGTTG
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TGGGGCTTACTCTCATCTGCTATCAAAATCACAAGGACAGAGTTTTTGAGTTACCAGAGG
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CGGCATAAACTGTATATAATGAAAAAAATGTAAAGATCTGGTTAAGTCCAATGACACTGT
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TGCTAAAGCCAAGTGAAGCAAATAATGCACCCTTGTAACCTTTGGTTATGGCTAAGAGTC
ACGTGACCTATGTATGCCTCGGATCTCTTGTTGTATTGCAATGGCTTTAACAGCCGTGTC
GAAGTCGGCATGCTTTTGCTGTCAACAAATTCAACATGGACAATCATATGGAAACGCGTT
GAACTTTTTTGGCTGCAGTCCGTTGCACAATAAAATTAGCAACATTTTCGTTTTGTTTTT
GGCAATAAAATTTGCAACAGCTAGACGAAGACTGTGCAAGCTAATTACCGCTGTAGACAA
GAAGAAGGCTGAGTAGACAAGGACGAGGCAAATTCCGTTCGTGCTTGATCAATGGTTGCG
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