Map Locations of contig_49586 (10352 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_49586

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_64975 3 6584 bp MLOC_64975.2 Available Available LOC_Os01g48370.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13101.m05016 protein OsFBT1 - F-box and tubby domain containing protein, expressed
MLOC_64976 1 427 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_64975






CDS Structure of MLOC_64976






Contig Sequence (10352 bp)

>contig_49586 10352 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTTTTTTTTTTAATATATATATATATATATATATATATATATATATATTGATTTGTATTT
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CAAAGCTCCCCGCTGGCACGAGCACTTGCAGTGCTGGTGCCTAAACTTCCATGGGCGGGT
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GCCGCCTCCTGCCGGCCACCGGTCAGGACGGTGTTGGCGCCGGCGCCGGCGAGGCCCGCC
CCGTTCGCTCCGGGCTTCGACGTCGACGACCCATTGTTTCTCCTCCCGAGCATGGCTATA
GCATGTGGCTATACAGTATACTCCTCTTTGATCGCACGGACCGGCCGGCTGGCCTTTTAT
TGGCGCGGGGAGACTTGGGGGAGGGGCTGCCTGCCTTGGCGGAGAGGTCACCGCGACGAT
GATATGATACATGGAGCTGGGGCTGGGTTCCTCGTTCTTGGTCAAATATGCTGCTGTGCT
GGGTCAAGAGTCCCACCCGGCGACTTGGACGCTCGGACCCGCCCCGGCCGACCCCCGTGC
ACATGAATCTGGCTGACCGGCGGGAAAGATCAAAGATCTCCTTCAGCGGCGTAGTACATA
CCCACATCGATCTCCGGCCTGGTTCTCTGTACACCACCGCACGGAACGGCAGCAGCAATC
GAGCCTGGAGCTCCGTTTCTGCAATCTGAGATTGATCAGCCGGGTTAATTGTTATGTCCT
GTGGCGTCGATCGTGCCGGATCAATCAGCTGGACGGGCGTTATTCGGGGATCTGGGAACC
GGACTGGATGGCGATGTGATTTTTTCTTTAGTTGCCAAGGTGCTAGTACCCGCCCGGAGT
CTCGTTGCGTCACTGCATGCGCACGGGGCATGGGTAAGGATGACAATGGATAGGGTATGG
GTAGGATAAATTTACAAATAAATTACATTCGGAATACAAATATTACATTTATATTGAATC
ACTACATAAAATTTTACAAAAGAAAAACAAAAATATAGGTCACAAGACTAGTAAAAATTG
AATTTATTGTACTTTTTGCACTATTTTTGTAT