Map Locations of contig_49509 (7130 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_49509

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_64920 3 1350 bp MLOC_64920.3 Available Available LOC_Os03g17470.1, FRAME:-1, EVALUE:2e-146, 13103.m02084 protein IN2-1 protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_64920






Contig Sequence (7130 bp)

>contig_49509 7130 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CAAGGGCATGCAATGATATGCTAAGCATGCATGCATGAGAAGGAAGTAGTAGGAAACACA
CATGAAATCATGGTACCAAATATAACATCATAATCTCTGACAAGGTGGACTCACTGCAAT
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TAGTCACGTAAGGTTGATATCCACACCGTTTGTGGTTAAAAATCATTTGTATAGCTCCTC
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TACTTAACCTTCCAAACTAACTCTTCTCTCCCCCCCTGATTTTCAGTGAGGGTGGAGTCC
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AAGCCTTTATAGGTGTAGCATTACTCTTTCTATATTCTTGTGTTTTTTCTCGTTTGAAAC
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TCATGTCGTCTTCTTCCTCTGTTTATCCACCCTGCTTAATGATGTCTGCCCAACGTCAAG
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CCCTTCATTATTTTGTGAAGTTAAAAAAATTATATGTACCAAAAAACGAAGTAGTGGTAA
TTGGGCATGTTTCAGTAAAACTTGTCTGATAACCCTTAATATTCTTTGAAAATAGGTTAC
AGCAGTAAATAGTTGAGGCCAAAGGATGATCTCGTTTTTAAAGCTGAAATGAAGCGTCTG
GTCTTATTGCTTGGCACCTTTCTAAACAAAACTATGCTTGTGTGCATCAGAAGATGTAGA
GACCCAGAGACTAACCCGTTCAAAAAATAAGCATTCAACAAGTACACAACACAAGATGAT
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TTTTATTCATAGTATGGTATATACTACAGTAGCAAGCAAGAACGCTCCTGATTGTCTAGT
CTCCATCTTCCATGCTGCAGTAGTTCCCTGGCCTCTGTTCATGCTTGGTCATATCTTCAC
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GTCCAGCTTCGTTTGTGTGTATGCATCGATCTTGTTCACTTCCTGTAACATATCGATTAA
ATTGCCTCTCGACCGCAAAAGAATTGCAAAGGAAATTGATTTGCATTAGACTAACATTTG
CCGATAAATGAGAATATACTTTAAACATAACAATACAATGTGGCATAGTCAAACCCGGAT
CATTCAGACTTACCTCGATGAATTTCTGAATGTTAGGTCTGTCCTTGGTGATATCATAGT
TTTTTATACCAGAAAAGAATATCTGAAACCTTTCGATAAATGGCACATATGCAATGTCCA
CCTGTGCAGAAATTAACATTGCAACAAGTCAAACATGTTAACACAATTCTTCTGAAATGG
AATTTTAAGGATTCCCGGATCGGCATGACATACCAAACTGAACTGGCCAAGGAAGAAAGG
GCCATCACTAAACTTTCCCAGGGCGGCTTCTATTTTATCCAGCGCAGCAACTAATGGAAG
GTAATGCATAAGAAGTTACAATTCTGAATACAGACTGCAGCCTATAGATTAAACAAGTTT
CAGGTATGGCTCTGTTGTTTTACCAGTTTCCTCTGCAACATCTCCCTTGGAGGTTATGGA
TGAGTATAGTGCTTTATTGAACTCATCGGTATACACAAGCAGCTCCTCGGAAAACTGCTT
CTTTGCAGAATCCTGCAGAGTTATGAATGGAAGCATTAAAGCCCCTGCGAAATTGCTTTA
CCCAGTTACCATGAATTATGATCATGATGGTTCAAAATATTTACATCAGGAAGCAATGCA
GGGCCATCGAAATTGCTGTCAATGTACTTGACCAAATCCAAGCTCTCTCCTTTCACTTGG
TTATTATGCTCCAGTGAAGGCACCTGTCCAAAAATAAGTTCAACGTGAGTGTGGATGGAG
ATCACAGAGATGATAAACTGAAACGGTGTTAAGATATCGTACACGTGGGGCAGAGTTGAG
ATGCTCCATACCTTGTTCTGTGGGTAAACCTTCTCCTTGTACCAGGCGGGCCTGTCTGCA
AGATCGACTGCGACTATCTTGATCTTGTCTTGCAAACCCTGGACAAGAAAAACAATTAGA
TTTCATTCAGGTGTAAGAATGATTCAGTGTTGTTTGCACAGCAGCAGCAAAAGTACGGTT
TCTGTTCAAATTACATAAGCAAATCAAAGAACAACAGTTACCTTGTAATTCCTGGCAATC
CAAGCGCGCTGCGCGTACGGGCAGTGATATGCAACATACAACCTTCACGAGACATGGAAA
AAAGCTTCAACAGGTTAACCCTTGATTTATGCAAAAGGGACAAGCCACAGGGTAGTAGTA
GTATACTATCTGCAATGCAATTTGATCTCTCGTATGCCTTGTCCAAATTCACCTGGTCGT
GCCGTCGAAGAGTGGCGGGGGCTCGGAGGTGGAGGTCAGCGAAGGGGGCAGATTTTCTTT
CGGGGAGCTTCGCACGTTGGATAGAGAAACGAACACCAAGTTAAAAACACAAGGGAGAAA
CGATTCGAATAATTTAATAGAGACTCAAACGCAGTAGATTCTGCGCCGCGACTCGGCCTG
CTCTGCTCACATGACCGGTGCGGCAGCGGCTGCGGCGGCCATGGCGACGGTCCGGGGGGA
GCTCGAATTCCTGGCGGCGATGAGGTGGCGATGGGGAGCAGCTCGTCGCGAGCGGCGGAT
CTTTATACACGGCGACGGGACGGGAGGGGAATTGGAGGCGGGCGTCAGTGGTGACGAGCG
GCAGGGGAAAGCGAGCGAACTCATTGGTGCGGCAGTAAATGTGGATTCGACACGTCGATT
CGGGTGATGCTCCATGGATGGGGTCGGCCGGCCGGCCGGCCTCACCTGGACGCGAACACG
GTGTAGGTGCCGTGGGGTTGCTCTTCCGGTACGTTCTGGAACGATGCCGTCGTGCCGATC
GTTGGCCTTTGTAATAGACACATTTTGCAACAACTACTTCCTTCGGTTCCTAAATATAAG
TCTTTAAAGAGATTTTACTAAAGCCTCGTTTGGTTAAAGGGGGATTGAGGAGGTTTTGAA
AGGGAGGGATTTCAGTGGATTGGGTGAATCCCTTTGTTTCACCCAATCCTCTCAAATTCC
CGGGGTTTTGCTTCCACTAGTCCTCCGAAGAGGGTTTTAAAACACATGGA