Map Locations of contig_49461 (12863 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_49461

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_64888 1 739 bp MLOC_64888.1 Available Available LOC_Os04g54240.1, FRAME:-1, EVALUE:1e-43, 13104.m05607 protein wound induced protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_64888






Contig Sequence (12863 bp)

>contig_49461 12863 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGGGGGGGGGGAGGGGGTGGCCGCCCCAGGCCCCCAAAACGAATGGGGGCCCAGCCTAG
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GCTAAGGCTACCACATAGGGGAGAAATCTGATGTGGCAAGATTAATAGGAGAGAGATGAA
TGTGGTGATCCCAAGAAGAAACAATGCTAAGTGTGTGAACCTAGGTAAAATAATTAAATA
AAAGAAATGCATCAATGCATGCACAACTTTAGTTGAAAAACATTAAATAAGGAGGCTTAG
CTACAATAAGCTAAACAACTATGCATCGGGTACTTTAGTTGCTAAACTATTTAATATACT
TAGCACCTTACCTTAGCACCAATGCATTGGAAGCGACCTTAGAGCGCTAATAAATCTGAC
TCCGTCTCCACTCCCCAGGAAGAAGAAGGACGAATTGTTTTTCCTCTAGCGACAGGAAGC
CGAGCGGGTTTTTAATGAAATGGGTTAAGCAGGAATTGAAGTCGTCCACTCCTCAACAAA
AAAAGGAATTGAAATCTCCCACCCCTCAATAAAAAAAGGAATTGAAGTGTCATTCCCTAA
AAAAGGAATTGAAGTCTCCCTCAACACTATACGTGTGTCAACCATCACTCCAGAAAAGAA
AAAACATGCGTGCGGTCGCTTGCAGCGGCACGTTGGGTCCAACACAAGTTTTGTTACACA
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TTTAGATTATCTTAATTATATATATTATGTCAAAGATTTTCCTATTCATGTTACTGGTTT
TGTTATGAAAAAGATCAGGTTCATTCTCATCACCCCGTACAAGCACGGATTACCTCGTTG
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AAAACTTATATTATTTTTCCAACTATGTTTGGCACATTTAAGTAAGTTCAGTTCCATCCA
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AGTACAAATTTATGGAGGACAATTTGTTTATTTTAGTTGTGAGTATTATTTATCTTATAT
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TTACTAGTAGAATGCACGTGCGTTGCCACGGGCAAAATATAGGAAAATATATCAGACTGA
TGACTAATTTACATCACTGAAGTCCTCCAAATAAATATTGATATTTATCAATTTCTTTAG
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CGTGCGTCATCTTGACCGAGCCACCTTCTTCGTAGGTCCACCGTTGCCCCTAAACATCCT
TCTATCCCCTCCCCTCTTCTAAATTCCATGCTTGTTGTCGTCTCCCTCCTCCTACACCCC
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GCCGCCTTCTTCGATGGTCAAATGTTGCTCCCGGCCATACCCCTAACGCCCCCTCTACGA
TGCCGATTAGCACCTACACCGCATGAGCACAATGATAGTAAGACAATAAAATACAATAAA
CTTCATCGGATGGTCTATAACTTTATCTTTGCACATCACGTTTGTCATAATTAGTTGATC
CTTAGCATGACCTATACAAACATGAAAAGTATGACTGATGGTCTCTCCACAACCTTTTGG
GCCAAAAGAACGAGACAATAAAGAAGCAAGCTGCTGCAAGTAATTAGTGGAATGAATTTA
GCTCTCGTGTCATCACCTTCATCTGACTAATTCTGTAGAAGAATGACCACTGCCTCACAT
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TGAAATTACATGCATCTTCACTGCCCATGCTAAACTTTATGTGCACACGACGTGTTTTAG
TCATCTATATTGAATAGTATATGCATCAGTTCATGGAAGCATGAACTGATGATGCCCAAC
GGGGGGGGGGGGGGGGGGTCTTCTTTAGAAGATGATTGTGGACATGTTTATTTTTCTTGC
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GGAAATGGCAAGAACTTTAGTCGAGCGCAAAGTATTTTTGAAATTGCAGTGTGCATTGAA
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ACACCTTGTTTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCCCCTCTTACCTTTTGGCGCCAACAACATTT
CTGTTTCCCGCCTAAAACAGCTCCCCTGCCTGCCTGGCAAGCTAAGGCGTCCAAAATGGA
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GCATTCATCTCATTTTTTTGTCGCCGTGAACTCTTTGGATAAACACTTCAATGAAAAAGC
AGTGTAGAAAAAAATGTCACAACGAGATGAAAGGAGTAGTAGCAAAAAGTACTCCAAAGT
GTTATTATTAAGGGAAAAAGAACAAGTTCTACCAATTGTAATCCACTATACCAAACGACT
GTCAACATGGCACAGGTGAATTAAAAAATTAATAAGCAAACTGGAAAATTTCAAAGATAT
ATTCGGAGTTAACGGTGTCATAGCTTGCACTTGAGACATGTAAGAACTTCGGTAGTTGCA
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TAACCATAAAAAGCTTCACAATTAAAAGTTTAACATATGCTAGGAAAAACATACCTATTC
AAAGTGTTCACTGGAGAATATGCAAATGATCTCCGATATAAAGAAGCAGATGAAGCAGCA
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GTATCAGCACCTGCATCCATTGTGGTCACATTGAATTAGGATTGGCGTAGAAAACTGGTT
GCATAATGTACTACTGAGCACTGACTAATAAAATGGGTTAAATGGGAAAGTGCAAAACTA
AAAACTTAGACCAATGAAGAGAAGCTTACGAGGCTGAACTCCAGGTTGAGCTCCATGTTG
TCATGTTGATGGTACATGTCCATTGTCTGGGGGTTAATTGGAGCTCTACAAGTATGTTGG
CGCTCTATCCATGACCTCAAGCCATGTATGAGGAACAAGTGCGCACAAAGCAGCTTCTTT
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TTCTAAATCATAAACAAGTTCGATTGCTGAATCGGTCAATCAACCAAAACAGTACCAATG
AAAATAAATGTAATAATCACGCGTCGAGGTCATCTGATGTACAGCATCTGGAAAGCGCTC
ATTCATGTTTGAAGTTATCTTTCTATAGCATACTGTGAAAACGTGAATTCTGAAATTGGG
GAAGGTCTCATACAACTCACGAATCAAGTGCAATGGGACACCATAGTTTCTGAGATATCA
AAATAACATATCAGCCTTAGAAATTCTAAAGGGGAAAGATTTTTTGAAAGAACTTACAGG
AAGATCGCTATGAAAAGAGCATAATACGAGTACAGATTGGTGATTGCAACATGTTCCATC
ACGAAGCAAACTTAAAATTAATCTTGGCATAGGTCAGGAACAAGTAGTCAATTACATGGT
CACGAGCTTGAATCAGGTCATCTTCGTTCCAAGAAGTTGTGGTCCTCCGATTTTTGTTGT
TGCAAATTGCGCTAATCACATGTCCGATCAAAAGGCCCTAGAGCTGGAACCGGATGGTGT
TCGATAACATCCGGACCTCGAATCTTGACTTGCGGCATTCGATCCAGGAGTACCTCCGAT
TGTGGGTGGTCCGGGCCCTTCCCGCACAGAATGTGCTCCGTTGCTGCTGTGGTGTGAAGC
TATAACTGATACCCCCCTCTCCTCTCTCTCTCTTTCTGGGCTCTGCAGAGCTATGTAATA
ACCGACCCTGCTGTCCATTATTATTAATTATACAAAAATGAGTGCACGTGGGCAATCACC
ACCTGTTGACTGCTAAAAAAAGGCCCTAAAAAAATCCCAAACAGTATCAATAGATTGATG
TACAGACATGAACATAATTGAAGGGGCAGGGGGACGAACCAGCGGTAGTCTTCTCTTTGT
GATCATCTGCGTTGGCACCTTCTTGACCCCGTCTTCCGTGAGCATCCAATCAATGTTCAT
GTTCAACCTATTAATGTGACACACCCAAAGAAAAAACTTCATCAGTACGTTAGATTGACT
TAAACTAAACATAGCTTAGTCCAATAATATGCATAGCTACGGCCTACGAGTCAAAGATAT
GGTCAGTAATCTCTGCCTAAACCTCTCTGAGCCGATCCTTGTTAATGCCTTCCTCCAGCT
CAATGTTCCTGTGCCTCCACATGTCCTGAACAGCTTGTTAGCAAACTCCTTGGGGTTCTC
CATAACTTGGATTGATAAGCATGTCCATTAGTCCACCCTCCAACATATTATAACTTTGTC
ATACAGTCGATCAACCGTTTAGTATGCACTGTTTCAGCTGCCACCGCTGCAGTGGTGAAC
TCGATCTGTAGGACATTTGTCAGATCTGTTTGGCTCACTGTTGTGTTATGTTCAAAGAAA
TAACAAAAAACATATTGGGTATTCTTGAGATTTTTATCTTGAAAGTTTAACAATTAAATG
GCACCGCAAAAGTAAATAAAAAGTCTGACACATTTGCACAATTTTTGTATCATGAAACCT
GTAAAAACTCAGTTAGTGGACAAGCATACAAACTGAAAATCCTACTGTTTTATGTAATCT
TCCCATTCCATTCGTCAAGGTGATAGAAGCAACCATTCTAATAAATGGAATCAAAACTTG
GAGACTCCCAAATAAGAAAAGCACAAGCATCGAACAAAATGAGATGAAACATACATAGCA
TAATTTGATCTGCCCAATTCACCCAAAGTAATCGGCCGGTGATATAATCAGTTGTATCAA
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CATGGGGTGGCATGATTGGTATTGAATGGCTAGATGAACATGCAAACCTCACCGGGGTCA
TGCCCCTCTCGAACCTTGATGATGGCGATGGAGAACCTCGGCATCAGTGTCTCGACGGCG
ACCTGGAGGCCCGCAATGAACTCGACGGCGAATCCTCTATGAACTCGACGGCAAATCCTC
TAGGAACTCGACGGCAGATCTCTCTTCTACCTCTACGGTGGCTCCTCTAGCCCTCGTTGC
CGCCAAGGAGATCAACGATGGCGGCGTGCGAGTAGTTTCCGTCGTCGTGCCAATCGATTG
GCGGCGTAAGGACCTGCGATGGCGGCAGGGGCTAGGTCTTGTCATTGCTGGATGCGATCG
AGGGATGCCTCGTTCGCTCCCTGGTTCGTGGGAGACAGCCTCGCTACCGGTTCGTTGTTT
TTTTTCTCGTGCGGGGGGCGTTGTTACCTGTTCGTTGGTTTTTTTCTCATGAGCCGGGCA
TCGGGTTTTTTTGGTAGCCATGGTTGATCGTACGTGAGCGAGGAGGTGGGAGGAGTGACT
AAAAAAACCCACACCAAGGTGGGAAGATGGACGAAAAAAGACCGGTGAGCGTCGGCTACT
AACTGCCTCTTTAGGAGTAGAGATTCGTTTCTTTTCTCTTTTGGTTTCATGGCCCTAGGG
CAAAATCCAAATTATCGGTCTTTCACTGGGACCTTGAAATATATGGAGTGACTTTGATGT
GCCTCACTCTATGATGGCACCGGTTTCCACTGAATGGTGTTTTTCATATGATATTTTCAA
TGATAGTTGTGACCAGAAAGCACGTTTACTTATTAATGTGGACATGTTGTCTAATCTGGA
GTTGTACCATGTTTAGTTGAATTACGATTATGTCAGTTTAGCAAATATACACCAAAGAAA
TTCAAAATATATTCGTTCAACCTCGTTGCATATCAGGTCGGCTGGAGCCATATAAAGTAC
TTTCTTTAACCAATGCGCAAAAAAGAAGAAGAAGACACAAAGTACTTTCAACCAATTCGA
AGTACTTCTCGTTTGATCTTGTTTTGGACTAACTAAGATTTCAGGAATTTTGAAATTGGA
TAAGTATCATAAATATTCAGGAAATCGTGTAATCTTATATTTTGTCCCTCAAAAAATATA
ATCTTATATTTTGACCCTCAAAAAAATATAATATGATATTGTCCCCCTCAAAATATGTAA
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CTTAGTAAATGTTCACAAAATTGTTCATTTTGACCAATTTTTTTTCTATAGCTCTTCACT
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GCTTCTAGAACCACTCTGCTACTACTACTCTGCTTGTTCACCCCGTACCTGTTGTCGTCA
TGTCGTTTTGTTTGTTCGCCATGGAATTGGTGGTTTTGACCTTTGGGAGAGTATGGATAC
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TAGCTCGATAGTTCATTTTTTTTCTTCAGAAAAAAGCTTTATTAAACTTTTAGACCGATA
AGTGTGCTTAAACGGGACCTGGTTTCGGAATCACACATAGATAAAGATAACATAAATAAA
ATAGGGAAATGAAAATAGTTTTTAGGAAAAAACATAAAAATCAGGTAAGATTTCAGGAAA
TTTGAAAATGGATAAGTAACATAAATATTCAGGAAATCATGAAATCTGATATTATGCCCC
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ATTTATTTTTCCTAAATGTTAATTCTTCACACTTAAAATTGACTTAGTAAATGTTCACAA
ATTCGTTCATTTTGACCATTTTTTTCCTGTAGCTCTTCACTTCCAAGTTATTTTGTATAC
ACAAACAAATTCCTAAAATTAAATATATATTGTTCAGCAAATGTCTAAAATGTTTATTGT
TCTATTTTCTCATCTTTCCCATGCTTTGTCAAAAAAAAAACATTGCGGTTATTGTGCTAC
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AAATCCAGACGGTTTTTACACTTGATAGAAAAATAATTATTCGGGTTCAAGATGAGTAAC
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TAATTTCGTTATTCAAATTTATTACTTCAACTTTACGGTAAGACAACCACAAATAGATCA
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TGTACAATTTTTTTTGTGAAGCAATCAATCACCTTTCCAGTGCGGTAGCCAAATTTTCTA
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TTTTTATTCTGTTATGCTATTCAAGCTTTATAAAACCGTATAGTAATCAAACATAATATA
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GTATTTTATAGGTTTCTGCACGAACATAACTAGGGAATCTTATCACCTCACGCTCATGCT
GTGGATGGGTGACAGTGTGACCACTAATATGAGAGCTGGCAAGGGGGGAAACCAGGGGAG
CAGGACATGGTTTCCAGCGCCACATGCTTCGCTTCGGTATAGTATTCCCTCTGTAAACTA
ACGTAAAAGCGTTTAGATTATTAAAGTAGTGTTTTAAATATTTTTATATTAGTTTACTAA
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GAAGTAACACTCACGGGTATGATGGTCGGACGAACACAATAAAAATGCCGTATTGTTTTT
GTTTGCAGACAAGGTGTGCTAGCTTCGCTAAGCTACTGCATGCGCTCTCTGCTTCGTCTC
TACCGGCCGTAATAACCTTGTGGACCAGGATCAATTTTCTGGGTCTCTGCATTTGTTCTG
CCTGTCGAAGCGGCGAACAGAACGACCAACTCGAAGGAATAATCCTCCAAAAGAATCCTA
AGCACACAGACCTGTCTGAACTCTGAAGCAGGGTTATGTCTGTCAACTCAAAGTGGGGGG
AAATTTCATCATCATCATCATCATCATCATGGTGAGACATATTTACAATCAGGAGGGAAT
TAACCAGCCAAGTCACACGTACGCCACGGTTGTTGCTGGCGGCTGGAGCTAGCAGAACTG
CAGAAACACCTCTCGCTAAGCTAGCACTAGTTGGGACCCCAGCAACTGAGGTACATGACG
GTCCTCAGCCCATCCTCGGCCTTCTCCGCCCGCCGCCTCTCCGACACCGTTGCGGCAGAC
GCTGGAAGCTGCTTCGTGCTCTGCGAGACGCCACCATGGACGTTTGCTCTGGCCTTGGCG
GTCCTGTGGATGGACTTGAGCGCGTAGTTCCAGCGGCAGAGGCCGGCCTGGTCCTTGAGG
GCCTCCACCGCGCCCACGCTCATCGCCACCATCCATGACGCCTTCGCCGCCCCCGCCATG
ATCTCTTGCCCTTCTTCTTTCGCAAAAGTTGATGGAGAGACTGTCTAAAGGCCGAACTCT
GTGATGCCTGAAGATTAGGAAGCTGTGGAGTGCAGAACCTGTTGAGCAAGCGAAGAACCG
ACTGCTTGTGTCGATGAGAGGAAGAGTGGGAGCCGGATGGCGTTATATACACGGGGAGGG
CCGGGGGAAAACAGGTGGCTGGGACGTTGGTTTTCCAGCATACCGGGTGCTGTAAGGGTC
ACTTTGCTTGTGTACGCCGGAGCTCTCCCTGTCGTCCCGGTGCAGTGGTTGCCGGCCCAC
CTCATGCCGTTTTGTTCATTGGCTGCAGTTTTGTCCATTCCGAGAGTTCGGGATCGGCGC
AATCCGACAGAGAAAAGATTGGTATGACGGATAGATAACGATTGTCATGATCCGGCGAGC
GGAATCAAATTGGGTCCTGCGAGTGACAGATCTCACTTCAAAATGAAAATGGATCCAGTT
TACAAGGTAAATAAGATCGAAAATAAAATACACTGGCCAGTTTATGAGGAAAACCGGTCG
CACCTCTGTTTGTTTACAACAAATCTCTTTTTCTTTTGAAATGGCAGTTATCTTGCTTCG
TCAAGAAGAAAAGAGTTGCTCAGTTAATTAAAAAAAACCGAACGAAAACCAGATTGTTCA
GTTAATTATGAAAAAAAAGGCAAAAACCGTTACAAGCACACAAAAAGAACCCACGCACAC
CACTACAAAGACGATCTCGGCGAGACAACACGCAGGCGTCATCGTCATCACTCCTCCCCT
ACATGCGTCCTCGTCATCCCTACACTCTGAGCAAACGACTCTGACTCCGCCGTAGGCGAT
CGTCGACTCAACCCACAGTGAAGAGGACACGTGAAGCTGCATGAAGATCTATGCCAAAAT
CTCAACCACCCGCATCCAAACGAAACAACTCCGACTCTAGCGAAGAGTTCTGCAGGTCAA
AACCAGGCACGGCTGGCGCCAAGGGAGATTGCCGAACGGTCTACCTGCATCCAGTCATCG
TATACCACAGGGCACCGCCGCCGCAACTTCGGCTCCATATAGCAACAAACAAACCGAGAC
AGAACCGTGGACACGCCGAAGAAGAGCCNNCTACCGCAACCATTGCCGCGTCGCCCACAT
CACTCCCACCATCATCGTTGCCACACAAACCTGGACGCCACACCCGCCAAAAACCGCCAT
CCACCGGTCCCACTCACCGACGTCAAGCTCCCATGACGAAGCCCTCAACAGGGAATACGA
CACCAAAGTGCCGCCATCGTCCGATCATAGATCAAGGTTTCCCTCGGACAGGCCGAACTG
TCCAGATCCGTGCAAGAGGGGTGGGAGTACGAAGCAACGATGCCTCCAAGAAGATCAACG
ACGGCCACAGCCGCCGCCATCGCTGGTCAAGGCACAAGGCCAAGACATGGTTTTCACCCA
GCTCCACACTACCTCAACCGCACATCATCCCGTATTGGCATCGGCAAGCCCACCAGAAAT
CACCACCATCGAAGCTGCCCATCGACGAAGAAGCATCAGGATCCGTCATAGCCAGCCGCA
CCACGCGGAGACCACTGACAGCCGAAGACCAGATCTGCAAGACACGCCGCCGGAGCGCAC
TTCCTCGTAACCATGGGCCTCCAATCCGCGCACCCCAGAGGGGGCGGCGTCCTCCACGAT
GTGCCAGACCGCGCAGACACACACCGGTAGCGCCCCTCGCGGCCAAAGTCGTCGCTGCTT
GAGCGCCAAGCAGGCCGCTCAAGCCCCTCCACCTGCATGTCAATCAACTAATATACTTAC
ACGCTCTTATAAATTCGCAAGGATGTCATTAAACTAGGAGACGACATTACCCTGCTAATG
GTACTAAATTCCCCCTAAAAAGTAGAAAAACAAAAAGCATGTGTCTTGAACAACGACGGC
AGATTAAGTTGGCTTCTGTTGTTGGAAGAAGTCTTGATTTTGGCGTGTCATCGTACCAGC
AGATGGCTCCTGTGGGGCATTTGAGGCCGGGTGTCCTATCTTCATACCAATTTGTGGTTG
TACTAAGACATTCGGAGCTCGGTGTCCTATCATTGTACCAACGGATGGTTGAAGTGAGGC
AGTTGGAGCTTGGTGTCCGATCATCGTACCTATGGATGACTGCAGTAAGGCATTCGGAGC
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TTGATCTGAATAGGTATACACGTGATTTGTCGGAACTCCAAAATGACCCTGTGAGTAGTA
GTAGCAAAGGTCAGTGTTCATAAAGCTTTAAAGATGACAAGATTGAAATCTGAGAGTAGG
TAGCTTATACCATTAAGCTATTGTAGTGTTGCAATTCAGCTGACAATCTTTGATCTTGTC
CATACATCGCCATAGGATTCAGGATTGTGTTGTACTGTGGTAGGTATGCAGGCATTTGAT
TTGTAAAAACCTTCGAATGACCCTATAAAAATAGTGAGATATCTTGTACTATACTTTATT
TTTTGATATCAGATCAAGTGTGA