Map Locations of contig_49343 (8390 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_49343

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_64806 1 2046 bp MLOC_64806.1 Available Available LOC_Os01g70200.1, FRAME:-1, EVALUE:0.0, 13101.m07620 protein exostosin family domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_64806






Contig Sequence (8390 bp)

>contig_49343 8390 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ACAAGTGGTTCCCCGTGTGCCCCTTCATTTTAGATGGTAAAAGCATCAAGTGTTCTCGAA
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GGTCGAATTGGTGGAAGAGCCAAAGGTAGAAGTAACATCAAATCCACTCCGCAAGCCAAA
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TATTGTTACGACCGTGATCATTTTCTCGATCATGATAATTGTAGTCAAAGCTTCTCTTAT
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GGCCAGTGCCAGGACCGTCCCGCTGGACAGGAGAACCCTCCCCACCCACCGACGGCGTCG
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GACCACCAACCCTGGACCTGGACCTGGATGATGCCCGTATCTGCTTCCAACGTCAACACG
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CGGCCGGCCACACAGAACCGAGTGAGGAGGGAGACGACAGAAATAATTAGGATCTTATAC
TACCTTATTAAACACGCCAACTGTCAAGTCTCACTCTTTGGTGCGTGCGGTGCGGTTCAT
TTGCTACTGTGTCGAGGTCTTCTGTTCCTCTGTGGCAAAGGACTTTCTCGATCCTTAATA
ATGTTGGCGATTTGGGCTGTTCCCTTGCACATCACATGGGATGAAACGGAGCTCGCTATC
ATGGCTCATGAGTCATTGTCCATTTTGAGGTCTTGATAATTGCGGCCAAAGCTTGTTATG
CTCGGTGGCTTCCTTCTTTATCTACGCCAAAACCGGAAGAGTTCGAGAAGAGCATAAAGC
ATTAGTTGTAGTATGTGTCTACTTGATCATGAGGGTCCAGGGGTTTGGTGATCAATCAAG
AGGGGACCCTGATGGACCAGCAGAATATAGAAACTGTGCACTTCCCAACCATCGGCGCGG
CAATGTGAGCGTGTGAGCCCCTCATTTTAGGCGAAAAAAATGTGGGCTTTTAGTTTCTTT
TCGTTTCGTTTGGTCATGCATTATTGTACGTACTTATTTGGAAAAAGGAATTGCGTGCTT
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TCTGCTGGAGATGATGAGACGACCCAGCTGGTTACAATATACTCCTTTCGTTCAGAATTC
CTTCGACAAGTATCTCGGGACGGAGGGGATATGTTCCTTATGGATGTCAACACGGGACAC
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CCCGGTTCTATTAAATTTTTACGATTTTTAAATCTTTGAATTATTTGATAATTTAATCTT
TAATCACCCCTACTCACCACTTCAGCGTGGAGCACTCATTTCAAATCGTCTAACTTCTCG
GCCAGTCACTCACTCCACTCATTTCAAATTATCTAACTTCCCGGTCGGTCACCCATCCTC
TCCCTAATCCAGCCCAAGCATGCTTAACTTTTCGGTTTTATCTCCACTAGTTTCCAAGTC
TGCACTTGTTGTTTTCTTGACAATAATAAGCTATCAGTCCTATTAACCCTTAGGTCTTGA
TGTCACATGAATTTTTTTTTAATTCTAACAATTATTAAAATAAACAACAATGATTAATAA
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