Map Locations of contig_49286 (6924 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_49286

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_64761 1 1313 bp AK358435 Available Available None





CDS Structure of MLOC_64761






Contig Sequence (6924 bp)

>contig_49286 6924 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GCGCCCCAGTGCGGTGCCCTCGCCCCCCCCCCCCCCGCCCACCCCCCCCCCCCCCCCGCA
CTACTACCTCAACGTAGTCCAAGTGCAAAGCTGAGGCGCATGCGCGCTGGCGGGGCTGGC
GCAACACGCAGCAAAAGGCAGCATTAGCCAAGTCCCAGGTACTTGTGGAGGCTTGGGCAA
TTGCCCAGTCCAAGACTATCATCTAGTCGGACGCCTGCAACCAGCGACGACTCAACACCC
AGCTCCTCCAAGTGGGGTTGACGAAGTTCGGGCGCGCCATGTTCATCTAAGCTGCTGACA
CGGCCTTAGACAAGCGGTGCAGGATACTGCCAAGCATCTGCGTTGTGAGCGTGCGGCGGT
GGCTAGGCAGGGGTGCTGCAACGACAACGGGGACAAGGACATCGGGTCGGAAAACGGCAG
AGGTGACGGTGGCCCTCGGAGGCCATTCCTATGAGGTCACCCCCTCAGGTACCTGGCCTA
GTTCAGTTAGTTTTCAGTTCAAGTTTAGTTTGAACTTATTAAATTTCATCCATTTGGTCC
TAAAAATATATCAAACTTTGTTAAATTTCATCCGTTTAGCTTAGCTTAAATTCCGTTTGT
GTTTGTGCTCGATCCGTTTGTGTTAGCTTCAATGAGATAGATGCAGGGAGAGAGGTGGTG
GAGGCAGCGCCACCGGAACGAACAGGAGCATGGTGGATAGAGGAGTTAAGGGGTTGTGCC
ATGCTTCTCCACGTCCATGGTCGGATTCTCCGTGTCCACCGACGGCGGGCAGCGTCACTG
CATACATGGCCACGTTCTTTGCATCGCTGTGGCCTAGCATCACCACATACGCGTCCGGCT
TCCCCGCGTCCAACGTAGGCGTCATCGCGTCTGTGTTCGCCAATGATGGCCGCGGTGTTG
CGTCCATCATTTGCATCCCCACATCCATGGCATGTGTTCGCGTCTACGAGGGCATGGGAC
AAAGCGACTAGGTGGGGCTATTCTCATCCAAAGTTAACCTCCAACGCATGCGTTAGTATT
AGAGCAAGATGTGCACTAGACAGAGGAAAGAAGGGAGTGGACCATTATTAATTCTCCCTA
CCTAGACTTCATGTGGCTGCCTCATGTAGAGGTTTGCCTTGCAAACTCAAAATAGAGAAC
GACTTGTGCTTTCCTAATCCTGAATGATTCCAGTACTGCACAACTATGACTCTCCATAAG
TGATTATTACTTCCTTAATTAACTAGGACCAAAACCTTAACCGGATCTGCTGCCTGGCTC
GTATGTCTTCCGCCACCTATGGGGATGCCCCACATGATAGAAAGTTGGAGTGGCGTTTTT
CTGAAGTCGGTTTTTGCAGTGGCACTCTTCAATTTTGAAGAGTTGTCAACGGCATTTAGG
AAATTAACCTGTAGTTATAACATTAGCAAACAACACTTCCTTTGGTATTATTGCCTACGC
ACTACTAGAGGGGGGGGGGGGGTATCAGCTTATTGTTTCCAAATATCTCCATTTTTCATA
AGAATATAAACAGATATTCTCAAAAATTGGGCAAAACACAGCACAGCTATGAACTTCAAT
CTTATGATGTTTCCCTGAATTTAGCACAAATAAGGATTCCTTCTTCTTAGGAAGAAGGAT
ATCTATCCAGTCTACTCAAACAAAAACTAATGTCTAATATATGACAAGCTTACTCAGTGT
GACAAATATATAAAACAAAATAGGGTATAAATACCATATCACGGCTCCAGCAGCTGCAAC
CTTTCGAAGCATGGATAAGCATTGCACCAATGTTCTTAAGTATTTCACATGGAGGGGAGC
ATCTGCCTTTCTCACTGATTCCTAAAGCAGCATTAAAAATAAATAGATAGCTCAGATAAT
TTGACCCCAAAATAATGTTAACCGACAAAGTACAGAATATAAGCCATACAAGGAACTCGT
CTGGTGTAGCGCAAGAAAGAAAAATTGGAATTTCACAAGAGAAACTTTTGGAATCCTTCC
GATCGTCGTCTAGGCCATCAAATGAAGAACTGAAGATGTGGAGAGAAAAATTAGGAAATC
AAAAAATAGATAACAAATACTCCCTCCGTCCCAATATAAGTGTCTCAAGCTTAGTACTTC
CTCTGTAAACTGATATAAGAGCATTTAGATTACTAAAATAGTGTTCTAAATGCTCTTATA
TTAGTTTACGGAGGGAGTACAAATTTATACTAGAGCTAGTAGAAAGTTGAGACACTTATT
TTGGGACGGAGGGAGTACTAGTTGTCAGTTTATTCCATACATTTAACAATGAGCTTCTGA
CTATTTGATACAGATGCAAATGACAAGAAATGGCTAACATAGTAATATATTTCACTGAAA
CAACTCAACAAGGATAACACAGTAGCTTAGCAACTCCATATACCTATTTTACTGTTTACA
TGTGCAGTTCTGATAGATTCGCTAAACATAAATTGAACTGATTCGAGGAAATAATTAATG
AATTTGACAGACATTACTCTAAAGCATATAATTGTTCACGTCCTGCAGGCATTCGGAACT
TATCATTTATGATAGCTATATGATATATAATGCATCAAAATTCAAAACTTCTGAGCGCAA
GGATGGAATTACCAAAACCTAGGTTTTTTACGTTATGAGATGCAAGGATATCATTAGCTC
CATCACAACTTGGAATAAGCATAGGGAATGGAACATACCATCCAACAGAACTAGTTTTTG
TTATCCCGTCTGCAGTAGCTGGTCCACTAAAGTGATTTTCACCTTTAATAGACATGGTTC
TCCTGGACAGAGGTTGCATGCTGCTTATTAAGCGACCAGTGGCTCCAGAAGTTGGTATGT
CCTCACTGTCAACCATGCTTAAAGTGACCAAGCTGGAACATTAAAAAATAGAGATGAATA
GCTGAAGGTCATTGACAGAATTTGAATCAAAAATCAGTTGACACGTATGGTGATCATTGC
CAAAAGAGTTACCAAGAAGTCTAAATCAAAATAAATATTCTCAAACACAACTTACTCACT
GGTGTTCACACTGTCATAGTAAAGTGCGTGTAAAAAAGATGTGATTGTAAAATAATTGTA
AGGCATAAGATGGCTACGGAAAAAATAGGGAATAATTAAAACAAGCCAAAAGGAATCGAG
GGCATGAAATGTACCTATATTCACCATTGTTGTATAGGTGGCAATGCAGCTCTTCTAAAA
TTTTGTAGAACAGTGCACCTCGCAGCTTTGTTAGATCAGATCGAACATCTTGAAGAGCAC
CTACCTTTAAAATTTTGTTAATATGTGAAAATGCTAAGATGAAAGAAAGAATGTGTCGTC
ATAGGATAAAGAGCTATTTTGAAGTACAGAATGTATTAAGAGGGCGACCAGACCGACAGG
CATACAAAAGATAAGACTTATTGATCTCTCATACGTCACTAAATGGAACTGCACTTTTAT
GTGTTACCGACCGGAAGTGCATATTCTGATAAACCTAGCACATGGTGCAGACATTGTAAA
TTGCAGCAGGCATATTGCAAATAAGTACACTGGCCTGTTACAAGAGTACTTGCATGTTAG
GACTAACCGCTTGAAGGCCTTCCCGCTCTAGCATCAGCATTGACTGGACATGCAACTGCA
CTGCGGCATATAGCTGCTTCTCTGCCATCAAGTTTTCAATCCGAGCTGGAACCTGCAGAA
ATTCAGTAAGTTATTACAGAAATTAACTCTTGGTAGTTGGGACGTAAAACATGCTAAGGT
TGAAATGAGCACTTAGAATGTAGACTGTAAAAGCTTGAAATTAGATACATACTCCAGTAT
CCTATAAGGAAATGTTGCTTAAAATCTCTCCACTATGAAATTTTGACTGGACCTGATTGA
CGCATTAAGCAAACATTTCATTTCAAAGGCAAAAACAAAAAGGAATTATACAGGATCACT
TCAATCTCCTTTCTATACTTCAGCAAGCTTAACAATTCAAAAGAAACTGCCAACAAAGAA
TTACAGACCAGTCTCATCCAGTCACAAATAGTTATTCGAGGCAAGGATGAAGGAGAAGCA
AACCACAATGAAGAAACAATTTTTTTACATACAAGAAAAATCGCCTGGATTTATGTTCCA
GATGTTAAATAAAATAGTAAACAAACATATGAAGGGTATATGAAATAAAAGCTTCGATTA
TTCTCACTGAGACTTCAATCATACAATTCTGACTAAACTTCAAACAGATCCGAATATGTC
ACAGGGCATGTGACTTCAAGATTAGTTTCGTGGGATGTCTTAAGATAATGGTAGGCAAGA
AGATTGAGCATTCTCGACACGGCGCTATCCTACACATGCAATGCATGCTTTTTGCAACGC
TGTCCTACACATGTTGAATTAGCCACCGATAAATTAACCACCCAACAGATGATTGGAAGA
ATGATACAGGATTGACAAAAAAATAGCTCCTCCGGAATCAGCCACGCTGATGAATATTAA
TTTTCCCAAATTGACAGTAGGTGTGCCATTGATCAGACAGAGAAAGGGAAGAGCATCCGA
CGGTGGAAAGAGATAGAGGAGGCAACTATTTTGAGGGATTTTAATTTTGCCAGACAAAAT
CAAATGAAATACAAAACATTGTATTAATTTTATCATTTTGTGGTGCTAATTGCATGGCTT
CATTAGCACTACTTGTAATAAAGACAATTAAAAATAACTAGCAACAGCAAGTAGTTCCAC
CTTTTTTCAGTATTGACCAGATTTTATGGATGGTTAAGGTGACTAGTATCCCTACACACT
CATACTTTTTATTGGTTTAAAGGGGAGTTGCTAGGTTCACCTCGCCTCCCCACTCGGTTT
TCCCTATCCTCGGTTGGTTTTCTGTAGATTTGTTTTTGTAATCTCAACCGATGCCGCACA
AAACAAAAACCGAAGTATATAGTTTAACTTGAAATAATCTGAACCAAATTGACATTTTCC
TTTCCTTGTCCTACTCATTCCCTTGAAACAAAAAAAACAACAACTATTAATTTGTGGAAA
GTATCATCTAGCGTTCGACGGAAGGATCACGTTAATTATGGAGAGTATCATTCTTTTCCG
GATTTGGCTATAGAATGCTTAGTGAGTTTAAATACCTCAAGCCAGGATCGCCTTAATTTA
GGGAAAATATCATTTATGTGGGCTCCTCCTAAAACCTCTCATTCCCTTTCCATTATCTTC
ACTTTCTGCTACACGATCCTACCCTTACGACGTCGATGTGGGACGGGCCATAGGGGGAAA
AATCACTCACGGCGTCTCTATTGAGGCACTCGTAGTTTTTACTAAATCAGTAAAATATGT
TTCCCATGTTGCAACGCACATGCAATTAGCTAGTAAGTATAGATAAGCATCTTACTAAAT
TATAATCATTTTTCCTTTTGTAATTGGTCAAAAAAAATTGTCAGGATATCATAACCCACA
AATCTAGCAGTTTATAAGATTTTTCCTTTCTAGGTCAGACAAATTGCCCTGGCATGATTA
TTACATGTACCAAACATGAGTATGCAACAACTGGGCTCATCTAGTGCATATGGATTTTTA
ACAACGCAAAGAAAATGGCAACACATACTAAAAATGATATTATTGTTCCATCCCACAAAT
GTCCCTTTTTTGTATCTGTGTTGATCATCAACGTCTGGTTGCACAAGACAGACAGAGCCT
AATTACCAGCTTCCGTTTAATGTAACGGTGCCGACAAGTAGTACATAACTGTAACGGGCG
AAGTGTGCCCACTGACCTTGGCCACATCTTCAACCTGATCCAGCAGGGAGATCACGTGGC
GCAGCGTGAGGGACCTGTACCATAGCTGCCCAAGGTGCTGATTCTTCCTCCCAAGCAGCT
TTTTGGCCTCTGCCATCTCCCCCTTGAGGCCGGTGATGCTCTCGGCGGACTCGCTGAACA
GCCGCAGGATCTGGCACCACACCGCACAATGGTAAAATATAAAACGCAACGGCGACTACA
CTCCCCAAATGGACGGGGATGAATAATCAGCCAGGGAGAAGGAATGCGCAGGTGGTGTGG
CGGACGGACATGGGAGTAGTTCTGTATGGCCTTGTTGAAGCCATGGTGGTACGCGTGGAC
GACCTCGTCAACGACGTCCTCGATGAGGTCGCTCTGCTCCTTGAGGAACTGGATCTCGCC
ATCGCGGTCCTTGGAGGTGAGGATGTGCACGACGTGCGGCAGCGAGTCGAACCGCGCCGC
TGCCCATCCCTCGTCGATCCGCGACAGCCCTTCCTTCAGGTACTGCACGCACGAACACCC
GACCAGAAACCAAATTCAAATTCCGTATAAATTCCAGGCGGGATCGAGGGATGTATTAGG
AAGGGAACGGGGCTTACAGATTTGTCTGGCGGAATTGGGAGGCCGTCGAAGATGCCACGC
CGGTGGCGGTTCATCGTTACCGACGGCGAGGCGGGACCCGGGGAGAGGCGCGAGATCTGG
AGAGACTGGGCTATACGAGAGGGGGTAGGACGTCGGAACCGGTAAGACGGGCAGGCCGAT
GAGATGACCTCTGTGCTTCCACACGTATAAGCCAAATAAATAAAATCCGCTCAAAAAAGG
CTACATAAATAAAAATATTATAAATGTCCTAATTTCTTTTTGTGTTAAGTCAGTTCCGAT
TTCTATACCTAATCTATATATACCTACCTCATCCTACCACCCAGGGTAGTTACTCTCCGA
TTTGATAGATACTACATACAACATACAAAACGTAAGTGGTGATAACTACCATCGATGGTA
GATAAAATTTGTCATATGTATATATATAATAATAATAAAGCGGCTATTGCTTCCGTCGGA
AAACCCACCGCGTCTTTTTTATAAAAAAGCTCTTGTAATTTTTGTTATTCAACCCNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNCAACGCAAAAGGAAAAAACGATTCGTTGCAAAAATTATATCCGTAC
GCATCGCCTCCTCCCGTCGACCCT